Protein–RNA interactions for Protein: Q15270

NKX1-1, NK1 transcription factor-related protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKX1-1Q15270 RNU6-1244P-201ENST00000363614 108 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
NKX1-1Q15270 RNU6-480P-201ENST00000384332 107 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
NKX1-1Q15270 RNU6-24P-201ENST00000384440 107 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
NKX1-1Q15270 MIR512-1-201ENST00000384913 84 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
NKX1-1Q15270 Y_RNA.611-201ENST00000410682 108 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
NKX1-1Q15270 RNU7-48P-201ENST00000458875 63 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
NKX1-1Q15270 MIR4658-201ENST00000584344 65 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
NKX1-1Q15270 CCDC168-201ENST00000322527 21466 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.56□□□□□ -1.84
NKX1-1Q15270 RNA5SP432-201ENST00000362480 116 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
NKX1-1Q15270 RNU6-633P-201ENST00000362612 103 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
NKX1-1Q15270 RNU6-509P-201ENST00000363519 107 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
NKX1-1Q15270 Y_RNA.244-201ENST00000364484 109 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
NKX1-1Q15270 Z98941.1-201ENST00000407764 100 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
NKX1-1Q15270 RNA5SP237-201ENST00000410414 113 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
NKX1-1Q15270 AC003982.1-202ENST00000469928 248 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
NKX1-1Q15270 RNA5SP282-201ENST00000516355 108 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
NKX1-1Q15270 RNU7-137P-201ENST00000516788 62 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
NKX1-1Q15270 MIR6715A-201ENST00000615929 79 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
NKX1-1Q15270 MIR4251-201ENST00000635819 61 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
NKX1-1Q15270 SYNE2-202ENST00000344113 21777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.54□□□□□ -1.84
NKX1-1Q15270 Y_RNA.607-201ENST00000410597 98 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
NKX1-1Q15270 RNA5SP100-201ENST00000410903 110 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
NKX1-1Q15270 RNA5SP59-201ENST00000410922 110 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
NKX1-1Q15270 RNA5SP508-201ENST00000411327 119 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
NKX1-1Q15270 AL161932.1-201ENST00000437408 146 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
NKX1-1Q15270 5S_rRNA.3-201ENST00000517021 110 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
NKX1-1Q15270 AC019288.1-201ENST00000557918 224 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
NKX1-1Q15270 MTND5P40-201ENST00000559945 246 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
NKX1-1Q15270 5S_rRNA.19-201ENST00000612131 110 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
NKX1-1Q15270 5S_rRNA.18-201ENST00000621941 110 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
NKX1-1Q15270 AP001362.1-201ENST00000625165 124 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
NKX1-1Q15270 KNL1-202ENST00000399668 7607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.54□□□□□ -1.84
NKX1-1Q15270 OR51L1-203ENST00000641819 7300 ntAPPRIS P1 BASIC3.54□□□□□ -1.84
NKX1-1Q15270 ERBIN-214ENST00000511297 4257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.53□□□□□ -1.84
NKX1-1Q15270 RNU6-1296P-201ENST00000383879 107 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
NKX1-1Q15270 U7.8-201ENST00000619968 63 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
NKX1-1Q15270 AC006160.2-201ENST00000637708 154 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
NKX1-1Q15270 PDE1A-205ENST00000435564 4885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.53□□□□□ -1.85
NKX1-1Q15270 MIR26A1-201ENST00000362205 77 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
NKX1-1Q15270 RNU6-1321P-201ENST00000390905 107 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
NKX1-1Q15270 MIR887-201ENST00000401258 79 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
NKX1-1Q15270 Y_RNA.609-201ENST00000410669 89 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
NKX1-1Q15270 UQCRHP3-201ENST00000451503 251 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
NKX1-1Q15270 HMSD-204ENST00000526932 162 ntTSL 3 BASIC3.52□□□□□ -1.85
NKX1-1Q15270 TRAJ36-201ENST00000614481 58 ntAPPRIS P1 BASIC3.52□□□□□ -1.85
NKX1-1Q15270 NEB-201ENST00000172853 20634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.52□□□□□ -1.85
NKX1-1Q15270 TFEC-202ENST00000320239 6605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.51□□□□□ -1.85
NKX1-1Q15270 ADGRV1-201ENST00000405460 19557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.51□□□□□ -1.85
NKX1-1Q15270 Y_RNA.4-201ENST00000362333 112 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
