Protein–RNA interactions for Protein: Q13751

LAMB3, Laminin subunit beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMB3Q13751 AL358944.1-201ENST00000528537 144 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
LAMB3Q13751 SNRPGP19-201ENST00000603826 189 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
LAMB3Q13751 AC025166.1-201ENST00000612411 163 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
LAMB3Q13751 Hammerhead_HH9.1-201ENST00000616606 77 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
LAMB3Q13751 U6.95-201ENST00000636931 70 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
LAMB3Q13751 GS1-279B7.1-204ENST00000641809 378 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
LAMB3Q13751 OR4C11-202ENST00000641580 2737 ntAPPRIS P1 BASIC1.87□□□□□ -2.11
LAMB3Q13751 RNU6-647P-201ENST00000364243 107 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
LAMB3Q13751 SNORA16.1-201ENST00000364597 132 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
LAMB3Q13751 MIR548O-201ENST00000408583 114 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
LAMB3Q13751 CYCTP-201ENST00000504253 315 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
LAMB3Q13751 RNA5SP236-201ENST00000516169 116 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
LAMB3Q13751 RNU7-25P-201ENST00000516544 62 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
LAMB3Q13751 LMBR1-222ENST00000638959 93 ntTSL 5 BASIC1.87□□□□□ -2.11
LAMB3Q13751 MTND5P18-201ENST00000445624 1801 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
LAMB3Q13751 AC008781.2-201ENST00000502205 2480 ntTSL 1 (best) BASIC1.86□□□□□ -2.11
LAMB3Q13751 RNU6-888P-201ENST00000363010 101 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
LAMB3Q13751 Y_RNA.164-201ENST00000363709 102 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
LAMB3Q13751 Y_RNA.366-201ENST00000365540 102 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
LAMB3Q13751 RNU6-147P-201ENST00000383983 107 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
LAMB3Q13751 MIR597-201ENST00000384968 97 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
LAMB3Q13751 ATP6V0E1P3-201ENST00000420036 246 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
LAMB3Q13751 AC245047.3-201ENST00000429428 127 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
LAMB3Q13751 SNRPGP13-201ENST00000442212 177 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
LAMB3Q13751 Y_RNA.649-201ENST00000459077 103 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
LAMB3Q13751 AL773524.1-201ENST00000614065 229 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
LAMB3Q13751 MUC15-203ENST00000455601 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.86□□□□□ -2.11
LAMB3Q13751 FSD1L-201ENST00000374707 7062 ntTSL 1 (best) BASIC1.85□□□□□ -2.11
LAMB3Q13751 MIR450A1-201ENST00000362262 91 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
LAMB3Q13751 Y_RNA.528-201ENST00000384575 108 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
LAMB3Q13751 RNU6-950P-201ENST00000384651 107 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
LAMB3Q13751 TRAJ41-201ENST00000390496 62 ntAPPRIS P1 BASIC1.85□□□□□ -2.11
LAMB3Q13751 RNA5SP450-201ENST00000411206 102 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
LAMB3Q13751 AC063976.4-201ENST00000421971 163 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
LAMB3Q13751 CALM2P4-201ENST00000430810 426 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
LAMB3Q13751 FTH1P12-201ENST00000432137 551 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
LAMB3Q13751 AC110009.1-201ENST00000512965 451 ntTSL 5 BASIC1.85□□□□□ -2.11
LAMB3Q13751 AC108729.3-201ENST00000513484 108 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
LAMB3Q13751 RNU6-1053P-201ENST00000515930 101 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
LAMB3Q13751 RNU6-240P-201ENST00000516098 97 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
LAMB3Q13751 SCARNA15-202ENST00000516881 127 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
LAMB3Q13751 AP002004.2-201ENST00000531656 154 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
LAMB3Q13751 AC024614.2-201ENST00000577584 372 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
LAMB3Q13751 MIR3613-201ENST00000579844 87 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
LAMB3Q13751 AL161716.1-201ENST00000606365 273 ntTSL 5 BASIC1.85□□□□□ -2.11
LAMB3Q13751 MBNL3-212ENST00000538204 11294 ntTSL 1 (best) BASIC1.85□□□□□ -2.11
LAMB3Q13751 PTPN22-206ENST00000525799 2118 ntTSL 1 (best) BASIC1.84□□□□□ -2.11
LAMB3Q13751 HIF1A-212ENST00000557538 3468 ntTSL 1 (best) BASIC1.84□□□□□ -2.11
LAMB3Q13751 RNU6-1298P-201ENST00000362456 101 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
LAMB3Q13751 Y_RNA.265-201ENST00000364677 108 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
