Protein–RNA interactions for Protein: Q13263

TRIM28, Transcription intermediary factor 1-beta, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 835 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM28Q13263 SNORD58A-201ENST00000383875 65 ntBASIC3□□□□□ -1.93
TRIM28Q13263 RNA5SP425-201ENST00000410336 112 ntBASIC3□□□□□ -1.93
TRIM28Q13263 RN7SKP223-201ENST00000410582 62 ntBASIC3□□□□□ -1.93
TRIM28Q13263 RNU4-69P-201ENST00000410677 143 ntBASIC3□□□□□ -1.93
TRIM28Q13263 AL035398.1-201ENST00000430869 322 ntBASIC3□□□□□ -1.93
TRIM28Q13263 MICF-203ENST00000432679 129 ntBASIC3□□□□□ -1.93
TRIM28Q13263 AC069257.2-201ENST00000441819 155 ntBASIC3□□□□□ -1.93
TRIM28Q13263 RNU7-45P-201ENST00000459460 63 ntBASIC3□□□□□ -1.93
TRIM28Q13263 RNU6-998P-201ENST00000515894 101 ntBASIC3□□□□□ -1.93
TRIM28Q13263 AL353149.1-201ENST00000610667 244 ntBASIC3□□□□□ -1.93
TRIM28Q13263 MIR548BB-201ENST00000626714 66 ntBASIC3□□□□□ -1.93
TRIM28Q13263 AC110079.1-202ENST00000635213 138 ntBASIC3□□□□□ -1.93
TRIM28Q13263 PRKD3-201ENST00000234179 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3□□□□□ -1.93
TRIM28Q13263 ZNF626-204ENST00000612591 4404 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.99□□□□□ -1.93
TRIM28Q13263 WWP1-201ENST00000265428 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
TRIM28Q13263 Y_RNA.96-201ENST00000363092 109 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
TRIM28Q13263 RNU1-109P-201ENST00000383960 147 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
TRIM28Q13263 RNA5SP323-201ENST00000391094 133 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
TRIM28Q13263 MIR889-201ENST00000401280 79 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
TRIM28Q13263 AL365434.1-201ENST00000412362 380 ntTSL 3 BASIC2.99□□□□□ -1.93
TRIM28Q13263 SEM1P1-201ENST00000506694 209 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
TRIM28Q13263 SCARNA3-201ENST00000517097 143 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
TRIM28Q13263 MIR3199-1-201ENST00000582434 88 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
TRIM28Q13263 MIR5739-201ENST00000619803 80 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
TRIM28Q13263 ZBBX-204ENST00000392767 3071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.99□□□□□ -1.93
TRIM28Q13263 Y_RNA.470-201ENST00000384307 117 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
TRIM28Q13263 RNU6-788P-201ENST00000390967 104 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
TRIM28Q13263 RNA5SP344-201ENST00000411081 104 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
TRIM28Q13263 AL606517.2-201ENST00000442855 241 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
TRIM28Q13263 RNU7-94P-201ENST00000459576 63 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
TRIM28Q13263 RNU6-1116P-201ENST00000517269 99 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
TRIM28Q13263 MIR7515-201ENST00000637837 67 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
TRIM28Q13263 CHD1-201ENST00000284049 6457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.98□□□□□ -1.93
TRIM28Q13263 MIER3-203ENST00000381213 5198 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.98□□□□□ -1.93
TRIM28Q13263 Y_RNA.94-201ENST00000363068 106 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
TRIM28Q13263 Y_RNA.241-201ENST00000364470 117 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
TRIM28Q13263 Y_RNA.299-201ENST00000364973 94 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
TRIM28Q13263 U8.15-201ENST00000390947 134 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
TRIM28Q13263 RNU2-63P-201ENST00000410792 194 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
TRIM28Q13263 RPS12P2-201ENST00000439728 269 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
TRIM28Q13263 RN7SL499P-201ENST00000481141 276 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
TRIM28Q13263 MIR1273D-201ENST00000577266 86 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
TRIM28Q13263 AL161431.1-201ENST00000618966 4205 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
TRIM28Q13263 HMGN2P35-201ENST00000412164 270 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
TRIM28Q13263 RNU7-113P-201ENST00000459273 62 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
TRIM28Q13263 AC114811.1-201ENST00000507207 168 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
TRIM28Q13263 FTX-214ENST00000638437 12267 ntTSL 5 BASIC2.96□□□□□ -1.94
TRIM28Q13263 STX7-202ENST00000367941 15791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.96□□□□□ -1.94
TRIM28Q13263 CHD9-203ENST00000447540 11509 ntTSL 5 BASIC2.96□□□□□ -1.94
TRIM28Q13263 PCM1-222ENST00000524226 5955 ntTSL 1 (best) BASIC2.96□□□□□ -1.94
TRIM28Q13263 SNORD115-2-201ENST00000362842 82 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
