Protein–RNA interactions for Protein: Q15042

RAB3GAP1, Rab3 GTPase-activating protein catalytic subunit, humanhuman

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Length 981 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB3GAP1Q15042 RNU1-148P-201ENST00000384472 162 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
RAB3GAP1Q15042 MIR29C-201ENST00000385231 88 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
RAB3GAP1Q15042 5S_rRNA.2-201ENST00000391293 112 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
RAB3GAP1Q15042 CFLAR-AS1-202ENST00000474886 223 ntTSL 3 BASIC2.38□□□□□ -2.03
RAB3GAP1Q15042 RNU6-548P-201ENST00000517083 115 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
RAB3GAP1Q15042 SNORA28-201ENST00000606769 126 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
RAB3GAP1Q15042 SNORA27-201ENST00000384323 126 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
RAB3GAP1Q15042 U8.16-201ENST00000391279 133 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
RAB3GAP1Q15042 SNX2P2-201ENST00000424553 323 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
RAB3GAP1Q15042 HMGN2P23-201ENST00000456759 269 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
RAB3GAP1Q15042 RNU6-998P-201ENST00000515894 101 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
RAB3GAP1Q15042 RNU6-904P-201ENST00000516206 101 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
RAB3GAP1Q15042 MIR5094-201ENST00000578766 85 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
RAB3GAP1Q15042 MIR3163-201ENST00000581592 73 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
RAB3GAP1Q15042 DLEU2_5.2-201ENST00000610606 84 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
RAB3GAP1Q15042 AC245884.12-201ENST00000615364 59 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
RAB3GAP1Q15042 MIPOL1-203ENST00000537471 5954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.37□□□□□ -2.03
RAB3GAP1Q15042 MIR342-201ENST00000362212 99 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
RAB3GAP1Q15042 Y_RNA.78-201ENST00000362970 110 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
RAB3GAP1Q15042 Y_RNA.241-201ENST00000364470 117 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
RAB3GAP1Q15042 RNU6-424P-201ENST00000384367 105 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
RAB3GAP1Q15042 MIR597-201ENST00000384968 97 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
RAB3GAP1Q15042 RNU6-482P-201ENST00000391068 107 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
RAB3GAP1Q15042 AC019129.1-201ENST00000403786 261 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
RAB3GAP1Q15042 RNA5SP144-201ENST00000410846 116 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
RAB3GAP1Q15042 RNA5SP489-201ENST00000410986 109 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
RAB3GAP1Q15042 AC015922.2-201ENST00000435593 184 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
RAB3GAP1Q15042 RN7SL274P-201ENST00000492268 272 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
RAB3GAP1Q15042 MIR4778-201ENST00000577635 80 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
RAB3GAP1Q15042 AL162726.3-218ENST00000636401 95 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
RAB3GAP1Q15042 GPR22-201ENST00000304402 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.36□□□□□ -2.03
RAB3GAP1Q15042 PYGO1-201ENST00000302000 8488 ntTSL 1 (best) BASIC2.36□□□□□ -2.03
RAB3GAP1Q15042 AL596028.1-201ENST00000326971 197 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
RAB3GAP1Q15042 SNORA63D-201ENST00000364359 132 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
RAB3GAP1Q15042 SNORA4.2-201ENST00000365313 147 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
RAB3GAP1Q15042 MIR1283-2-201ENST00000408621 87 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
RAB3GAP1Q15042 RN7SKP200-201ENST00000410564 320 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
RAB3GAP1Q15042 AC090821.2-201ENST00000523552 176 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
RAB3GAP1Q15042 MIR5089-201ENST00000580047 84 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
RAB3GAP1Q15042 SNRPGP19-201ENST00000603826 189 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
RAB3GAP1Q15042 MIR6845-201ENST00000613182 61 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
RAB3GAP1Q15042 Y_RNA.818-201ENST00000618813 71 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
RAB3GAP1Q15042 AL353997.5-201ENST00000618886 171 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
RAB3GAP1Q15042 hsa-mir-3158-1.1-201ENST00000637571 81 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
RAB3GAP1Q15042 HIF1A-212ENST00000557538 3468 ntTSL 1 (best) BASIC2.34□□□□□ -2.03
RAB3GAP1Q15042 SCN7A-201ENST00000409855 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.34□□□□□ -2.03
RAB3GAP1Q15042 SNORD115-34-201ENST00000362441 82 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
RAB3GAP1Q15042 SNORD115-12-201ENST00000362583 82 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
RAB3GAP1Q15042 SNORD115-29-201ENST00000362834 82 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
