Protein–RNA interactions for Protein: Q12857

NFIA, Nuclear factor 1 A-type, humanhuman

Predictions only

Length 509 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFIAQ12857 RNU6-241P-201ENST00000391148 104 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
NFIAQ12857 RNU6-177P-201ENST00000411257 104 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
NFIAQ12857 AC092783.1-201ENST00000435832 231 ntTSL 3 BASIC2.71□□□□□ -1.98
NFIAQ12857 STAG3L5P-204ENST00000443759 179 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
NFIAQ12857 AC108729.3-201ENST00000513484 108 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
NFIAQ12857 AL049779.4-201ENST00000604500 156 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
NFIAQ12857 MIR6873-201ENST00000622788 63 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
NFIAQ12857 DENND4A-202ENST00000443035 8665 ntTSL 1 (best) BASIC2.71□□□□□ -1.98
NFIAQ12857 SNORA22.1-201ENST00000362701 134 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
NFIAQ12857 Y_RNA.247-201ENST00000364500 92 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
NFIAQ12857 Y_RNA.430-201ENST00000384081 110 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
NFIAQ12857 SNORA67.3-201ENST00000384366 140 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
NFIAQ12857 RNU6-160P-201ENST00000384591 107 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
NFIAQ12857 MIR889-201ENST00000401280 79 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
NFIAQ12857 AL023284.1-201ENST00000403956 276 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
NFIAQ12857 MIR1267-201ENST00000408723 78 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
NFIAQ12857 AC015922.2-201ENST00000435593 184 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
NFIAQ12857 IGHVIII-5-1-201ENST00000523059 99 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
NFIAQ12857 AC009093.3-203ENST00000565800 121 ntTSL 2 BASIC2.7□□□□□ -1.98
NFIAQ12857 MIR6841-201ENST00000637129 72 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
NFIAQ12857 AGTPBP1-205ENST00000376083 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.7□□□□□ -1.98
NFIAQ12857 MAP4K3-205ENST00000437545 3924 ntTSL 5 BASIC2.7□□□□□ -1.98
NFIAQ12857 RNU6-424P-201ENST00000384367 105 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
NFIAQ12857 MIR1262-201ENST00000408276 93 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
NFIAQ12857 Y_RNA.607-201ENST00000410597 98 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
NFIAQ12857 AC090844.1-201ENST00000422019 156 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
NFIAQ12857 AC103810.7-201ENST00000607821 91 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
NFIAQ12857 OXR1-215ENST00000531443 3599 ntTSL 5 BASIC2.69□□□□□ -1.98
NFIAQ12857 SAGE1-201ENST00000324447 2952 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.68□□□□□ -1.98
NFIAQ12857 Y_RNA.316-201ENST00000365118 111 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
NFIAQ12857 SNORA25B-201ENST00000365507 128 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
NFIAQ12857 UBL5P1-201ENST00000507979 193 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
NFIAQ12857 LINC02386-203ENST00000552182 501 ntTSL 3 BASIC2.68□□□□□ -1.98
NFIAQ12857 RNU6-86P-201ENST00000606534 107 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
NFIAQ12857 MIR8054-201ENST00000620877 86 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
NFIAQ12857 MIR6766-201ENST00000622641 72 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
NFIAQ12857 AC027279.3-201ENST00000625055 122 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
NFIAQ12857 COMMD6-213ENST00000626103 120 ntTSL 5 BASIC2.68□□□□□ -1.98
NFIAQ12857 AC245060.5-201ENST00000610778 3293 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
NFIAQ12857 CEP44-203ENST00000426172 3037 ntTSL 5 BASIC2.67□□□□□ -1.98
NFIAQ12857 OR4C11-202ENST00000641580 2737 ntAPPRIS P1 BASIC2.67□□□□□ -1.98
NFIAQ12857 NEDD1-204ENST00000457368 3162 ntTSL 2 BASIC2.67□□□□□ -1.98
NFIAQ12857 RNU6-633P-201ENST00000362612 103 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
NFIAQ12857 Y_RNA.94-201ENST00000363068 106 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
NFIAQ12857 SNORA67.1-201ENST00000364749 141 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
NFIAQ12857 SNORA32-201ENST00000384072 121 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
NFIAQ12857 TRDJ3-201ENST00000390476 59 ntAPPRIS P1 BASIC2.67□□□□□ -1.98
NFIAQ12857 RNU6-788P-201ENST00000390967 104 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
NFIAQ12857 SNORA26.6-201ENST00000391256 115 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
NFIAQ12857 AL591806.2-201ENST00000433122 173 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
