Protein–RNA interactions for Protein: Q14008

CKAP5, Cytoskeleton-associated protein 5, humanhuman

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Length 2,032 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CKAP5Q14008 SNORA75.5-201ENST00000391291 81 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
CKAP5Q14008 U7.2-201ENST00000607576 63 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
CKAP5Q14008 MIR8074-201ENST00000615081 81 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
CKAP5Q14008 AL513423.1-201ENST00000621695 132 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
CKAP5Q14008 AC080100.1-201ENST00000624239 5356 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
CKAP5Q14008 Y_RNA.71-201ENST00000362892 104 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
CKAP5Q14008 Y_RNA.336-201ENST00000365307 109 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
CKAP5Q14008 Y_RNA.351-201ENST00000365436 96 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
CKAP5Q14008 RNU6-602P-201ENST00000411155 105 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
CKAP5Q14008 RNU6-1299P-201ENST00000516316 100 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
CKAP5Q14008 SNORA18.7-201ENST00000516910 131 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
CKAP5Q14008 AC090142.3-201ENST00000519012 385 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
CKAP5Q14008 U1.36-201ENST00000620684 176 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
CKAP5Q14008 LINC01068-202ENST00000620874 626 ntTSL 3 BASIC1.56□□□□□ -2.16
CKAP5Q14008 U2.22-201ENST00000636441 106 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
CKAP5Q14008 SCN7A-201ENST00000409855 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.55□□□□□ -2.16
CKAP5Q14008 RNU6-60P-201ENST00000364792 103 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
CKAP5Q14008 RNU6-53P-201ENST00000365367 106 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
CKAP5Q14008 SNORA20-201ENST00000384662 132 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
CKAP5Q14008 MIR526A1-201ENST00000384897 85 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
CKAP5Q14008 MIR517C-201ENST00000385103 95 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
CKAP5Q14008 MIR613-201ENST00000385248 95 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
CKAP5Q14008 U8.17-201ENST00000391292 132 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
CKAP5Q14008 Y_RNA.621-201ENST00000411065 96 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
CKAP5Q14008 RNU4-61P-201ENST00000411243 107 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
CKAP5Q14008 HSPE1P9-201ENST00000440046 311 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
CKAP5Q14008 RNU6-62P-201ENST00000516526 102 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
CKAP5Q14008 MIR4421-201ENST00000578133 69 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
CKAP5Q14008 MIR548X2-201ENST00000579776 100 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
CKAP5Q14008 AC011603.4-201ENST00000611325 277 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
CKAP5Q14008 GNAS-AS1_4.1-201ENST00000616546 112 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
CKAP5Q14008 Y_RNA.52-201ENST00000362760 96 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
CKAP5Q14008 RNU6-508P-201ENST00000363231 103 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
CKAP5Q14008 SNORA25.9-201ENST00000365087 128 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
CKAP5Q14008 MIR539-201ENST00000365690 78 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
CKAP5Q14008 Y_RNA.410-201ENST00000383992 113 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
CKAP5Q14008 SNORA27-201ENST00000384323 126 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
CKAP5Q14008 MIR1287-201ENST00000408492 90 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
CKAP5Q14008 RNU6-257P-201ENST00000410238 98 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
CKAP5Q14008 AC006461.1-201ENST00000412637 326 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
CKAP5Q14008 RPL31P63-201ENST00000422565 375 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
CKAP5Q14008 CERS6-AS1-202ENST00000594898 499 ntTSL 5 BASIC1.54□□□□□ -2.16
CKAP5Q14008 KIF20B-202ENST00000371728 6419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.54□□□□□ -2.16
CKAP5Q14008 RNA5SP276-201ENST00000362580 94 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
CKAP5Q14008 Y_RNA.118-201ENST00000363300 101 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
CKAP5Q14008 SNORA1.2-201ENST00000365189 134 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
CKAP5Q14008 SNORD61-201ENST00000384252 73 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
CKAP5Q14008 Y_RNA.568-201ENST00000384742 113 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
CKAP5Q14008 RNU6-1031P-201ENST00000384773 107 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