RAB3GAP1Q15042 SNORD115-9-201ENST00000362912 82 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
RAB3GAP1Q15042 SNORD115-21-201ENST00000362963 81 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
RAB3GAP1Q15042 SNORD115-14-201ENST00000363090 81 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
RAB3GAP1Q15042 SNORD115-13-201ENST00000363358 82 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
RAB3GAP1Q15042 RNU6-833P-201ENST00000363486 107 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
RAB3GAP1Q15042 SNORD115-41-201ENST00000363608 82 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
RAB3GAP1Q15042 SNORD115-11-201ENST00000363616 82 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
RAB3GAP1Q15042 SNORD115-5-201ENST00000363633 82 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
RAB3GAP1Q15042 SNORD115-39-201ENST00000363694 82 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
RAB3GAP1Q15042 SNORD115-4-201ENST00000363810 82 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
RAB3GAP1Q15042 SNORD115-16-201ENST00000363887 82 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
RAB3GAP1Q15042 SNORD115-6-201ENST00000363942 82 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
RAB3GAP1Q15042 SNORD115-42-201ENST00000364273 82 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
RAB3GAP1Q15042 SNORD115-15-201ENST00000364809 81 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
RAB3GAP1Q15042 SNORD115-1-201ENST00000364961 82 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
RAB3GAP1Q15042 SNORD115-26-201ENST00000365067 82 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
RAB3GAP1Q15042 SNORD115-10-201ENST00000365073 81 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
RAB3GAP1Q15042 SNORD115-43-201ENST00000365503 82 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
RAB3GAP1Q15042 SNORD115-36-201ENST00000365629 82 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
RAB3GAP1Q15042 MIR583-201ENST00000384846 75 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
RAB3GAP1Q15042 TRAJ41-201ENST00000390496 62 ntAPPRIS P1 BASIC2.34□□□□□ -2.03
RAB3GAP1Q15042 LINC01866-201ENST00000421181 201 ntTSL 3 BASIC2.34□□□□□ -2.03
RAB3GAP1Q15042 AC092783.1-201ENST00000435832 231 ntTSL 3 BASIC2.34□□□□□ -2.03
RAB3GAP1Q15042 RNU7-96P-201ENST00000459535 64 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
RAB3GAP1Q15042 LINC02514-201ENST00000509058 498 ntTSL 3 BASIC2.34□□□□□ -2.03
RAB3GAP1Q15042 RNA5SP168-201ENST00000516642 112 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
RAB3GAP1Q15042 RNU7-6P-201ENST00000516845 62 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
RAB3GAP1Q15042 RNU6-158P-201ENST00000517104 100 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
RAB3GAP1Q15042 RNU6-762P-201ENST00000517107 102 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
RAB3GAP1Q15042 RNU7-181P-201ENST00000517234 74 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
RAB3GAP1Q15042 AC141557.1-201ENST00000540982 400 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
RAB3GAP1Q15042 CERS6-AS1-202ENST00000594898 499 ntTSL 5 BASIC2.34□□□□□ -2.03
RAB3GAP1Q15042 SNORD115-40-201ENST00000606510 82 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
RAB3GAP1Q15042 SNORD14A-201ENST00000606526 91 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
RAB3GAP1Q15042 HOTAIRM1_4.1-201ENST00000617934 102 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
RAB3GAP1Q15042 AC087741.2-201ENST00000619415 172 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
RAB3GAP1Q15042 KTN1-207ENST00000438792 4449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.34□□□□□ -2.03
RAB3GAP1Q15042 MIER3-204ENST00000381226 5210 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.34□□□□□ -2.04
RAB3GAP1Q15042 AP006437.1-201ENST00000641440 3685 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
RAB3GAP1Q15042 SNORA40.18-201ENST00000391200 128 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
RAB3GAP1Q15042 ATP6V0E1P1-201ENST00000412537 226 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
RAB3GAP1Q15042 AL445685.2-201ENST00000422551 342 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
RAB3GAP1Q15042 AL512326.2-201ENST00000426359 151 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
RAB3GAP1Q15042 MTATP8P2-201ENST00000435212 202 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
RAB3GAP1Q15042 RNU6-970P-201ENST00000516312 107 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
RAB3GAP1Q15042 AL161716.1-201ENST00000606365 273 ntTSL 5 BASIC2.33□□□□□ -2.04
RAB3GAP1Q15042 MALAT1-207ENST00000613376 132 ntTSL 3 BASIC2.33□□□□□ -2.04
RAB3GAP1Q15042 AC095038.3-201ENST00000634439 195 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
RAB3GAP1Q15042 PTPRQ-208ENST00000614701 8289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.33□□□□□ -2.04
RAB3GAP1Q15042 XIRP2-201ENST00000295237 5246 ntTSL 2 BASIC2.32□□□□□ -2.04
RAB3GAP1Q15042 RNU6-816P-201ENST00000390914 107 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
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