Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMW8

USP18, Ubl carboxyl-terminal hydrolase 18, humanhuman

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Length 372 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP18Q9UMW8 ATP13A3-201ENST00000256031 7322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.05□□□□□ -2.08
USP18Q9UMW8 U8.1-201ENST00000362843 134 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
USP18Q9UMW8 TRAJ49-201ENST00000390488 56 ntAPPRIS P1 BASIC2.04□□□□□ -2.08
USP18Q9UMW8 AL161935.2-201ENST00000414627 60 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
USP18Q9UMW8 AC087499.4-201ENST00000448505 178 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
USP18Q9UMW8 SNORD13-201ENST00000459299 104 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
USP18Q9UMW8 MIR5197-201ENST00000583721 112 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
USP18Q9UMW8 SNRPGP19-201ENST00000603826 189 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
USP18Q9UMW8 SNORD3E-202ENST00000627253 216 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
USP18Q9UMW8 hsa-mir-3158-1.1-201ENST00000637571 81 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
USP18Q9UMW8 TEX15-203ENST00000638951 11341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.03□□□□□ -2.08
USP18Q9UMW8 RNU6-1123P-201ENST00000362347 106 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
USP18Q9UMW8 MIR452-201ENST00000385020 85 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
USP18Q9UMW8 AL603914.1-201ENST00000401964 204 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
USP18Q9UMW8 SNORA25.15-201ENST00000516487 89 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
USP18Q9UMW8 Y_RNA.686-201ENST00000516548 134 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
USP18Q9UMW8 SCARNA15-202ENST00000516881 127 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
USP18Q9UMW8 U7.2-201ENST00000607576 63 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
USP18Q9UMW8 AC015726.2-201ENST00000620112 122 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
USP18Q9UMW8 ZNF732-201ENST00000419098 2193 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC2.03□□□□□ -2.08
USP18Q9UMW8 MIR539-201ENST00000365690 78 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
USP18Q9UMW8 MIR548I2-201ENST00000408348 149 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
USP18Q9UMW8 RNA5SP233-201ENST00000459153 113 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
USP18Q9UMW8 AC078980.1-201ENST00000485384 262 ntTSL 2 BASIC2.02□□□□□ -2.09
USP18Q9UMW8 RNA5SP236-201ENST00000516169 116 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
USP18Q9UMW8 IGHVIII-67-2-201ENST00000519849 88 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
USP18Q9UMW8 MIR4778-201ENST00000577635 80 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
USP18Q9UMW8 MTND5P32-201ENST00000560711 1802 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
USP18Q9UMW8 RNU6-661P-201ENST00000362409 107 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
USP18Q9UMW8 RNU6-1189P-201ENST00000383958 107 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
USP18Q9UMW8 RNU6-1117P-201ENST00000384525 104 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
USP18Q9UMW8 MIR526A1-201ENST00000384897 85 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
USP18Q9UMW8 RNU2-40P-201ENST00000410833 196 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
USP18Q9UMW8 AC004965.1-201ENST00000413033 213 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
USP18Q9UMW8 SNORD36C-201ENST00000516733 66 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
USP18Q9UMW8 RNU6-971P-201ENST00000516920 106 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
USP18Q9UMW8 MIR3121-201ENST00000579680 77 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
USP18Q9UMW8 MIR4713-201ENST00000582691 75 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
USP18Q9UMW8 AC095038.3-201ENST00000634439 195 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
USP18Q9UMW8 BRCA1-202ENST00000354071 4497 ntTSL 1 (best) BASIC2.01□□□□□ -2.09
USP18Q9UMW8 ZNF355P-201ENST00000427301 3216 ntBASIC2□□□□□ -2.09
USP18Q9UMW8 MIR136-201ENST00000385207 82 ntBASIC2□□□□□ -2.09
USP18Q9UMW8 TRAJ23-201ENST00000390514 63 ntAPPRIS P1 BASIC2□□□□□ -2.09
USP18Q9UMW8 FAR2P3-204ENST00000434661 444 ntTSL 2 BASIC2□□□□□ -2.09
USP18Q9UMW8 JTBP1-201ENST00000441314 247 ntBASIC2□□□□□ -2.09
USP18Q9UMW8 AP003484.1-201ENST00000530974 250 ntBASIC2□□□□□ -2.09
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USP18Q9UMW8 C16orf97-206ENST00000622950 415 ntTSL 2 BASIC2□□□□□ -2.09
USP18Q9UMW8 Y_RNA.218-201ENST00000364218 104 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
