Protein–RNA interactions for Protein: Q149N8

SHPRH, E3 ubiquitin-protein ligase SHPRH, humanhuman

Predictions only

Length 1,683 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHPRHQ149N8 MIR599-201ENST00000385069 95 ntBASIC-1.99□□□□□ -2.73
SHPRHQ149N8 MTCO2P16-201ENST00000436962 677 ntBASIC-1.99□□□□□ -2.73
SHPRHQ149N8 AC023449.1-201ENST00000454464 154 ntBASIC-1.99□□□□□ -2.73
SHPRHQ149N8 TRAJ51-201ENST00000504127 63 ntBASIC-1.99□□□□□ -2.73
SHPRHQ149N8 RNU6-998P-201ENST00000515894 101 ntBASIC-1.99□□□□□ -2.73
SHPRHQ149N8 MIR548AE1-201ENST00000583292 70 ntBASIC-1.99□□□□□ -2.73
SHPRHQ149N8 snoR1.1-201ENST00000628177 80 ntBASIC-1.99□□□□□ -2.73
SHPRHQ149N8 Y_RNA.117-201ENST00000363294 101 ntBASIC-2□□□□□ -2.73
SHPRHQ149N8 RNU6-429P-201ENST00000384582 108 ntBASIC-2□□□□□ -2.73
SHPRHQ149N8 MIR527-201ENST00000385244 85 ntBASIC-2□□□□□ -2.73
SHPRHQ149N8 AL031003.1-201ENST00000404229 172 ntBASIC-2□□□□□ -2.73
SHPRHQ149N8 RNU6-1086P-201ENST00000410930 100 ntBASIC-2□□□□□ -2.73
SHPRHQ149N8 MCHR2-AS1-203ENST00000451220 429 ntTSL 3 BASIC-2□□□□□ -2.73
SHPRHQ149N8 FGF14-AS1-202ENST00000451630 321 ntTSL 2 BASIC-2□□□□□ -2.73
SHPRHQ149N8 RNU6-1192P-201ENST00000612197 107 ntBASIC-2□□□□□ -2.73
SHPRHQ149N8 RNU6-489P-201ENST00000618289 107 ntBASIC-2□□□□□ -2.73
SHPRHQ149N8 RNU6-1001P-201ENST00000411265 100 ntBASIC-2.01□□□□□ -2.73
SHPRHQ149N8 PCMTD1P1-201ENST00000455560 355 ntBASIC-2.01□□□□□ -2.73
SHPRHQ149N8 MIR4460-201ENST00000577862 86 ntBASIC-2.01□□□□□ -2.73
SHPRHQ149N8 AL353803.5-201ENST00000599815 141 ntBASIC-2.01□□□□□ -2.73
SHPRHQ149N8 HULC.1-201ENST00000612720 240 ntBASIC-2.01□□□□□ -2.73
SHPRHQ149N8 DISC2.1-201ENST00000612827 205 ntBASIC-2.01□□□□□ -2.73
SHPRHQ149N8 AL607023.1-201ENST00000620045 248 ntBASIC-2.01□□□□□ -2.73
SHPRHQ149N8 Y_RNA.225-201ENST00000364326 97 ntBASIC-2.02□□□□□ -2.73
SHPRHQ149N8 SNORD116-9-201ENST00000384000 95 ntBASIC-2.02□□□□□ -2.73
SHPRHQ149N8 SNORD116-3-201ENST00000384287 95 ntBASIC-2.02□□□□□ -2.73
SHPRHQ149N8 SNORD116-8-201ENST00000384365 95 ntBASIC-2.02□□□□□ -2.73
SHPRHQ149N8 SNORD116-7-201ENST00000384404 95 ntBASIC-2.02□□□□□ -2.73
SHPRHQ149N8 SNORD116-5-201ENST00000384462 95 ntBASIC-2.02□□□□□ -2.73
SHPRHQ149N8 MIR519E-201ENST00000385075 84 ntBASIC-2.02□□□□□ -2.73
SHPRHQ149N8 TRAJ1-201ENST00000390536 62 ntAPPRIS P1 BASIC-2.02□□□□□ -2.73
SHPRHQ149N8 AP003357.1-201ENST00000604497 148 ntBASIC-2.02□□□□□ -2.73
