Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPL8

TIMMDC1, Complex I assembly factor TIMMDC1, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 285 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TIMMDC1Q9NPL8 RNA5SP374-201ENST00000362939 125 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
TIMMDC1Q9NPL8 TRAJ41-201ENST00000390496 62 ntAPPRIS P1 BASIC2.94□□□□□ -1.94
TIMMDC1Q9NPL8 MIR1289-1-201ENST00000408836 144 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
TIMMDC1Q9NPL8 AL355388.1-201ENST00000415726 401 ntTSL 2 BASIC2.94□□□□□ -1.94
TIMMDC1Q9NPL8 RAB6C-AS1-202ENST00000433431 123 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
TIMMDC1Q9NPL8 RPS12P2-201ENST00000439728 269 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
TIMMDC1Q9NPL8 RNU7-73P-201ENST00000458743 63 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
TIMMDC1Q9NPL8 AC008892.1-201ENST00000511861 384 ntTSL 3 BASIC2.94□□□□□ -1.94
TIMMDC1Q9NPL8 AL162274.2-201ENST00000614406 332 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
TIMMDC1Q9NPL8 AC068631.1-220ENST00000630726 256 ntTSL 5 BASIC2.94□□□□□ -1.94
TIMMDC1Q9NPL8 KTN1-203ENST00000395309 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.94□□□□□ -1.94
TIMMDC1Q9NPL8 LIG4-203ENST00000442234 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.94□□□□□ -1.94
TIMMDC1Q9NPL8 ROCK2-203ENST00000401753 4017 ntTSL 1 (best) BASIC2.94□□□□□ -1.94
TIMMDC1Q9NPL8 AKAP9-203ENST00000359028 12247 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.93□□□□□ -1.94
TIMMDC1Q9NPL8 OR4K2-204ENST00000641885 8681 ntAPPRIS P1 BASIC2.93□□□□□ -1.94
TIMMDC1Q9NPL8 RNU1-58P-201ENST00000362413 163 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
TIMMDC1Q9NPL8 MIR136-201ENST00000385207 82 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
TIMMDC1Q9NPL8 Y_RNA.607-201ENST00000410597 98 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
TIMMDC1Q9NPL8 AC026271.5-201ENST00000577873 130 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
TIMMDC1Q9NPL8 MIR5094-201ENST00000578766 85 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
TIMMDC1Q9NPL8 MIR2682-201ENST00000580305 110 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
TIMMDC1Q9NPL8 MIR4325-201ENST00000583049 90 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
TIMMDC1Q9NPL8 SEPT14P17-201ENST00000617978 177 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
TIMMDC1Q9NPL8 AC243994.1-201ENST00000618627 109 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
TIMMDC1Q9NPL8 KTN1-207ENST00000438792 4449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.93□□□□□ -1.94
TIMMDC1Q9NPL8 IKZF2-213ENST00000457361 9350 ntTSL 5 BASIC2.93□□□□□ -1.94
TIMMDC1Q9NPL8 WDR3-201ENST00000349139 9974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.92□□□□□ -1.94
TIMMDC1Q9NPL8 MIR422A-201ENST00000362286 90 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
TIMMDC1Q9NPL8 SNORD38.1-201ENST00000363863 68 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
TIMMDC1Q9NPL8 SNORD28B-201ENST00000390993 75 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
TIMMDC1Q9NPL8 RNU6-1307P-201ENST00000391012 103 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
TIMMDC1Q9NPL8 Y_RNA.609-201ENST00000410669 89 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
TIMMDC1Q9NPL8 RNA5SP229-201ENST00000410809 99 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
TIMMDC1Q9NPL8 AC073261.1-201ENST00000429409 121 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
TIMMDC1Q9NPL8 MIR548AR-201ENST00000582191 57 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
TIMMDC1Q9NPL8 AC022202.1-201ENST00000613515 211 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
TIMMDC1Q9NPL8 PLD1-217ENST00000627725 174 ntTSL 5 BASIC2.92□□□□□ -1.94
TIMMDC1Q9NPL8 PIK3C2G-206ENST00000538779 4963 ntTSL 5 BASIC2.92□□□□□ -1.94
TIMMDC1Q9NPL8 ZNF705G-201ENST00000400156 3644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.92□□□□□ -1.94
TIMMDC1Q9NPL8 SNORD15B-201ENST00000384714 146 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
TIMMDC1Q9NPL8 RNU6-1031P-201ENST00000384773 107 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
TIMMDC1Q9NPL8 MIR128-1-201ENST00000384921 82 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
TIMMDC1Q9NPL8 SNORA48.2-201ENST00000390926 124 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
TIMMDC1Q9NPL8 AL445685.2-201ENST00000422551 342 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
TIMMDC1Q9NPL8 AC093850.1-201ENST00000454121 251 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
TIMMDC1Q9NPL8 RNU6-56P-201ENST00000516986 93 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
TIMMDC1Q9NPL8 AC118755.2-201ENST00000584676 212 ntTSL 3 BASIC2.91□□□□□ -1.94
TIMMDC1Q9NPL8 KBTBD3-207ENST00000534815 3396 ntTSL 5 BASIC2.91□□□□□ -1.94
TIMMDC1Q9NPL8 CHORDC1-205ENST00000529726 4805 ntTSL 2 BASIC2.91□□□□□ -1.94
TIMMDC1Q9NPL8 OGN-201ENST00000262551 2971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.91□□□□□ -1.94
