Protein–RNA interactions for Protein: Q13278

RIG, Putative protein RIG, humanhuman

Predictions only

Length 110 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIGQ13278 GNPDA2-204ENST00000509756 5382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC1.11□□□□□ -2.23
RIGQ13278 Y_RNA.120-201ENST00000363304 110 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
RIGQ13278 Y_RNA.370-201ENST00000365589 108 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
RIGQ13278 SNORD18B-201ENST00000365659 72 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
RIGQ13278 RNU6-1292P-201ENST00000383856 107 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
RIGQ13278 SNORD26-201ENST00000384147 75 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
RIGQ13278 SNORA27-201ENST00000384323 126 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
RIGQ13278 RNU6-1117P-201ENST00000384525 104 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
RIGQ13278 SNORD41-201ENST00000386967 70 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
RIGQ13278 RNU6-1154P-201ENST00000391001 104 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
RIGQ13278 Z98742.3-201ENST00000418637 326 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
RIGQ13278 HMGN1P33-201ENST00000432945 451 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
RIGQ13278 RNU7-41P-201ENST00000515917 61 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
RIGQ13278 RNU6-772P-201ENST00000516042 105 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
RIGQ13278 Y_RNA.692-201ENST00000516627 105 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
RIGQ13278 RNU6-958P-201ENST00000516995 106 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
RIGQ13278 IGLVVI-22-1-201ENST00000521183 211 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
RIGQ13278 AC074050.1-201ENST00000563247 211 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
RIGQ13278 RNU6-1290P-201ENST00000362957 109 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
RIGQ13278 Y_RNA.127-201ENST00000363386 109 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
RIGQ13278 MIR583-201ENST00000384846 75 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
RIGQ13278 RNU6-913P-201ENST00000390913 95 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
RIGQ13278 MIR1263-201ENST00000408324 86 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
RIGQ13278 RN7SKP223-201ENST00000410582 62 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
RIGQ13278 RPL39P39-201ENST00000455840 151 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
RIGQ13278 RNU2-11P-201ENST00000459191 187 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
RIGQ13278 AC110009.1-201ENST00000512965 451 ntTSL 5 BASIC1.1□□□□□ -2.23
RIGQ13278 AL357312.1-201ENST00000603879 298 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
RIGQ13278 AC034238.1-213ENST00000611148 150 ntTSL 5 BASIC1.1□□□□□ -2.23
RIGQ13278 TUG1_4.1-201ENST00000619464 181 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
RIGQ13278 CALCRL-201ENST00000392370 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.1□□□□□ -2.23
RIGQ13278 ABCA5-201ENST00000392676 8220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.09□□□□□ -2.23
RIGQ13278 SNORA25.3-201ENST00000363205 127 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
RIGQ13278 Y_RNA.280-201ENST00000364765 112 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
RIGQ13278 SNORA25.8-201ENST00000364831 128 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
RIGQ13278 SNORD116-14-201ENST00000383894 92 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
RIGQ13278 SNORD116-17-201ENST00000383929 92 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
RIGQ13278 Y_RNA.410-201ENST00000383992 113 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
RIGQ13278 SNORD116-15-201ENST00000384445 92 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
RIGQ13278 SNORD116-19-201ENST00000384729 92 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
RIGQ13278 MIR517C-201ENST00000385103 95 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
RIGQ13278 RNU6-1168P-201ENST00000390831 104 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
RIGQ13278 SNORA40.18-201ENST00000391200 128 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
RIGQ13278 AL603914.1-201ENST00000401964 204 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
RIGQ13278 MIR548I2-201ENST00000408348 149 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
RIGQ13278 RNU2-51P-201ENST00000410708 197 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
RIGQ13278 AL158147.1-201ENST00000443970 75 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
RIGQ13278 AC103879.1-201ENST00000503093 255 ntTSL 2 BASIC1.09□□□□□ -2.23
RIGQ13278 AC019288.1-201ENST00000557918 224 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