CKAP5Q14008 MIR660-201ENST00000385235 97 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
CKAP5Q14008 HMGN2P32-201ENST00000444648 269 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
CKAP5Q14008 RNU6-998P-201ENST00000515894 101 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
CKAP5Q14008 MIR4764-201ENST00000580680 88 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
CKAP5Q14008 AC087685.1-201ENST00000587507 141 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
CKAP5Q14008 Y_RNA.191-201ENST00000363972 113 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
CKAP5Q14008 SNORA22C-201ENST00000384614 134 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
CKAP5Q14008 SUMO2P12-201ENST00000405924 140 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
CKAP5Q14008 AL136985.1-201ENST00000424592 395 ntTSL 3 BASIC1.53□□□□□ -2.16
CKAP5Q14008 HSPE1P24-201ENST00000450782 238 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
CKAP5Q14008 RPS27P21-201ENST00000486977 252 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
CKAP5Q14008 AC079140.2-201ENST00000506193 142 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
CKAP5Q14008 TRMT112P2-201ENST00000512910 132 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
CKAP5Q14008 SNORD45.4-201ENST00000516629 73 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
CKAP5Q14008 AC087362.2-201ENST00000529325 256 ntTSL 3 BASIC1.53□□□□□ -2.16
CKAP5Q14008 AL670379.3-201ENST00000605040 251 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
CKAP5Q14008 FAS-AS1.2-201ENST00000620386 170 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
CKAP5Q14008 Y_RNA.37-201ENST00000362606 108 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
CKAP5Q14008 Y_RNA.215-201ENST00000364204 112 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
CKAP5Q14008 SNORA24-201ENST00000384096 131 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
CKAP5Q14008 Y_RNA.494-201ENST00000384432 111 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
CKAP5Q14008 RNU6-1117P-201ENST00000384525 104 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
CKAP5Q14008 AC004965.1-201ENST00000413033 213 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
CKAP5Q14008 AL356379.1-201ENST00000414105 126 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
CKAP5Q14008 RNU7-197P-201ENST00000458836 62 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
CKAP5Q14008 AL359881.1-201ENST00000602916 267 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
CKAP5Q14008 AL096840.1-201ENST00000603287 93 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
CKAP5Q14008 AC106754.2-201ENST00000623006 233 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
CKAP5Q14008 AL442644.1-201ENST00000454390 3105 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
CKAP5Q14008 RNU6-349P-201ENST00000362402 107 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
CKAP5Q14008 Y_RNA.299-201ENST00000364973 94 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
CKAP5Q14008 SNORA1-201ENST00000384107 130 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
CKAP5Q14008 Y_RNA.537-201ENST00000384626 109 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
CKAP5Q14008 RNU6-997P-201ENST00000384725 107 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
CKAP5Q14008 MIR452-201ENST00000385020 85 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
CKAP5Q14008 TMSB4XP3-201ENST00000445144 114 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
CKAP5Q14008 RN7SL274P-201ENST00000492268 272 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
CKAP5Q14008 RNU7-70P-201ENST00000516941 66 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
CKAP5Q14008 RNU6-789P-201ENST00000517105 102 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
CKAP5Q14008 Y_RNA.49-201ENST00000362714 112 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
CKAP5Q14008 SNORD14E-201ENST00000364009 85 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
CKAP5Q14008 Y_RNA.525-201ENST00000384570 113 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
CKAP5Q14008 AL603914.1-201ENST00000401964 204 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
CKAP5Q14008 RPS27P16-201ENST00000425758 201 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
CKAP5Q14008 RNU6-1053P-201ENST00000515930 101 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
CKAP5Q14008 RNU6-1116P-201ENST00000517269 99 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
CKAP5Q14008 AL157834.3-201ENST00000615543 103 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
CKAP5Q14008 MIR7111-201ENST00000619751 72 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
CKAP5Q14008 Y_RNA.686-201ENST00000516548 134 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
CKAP5Q14008 MIR548AR-201ENST00000582191 57 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
CKAP5Q14008 MIR6129-201ENST00000616087 109 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
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