Protein–RNA interactions for Protein: Q17RM4

CCDC142, Coiled-coil domain-containing protein 142, humanhuman

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Length 750 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC142Q17RM4 MIR1255B1-201ENST00000636325 63 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
CCDC142Q17RM4 U6.108-201ENST00000637764 58 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
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CCDC142Q17RM4 RNU4-16P-201ENST00000364737 141 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
CCDC142Q17RM4 Y_RNA.410-201ENST00000383992 113 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
CCDC142Q17RM4 Y_RNA.440-201ENST00000384120 114 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
CCDC142Q17RM4 Y_RNA.547-201ENST00000384654 119 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
CCDC142Q17RM4 MIR577-201ENST00000385196 96 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
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CCDC142Q17RM4 MIR6079-201ENST00000635807 62 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
CCDC142Q17RM4 AC091304.10-201ENST00000641554 121 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
CCDC142Q17RM4 DYNC2H1-203ENST00000398093 12945 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.09□□□□□ -2.07
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CCDC142Q17RM4 CSNK1G3-202ENST00000360683 4047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.08□□□□□ -2.08
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CCDC142Q17RM4 RNU1-133P-201ENST00000364867 167 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
CCDC142Q17RM4 SNORA4.2-201ENST00000365313 147 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
CCDC142Q17RM4 SNORA25B-201ENST00000365507 128 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
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CCDC142Q17RM4 U8.13-201ENST00000390842 128 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
CCDC142Q17RM4 SUMO2P12-201ENST00000405924 140 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
CCDC142Q17RM4 MIR1912-201ENST00000410389 80 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
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CCDC142Q17RM4 LINC00645-203ENST00000557399 3512 ntTSL 1 (best) BASIC2.08□□□□□ -2.08
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CCDC142Q17RM4 MUC15-202ENST00000436318 3118 ntTSL 5 BASIC2.05□□□□□ -2.08
CCDC142Q17RM4 RNU6-363P-201ENST00000362895 105 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
CCDC142Q17RM4 SNORD68-201ENST00000363214 84 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
CCDC142Q17RM4 Y_RNA.155-201ENST00000363632 101 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
CCDC142Q17RM4 SNORD115-35-201ENST00000365122 82 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
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CCDC142Q17RM4 Y_RNA.437-201ENST00000384113 113 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
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CCDC142Q17RM4 RPL23AP63-201ENST00000498752 471 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
CCDC142Q17RM4 AP003484.1-201ENST00000530974 250 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
CCDC142Q17RM4 MIR4694-201ENST00000578534 80 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
CCDC142Q17RM4 MIR3683-201ENST00000580847 82 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
CCDC142Q17RM4 LRRD1-203ENST00000430130 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.03□□□□□ -2.08
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