TIMMDC1Q9NPL8 MUC15-202ENST00000436318 3118 ntTSL 5 BASIC2.9□□□□□ -1.94
TIMMDC1Q9NPL8 DYNC2H1-202ENST00000375735 13678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.94
TIMMDC1Q9NPL8 OR51A4-202ENST00000641898 4393 ntAPPRIS P1 BASIC2.9□□□□□ -1.94
TIMMDC1Q9NPL8 AL035425.3-201ENST00000564206 4996 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
TIMMDC1Q9NPL8 Y_RNA.316-201ENST00000365118 111 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
TIMMDC1Q9NPL8 SNORA7.4-201ENST00000384249 137 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
TIMMDC1Q9NPL8 RNU6-342P-201ENST00000384521 104 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
TIMMDC1Q9NPL8 RNU6-950P-201ENST00000384651 107 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
TIMMDC1Q9NPL8 MIR206-201ENST00000384872 86 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
TIMMDC1Q9NPL8 BX510359.4-201ENST00000423750 193 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
TIMMDC1Q9NPL8 AC073127.1-201ENST00000447336 333 ntTSL 3 BASIC2.9□□□□□ -1.95
TIMMDC1Q9NPL8 AC139453.2-201ENST00000487255 133 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
TIMMDC1Q9NPL8 RNA5SP341-201ENST00000516261 117 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
TIMMDC1Q9NPL8 MIR622-201ENST00000638396 96 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
TIMMDC1Q9NPL8 AC009487.2-201ENST00000420969 6821 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
TIMMDC1Q9NPL8 Y_RNA.94-201ENST00000363068 106 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
TIMMDC1Q9NPL8 VTRNA1-1-201ENST00000363120 99 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
TIMMDC1Q9NPL8 MIR34C-201ENST00000384831 77 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
TIMMDC1Q9NPL8 MIR29C-201ENST00000385231 88 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
TIMMDC1Q9NPL8 HMGN1P33-201ENST00000432945 451 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
TIMMDC1Q9NPL8 SNORD123-201ENST00000459473 70 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
TIMMDC1Q9NPL8 MIR3670-2-201ENST00000582974 65 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
TIMMDC1Q9NPL8 MIR3670-1-201ENST00000584160 65 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
TIMMDC1Q9NPL8 MIR3670-3-201ENST00000584855 65 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
TIMMDC1Q9NPL8 MIR3670-4-201ENST00000612260 65 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
TIMMDC1Q9NPL8 SNORD3E-202ENST00000627253 216 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
TIMMDC1Q9NPL8 TCF12-203ENST00000343827 3956 ntTSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
TIMMDC1Q9NPL8 ANKRD18EP-201ENST00000405487 2632 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
TIMMDC1Q9NPL8 RNU6-1244P-201ENST00000363614 108 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
TIMMDC1Q9NPL8 NDUFB4P4-201ENST00000404822 243 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
TIMMDC1Q9NPL8 RNU6ATAC41P-201ENST00000408600 126 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
TIMMDC1Q9NPL8 AL020994.3-201ENST00000449126 274 ntTSL 3 BASIC2.88□□□□□ -1.95
TIMMDC1Q9NPL8 UBL5P2-201ENST00000583788 219 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
TIMMDC1Q9NPL8 CACNB4-238ENST00000636901 7706 ntTSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
TIMMDC1Q9NPL8 SCN1A-219ENST00000641575 12874 ntAPPRIS ALT1 BASIC2.87□□□□□ -1.95
TIMMDC1Q9NPL8 AL355596.1-201ENST00000565399 3996 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
TIMMDC1Q9NPL8 RNA5SP274-201ENST00000410484 108 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
TIMMDC1Q9NPL8 AL353795.2-201ENST00000431804 425 ntTSL 2 BASIC2.87□□□□□ -1.95
TIMMDC1Q9NPL8 RPS29P6-201ENST00000438196 145 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
TIMMDC1Q9NPL8 RPS29P28-201ENST00000446439 141 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
TIMMDC1Q9NPL8 SCARNA16.3-201ENST00000516595 184 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
TIMMDC1Q9NPL8 RNU7-35P-201ENST00000517174 62 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
TIMMDC1Q9NPL8 RGPD6-201ENST00000329516 7165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
TIMMDC1Q9NPL8 ZNF680-202ENST00000447137 2159 ntTSL 2 BASIC2.87□□□□□ -1.95
TIMMDC1Q9NPL8 SNORD115-27-201ENST00000364430 82 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
TIMMDC1Q9NPL8 MIR526A1-201ENST00000384897 85 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
TIMMDC1Q9NPL8 AC245047.7-201ENST00000440265 293 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
TIMMDC1Q9NPL8 S100A11P2-201ENST00000467589 312 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
TIMMDC1Q9NPL8 MIR8055-201ENST00000610739 97 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
TIMMDC1Q9NPL8 PRKACB-204ENST00000370685 4481 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
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