Protein–RNA interactions for Protein: Q12983

BNIP3, BCL2/adenovirus E1B 19 kDa protein-interacting protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 259 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BNIP3Q12983 MIR4666B-201ENST00000578142 81 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
BNIP3Q12983 MIR548Z-201ENST00000584743 97 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
BNIP3Q12983 SAGE1-202ENST00000370709 2879 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.62□□□□□ -1.99
BNIP3Q12983 RNF219-AS1-214ENST00000607862 6001 ntTSL 1 (best) BASIC2.61□□□□□ -1.99
BNIP3Q12983 MIR342-201ENST00000362212 99 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
BNIP3Q12983 DEFA7P-201ENST00000382676 285 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
BNIP3Q12983 SNORA18-201ENST00000384416 132 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
BNIP3Q12983 SNORA67.4-201ENST00000384688 142 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
BNIP3Q12983 BTF3P4-201ENST00000418852 495 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
BNIP3Q12983 MRPL35P3-201ENST00000421557 364 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
BNIP3Q12983 SNX2P2-201ENST00000424553 323 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
BNIP3Q12983 RNU1-41P-201ENST00000516161 162 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
BNIP3Q12983 RNU1-48P-201ENST00000516400 162 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
BNIP3Q12983 AC010297.1-201ENST00000623948 149 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
BNIP3Q12983 OGN-202ENST00000375561 2743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.61□□□□□ -1.99
BNIP3Q12983 ARHGAP15-202ENST00000409869 2968 ntTSL 5 BASIC2.61□□□□□ -1.99
BNIP3Q12983 MAP4K3-205ENST00000437545 3924 ntTSL 5 BASIC2.61□□□□□ -1.99
BNIP3Q12983 SENP7-205ENST00000394091 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.6□□□□□ -1.99
BNIP3Q12983 AP003174.1-201ENST00000306533 376 ntTSL 2 BASIC2.6□□□□□ -1.99
BNIP3Q12983 MIR26A1-201ENST00000362205 77 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
BNIP3Q12983 Y_RNA.73-201ENST00000362910 113 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
BNIP3Q12983 Y_RNA.190-201ENST00000363964 101 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
BNIP3Q12983 RNA5SP493-201ENST00000364115 91 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
BNIP3Q12983 Y_RNA.241-201ENST00000364470 117 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
BNIP3Q12983 Y_RNA.244-201ENST00000364484 109 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
BNIP3Q12983 SNORD45B-201ENST00000364617 72 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
BNIP3Q12983 SNORD115-35-201ENST00000365122 82 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
BNIP3Q12983 RNU6-497P-201ENST00000365316 104 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
BNIP3Q12983 SNORD116-22-201ENST00000384430 92 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
BNIP3Q12983 RNU6-1319P-201ENST00000390855 104 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
BNIP3Q12983 RNU6-747P-201ENST00000390928 104 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
BNIP3Q12983 RNU6-241P-201ENST00000391148 104 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
BNIP3Q12983 MIR1262-201ENST00000408276 93 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
BNIP3Q12983 RNU6-177P-201ENST00000411257 104 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
BNIP3Q12983 HMGN2P35-201ENST00000412164 270 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
BNIP3Q12983 RNU7-171P-201ENST00000459581 62 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
BNIP3Q12983 RNU6-1258P-201ENST00000516911 111 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
BNIP3Q12983 MIR3169-201ENST00000578032 83 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
BNIP3Q12983 SNORD53-201ENST00000579969 78 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
BNIP3Q12983 AC091304.10-201ENST00000641554 121 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
BNIP3Q12983 MUC15-202ENST00000436318 3118 ntTSL 5 BASIC2.6□□□□□ -1.99
