Protein–RNA interactions for Protein: Q15477

SKIV2L, Helicase SKI2W, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,246 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKIV2LQ15477 AC055731.1-201ENST00000474387 401 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
SKIV2LQ15477 SNORA31.15-201ENST00000516771 132 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
SKIV2LQ15477 RNU6-844P-201ENST00000517175 102 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
SKIV2LQ15477 FO624990.1-201ENST00000636373 85 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
SKIV2LQ15477 RNA5SP259-201ENST00000365541 109 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
SKIV2LQ15477 RNY1P7-201ENST00000384743 110 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
SKIV2LQ15477 RNU6-679P-201ENST00000391003 106 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
SKIV2LQ15477 AL451046.2-201ENST00000403074 277 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
SKIV2LQ15477 RNA5SP274-201ENST00000410484 108 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
SKIV2LQ15477 AP004217.1-201ENST00000480579 346 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
SKIV2LQ15477 CYP3A52P-201ENST00000563326 91 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
SKIV2LQ15477 FSIP2-206ENST00000611759 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.94□□□□□ -1.94
SKIV2LQ15477 MBNL3-205ENST00000370857 8760 ntTSL 5 BASIC2.94□□□□□ -1.94
SKIV2LQ15477 ASPM-202ENST00000367408 3747 ntTSL 1 (best) BASIC2.93□□□□□ -1.94
SKIV2LQ15477 TFEC-202ENST00000320239 6605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.93□□□□□ -1.94
SKIV2LQ15477 RNA5SP276-201ENST00000362580 94 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
SKIV2LQ15477 RNA5SP393-201ENST00000363423 117 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
SKIV2LQ15477 MIR194-1-201ENST00000384892 85 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
SKIV2LQ15477 RNU6ATAC3P-201ENST00000387974 126 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
SKIV2LQ15477 RNA5SP425-201ENST00000410336 112 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
SKIV2LQ15477 Z97988.1-201ENST00000637697 135 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
SKIV2LQ15477 Y_RNA.164-201ENST00000363709 102 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
SKIV2LQ15477 SNORD45B-201ENST00000364617 72 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
SKIV2LQ15477 Y_RNA.466-201ENST00000384294 113 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
SKIV2LQ15477 SNORA67.4-201ENST00000384688 142 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
SKIV2LQ15477 MIR653-201ENST00000385279 96 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
SKIV2LQ15477 SNORA26.2-201ENST00000390922 122 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
SKIV2LQ15477 RNA5SP21-201ENST00000410917 96 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
SKIV2LQ15477 MIR1270-201ENST00000459320 83 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
SKIV2LQ15477 MIR4648-201ENST00000580107 72 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
SKIV2LQ15477 AC096720.1-201ENST00000604441 183 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
SKIV2LQ15477 MIR4251-201ENST00000635819 61 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
SKIV2LQ15477 AKAP9-202ENST00000358100 10309 ntTSL 1 (best) BASIC2.92□□□□□ -1.94
SKIV2LQ15477 FOXP2-211ENST00000408937 6443 ntTSL 1 (best) BASIC2.92□□□□□ -1.94
SKIV2LQ15477 SACS-201ENST00000382292 15324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.91□□□□□ -1.94
SKIV2LQ15477 Y_RNA.342-201ENST00000365352 113 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
SKIV2LQ15477 RNU4-53P-201ENST00000410828 140 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
SKIV2LQ15477 RNA5SP458-201ENST00000516188 119 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
SKIV2LQ15477 RNU6-795P-201ENST00000516323 103 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
SKIV2LQ15477 MIR7111-201ENST00000619751 72 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
SKIV2LQ15477 OR4K2-204ENST00000641885 8681 ntAPPRIS P1 BASIC2.9□□□□□ -1.94
SKIV2LQ15477 RNU6-170P-201ENST00000362832 104 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
SKIV2LQ15477 Y_RNA.96-201ENST00000363092 109 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
SKIV2LQ15477 MIR513A1-201ENST00000385138 129 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
SKIV2LQ15477 JTBP1-201ENST00000441314 247 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
SKIV2LQ15477 Y_RNA.659-201ENST00000515994 113 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
SKIV2LQ15477 AL035078.1-202ENST00000531627 413 ntTSL 2 BASIC2.9□□□□□ -1.95
SKIV2LQ15477 MIR3935-201ENST00000583472 104 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
SKIV2LQ15477 AC012531.4-201ENST00000616509 177 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
SKIV2LQ15477 RNA5SP289-201ENST00000362332 137 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
