Protein–RNA interactions for Protein: P53609

PGGT1B, Geranylgeranyl transferase type-1 subunit beta, humanhuman

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Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1BP53609 AC007370.2-201ENST00000506899 2694 ntTSL 5 BASIC1.65□□□□□ -2.15
PGGT1BP53609 FSD1L-201ENST00000374707 7062 ntTSL 1 (best) BASIC1.64□□□□□ -2.15
PGGT1BP53609 SNORD18B-201ENST00000365659 72 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
PGGT1BP53609 MIR676-201ENST00000390702 67 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
PGGT1BP53609 AL627390.1-201ENST00000396055 340 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
PGGT1BP53609 RNU6-938P-201ENST00000411285 103 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
PGGT1BP53609 AL353614.1-201ENST00000445631 206 ntTSL 5 BASIC1.64□□□□□ -2.15
PGGT1BP53609 AC099513.1-201ENST00000490423 301 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
PGGT1BP53609 CYCTP-201ENST00000504253 315 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
PGGT1BP53609 AC131956.1-201ENST00000506420 258 ntTSL 2 BASIC1.64□□□□□ -2.15
PGGT1BP53609 RNA5SP182-201ENST00000516064 82 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
PGGT1BP53609 Y_RNA.692-201ENST00000516627 105 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
PGGT1BP53609 RNU6-250P-201ENST00000516958 103 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
PGGT1BP53609 MIR4709-201ENST00000577272 72 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
PGGT1BP53609 MIR3121-201ENST00000579680 77 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
PGGT1BP53609 AC108081.1-201ENST00000604358 221 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
PGGT1BP53609 AC012493.3-201ENST00000604494 112 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
PGGT1BP53609 AL022345.2-201ENST00000606307 135 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
PGGT1BP53609 HS1BP3-208ENST00000631166 78 ntTSL 5 BASIC1.64□□□□□ -2.15
PGGT1BP53609 CALCRL-201ENST00000392370 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.64□□□□□ -2.15
PGGT1BP53609 RNU6-661P-201ENST00000362409 107 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
PGGT1BP53609 Y_RNA.37-201ENST00000362606 108 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
PGGT1BP53609 SNORD115-28-201ENST00000363931 81 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
PGGT1BP53609 Y_RNA.630-201ENST00000411370 108 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
PGGT1BP53609 snoU13.27-201ENST00000459278 104 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
PGGT1BP53609 RNU6-659P-201ENST00000516454 104 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
PGGT1BP53609 RNU6-1061P-201ENST00000516530 99 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
PGGT1BP53609 SCARNA15-202ENST00000516881 127 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
PGGT1BP53609 RNU7-181P-201ENST00000517234 74 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
PGGT1BP53609 RNA5SP205-201ENST00000364653 136 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
PGGT1BP53609 Y_RNA.336-201ENST00000365307 109 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
PGGT1BP53609 RNU6-1292P-201ENST00000383856 107 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
PGGT1BP53609 Y_RNA.494-201ENST00000384432 111 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
PGGT1BP53609 AL603914.1-201ENST00000401964 204 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
PGGT1BP53609 AC015922.2-201ENST00000435593 184 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
PGGT1BP53609 RNU6-772P-201ENST00000516042 105 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
PGGT1BP53609 RNA5SP236-201ENST00000516169 116 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
PGGT1BP53609 RNU6-781P-201ENST00000516377 101 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
PGGT1BP53609 RNA5SP481-201ENST00000516814 122 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
PGGT1BP53609 RNU6-295P-201ENST00000516901 104 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
PGGT1BP53609 DEFB122-202ENST00000569013 197 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
PGGT1BP53609 MIR3198-2-201ENST00000577868 80 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
PGGT1BP53609 Y_RNA.757-201ENST00000578934 114 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
PGGT1BP53609 ZNFX1-AS1_2.1-201ENST00000610973 93 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
PGGT1BP53609 TP73-AS1.1-201ENST00000611447 161 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
