Protein–RNA interactions for Protein: Q15477

SKIV2L, Helicase SKI2W, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKIV2LQ15477 MIR6841-201ENST00000637129 72 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
SKIV2LQ15477 Y_RNA.107-201ENST00000363190 121 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
SKIV2LQ15477 RNA5SP68-201ENST00000363885 119 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
SKIV2LQ15477 MIR1302-4-201ENST00000408701 150 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
SKIV2LQ15477 RN7SKP123-201ENST00000410732 291 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
SKIV2LQ15477 RNU6-1190P-201ENST00000410811 104 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
SKIV2LQ15477 RNU7-43P-201ENST00000516554 64 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
SKIV2LQ15477 DEFB122-202ENST00000569013 197 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
SKIV2LQ15477 MIR548AE2-201ENST00000583456 67 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
SKIV2LQ15477 AC007218.2-201ENST00000636913 179 ntTSL 5 BASIC3.05□□□□□ -1.92
SKIV2LQ15477 FOXP2-210ENST00000403559 6415 ntTSL 2 BASIC3.05□□□□□ -1.92
SKIV2LQ15477 SLC6A15-202ENST00000309283 3108 ntTSL 5 BASIC3.05□□□□□ -1.92
SKIV2LQ15477 MIR133A1HG-202ENST00000581072 4226 ntTSL 1 (best) BASIC3.04□□□□□ -1.92
SKIV2LQ15477 GCNT4-201ENST00000322348 5554 ntAPPRIS P1 BASIC3.04□□□□□ -1.92
SKIV2LQ15477 ZNF567-201ENST00000360729 2691 ntTSL 1 (best) BASIC3.04□□□□□ -1.92
SKIV2LQ15477 RNU6-1099P-201ENST00000363533 107 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
SKIV2LQ15477 AL023284.1-201ENST00000403956 276 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
SKIV2LQ15477 Y_RNA.601-201ENST00000410500 113 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
SKIV2LQ15477 RAB6C-AS1-202ENST00000433431 123 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
SKIV2LQ15477 RNA5SP148-201ENST00000516527 94 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
SKIV2LQ15477 RNU6-548P-201ENST00000517083 115 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
SKIV2LQ15477 AC015712.3-201ENST00000559380 164 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
SKIV2LQ15477 CPD-202ENST00000543464 4007 ntTSL 2 BASIC3.04□□□□□ -1.92
SKIV2LQ15477 SNORA1.1-201ENST00000364671 133 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
SKIV2LQ15477 SNORA67.1-201ENST00000364749 141 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
SKIV2LQ15477 SNORA3.2-201ENST00000408221 125 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
SKIV2LQ15477 MIR4694-201ENST00000578534 80 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
SKIV2LQ15477 ZNF658B-202ENST00000615961 3375 ntBASIC3.03□□□□□ -1.93
SKIV2LQ15477 PRKACB-218ENST00000610703 4240 ntTSL 2 BASIC3.02□□□□□ -1.93
SKIV2LQ15477 OR2J3-203ENST00000641960 3342 ntAPPRIS P1 BASIC3.02□□□□□ -1.93
SKIV2LQ15477 Y_RNA.354-201ENST00000365448 111 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
SKIV2LQ15477 Y_RNA.360-201ENST00000365512 102 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
SKIV2LQ15477 RNU6-49P-201ENST00000384256 107 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
SKIV2LQ15477 MIR520C-201ENST00000385005 87 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
SKIV2LQ15477 SNORA7.5-201ENST00000410672 110 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
SKIV2LQ15477 AL731684.2-201ENST00000426839 333 ntTSL 5 BASIC3.02□□□□□ -1.93
SKIV2LQ15477 AC099850.3-201ENST00000577678 321 ntTSL 3 BASIC3.02□□□□□ -1.93
SKIV2LQ15477 ZBTB6-201ENST00000373659 4106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.02□□□□□ -1.93
SKIV2LQ15477 AGL-204ENST00000370161 6923 ntTSL 5 BASIC3.01□□□□□ -1.93
SKIV2LQ15477 SNORD73B-201ENST00000364394 72 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
SKIV2LQ15477 RNU6-616P-201ENST00000384353 107 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
SKIV2LQ15477 Y_RNA.558-201ENST00000384685 113 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
SKIV2LQ15477 RNU6-482P-201ENST00000391068 107 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
SKIV2LQ15477 RNA5SP344-201ENST00000411081 104 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
SKIV2LQ15477 AL591806.2-201ENST00000433122 173 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
SKIV2LQ15477 RNU6-322P-201ENST00000516010 103 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
SKIV2LQ15477 RNU2-19P-201ENST00000517288 84 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
SKIV2LQ15477 MIR4764-201ENST00000580680 88 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