SKIV2LQ15477 SNORD115-35-201ENST00000365122 82 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
SKIV2LQ15477 Y_RNA.377-201ENST00000365644 108 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
SKIV2LQ15477 NEBL-202ENST00000377122 9216 ntTSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
SKIV2LQ15477 RNU6-342P-201ENST00000384521 104 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
SKIV2LQ15477 SNORD38B-201ENST00000384690 67 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
SKIV2LQ15477 SNORD88.1-201ENST00000408684 91 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
SKIV2LQ15477 AC009093.3-203ENST00000565800 121 ntTSL 2 BASIC2.89□□□□□ -1.95
SKIV2LQ15477 AC025887.1-201ENST00000578349 264 ntTSL 3 BASIC2.89□□□□□ -1.95
SKIV2LQ15477 AL353997.5-201ENST00000618886 171 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
SKIV2LQ15477 FAS-AS1.2-201ENST00000620386 170 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
SKIV2LQ15477 SNORD38B-202ENST00000625943 69 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
SKIV2LQ15477 RNU6-1201P-201ENST00000384227 107 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
SKIV2LQ15477 MIR512-1-201ENST00000384913 84 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
SKIV2LQ15477 RNU6-602P-201ENST00000411155 105 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
SKIV2LQ15477 AC096949.1-201ENST00000412047 152 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
SKIV2LQ15477 AC004941.2-201ENST00000427009 228 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
SKIV2LQ15477 AL353813.1-201ENST00000440700 253 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
SKIV2LQ15477 RN7SL499P-201ENST00000481141 276 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
SKIV2LQ15477 IGHVIII-5-1-201ENST00000523059 99 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
SKIV2LQ15477 MIR8065-201ENST00000620577 100 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
SKIV2LQ15477 MIR6733-201ENST00000635723 61 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
SKIV2LQ15477 LIFR-201ENST00000263409 10089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
SKIV2LQ15477 CHD9-202ENST00000398510 11337 ntTSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
SKIV2LQ15477 FGF14-201ENST00000376131 12882 ntTSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
SKIV2LQ15477 Y_RNA.338-201ENST00000365320 114 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
SKIV2LQ15477 RNY4P29-201ENST00000410801 97 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
SKIV2LQ15477 RNU7-61P-201ENST00000515897 61 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
SKIV2LQ15477 RNU7-2P-201ENST00000516096 62 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
SKIV2LQ15477 RNU7-35P-201ENST00000517174 62 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
SKIV2LQ15477 MIR548AO-201ENST00000579992 96 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
SKIV2LQ15477 RNU6-1134P-201ENST00000365156 101 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
SKIV2LQ15477 RNU6-644P-201ENST00000391155 98 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
SKIV2LQ15477 5S_rRNA.2-201ENST00000391293 112 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
SKIV2LQ15477 RNU6-1086P-201ENST00000410930 100 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
SKIV2LQ15477 RN7SL633P-201ENST00000488974 297 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
SKIV2LQ15477 AC108729.3-201ENST00000513484 108 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
SKIV2LQ15477 RNU6-762P-201ENST00000517107 102 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
SKIV2LQ15477 PRKAA2-201ENST00000371244 9347 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
SKIV2LQ15477 LTN1-201ENST00000361371 7685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
SKIV2LQ15477 RNU6-1313P-201ENST00000362622 102 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
SKIV2LQ15477 RNU6-60P-201ENST00000364792 103 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
SKIV2LQ15477 AC026421.1-201ENST00000519101 163 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
SKIV2LQ15477 AL773524.1-201ENST00000614065 229 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
SKIV2LQ15477 TRAJ36-201ENST00000614481 58 ntAPPRIS P1 BASIC2.85□□□□□ -1.95
SKIV2LQ15477 BRCA1-202ENST00000354071 4497 ntTSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
SKIV2LQ15477 MIR27B-201ENST00000385129 97 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
SKIV2LQ15477 AL161935.2-201ENST00000414627 60 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
SKIV2LQ15477 MRPL35P3-201ENST00000421557 364 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
SKIV2LQ15477 RNU7-41P-201ENST00000515917 61 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
SKIV2LQ15477 RNU7-79P-201ENST00000516082 62 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
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