LAMB3Q13751 AL590705.2-201ENST00000420204 281 ntTSL 5 BASIC1.84□□□□□ -2.11
LAMB3Q13751 STAG3L5P-204ENST00000443759 179 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
LAMB3Q13751 AC079760.1-201ENST00000456952 202 ntTSL 3 BASIC1.84□□□□□ -2.11
LAMB3Q13751 RNU6ATAC12P-201ENST00000516542 115 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
LAMB3Q13751 SNORD45.4-201ENST00000516629 73 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
LAMB3Q13751 SNORD36C-201ENST00000516733 66 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
LAMB3Q13751 SUB1P4-201ENST00000566062 339 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
LAMB3Q13751 MIR5094-201ENST00000578766 85 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
LAMB3Q13751 MIR3618-201ENST00000580330 88 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
LAMB3Q13751 uc_338.28-201ENST00000612082 187 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
LAMB3Q13751 SNORD14E-201ENST00000364009 85 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
LAMB3Q13751 RNU6-268P-201ENST00000364174 107 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
LAMB3Q13751 MIR583-201ENST00000384846 75 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
LAMB3Q13751 MIRLET7F2-201ENST00000385277 83 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
LAMB3Q13751 RNA5SP501-201ENST00000410990 112 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
LAMB3Q13751 MTATP6P21-201ENST00000440681 189 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
LAMB3Q13751 AC084364.2-201ENST00000546924 395 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
LAMB3Q13751 HSPE1P19-201ENST00000603327 295 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
LAMB3Q13751 AC015726.2-201ENST00000620112 122 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
LAMB3Q13751 UGP2-230ENST00000626380 276 ntTSL 5 BASIC1.83□□□□□ -2.12
LAMB3Q13751 SLC9C2-201ENST00000367714 4428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.83□□□□□ -2.12
LAMB3Q13751 AC025539.1-201ENST00000515343 4019 ntTSL 2 BASIC1.82□□□□□ -2.12
LAMB3Q13751 SENP7-201ENST00000314261 4736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.82□□□□□ -2.12
LAMB3Q13751 MIR342-201ENST00000362212 99 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
LAMB3Q13751 RNU1-17P-201ENST00000363022 152 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
LAMB3Q13751 Y_RNA.346-201ENST00000365385 112 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
LAMB3Q13751 SNORA2.2-201ENST00000365473 135 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
LAMB3Q13751 SNORD24-201ENST00000383884 75 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
LAMB3Q13751 Y_RNA.547-201ENST00000384654 119 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
LAMB3Q13751 Y_RNA.549-201ENST00000384657 102 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
LAMB3Q13751 RNU6-997P-201ENST00000384725 107 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
LAMB3Q13751 MIR520A-201ENST00000384862 85 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
LAMB3Q13751 RNA5SP89-201ENST00000410300 108 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
LAMB3Q13751 HSPE1P9-201ENST00000440046 311 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
LAMB3Q13751 AC114811.1-201ENST00000507207 168 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
LAMB3Q13751 RNU6-126P-201ENST00000516685 103 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
LAMB3Q13751 Y_RNA.714-201ENST00000517065 90 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
LAMB3Q13751 FSIP2-202ENST00000424728 20788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC1.81□□□□□ -2.12
LAMB3Q13751 ASPM-202ENST00000367408 3747 ntTSL 1 (best) BASIC1.81□□□□□ -2.12
LAMB3Q13751 SNORA63D-201ENST00000364359 132 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
LAMB3Q13751 RNA5SP363-201ENST00000365072 115 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
LAMB3Q13751 SNORA4.2-201ENST00000365313 147 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
LAMB3Q13751 RNU6-1292P-201ENST00000383856 107 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
LAMB3Q13751 RNU6-442P-201ENST00000383968 104 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
LAMB3Q13751 Y_RNA.508-201ENST00000384502 114 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
LAMB3Q13751 RNU6-440P-201ENST00000390882 105 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
LAMB3Q13751 AC244636.1-201ENST00000421152 228 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
LAMB3Q13751 SNX2P2-201ENST00000424553 323 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
LAMB3Q13751 SNORA31.10-201ENST00000516482 106 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
LAMB3Q13751 RNU7-28P-201ENST00000516759 62 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 106.6 ms