Protein–RNA interactions for Protein: Q14139

UBE4A, Ubiquitin conjugation factor E4 A, humanhuman

Predictions only

Length 1,066 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE4AQ14139 SNORD115-43-201ENST00000365503 82 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
UBE4AQ14139 SNORD115-36-201ENST00000365629 82 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
UBE4AQ14139 SNORD111-201ENST00000408139 94 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
UBE4AQ14139 RNU2-70P-201ENST00000410718 179 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
UBE4AQ14139 AC131055.1-201ENST00000584626 316 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
UBE4AQ14139 SNORD115-40-201ENST00000606510 82 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
UBE4AQ14139 Y_RNA.416-201ENST00000384014 113 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
UBE4AQ14139 MIR532-201ENST00000385025 91 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
UBE4AQ14139 MT-TT-201ENST00000387460 66 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
UBE4AQ14139 MIR1302-3-201ENST00000408128 138 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
UBE4AQ14139 RNU6-994P-201ENST00000410507 111 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
UBE4AQ14139 AL392103.1-201ENST00000447000 198 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
UBE4AQ14139 AL353742.1-201ENST00000453455 224 ntTSL 3 BASIC1.2□□□□□ -2.22
UBE4AQ14139 AL583859.1-201ENST00000455871 335 ntTSL 3 BASIC1.2□□□□□ -2.22
UBE4AQ14139 RNU7-67P-201ENST00000459003 62 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
UBE4AQ14139 RNU6-1132P-201ENST00000459214 107 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
UBE4AQ14139 RNU6-453P-201ENST00000516819 85 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
UBE4AQ14139 AC092071.1-201ENST00000597260 549 ntTSL 5 BASIC1.2□□□□□ -2.22
UBE4AQ14139 PVT1_3.1-201ENST00000620853 95 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
UBE4AQ14139 MTND1P7-201ENST00000632801 297 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
UBE4AQ14139 Y_RNA.144-201ENST00000363521 113 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
UBE4AQ14139 snoU2_19.4-201ENST00000364329 80 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
UBE4AQ14139 SNORD113.3-201ENST00000364630 78 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
UBE4AQ14139 snoU13.16-201ENST00000459350 104 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
UBE4AQ14139 AL136317.1-201ENST00000612653 226 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
UBE4AQ14139 MIR6857-201ENST00000613267 93 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
UBE4AQ14139 AC106800.4-201ENST00000614905 153 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
UBE4AQ14139 SNORD114-26-201ENST00000363543 72 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
UBE4AQ14139 Y_RNA.288-201ENST00000364854 92 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
UBE4AQ14139 Y_RNA.304-201ENST00000365011 112 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
UBE4AQ14139 Y_RNA.432-201ENST00000384087 111 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
UBE4AQ14139 Y_RNA.518-201ENST00000384552 113 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
UBE4AQ14139 Y_RNA.556-201ENST00000384677 113 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
UBE4AQ14139 MIR598-201ENST00000384868 97 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
UBE4AQ14139 snosnR66.1-201ENST00000391095 99 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
UBE4AQ14139 RNU2-13P-201ENST00000515909 113 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
UBE4AQ14139 RNU6-561P-201ENST00000516222 102 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
UBE4AQ14139 MIR3149-201ENST00000584629 83 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
UBE4AQ14139 AP000753.3-201ENST00000604083 169 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
UBE4AQ14139 AC134878.1-201ENST00000619901 243 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
UBE4AQ14139 MIR6516-201ENST00000630554 81 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
UBE4AQ14139 Y_RNA.65-201ENST00000362846 100 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
UBE4AQ14139 Y_RNA.447-201ENST00000384184 113 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
UBE4AQ14139 RNU6-196P-201ENST00000384315 107 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
UBE4AQ14139 RNU6-463P-201ENST00000384340 107 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
UBE4AQ14139 RNU6-342P-201ENST00000384521 104 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
UBE4AQ14139 Y_RNA.562-201ENST00000384695 113 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
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UBE4AQ14139 SNORA79-201ENST00000408376 140 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
UBE4AQ14139 MIR548H3-201ENST00000408771 118 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
UBE4AQ14139 RNU6-613P-201ENST00000410412 108 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
UBE4AQ14139 RPS3AP1-201ENST00000413190 320 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
UBE4AQ14139 RNA5SP153-201ENST00000516498 76 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
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UBE4AQ14139 7SK.10-201ENST00000621414 298 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
UBE4AQ14139 Y_RNA.199-201ENST00000364014 102 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
UBE4AQ14139 Y_RNA.262-201ENST00000364641 102 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
UBE4AQ14139 SNORA2B-201ENST00000384583 137 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
UBE4AQ14139 RNU7-53P-201ENST00000516705 60 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
UBE4AQ14139 AP003484.1-201ENST00000530974 250 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
UBE4AQ14139 MIR3973-201ENST00000579824 107 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
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UBE4AQ14139 MIR4282-201ENST00000583613 67 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
UBE4AQ14139 AC211469.2-201ENST00000605461 205 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
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UBE4AQ14139 RNU6-888P-201ENST00000363010 101 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
UBE4AQ14139 RNU1-36P-201ENST00000365130 165 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
UBE4AQ14139 AC073127.1-201ENST00000447336 333 ntTSL 3 BASIC1.15□□□□□ -2.23
UBE4AQ14139 U7.7-201ENST00000459276 60 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
UBE4AQ14139 RNA5SP255-201ENST00000516370 107 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
UBE4AQ14139 RNU6-1270P-201ENST00000517128 108 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
UBE4AQ14139 AC036111.3-201ENST00000526389 112 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
UBE4AQ14139 AC025627.3-201ENST00000582078 182 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
UBE4AQ14139 AC062037.2-201ENST00000610137 73 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
UBE4AQ14139 U4.1-201ENST00000620349 87 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
UBE4AQ14139 AL365265.1-201ENST00000621045 234 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
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UBE4AQ14139 SNORD61-201ENST00000384252 73 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
UBE4AQ14139 MT-TN-201ENST00000387400 73 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
UBE4AQ14139 AL606845.1-201ENST00000404881 255 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
UBE4AQ14139 MIR1302-7-201ENST00000408841 72 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
UBE4AQ14139 RNU2-64P-201ENST00000411315 191 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
UBE4AQ14139 DIP2A-IT1-201ENST00000442434 428 ntTSL 2 BASIC1.14□□□□□ -2.23
UBE4AQ14139 AC137770.1-201ENST00000504620 530 ntTSL 3 BASIC1.14□□□□□ -2.23
UBE4AQ14139 AC032019.2-201ENST00000584916 403 ntTSL 5 BASIC1.14□□□□□ -2.23
UBE4AQ14139 AP000942.4-201ENST00000604811 241 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
UBE4AQ14139 CCDC73-201ENST00000335185 3849 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC1.13□□□□□ -2.23
UBE4AQ14139 RNU6-653P-201ENST00000363074 106 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
UBE4AQ14139 RNU4-17P-201ENST00000365598 141 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
UBE4AQ14139 SNORA24-201ENST00000384096 131 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
UBE4AQ14139 Y_RNA.452-201ENST00000384202 108 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
UBE4AQ14139 SNORA27-201ENST00000384323 126 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
UBE4AQ14139 Y_RNA.494-201ENST00000384432 111 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
UBE4AQ14139 MIR518F-201ENST00000384973 87 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
UBE4AQ14139 CPEB3_ribozyme.1-201ENST00000408115 78 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
UBE4AQ14139 AC022559.1-201ENST00000520905 205 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
UBE4AQ14139 AC007751.1-201ENST00000529260 376 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
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