TRIM28Q13263 U8.2-201ENST00000363156 134 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
TRIM28Q13263 RNU6-509P-201ENST00000363519 107 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
TRIM28Q13263 Y_RNA.247-201ENST00000364500 92 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
TRIM28Q13263 SNORD115-20-201ENST00000365099 82 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
TRIM28Q13263 MCF2-204ENST00000414978 3813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.95□□□□□ -1.94
TRIM28Q13263 AL590705.2-201ENST00000420204 281 ntTSL 5 BASIC2.95□□□□□ -1.94
TRIM28Q13263 AL592431.2-201ENST00000422198 171 ntTSL 3 BASIC2.95□□□□□ -1.94
TRIM28Q13263 RNU7-96P-201ENST00000459535 64 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
TRIM28Q13263 RPPH1-2P-201ENST00000516688 293 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
TRIM28Q13263 MIR4648-201ENST00000580107 72 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
TRIM28Q13263 MIR548AE2-201ENST00000583456 67 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
TRIM28Q13263 SNORD116-10-201ENST00000363791 102 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
TRIM28Q13263 RNU6ATAC37P-201ENST00000408328 131 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
TRIM28Q13263 SRIP3-201ENST00000413200 219 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
TRIM28Q13263 AC018511.2-201ENST00000413431 189 ntTSL 3 BASIC2.94□□□□□ -1.94
TRIM28Q13263 AL162400.2-201ENST00000427547 157 ntTSL 3 BASIC2.94□□□□□ -1.94
TRIM28Q13263 snoU13.15-201ENST00000459407 104 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
TRIM28Q13263 AC018868.1-201ENST00000491307 315 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
TRIM28Q13263 SNORA48.11-201ENST00000517015 89 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
TRIM28Q13263 LINC02386-203ENST00000552182 501 ntTSL 3 BASIC2.94□□□□□ -1.94
TRIM28Q13263 AL512310.12-203ENST00000640543 90 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
TRIM28Q13263 USP45-208ENST00000500704 5826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.94□□□□□ -1.94
TRIM28Q13263 ZNF334-205ENST00000615481 3706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.94□□□□□ -1.94
TRIM28Q13263 GABRG2-209ENST00000638660 3799 ntTSL 5 BASIC2.93□□□□□ -1.94
TRIM28Q13263 RNU6-1313P-201ENST00000362622 102 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
TRIM28Q13263 RNU6-862P-201ENST00000362804 105 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
TRIM28Q13263 SNORA25.6-201ENST00000364121 118 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
TRIM28Q13263 SNORD114-30-201ENST00000364448 72 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
TRIM28Q13263 Y_RNA.316-201ENST00000365118 111 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
TRIM28Q13263 RNA5SP482-201ENST00000391269 118 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
TRIM28Q13263 Y_RNA.607-201ENST00000410597 98 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
TRIM28Q13263 AL353747.2-201ENST00000439207 205 ntTSL 3 BASIC2.93□□□□□ -1.94
TRIM28Q13263 ATP5J2P3-201ENST00000451550 258 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
TRIM28Q13263 RNU6-667P-201ENST00000517186 102 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
TRIM28Q13263 RNU7-181P-201ENST00000517234 74 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
TRIM28Q13263 AC024995.1-201ENST00000523014 93 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
TRIM28Q13263 IGHVIII-5-1-201ENST00000523059 99 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
TRIM28Q13263 AC090821.2-201ENST00000523552 176 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
TRIM28Q13263 AC103810.7-201ENST00000607821 91 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
TRIM28Q13263 MIR376B-201ENST00000614515 100 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
TRIM28Q13263 MIR7157-201ENST00000635801 60 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
TRIM28Q13263 MIR21-201ENST00000362134 72 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
TRIM28Q13263 RNU6-633P-201ENST00000362612 103 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
TRIM28Q13263 MIR627-201ENST00000384979 97 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
TRIM28Q13263 RNU6-1319P-201ENST00000390855 104 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
TRIM28Q13263 RNU6-747P-201ENST00000390928 104 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
TRIM28Q13263 RNU6-241P-201ENST00000391148 104 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
TRIM28Q13263 RNU6-177P-201ENST00000411257 104 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
TRIM28Q13263 AC090844.1-201ENST00000422019 156 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 104.8 ms