RIGQ13278 AC022523.2-201ENST00000561045 150 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
RIGQ13278 AC133485.4-201ENST00000561835 220 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
RIGQ13278 AC138907.4-201ENST00000570107 226 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
RIGQ13278 MIR3192-201ENST00000584920 77 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
RIGQ13278 MIR4791-201ENST00000607666 84 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
RIGQ13278 AL442644.1-201ENST00000454390 3105 ntBASIC1.09□□□□□ -2.24
RIGQ13278 SKIL-204ENST00000458537 7182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.08□□□□□ -2.24
RIGQ13278 RNU6-349P-201ENST00000362402 107 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
RIGQ13278 RNA5SP327-201ENST00000362494 101 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
RIGQ13278 Y_RNA.242-201ENST00000364473 110 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
RIGQ13278 RNU1-133P-201ENST00000364867 167 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
RIGQ13278 Y_RNA.291-201ENST00000364886 113 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
RIGQ13278 RNU6-690P-201ENST00000365242 106 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
RIGQ13278 SNORA40.5-201ENST00000391061 128 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
RIGQ13278 RNU6-735P-201ENST00000410612 107 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
RIGQ13278 AL353614.1-201ENST00000445631 206 ntTSL 5 BASIC1.08□□□□□ -2.24
RIGQ13278 AC087499.4-201ENST00000448505 178 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
RIGQ13278 snoU13.25-201ENST00000458945 104 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
RIGQ13278 RNU7-67P-201ENST00000459003 62 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
RIGQ13278 RPS29P24-201ENST00000486345 171 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
RIGQ13278 RN7SKP19-201ENST00000516016 252 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
RIGQ13278 RNU6-313P-201ENST00000516317 112 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
RIGQ13278 RNU6-830P-201ENST00000516353 107 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
RIGQ13278 RNU6-659P-201ENST00000516454 104 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
RIGQ13278 RNU7-70P-201ENST00000516941 66 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
RIGQ13278 RNU6-250P-201ENST00000516958 103 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
RIGQ13278 SNORA74.3-201ENST00000517108 154 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
RIGQ13278 MIR4764-201ENST00000580680 88 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
RIGQ13278 AL096861.1-201ENST00000610899 123 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
RIGQ13278 SNORD58C-201ENST00000365223 64 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
RIGQ13278 MIR539-201ENST00000365690 78 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
RIGQ13278 RNU6-80P-201ENST00000384195 107 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
RIGQ13278 MIR520C-201ENST00000385005 87 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
RIGQ13278 MT-TI-201ENST00000387365 69 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
RIGQ13278 RNU6ATAC37P-201ENST00000408328 131 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
RIGQ13278 AC090844.1-201ENST00000422019 156 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
RIGQ13278 RNU6-998P-201ENST00000515894 101 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
RIGQ13278 SNORD33.1-201ENST00000516213 88 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
RIGQ13278 SNORD111.1-201ENST00000516421 86 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
RIGQ13278 RNA5SP61-201ENST00000516453 100 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
RIGQ13278 RNU6-1258P-201ENST00000516911 111 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
RIGQ13278 Y_RNA.757-201ENST00000578934 114 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
RIGQ13278 MIR548AO-201ENST00000579992 96 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
RIGQ13278 AC079466.2-201ENST00000585394 185 ntTSL 5 BASIC1.07□□□□□ -2.24
RIGQ13278 SNORD115-34-201ENST00000362441 82 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
RIGQ13278 SNORD115-12-201ENST00000362583 82 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
RIGQ13278 SNORD115-29-201ENST00000362834 82 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
RIGQ13278 SNORD115-9-201ENST00000362912 82 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
RIGQ13278 SNORD115-21-201ENST00000362963 81 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
RIGQ13278 SNORD115-14-201ENST00000363090 81 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
RIGQ13278 SNORD115-13-201ENST00000363358 82 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 104.2 ms