SHPRHQ149N8 RN7SKP299-201ENST00000606679 301 ntBASIC-2.02□□□□□ -2.73
SHPRHQ149N8 NCBP1-205ENST00000629069 249 ntTSL 5 BASIC-2.02□□□□□ -2.73
SHPRHQ149N8 RNU6-82P-201ENST00000363970 107 ntBASIC-2.02□□□□□ -2.73
SHPRHQ149N8 MIR496-201ENST00000385226 102 ntBASIC-2.02□□□□□ -2.73
SHPRHQ149N8 RNU2-61P-201ENST00000411069 191 ntBASIC-2.02□□□□□ -2.73
SHPRHQ149N8 EIF1P2-201ENST00000428233 350 ntBASIC-2.02□□□□□ -2.73
SHPRHQ149N8 MTND3P7-201ENST00000474435 343 ntBASIC-2.02□□□□□ -2.73
SHPRHQ149N8 AC092378.2-202ENST00000569328 445 ntTSL 3 BASIC-2.02□□□□□ -2.73
SHPRHQ149N8 AC006566.1-201ENST00000608943 513 ntBASIC-2.02□□□□□ -2.73
SHPRHQ149N8 SNORD115-25-201ENST00000362619 82 ntBASIC-2.03□□□□□ -2.73
SHPRHQ149N8 MIR889-201ENST00000401280 79 ntBASIC-2.03□□□□□ -2.73
SHPRHQ149N8 RNU2-14P-201ENST00000411053 191 ntBASIC-2.03□□□□□ -2.73
SHPRHQ149N8 AC022028.1-201ENST00000412054 408 ntBASIC-2.03□□□□□ -2.73
SHPRHQ149N8 CYCSP46-201ENST00000423569 204 ntBASIC-2.03□□□□□ -2.73
SHPRHQ149N8 UBE2V1P7-201ENST00000446395 340 ntBASIC-2.03□□□□□ -2.73
SHPRHQ149N8 USP9YP23-201ENST00000455085 407 ntBASIC-2.03□□□□□ -2.73
SHPRHQ149N8 Y_RNA.653-201ENST00000459091 95 ntBASIC-2.03□□□□□ -2.73
SHPRHQ149N8 RNU7-79P-201ENST00000516082 62 ntBASIC-2.03□□□□□ -2.73
SHPRHQ149N8 RNU6-436P-201ENST00000516171 114 ntBASIC-2.03□□□□□ -2.73
SHPRHQ149N8 MIR5692C1-201ENST00000585309 91 ntBASIC-2.03□□□□□ -2.73
SHPRHQ149N8 ULK3-223ENST00000631115 126 ntTSL 5 BASIC-2.03□□□□□ -2.73
SHPRHQ149N8 Y_RNA.119-201ENST00000363301 96 ntBASIC-2.04□□□□□ -2.74
SHPRHQ149N8 Y_RNA.341-201ENST00000365341 102 ntBASIC-2.04□□□□□ -2.74
SHPRHQ149N8 TPTE2P5-203ENST00000458118 728 ntBASIC-2.04□□□□□ -2.74
SHPRHQ149N8 RNU6-189P-201ENST00000516120 101 ntBASIC-2.04□□□□□ -2.74
SHPRHQ149N8 AL358937.1-201ENST00000524512 336 ntTSL 2 BASIC-2.04□□□□□ -2.74
SHPRHQ149N8 MTND5P40-201ENST00000559945 246 ntBASIC-2.04□□□□□ -2.74
SHPRHQ149N8 AC145350.1-201ENST00000567426 208 ntBASIC-2.04□□□□□ -2.74
SHPRHQ149N8 AC079248.2-201ENST00000623779 326 ntBASIC-2.04□□□□□ -2.74
SHPRHQ149N8 SNORD115-35-201ENST00000365122 82 ntBASIC-2.05□□□□□ -2.74
SHPRHQ149N8 Y_RNA.430-201ENST00000384081 110 ntBASIC-2.05□□□□□ -2.74
SHPRHQ149N8 MTCYBP8-201ENST00000422855 651 ntBASIC-2.05□□□□□ -2.74
SHPRHQ149N8 RNU6-1170P-201ENST00000515974 106 ntBASIC-2.05□□□□□ -2.74
SHPRHQ149N8 AC055872.1-201ENST00000570978 278 ntBASIC-2.05□□□□□ -2.74