SKIV2LQ15477 AC007318.2-201ENST00000620999 243 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
SKIV2LQ15477 COMMD6-213ENST00000626103 120 ntTSL 5 BASIC3.01□□□□□ -1.93
SKIV2LQ15477 AF165147.1-201ENST00000433310 6103 ntTSL 2 BASIC3.01□□□□□ -1.93
SKIV2LQ15477 KCNIP4-IT1-201ENST00000627566 9848 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
SKIV2LQ15477 AC005336.3-201ENST00000623833 2679 ntBASIC3□□□□□ -1.93
SKIV2LQ15477 PRKACB-207ENST00000394838 4294 ntTSL 5 BASIC3□□□□□ -1.93
SKIV2LQ15477 SAGE1-201ENST00000324447 2952 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC3□□□□□ -1.93
SKIV2LQ15477 SNORA32-201ENST00000384072 121 ntBASIC3□□□□□ -1.93
SKIV2LQ15477 MIR605-201ENST00000385078 83 ntBASIC3□□□□□ -1.93
SKIV2LQ15477 AL138827.1-201ENST00000402666 306 ntBASIC3□□□□□ -1.93
SKIV2LQ15477 RNU6ATAC37P-201ENST00000408328 131 ntBASIC3□□□□□ -1.93
SKIV2LQ15477 AC004965.1-201ENST00000413033 213 ntBASIC3□□□□□ -1.93
SKIV2LQ15477 AC073127.1-201ENST00000447336 333 ntTSL 3 BASIC3□□□□□ -1.93
SKIV2LQ15477 AC011753.1-201ENST00000451001 220 ntBASIC3□□□□□ -1.93
SKIV2LQ15477 AC003982.1-202ENST00000469928 248 ntBASIC3□□□□□ -1.93
SKIV2LQ15477 MIR5194-201ENST00000582634 120 ntBASIC3□□□□□ -1.93
SKIV2LQ15477 AC008133.2-201ENST00000624540 351 ntBASIC3□□□□□ -1.93
SKIV2LQ15477 PCDH11Y-201ENST00000215473 4595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3□□□□□ -1.93
SKIV2LQ15477 MUC15-203ENST00000455601 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.99□□□□□ -1.93
SKIV2LQ15477 AC073325.2-201ENST00000339545 159 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
SKIV2LQ15477 RNU6-832P-201ENST00000363319 107 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
SKIV2LQ15477 RNA5SP99-201ENST00000364020 114 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
SKIV2LQ15477 MIR488-201ENST00000365739 83 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
SKIV2LQ15477 RNU6-203P-201ENST00000384038 104 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
SKIV2LQ15477 HMGN1P33-201ENST00000432945 451 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
SKIV2LQ15477 AC234781.5-201ENST00000508429 271 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
SKIV2LQ15477 RNU6-917P-201ENST00000516294 104 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
SKIV2LQ15477 MIR8055-201ENST00000610739 97 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
SKIV2LQ15477 NEDD4-205ENST00000506154 6751 ntTSL 1 (best) BASIC2.98□□□□□ -1.93
SKIV2LQ15477 MIR577-201ENST00000385196 96 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
SKIV2LQ15477 SNORD23.1-201ENST00000408212 104 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
SKIV2LQ15477 MIR4446-201ENST00000578505 67 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
SKIV2LQ15477 SIRT1-203ENST00000406900 3295 ntTSL 2 BASIC2.98□□□□□ -1.93
SKIV2LQ15477 RNU1-112P-201ENST00000364401 164 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
SKIV2LQ15477 SNORA18-201ENST00000384416 132 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
SKIV2LQ15477 MIR9-1-201ENST00000385198 89 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
SKIV2LQ15477 MIR764-201ENST00000390811 85 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
SKIV2LQ15477 RNA5SP212-201ENST00000391223 107 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
SKIV2LQ15477 AL359195.1-201ENST00000416657 339 ntTSL 3 BASIC2.97□□□□□ -1.93
SKIV2LQ15477 Z98742.3-201ENST00000418637 326 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
SKIV2LQ15477 AC245047.7-201ENST00000440265 293 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
SKIV2LQ15477 MALAT1.1-201ENST00000618249 95 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
SKIV2LQ15477 AL512310.12-203ENST00000640543 90 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
SKIV2LQ15477 CHD9-218ENST00000566029 13110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.97□□□□□ -1.93
SKIV2LQ15477 RNU6-1018P-201ENST00000516577 106 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
SKIV2LQ15477 RNU6-521P-201ENST00000516663 105 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
SKIV2LQ15477 AL442128.1-201ENST00000615151 90 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
SKIV2LQ15477 CHD9-203ENST00000447540 11509 ntTSL 5 BASIC2.96□□□□□ -1.94
SKIV2LQ15477 PCM1-222ENST00000524226 5955 ntTSL 1 (best) BASIC2.95□□□□□ -1.94
SKIV2LQ15477 SNORD114-30-201ENST00000364448 72 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
SKIV2LQ15477 MIR1289-2-201ENST00000408360 111 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
SKIV2LQ15477 AL603825.1-201ENST00000438481 80 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 108.2 ms