Protein–RNA interactions for Protein: Q13454

TUSC3, Tumor suppressor candidate 3, humanhuman

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Length 348 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUSC3Q13454 LMBR1-222ENST00000638959 93 ntTSL 5 BASIC2.1□□□□□ -2.07
TUSC3Q13454 LRRCC1-202ENST00000414626 4493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.09□□□□□ -2.07
TUSC3Q13454 RNA5SP276-201ENST00000362580 94 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
TUSC3Q13454 RNU6-457P-201ENST00000363999 107 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
TUSC3Q13454 SNORA16B-201ENST00000364674 135 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
TUSC3Q13454 RNU6-203P-201ENST00000384038 104 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
TUSC3Q13454 RNU6-482P-201ENST00000391068 107 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
TUSC3Q13454 5S_rRNA.2-201ENST00000391293 112 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
TUSC3Q13454 AC244636.1-201ENST00000421152 228 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
TUSC3Q13454 AC063976.4-201ENST00000421971 163 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
TUSC3Q13454 AC025033.1-201ENST00000463883 194 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
TUSC3Q13454 RNY4P20-201ENST00000516678 93 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
TUSC3Q13454 AL049779.4-201ENST00000604500 156 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
TUSC3Q13454 MIR302B-201ENST00000362188 73 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
TUSC3Q13454 SNORA63.4-201ENST00000362763 126 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
TUSC3Q13454 RNU6-153P-201ENST00000364422 104 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
TUSC3Q13454 AL445685.2-201ENST00000422551 342 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
TUSC3Q13454 AC079760.1-201ENST00000456952 202 ntTSL 3 BASIC2.08□□□□□ -2.08
TUSC3Q13454 SNORD123-201ENST00000459473 70 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
TUSC3Q13454 PDCD5P2-201ENST00000507570 312 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
TUSC3Q13454 AL035078.1-202ENST00000531627 413 ntTSL 2 BASIC2.08□□□□□ -2.08
TUSC3Q13454 AC022254.1-201ENST00000567857 235 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
TUSC3Q13454 MIR3683-201ENST00000580847 82 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
TUSC3Q13454 MIR4305-201ENST00000583252 102 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
TUSC3Q13454 HSPE1P19-201ENST00000603327 295 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
TUSC3Q13454 SCN7A-206ENST00000619410 7186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.08□□□□□ -2.08
TUSC3Q13454 SCN7A-207ENST00000621965 7186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.08□□□□□ -2.08
TUSC3Q13454 CALCRL-201ENST00000392370 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.08□□□□□ -2.08
TUSC3Q13454 USP53-202ENST00000450251 6072 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.07□□□□□ -2.08
TUSC3Q13454 PTPRQ-208ENST00000614701 8289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.07□□□□□ -2.08
TUSC3Q13454 Y_RNA.198-201ENST00000364013 98 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
TUSC3Q13454 Y_RNA.298-201ENST00000364960 107 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
TUSC3Q13454 SNORA22-201ENST00000383907 134 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
TUSC3Q13454 SNORA70.7-201ENST00000384159 133 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
TUSC3Q13454 MIR194-1-201ENST00000384892 85 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
TUSC3Q13454 SNORA40.18-201ENST00000391200 128 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
TUSC3Q13454 SNORA31.4-201ENST00000516049 129 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
TUSC3Q13454 MIR4287-201ENST00000579398 78 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
TUSC3Q13454 MIR548AR-201ENST00000582191 57 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
TUSC3Q13454 FAM106DP-201ENST00000586416 501 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
TUSC3Q13454 SNRPGP19-201ENST00000603826 189 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
TUSC3Q13454 BRCA1-202ENST00000354071 4497 ntTSL 1 (best) BASIC2.07□□□□□ -2.08
TUSC3Q13454 MIER3-204ENST00000381226 5210 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.06□□□□□ -2.08
TUSC3Q13454 RNU6-661P-201ENST00000362409 107 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
TUSC3Q13454 RNU6-755P-201ENST00000364400 103 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
TUSC3Q13454 RNU4-16P-201ENST00000364737 141 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
TUSC3Q13454 RNA5SP160-201ENST00000364866 120 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
TUSC3Q13454 SNORA6-201ENST00000384033 151 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
TUSC3Q13454 SNORD28B-201ENST00000390993 75 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
