Protein–RNA interactions for Protein: Q13064

MKRN3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase makorin-3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 507 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKRN3Q13064 FNDC3A-202ENST00000398316 5714 ntTSL 1 (best) BASIC4□□□□□ -1.77
MKRN3Q13064 SNORA11.4-201ENST00000408823 129 ntBASIC4□□□□□ -1.77
MKRN3Q13064 AC092427.1-202ENST00000430569 476 ntBASIC4□□□□□ -1.77
MKRN3Q13064 Z96811.1-201ENST00000445880 108 ntBASIC4□□□□□ -1.77
MKRN3Q13064 AC093850.1-201ENST00000454121 251 ntBASIC4□□□□□ -1.77
MKRN3Q13064 SNORD123-201ENST00000459473 70 ntBASIC4□□□□□ -1.77
MKRN3Q13064 SNORA70.19-201ENST00000516717 90 ntBASIC4□□□□□ -1.77
MKRN3Q13064 MIR4672-201ENST00000583126 81 ntBASIC4□□□□□ -1.77
MKRN3Q13064 FAM13A-AS1_1.1-201ENST00000612555 119 ntBASIC4□□□□□ -1.77
MKRN3Q13064 DICER1-203ENST00000526495 10331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4□□□□□ -1.77
MKRN3Q13064 NUFIP2-201ENST00000225388 10850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4□□□□□ -1.77
MKRN3Q13064 AC025164.2-202ENST00000499685 5699 ntTSL 3 BASIC3.99□□□□□ -1.77
MKRN3Q13064 PSMA5-201ENST00000271308 3729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.99□□□□□ -1.77
MKRN3Q13064 MIR449A-201ENST00000362113 91 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
MKRN3Q13064 SNORA44-201ENST00000384584 132 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
MKRN3Q13064 MTND4LP19-201ENST00000403051 166 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
MKRN3Q13064 AL034345.1-201ENST00000407768 123 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
MKRN3Q13064 MIR8066-201ENST00000617280 78 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
MKRN3Q13064 SYNE2-212ENST00000554584 20508 ntTSL 5 BASIC3.99□□□□□ -1.77
MKRN3Q13064 HSBP1P2-201ENST00000299671 229 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
MKRN3Q13064 Y_RNA.660-201ENST00000516002 120 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
MKRN3Q13064 Y_RNA.681-201ENST00000516445 113 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
MKRN3Q13064 CAPS2-203ENST00000393284 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.98□□□□□ -1.77
MKRN3Q13064 AP000648.3-201ENST00000623539 4507 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
MKRN3Q13064 GEN1-201ENST00000317402 9854 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.98□□□□□ -1.77
MKRN3Q13064 ADGRL2-211ENST00000370730 6173 ntTSL 5 BASIC3.98□□□□□ -1.77
MKRN3Q13064 USP33-201ENST00000357428 4155 ntTSL 5 BASIC3.98□□□□□ -1.77
MKRN3Q13064 FIGNL1-212ENST00000613602 3187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.98□□□□□ -1.77
MKRN3Q13064 GPR22-201ENST00000304402 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.98□□□□□ -1.77
MKRN3Q13064 RNU6-23P-201ENST00000363283 107 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
MKRN3Q13064 Y_RNA.354-201ENST00000365448 111 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
MKRN3Q13064 Y_RNA.537-201ENST00000384626 109 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
MKRN3Q13064 snoU13.16-201ENST00000459350 104 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
MKRN3Q13064 FGF7P7-201ENST00000514120 227 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
MKRN3Q13064 AC026271.5-201ENST00000577873 130 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
MKRN3Q13064 AL512598.1-201ENST00000610158 273 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
MKRN3Q13064 RNVU1-4-201ENST00000612985 164 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
MKRN3Q13064 RNF38-203ENST00000353739 4945 ntTSL 1 (best) BASIC3.97□□□□□ -1.77
MKRN3Q13064 KTN1-203ENST00000395309 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.97□□□□□ -1.77
MKRN3Q13064 ADGRG4-203ENST00000394143 9931 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.97□□□□□ -1.77
MKRN3Q13064 NAIP-205ENST00000508426 4153 ntTSL 1 (best) BASIC3.96□□□□□ -1.78
MKRN3Q13064 SNORA25.9-201ENST00000365087 128 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
MKRN3Q13064 MIR635-201ENST00000384830 98 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
MKRN3Q13064 RPL12P50-201ENST00000603116 116 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
MKRN3Q13064 MME-216ENST00000615825 5523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.96□□□□□ -1.78
MKRN3Q13064 AP006437.1-201ENST00000641440 3685 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
MKRN3Q13064 GRAMD1C-202ENST00000440446 3475 ntTSL 1 (best) BASIC3.95□□□□□ -1.78
MKRN3Q13064 MIR6715A-201ENST00000615929 79 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
MKRN3Q13064 MIR664A-201ENST00000626086 82 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
MKRN3Q13064 SLITRK5-201ENST00000325089 21103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.95□□□□□ -1.78