BNIP3Q12983 SLC6A15-202ENST00000309283 3108 ntTSL 5 BASIC2.59□□□□□ -1.99
BNIP3Q12983 Y_RNA.95-201ENST00000363079 95 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
BNIP3Q12983 AL353747.2-201ENST00000439207 205 ntTSL 3 BASIC2.59□□□□□ -1.99
BNIP3Q12983 RPL23AP63-201ENST00000498752 471 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
BNIP3Q12983 SNORA9.3-201ENST00000516383 129 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
BNIP3Q12983 RNU6-1116P-201ENST00000517269 99 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
BNIP3Q12983 MIR5588-201ENST00000581890 63 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
BNIP3Q12983 AL513534.2-201ENST00000603836 250 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
BNIP3Q12983 Hammerhead_HH9.1-201ENST00000616606 77 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
BNIP3Q12983 GABRA2-209ENST00000510861 3411 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.59□□□□□ -2
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BNIP3Q12983 RNU6-219P-201ENST00000364728 107 ntBASIC2.58□□□□□ -2
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BNIP3Q12983 RNA5SP492-201ENST00000411330 114 ntBASIC2.58□□□□□ -2
BNIP3Q12983 AC015922.2-201ENST00000435593 184 ntBASIC2.58□□□□□ -2
BNIP3Q12983 VTRNA2-2P-201ENST00000516091 103 ntBASIC2.58□□□□□ -2
BNIP3Q12983 SNORA31.15-201ENST00000516771 132 ntBASIC2.58□□□□□ -2
BNIP3Q12983 IGLV3-17-201ENST00000519099 244 ntBASIC2.58□□□□□ -2
BNIP3Q12983 AC090821.2-201ENST00000523552 176 ntBASIC2.58□□□□□ -2
BNIP3Q12983 AL449363.1-201ENST00000617815 186 ntBASIC2.58□□□□□ -2
BNIP3Q12983 MIR8054-201ENST00000620877 86 ntBASIC2.58□□□□□ -2
BNIP3Q12983 OR51A4-202ENST00000641898 4393 ntAPPRIS P1 BASIC2.58□□□□□ -2
BNIP3Q12983 PIK3CA-201ENST00000263967 9093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.57□□□□□ -2
BNIP3Q12983 OGN-201ENST00000262551 2971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.57□□□□□ -2
BNIP3Q12983 RNA5SP432-201ENST00000362480 116 ntBASIC2.57□□□□□ -2
BNIP3Q12983 Y_RNA.171-201ENST00000363760 102 ntBASIC2.57□□□□□ -2
BNIP3Q12983 RNU6-163P-201ENST00000384396 106 ntBASIC2.57□□□□□ -2
BNIP3Q12983 TRAJ26-201ENST00000390511 60 ntAPPRIS P1 BASIC2.57□□□□□ -2
BNIP3Q12983 RNA5SP109-201ENST00000391010 116 ntBASIC2.57□□□□□ -2
BNIP3Q12983 MIR1270-201ENST00000459320 83 ntBASIC2.57□□□□□ -2
BNIP3Q12983 RNU6-65P-201ENST00000516332 98 ntBASIC2.57□□□□□ -2
BNIP3Q12983 RPPH1-2P-201ENST00000516688 293 ntBASIC2.57□□□□□ -2
BNIP3Q12983 Y_RNA.705-201ENST00000516862 110 ntBASIC2.57□□□□□ -2
BNIP3Q12983 LINC02386-203ENST00000552182 501 ntTSL 3 BASIC2.57□□□□□ -2
BNIP3Q12983 AC007336.1-201ENST00000576365 3828 ntBASIC2.57□□□□□ -2
BNIP3Q12983 SNORA28-201ENST00000606769 126 ntBASIC2.57□□□□□ -2
BNIP3Q12983 DLEU2_6.1-201ENST00000610536 112 ntBASIC2.57□□□□□ -2
BNIP3Q12983 AC022513.1-201ENST00000624512 117 ntBASIC2.57□□□□□ -2
BNIP3Q12983 CENPE-201ENST00000265148 8612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.56□□□□□ -2
BNIP3Q12983 RNA5SP289-201ENST00000362332 137 ntBASIC2.56□□□□□ -2
BNIP3Q12983 Y_RNA.221-201ENST00000364248 96 ntBASIC2.56□□□□□ -2
BNIP3Q12983 RNU6-424P-201ENST00000384367 105 ntBASIC2.56□□□□□ -2
BNIP3Q12983 RNA5SP181-201ENST00000410246 98 ntBASIC2.56□□□□□ -2
BNIP3Q12983 RNU6-887P-201ENST00000410660 100 ntBASIC2.56□□□□□ -2
BNIP3Q12983 SNORA7.5-201ENST00000410672 110 ntBASIC2.56□□□□□ -2
BNIP3Q12983 AC092783.1-201ENST00000435832 231 ntTSL 3 BASIC2.56□□□□□ -2
BNIP3Q12983 AC104389.3-201ENST00000445629 235 ntBASIC2.56□□□□□ -2
BNIP3Q12983 RNU7-113P-201ENST00000459273 62 ntBASIC2.56□□□□□ -2
BNIP3Q12983 RNU6-521P-201ENST00000516663 105 ntBASIC2.56□□□□□ -2
BNIP3Q12983 MIR4439-201ENST00000583746 80 ntBASIC2.56□□□□□ -2
BNIP3Q12983 MIR6841-201ENST00000637129 72 ntBASIC2.56□□□□□ -2
BNIP3Q12983 AC080100.1-201ENST00000624239 5356 ntBASIC2.56□□□□□ -2
BNIP3Q12983 RNU6-833P-201ENST00000363486 107 ntBASIC2.55□□□□□ -2
BNIP3Q12983 SNORD114-30-201ENST00000364448 72 ntBASIC2.55□□□□□ -2
BNIP3Q12983 RNU6-616P-201ENST00000384353 107 ntBASIC2.55□□□□□ -2
BNIP3Q12983 MIR1267-201ENST00000408723 78 ntBASIC2.55□□□□□ -2
BNIP3Q12983 RNU2-40P-201ENST00000410833 196 ntBASIC2.55□□□□□ -2
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