PGGT1BP53609 AC134878.1-201ENST00000619901 243 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
PGGT1BP53609 MIR342-201ENST00000362212 99 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
PGGT1BP53609 SNORA2.2-201ENST00000365473 135 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
PGGT1BP53609 RNU6-1189P-201ENST00000383958 107 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
PGGT1BP53609 RNU6-203P-201ENST00000384038 104 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
PGGT1BP53609 RNU6-439P-201ENST00000384188 106 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
PGGT1BP53609 AL591806.2-201ENST00000433122 173 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
PGGT1BP53609 AL158147.1-201ENST00000443970 75 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
PGGT1BP53609 HMGN2P32-201ENST00000444648 269 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
PGGT1BP53609 snoU13.23-201ENST00000458863 104 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
PGGT1BP53609 CFLAR-AS1-202ENST00000474886 223 ntTSL 3 BASIC1.61□□□□□ -2.15
PGGT1BP53609 IGKV1-22-201ENST00000524313 326 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
PGGT1BP53609 MIR4524B-201ENST00000581569 115 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
PGGT1BP53609 MIR5197-201ENST00000583721 112 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
PGGT1BP53609 AL359881.1-201ENST00000602916 267 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
PGGT1BP53609 SENP7-201ENST00000314261 4736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.61□□□□□ -2.15
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PGGT1BP53609 MIR526A1-201ENST00000384897 85 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
PGGT1BP53609 ATP6V0E1P3-201ENST00000420036 246 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
PGGT1BP53609 SNX2P2-201ENST00000424553 323 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
PGGT1BP53609 PGBD4P5-201ENST00000445958 426 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
PGGT1BP53609 AC108752.1-201ENST00000484679 576 ntTSL 5 BASIC1.6□□□□□ -2.15
PGGT1BP53609 AC110009.1-201ENST00000512965 451 ntTSL 5 BASIC1.6□□□□□ -2.15
PGGT1BP53609 AP003484.1-201ENST00000530974 250 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
PGGT1BP53609 AC133485.4-201ENST00000561835 220 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
PGGT1BP53609 AC138907.4-201ENST00000570107 226 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
PGGT1BP53609 HSPE1P19-201ENST00000603327 295 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
PGGT1BP53609 AC106754.2-201ENST00000623006 233 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
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PGGT1BP53609 SNORD20-201ENST00000384550 80 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
PGGT1BP53609 RNU6-950P-201ENST00000384651 107 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
PGGT1BP53609 SNORA26.9-201ENST00000391322 122 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
PGGT1BP53609 MIR1323-201ENST00000408090 73 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
PGGT1BP53609 AC092783.1-201ENST00000435832 231 ntTSL 3 BASIC1.59□□□□□ -2.15
PGGT1BP53609 AC108210.2-201ENST00000503681 201 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
PGGT1BP53609 SNORA18.7-201ENST00000516910 131 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
PGGT1BP53609 AC090049.2-201ENST00000550377 109 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
PGGT1BP53609 AC015712.3-201ENST00000559380 164 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
PGGT1BP53609 MIR3122-201ENST00000577243 73 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
PGGT1BP53609 AC008163.1-205ENST00000413944 4649 ntTSL 1 (best) BASIC1.58□□□□□ -2.16
PGGT1BP53609 BRCA1-202ENST00000354071 4497 ntTSL 1 (best) BASIC1.58□□□□□ -2.16
PGGT1BP53609 Y_RNA.241-201ENST00000364470 117 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
PGGT1BP53609 Y_RNA.440-201ENST00000384120 114 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
PGGT1BP53609 MIR570-201ENST00000384917 97 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
PGGT1BP53609 TRAJ23-201ENST00000390514 63 ntAPPRIS P1 BASIC1.58□□□□□ -2.16
PGGT1BP53609 SNORA40.5-201ENST00000391061 128 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
PGGT1BP53609 RNU6ATAC12P-201ENST00000516542 115 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
PGGT1BP53609 RNU6-548P-201ENST00000517083 115 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
PGGT1BP53609 SUMO2P16-201ENST00000519475 264 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
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