MKRN3Q13064 TSGA10-205ENST00000410001 3036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.95□□□□□ -1.78
MKRN3Q13064 AGL-205ENST00000370163 7166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.95□□□□□ -1.78
MKRN3Q13064 WRN-201ENST00000298139 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.94□□□□□ -1.78
MKRN3Q13064 RNU6-800P-201ENST00000384473 103 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
MKRN3Q13064 RNU6-540P-201ENST00000384622 101 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
MKRN3Q13064 SNORD30.1-201ENST00000391309 70 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
MKRN3Q13064 RNU4-83P-201ENST00000410863 133 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
MKRN3Q13064 AC104389.3-201ENST00000445629 235 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
MKRN3Q13064 RNU6-807P-201ENST00000516805 107 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
MKRN3Q13064 MIR3186-201ENST00000577404 85 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
MKRN3Q13064 Z97988.1-201ENST00000637697 135 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
MKRN3Q13064 ZNF804B-202ENST00000611114 3968 ntTSL 5 BASIC3.94□□□□□ -1.78
MKRN3Q13064 RPL23AP6-201ENST00000446637 472 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
MKRN3Q13064 RPS29P11-201ENST00000496507 171 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
MKRN3Q13064 C5orf42-205ENST00000508244 11062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC3.93□□□□□ -1.78
MKRN3Q13064 ATXN3-248ENST00000558190 26812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.93□□□□□ -1.78
MKRN3Q13064 UBE2W-203ENST00000517608 8426 ntTSL 1 (best) BASIC3.93□□□□□ -1.78
MKRN3Q13064 KIAA1524-206ENST00000491772 3877 ntTSL 1 (best) BASIC3.93□□□□□ -1.78
MKRN3Q13064 RNU6-1019P-201ENST00000364424 107 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
MKRN3Q13064 RNY1P13-201ENST00000365030 105 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
MKRN3Q13064 RPS29P31-201ENST00000446147 164 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
MKRN3Q13064 FER-201ENST00000281092 12119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.92□□□□□ -1.78
MKRN3Q13064 ZNF567-201ENST00000360729 2691 ntTSL 1 (best) BASIC3.91□□□□□ -1.78
MKRN3Q13064 FOXP2-206ENST00000393491 6085 ntTSL 5 BASIC3.91□□□□□ -1.78
MKRN3Q13064 AC093908.1-201ENST00000623125 8092 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
MKRN3Q13064 ATM-203ENST00000452508 12954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.91□□□□□ -1.78
MKRN3Q13064 RNU5F-1-201ENST00000362507 117 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
MKRN3Q13064 RNU6-1067P-201ENST00000384752 107 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
MKRN3Q13064 RNU6-1237P-201ENST00000384777 107 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
MKRN3Q13064 MIR526A1-201ENST00000384897 85 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
MKRN3Q13064 RNA5SP292-201ENST00000390974 118 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
MKRN3Q13064 RNU6-587P-201ENST00000391282 106 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
MKRN3Q13064 RNU4-47P-201ENST00000410876 114 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
MKRN3Q13064 AC104984.5-201ENST00000586878 94 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
MKRN3Q13064 AC069114.2-201ENST00000604699 304 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
MKRN3Q13064 SNORD14A-201ENST00000606526 91 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
MKRN3Q13064 U6.111-201ENST00000636093 83 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
MKRN3Q13064 MIR1297-201ENST00000637311 77 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
MKRN3Q13064 CHORDC1-205ENST00000529726 4805 ntTSL 2 BASIC3.91□□□□□ -1.78
MKRN3Q13064 PRRG1-202ENST00000449135 4481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.91□□□□□ -1.78
MKRN3Q13064 SENP7-201ENST00000314261 4736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.9□□□□□ -1.78
MKRN3Q13064 ZNF117-204ENST00000620222 5317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.9□□□□□ -1.78
MKRN3Q13064 PHF6-201ENST00000332070 4759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.9□□□□□ -1.78
MKRN3Q13064 RNA5SP432-201ENST00000362480 116 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
MKRN3Q13064 AL354733.1-201ENST00000458016 476 ntTSL 3 BASIC3.9□□□□□ -1.79
MKRN3Q13064 Y_RNA.648-201ENST00000459455 110 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
MKRN3Q13064 RN7SL863P-201ENST00000462370 296 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
MKRN3Q13064 MIR4425-201ENST00000580572 84 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
MKRN3Q13064 ADARB1-213ENST00000611195 159 ntTSL 5 BASIC3.9□□□□□ -1.79
MKRN3Q13064 KCNJ16-203ENST00000392671 3981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.9□□□□□ -1.79
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