TUSC3Q13454 RNU2-11P-201ENST00000459191 187 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
TUSC3Q13454 RNU7-164P-201ENST00000459221 62 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
TUSC3Q13454 LINC02514-201ENST00000509058 498 ntTSL 3 BASIC2.06□□□□□ -2.08
TUSC3Q13454 RNU2-13P-201ENST00000515909 113 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
TUSC3Q13454 SUMO2P16-201ENST00000519475 264 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
TUSC3Q13454 PYGO1-201ENST00000302000 8488 ntTSL 1 (best) BASIC2.06□□□□□ -2.08
TUSC3Q13454 AC131280.1-202ENST00000624067 4211 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
TUSC3Q13454 RNA5SP99-201ENST00000364020 114 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
TUSC3Q13454 SNORA24-201ENST00000384096 131 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
TUSC3Q13454 AC004965.1-201ENST00000413033 213 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
TUSC3Q13454 RPL23AP6-201ENST00000446637 472 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
TUSC3Q13454 RPS29P29-201ENST00000456396 171 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
TUSC3Q13454 RNU7-67P-201ENST00000459003 62 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
TUSC3Q13454 SNORA74.3-201ENST00000517108 154 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
TUSC3Q13454 AC007012.1-201ENST00000567192 175 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
TUSC3Q13454 MIR4713-201ENST00000582691 75 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
TUSC3Q13454 AL353997.5-201ENST00000618886 171 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
TUSC3Q13454 C16orf97-206ENST00000622950 415 ntTSL 2 BASIC2.05□□□□□ -2.08
TUSC3Q13454 RNU6-414P-201ENST00000363705 104 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
TUSC3Q13454 Y_RNA.213-201ENST00000364178 111 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
TUSC3Q13454 MIR17-201ENST00000385012 84 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
TUSC3Q13454 AL161935.2-201ENST00000414627 60 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
TUSC3Q13454 RNU7-123P-201ENST00000515911 60 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
TUSC3Q13454 RNU7-53P-201ENST00000516705 60 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
TUSC3Q13454 RNU1-40P-201ENST00000516816 164 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
TUSC3Q13454 RNU1-97P-201ENST00000516872 164 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
TUSC3Q13454 AC106754.2-201ENST00000623006 233 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
TUSC3Q13454 AC021613.1-201ENST00000623880 111 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
TUSC3Q13454 BRDT-206ENST00000402388 3125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.04□□□□□ -2.08
TUSC3Q13454 AC130466.1-201ENST00000636354 4683 ntTSL 5 BASIC2.03□□□□□ -2.08
TUSC3Q13454 TBL1XR1-208ENST00000430069 7948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.03□□□□□ -2.08
TUSC3Q13454 JTBP1-201ENST00000441314 247 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
TUSC3Q13454 RNU6-917P-201ENST00000516294 104 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
TUSC3Q13454 RNU2-35P-201ENST00000516446 142 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
TUSC3Q13454 RNU6-958P-201ENST00000516995 106 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
TUSC3Q13454 AC243994.1-201ENST00000618627 109 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
TUSC3Q13454 AC095038.3-201ENST00000634439 195 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
TUSC3Q13454 ATP13A3-201ENST00000256031 7322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.03□□□□□ -2.08
TUSC3Q13454 ZBTB6-201ENST00000373659 4106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.03□□□□□ -2.08
TUSC3Q13454 SI-201ENST00000264382 6011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.02□□□□□ -2.09
TUSC3Q13454 FSIP2-206ENST00000611759 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.02□□□□□ -2.09
TUSC3Q13454 Y_RNA.281-201ENST00000364774 94 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
TUSC3Q13454 Y_RNA.537-201ENST00000384626 109 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
TUSC3Q13454 RNU6-1067P-201ENST00000384752 107 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
TUSC3Q13454 MIR144-201ENST00000384886 86 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
TUSC3Q13454 MIR759-201ENST00000390224 91 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
TUSC3Q13454 RNA5SP144-201ENST00000410846 116 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
TUSC3Q13454 AC003989.2-201ENST00000440224 169 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
TUSC3Q13454 RNU6-412P-201ENST00000516434 106 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
TUSC3Q13454 MIR4299-201ENST00000577899 72 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
TUSC3Q13454 MIR4791-201ENST00000607666 84 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
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