NKX1-1Q15270 RNA5SP138-201ENST00000365098 114 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
NKX1-1Q15270 RNA5SP492-201ENST00000411330 114 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
NKX1-1Q15270 RPL31P63-201ENST00000422565 375 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
NKX1-1Q15270 AC133485.1-201ENST00000567176 124 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
NKX1-1Q15270 DEFB122-202ENST00000569013 197 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
NKX1-1Q15270 MIR548BB-201ENST00000626714 66 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
NKX1-1Q15270 RNA5SP48-201ENST00000363969 126 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
NKX1-1Q15270 RNU6-787P-201ENST00000384032 107 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
NKX1-1Q15270 SNORA70B-201ENST00000384210 135 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
NKX1-1Q15270 RNU6-857P-201ENST00000515893 110 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
NKX1-1Q15270 RNU6-917P-201ENST00000516294 104 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
NKX1-1Q15270 ASPM-202ENST00000367408 3747 ntTSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
NKX1-1Q15270 THOC2-201ENST00000245838 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.49□□□□□ -1.85
NKX1-1Q15270 RNU6-805P-201ENST00000365643 106 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
NKX1-1Q15270 MIR653-201ENST00000385279 96 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
NKX1-1Q15270 RNA5SP293-201ENST00000410527 113 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
NKX1-1Q15270 RPS29P6-201ENST00000438196 145 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
NKX1-1Q15270 SNORA31.17-201ENST00000516953 127 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
NKX1-1Q15270 AL035078.1-202ENST00000531627 413 ntTSL 2 BASIC3.49□□□□□ -1.85
NKX1-1Q15270 SNORD53-201ENST00000579969 78 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
NKX1-1Q15270 MIR4662A-201ENST00000637499 67 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
NKX1-1Q15270 NEB-204ENST00000409198 20637 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC3.49□□□□□ -1.85
NKX1-1Q15270 LIG4-203ENST00000442234 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.48□□□□□ -1.85
NKX1-1Q15270 Y_RNA.173-201ENST00000363776 113 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
NKX1-1Q15270 RNA5SP24-201ENST00000516478 95 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
NKX1-1Q15270 SNORA31.15-201ENST00000516771 132 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
NKX1-1Q15270 SNORA31.26-201ENST00000517250 137 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
NKX1-1Q15270 AC099850.3-201ENST00000577678 321 ntTSL 3 BASIC3.48□□□□□ -1.85
NKX1-1Q15270 MIR548AO-201ENST00000579992 96 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
NKX1-1Q15270 AC012676.2-201ENST00000619258 186 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
NKX1-1Q15270 AC008781.2-201ENST00000502205 2480 ntTSL 1 (best) BASIC3.48□□□□□ -1.85
NKX1-1Q15270 FAM214A-201ENST00000261844 4217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.47□□□□□ -1.85
NKX1-1Q15270 Y_RNA.313-201ENST00000365095 103 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
NKX1-1Q15270 RNU6-1307P-201ENST00000391012 103 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
NKX1-1Q15270 AL365434.1-201ENST00000412362 380 ntTSL 3 BASIC3.47□□□□□ -1.85
NKX1-1Q15270 AC004965.1-201ENST00000413033 213 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
NKX1-1Q15270 AC105081.1-201ENST00000617727 106 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
NKX1-1Q15270 POSTN-209ENST00000541179 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.47□□□□□ -1.85
NKX1-1Q15270 DST-204ENST00000361203 22431 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.46□□□□□ -1.85
NKX1-1Q15270 SNORD115-37-201ENST00000363768 82 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
NKX1-1Q15270 SNORA3.2-201ENST00000408221 125 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
NKX1-1Q15270 RNA5SP450-201ENST00000411206 102 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
NKX1-1Q15270 RNU1-98P-201ENST00000458992 160 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
NKX1-1Q15270 SEPT14P17-201ENST00000617978 177 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
NKX1-1Q15270 LPP-220ENST00000617246 18220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.45□□□□□ -1.86
NKX1-1Q15270 KCNT2-202ENST00000367433 5883 ntTSL 1 (best) BASIC3.45□□□□□ -1.86
NKX1-1Q15270 Y_RNA.168-201ENST00000363740 102 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
NKX1-1Q15270 RPS29P11-201ENST00000496507 171 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
NKX1-1Q15270 AC008413.1-201ENST00000511864 177 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
NKX1-1Q15270 CERS6-AS1-202ENST00000594898 499 ntTSL 5 BASIC3.45□□□□□ -1.86
NKX1-1Q15270 AP000753.3-201ENST00000604083 169 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 104.5 ms