USP18Q9UMW8 Y_RNA.280-201ENST00000364765 112 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
USP18Q9UMW8 SNORD18B-201ENST00000365659 72 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
USP18Q9UMW8 Y_RNA.440-201ENST00000384120 114 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
USP18Q9UMW8 RNU6-439P-201ENST00000384188 106 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
USP18Q9UMW8 RNU4-62P-201ENST00000410125 130 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
USP18Q9UMW8 AP1B1P2-201ENST00000416196 106 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
USP18Q9UMW8 Y_RNA.692-201ENST00000516627 105 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
USP18Q9UMW8 RNU6-1149P-201ENST00000516810 97 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
USP18Q9UMW8 MIR4287-201ENST00000579398 78 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
USP18Q9UMW8 AC011603.4-201ENST00000611325 277 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
USP18Q9UMW8 ZGRF1-203ENST00000445203 6529 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.98□□□□□ -2.09
USP18Q9UMW8 RNU6-22P-201ENST00000384355 107 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
USP18Q9UMW8 MIR516B2-201ENST00000385190 85 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
USP18Q9UMW8 RPL23AP6-201ENST00000446637 472 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
USP18Q9UMW8 RNU6-1211P-201ENST00000459179 105 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
USP18Q9UMW8 Y_RNA.690-201ENST00000516603 95 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
USP18Q9UMW8 SNORA77B-201ENST00000578179 125 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
USP18Q9UMW8 DYNC2H1-203ENST00000398093 12945 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC1.97□□□□□ -2.09
USP18Q9UMW8 ICE2P2-201ENST00000483823 2787 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
USP18Q9UMW8 Y_RNA.71-201ENST00000362892 104 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
USP18Q9UMW8 RNU6-508P-201ENST00000363231 103 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
USP18Q9UMW8 RNU6-414P-201ENST00000363705 104 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
USP18Q9UMW8 RNU6-309P-201ENST00000364573 106 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
USP18Q9UMW8 SNORA40.5-201ENST00000391061 128 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
USP18Q9UMW8 U8.17-201ENST00000391292 132 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
USP18Q9UMW8 SUMO2P12-201ENST00000405924 140 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
USP18Q9UMW8 MTATP6P21-201ENST00000440681 189 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
USP18Q9UMW8 Y_RNA.651-201ENST00000459380 103 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
USP18Q9UMW8 Y_RNA.757-201ENST00000578934 114 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
USP18Q9UMW8 CERS6-AS1-202ENST00000594898 499 ntTSL 5 BASIC1.97□□□□□ -2.09
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USP18Q9UMW8 RNU6-80P-201ENST00000384195 107 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
USP18Q9UMW8 AL627390.1-201ENST00000396055 340 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
USP18Q9UMW8 LINC01866-201ENST00000421181 201 ntTSL 3 BASIC1.96□□□□□ -2.1
USP18Q9UMW8 AC092783.1-201ENST00000435832 231 ntTSL 3 BASIC1.96□□□□□ -2.1
USP18Q9UMW8 RNU6-479P-201ENST00000516348 105 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
USP18Q9UMW8 RNU6-62P-201ENST00000516526 102 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
USP18Q9UMW8 SUMO2P16-201ENST00000519475 264 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
USP18Q9UMW8 MIR4448-201ENST00000584360 86 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
USP18Q9UMW8 AC103810.8-201ENST00000607347 118 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
USP18Q9UMW8 AC108866.1-201ENST00000503073 2339 ntTSL 5 BASIC1.96□□□□□ -2.1
USP18Q9UMW8 SNORD115-34-201ENST00000362441 82 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
USP18Q9UMW8 SNORD115-12-201ENST00000362583 82 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
USP18Q9UMW8 SNORD115-29-201ENST00000362834 82 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
USP18Q9UMW8 SNORD115-9-201ENST00000362912 82 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
USP18Q9UMW8 SNORD115-21-201ENST00000362963 81 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
USP18Q9UMW8 SNORD115-14-201ENST00000363090 81 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
USP18Q9UMW8 SNORD115-13-201ENST00000363358 82 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
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