SHPRHQ149N8 AC007494.3-201ENST00000624660 743 ntBASIC-2.05□□□□□ -2.74
SHPRHQ149N8 Y_RNA.220-201ENST00000364244 109 ntBASIC-2.06□□□□□ -2.74
SHPRHQ149N8 Y_RNA.351-201ENST00000365436 96 ntBASIC-2.06□□□□□ -2.74
SHPRHQ149N8 Y_RNA.405-201ENST00000383979 100 ntBASIC-2.06□□□□□ -2.74
SHPRHQ149N8 Y_RNA.451-201ENST00000384200 100 ntBASIC-2.06□□□□□ -2.74
SHPRHQ149N8 Y_RNA.524-201ENST00000384564 100 ntBASIC-2.06□□□□□ -2.74
SHPRHQ149N8 Y_RNA.561-201ENST00000384694 100 ntBASIC-2.06□□□□□ -2.74
SHPRHQ149N8 Y_RNA.577-201ENST00000384794 101 ntBASIC-2.06□□□□□ -2.74
SHPRHQ149N8 RNU6-938P-201ENST00000411285 103 ntBASIC-2.06□□□□□ -2.74
SHPRHQ149N8 AC009961.2-201ENST00000435771 251 ntBASIC-2.06□□□□□ -2.74
SHPRHQ149N8 AL158210.1-201ENST00000448835 500 ntTSL 3 BASIC-2.06□□□□□ -2.74
SHPRHQ149N8 RNU7-96P-201ENST00000459535 64 ntBASIC-2.06□□□□□ -2.74
SHPRHQ149N8 RNU4ATAC4P-201ENST00000516307 126 ntBASIC-2.06□□□□□ -2.74
SHPRHQ149N8 Y_RNA.706-201ENST00000516933 99 ntBASIC-2.06□□□□□ -2.74
SHPRHQ149N8 AC122108.2-201ENST00000611946 526 ntBASIC-2.06□□□□□ -2.74
SHPRHQ149N8 U6.109-201ENST00000636749 87 ntBASIC-2.06□□□□□ -2.74
SHPRHQ149N8 RNY4P34-201ENST00000364779 95 ntBASIC-2.06□□□□□ -2.74
SHPRHQ149N8 Y_RNA.785-201ENST00000384290 109 ntBASIC-2.06□□□□□ -2.74
SHPRHQ149N8 MIR652-201ENST00000385278 98 ntBASIC-2.06□□□□□ -2.74
SHPRHQ149N8 MIR1278-201ENST00000408753 81 ntBASIC-2.06□□□□□ -2.74
SHPRHQ149N8 RNU6-710P-201ENST00000410424 105 ntBASIC-2.06□□□□□ -2.74
SHPRHQ149N8 Y_RNA.679-201ENST00000516416 91 ntBASIC-2.06□□□□□ -2.74
SHPRHQ149N8 AC022140.2-201ENST00000623500 188 ntBASIC-2.06□□□□□ -2.74
SHPRHQ149N8 Y_RNA.358-201ENST00000365491 99 ntBASIC-2.07□□□□□ -2.74
SHPRHQ149N8 MTATP6P20-201ENST00000414147 562 ntBASIC-2.07□□□□□ -2.74
SHPRHQ149N8 RNU7-187P-201ENST00000458985 68 ntBASIC-2.07□□□□□ -2.74
SHPRHQ149N8 RNU6-287P-201ENST00000516230 98 ntBASIC-2.07□□□□□ -2.74
SHPRHQ149N8 RNU7-115P-201ENST00000516433 55 ntBASIC-2.07□□□□□ -2.74
SHPRHQ149N8 AC100767.1-201ENST00000528178 123 ntBASIC-2.07□□□□□ -2.74
SHPRHQ149N8 AC145423.2-201ENST00000610631 239 ntBASIC-2.07□□□□□ -2.74
SHPRHQ149N8 AC103705.1-201ENST00000619013 241 ntBASIC-2.07□□□□□ -2.74
SHPRHQ149N8 AC009161.2-201ENST00000624626 138 ntBASIC-2.07□□□□□ -2.74
SHPRHQ149N8 snoU2_19.2-201ENST00000363024 80 ntBASIC-2.08□□□□□ -2.74
SHPRHQ149N8 Y_RNA.244-201ENST00000364484 109 ntBASIC-2.08□□□□□ -2.74
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