NFIAQ12857 RNU7-34P-201ENST00000459394 64 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
NFIAQ12857 MIR3152-201ENST00000579801 74 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
NFIAQ12857 VPS54-202ENST00000354504 3594 ntTSL 1 (best) BASIC2.66□□□□□ -1.98
NFIAQ12857 DNAH7-201ENST00000312428 12394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.66□□□□□ -1.98
NFIAQ12857 FAR1-204ENST00000532502 5820 ntTSL 2 BASIC2.66□□□□□ -1.98
NFIAQ12857 RNA5SP493-201ENST00000364115 91 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
NFIAQ12857 RNU1-51P-201ENST00000365345 176 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
NFIAQ12857 Y_RNA.609-201ENST00000410669 89 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
NFIAQ12857 snoU13.23-201ENST00000458863 104 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
NFIAQ12857 AC021785.1-201ENST00000520780 453 ntTSL 3 BASIC2.66□□□□□ -1.98
NFIAQ12857 Hammerhead_HH9.1-201ENST00000616606 77 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
NFIAQ12857 OGN-201ENST00000262551 2971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.65□□□□□ -1.98
NFIAQ12857 TTK-202ENST00000369798 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.65□□□□□ -1.99
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NFIAQ12857 RNU6-1163P-201ENST00000364516 107 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
NFIAQ12857 RNU6-220P-201ENST00000390919 107 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
NFIAQ12857 RNU6-1190P-201ENST00000410811 104 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
NFIAQ12857 AL353795.2-201ENST00000431804 425 ntTSL 2 BASIC2.65□□□□□ -1.99
NFIAQ12857 RNU6-958P-201ENST00000516995 106 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
NFIAQ12857 RNU6-1006P-201ENST00000516998 103 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
NFIAQ12857 AL161716.1-201ENST00000606365 273 ntTSL 5 BASIC2.65□□□□□ -1.99
NFIAQ12857 SEPT14P17-201ENST00000617978 177 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
NFIAQ12857 NFIA-AS1-206ENST00000630199 220 ntTSL 5 BASIC2.65□□□□□ -1.99
NFIAQ12857 PRKACB-204ENST00000370685 4481 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.65□□□□□ -1.99
NFIAQ12857 NAALADL2-203ENST00000454872 9865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.64□□□□□ -1.99
NFIAQ12857 Y_RNA.140-201ENST00000363474 103 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
NFIAQ12857 SNORA31.10-201ENST00000516482 106 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
NFIAQ12857 MIR3169-201ENST00000578032 83 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
NFIAQ12857 SNORA28-201ENST00000606769 126 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
NFIAQ12857 AC022513.1-201ENST00000624512 117 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
NFIAQ12857 ERBIN-202ENST00000380935 6692 ntTSL 5 BASIC2.64□□□□□ -1.99
NFIAQ12857 CCSAP-202ENST00000366686 4399 ntTSL 2 BASIC2.64□□□□□ -1.99
NFIAQ12857 KNL1-204ENST00000527044 5404 ntTSL 5 BASIC2.63□□□□□ -1.99
NFIAQ12857 TSGA10-205ENST00000410001 3036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.63□□□□□ -1.99
NFIAQ12857 CFH-202ENST00000367429 4127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.63□□□□□ -1.99
NFIAQ12857 U8.16-201ENST00000391279 133 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
NFIAQ12857 AC015712.3-201ENST00000559380 164 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
NFIAQ12857 SNORD115-27-201ENST00000364430 82 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
NFIAQ12857 Y_RNA.370-201ENST00000365589 108 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
NFIAQ12857 RNU6-1307P-201ENST00000391012 103 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
NFIAQ12857 RNU7-67P-201ENST00000459003 62 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
NFIAQ12857 RNU7-2P-201ENST00000516096 62 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
NFIAQ12857 RNU7-53P-201ENST00000516705 60 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
NFIAQ12857 MIR4791-201ENST00000607666 84 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
NFIAQ12857 U4atac.1-201ENST00000618345 95 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
NFIAQ12857 MIR6717-201ENST00000622747 73 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
NFIAQ12857 IDE-201ENST00000265986 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.62□□□□□ -1.99
NFIAQ12857 RNU6-23P-201ENST00000363283 107 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
NFIAQ12857 RNU6-833P-201ENST00000363486 107 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
NFIAQ12857 SNORD38.1-201ENST00000363863 68 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
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