Protein–RNA interactions for Protein: P49454

CENPF, Centromere protein F, humanhuman

Predictions only

Length 3,210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPFP49454 RNU6-378P-201ENST00000384324 107 ntBASIC-2.98□□□□□ -2.89
CENPFP49454 RNU6-921P-201ENST00000384361 107 ntBASIC-2.98□□□□□ -2.89
CENPFP49454 Y_RNA.576-201ENST00000384781 102 ntBASIC-2.98□□□□□ -2.89
CENPFP49454 RNU6-572P-201ENST00000516724 80 ntBASIC-2.98□□□□□ -2.89
CENPFP49454 RNU6-1308P-201ENST00000516817 103 ntBASIC-2.98□□□□□ -2.89
CENPFP49454 Y_RNA.601-201ENST00000410500 113 ntBASIC-2.99□□□□□ -2.89
CENPFP49454 RNU6-602P-201ENST00000411155 105 ntBASIC-2.99□□□□□ -2.89
CENPFP49454 RNU7-181P-201ENST00000517234 74 ntBASIC-2.99□□□□□ -2.89
CENPFP49454 MIR8055-201ENST00000610739 97 ntBASIC-2.99□□□□□ -2.89
CENPFP49454 TPTEP1-208ENST00000636884 213 ntBASIC-2.99□□□□□ -2.89
CENPFP49454 RNU6-665P-201ENST00000384639 107 ntBASIC-2.99□□□□□ -2.89
CENPFP49454 AC096586.1-201ENST00000610267 561 ntBASIC-2.99□□□□□ -2.89
CENPFP49454 MIRLET7A2-201ENST00000362105 72 ntBASIC-3□□□□□ -2.89
CENPFP49454 AC005696.2-201ENST00000610120 626 ntTSL 3 BASIC-3□□□□□ -2.89
CENPFP49454 SMIM18-202ENST00000626298 114 ntTSL 5 BASIC-3□□□□□ -2.89
CENPFP49454 RNU4-17P-201ENST00000365598 141 ntBASIC-3□□□□□ -2.89
CENPFP49454 RNU6-98P-201ENST00000384173 107 ntBASIC-3□□□□□ -2.89
CENPFP49454 Y_RNA.504-201ENST00000384481 104 ntBASIC-3□□□□□ -2.89
CENPFP49454 AL136370.1-201ENST00000608166 691 ntBASIC-3□□□□□ -2.89
CENPFP49454 AC099654.9-201ENST00000637055 678 ntBASIC-3□□□□□ -2.89
CENPFP49454 FGF7P2-201ENST00000332473 296 ntBASIC-3.01□□□□□ -2.89
CENPFP49454 RNU6-341P-201ENST00000516973 96 ntBASIC-3.01□□□□□ -2.89
CENPFP49454 AC009145.3-201ENST00000567386 476 ntTSL 3 BASIC-3.01□□□□□ -2.89
CENPFP49454 AC011825.2-201ENST00000583138 553 ntTSL 4 BASIC-3.01□□□□□ -2.89
CENPFP49454 RNA5SP133-201ENST00000363368 119 ntBASIC-3.01□□□□□ -2.89
CENPFP49454 RNU6-978P-201ENST00000364371 103 ntBASIC-3.01□□□□□ -2.89
CENPFP49454 RNU6-384P-201ENST00000364900 104 ntBASIC-3.02□□□□□ -2.89
CENPFP49454 RNU6-767P-201ENST00000384132 107 ntBASIC-3.02□□□□□ -2.89
CENPFP49454 MTCO1P29-201ENST00000496868 288 ntBASIC-3.02□□□□□ -2.89
CENPFP49454 SNORA31.19-201ENST00000517079 126 ntBASIC-3.02□□□□□ -2.89
CENPFP49454 ST7-OT3_1.1-201ENST00000619607 74 ntBASIC-3.02□□□□□ -2.89
CENPFP49454 RNU6-454P-201ENST00000364292 107 ntBASIC-3.02□□□□□ -2.89
CENPFP49454 Y_RNA.486-201ENST00000384398 107 ntBASIC-3.02□□□□□ -2.89
CENPFP49454 MIR5006-201ENST00000583027 110 ntBASIC-3.02□□□□□ -2.89
CENPFP49454 RNU6-1179P-201ENST00000384667 107 ntBASIC-3.02□□□□□ -2.89
CENPFP49454 RBMX2P4-201ENST00000441256 376 ntBASIC-3.02□□□□□ -2.89
CENPFP49454 RNU6-528P-201ENST00000516926 100 ntBASIC-3.02□□□□□ -2.89
CENPFP49454 AC091178.2-201ENST00000584401 117 ntBASIC-3.02□□□□□ -2.89
CENPFP49454 RNU6-630P-201ENST00000391258 106 ntBASIC-3.03□□□□□ -2.89
CENPFP49454 AL359636.3-201ENST00000439471 301 ntTSL 2 BASIC-3.03□□□□□ -2.89
CENPFP49454 AL357793.1-201ENST00000448412 401 ntTSL 5 BASIC-3.03□□□□□ -2.89
CENPFP49454 SNORD115-14-201ENST00000363090 81 ntBASIC-3.03□□□□□ -2.89
CENPFP49454 RNU4-58P-201ENST00000363192 141 ntBASIC-3.03□□□□□ -2.89
CENPFP49454 RNU6-324P-201ENST00000363957 106 ntBASIC-3.03□□□□□ -2.89
CENPFP49454 UBE2V1P11-201ENST00000411559 285 ntBASIC-3.03□□□□□ -2.89
CENPFP49454 MTND2P22-201ENST00000444325 1033 ntBASIC-3.03□□□□□ -2.89
CENPFP49454 AC010486.2-201ENST00000505572 483 ntBASIC-3.03□□□□□ -2.89
CENPFP49454 UPP2-IT1-201ENST00000439185 357 ntTSL 3 BASIC-3.04□□□□□ -2.9
CENPFP49454 AC021451.1-201ENST00000523498 1129 ntBASIC-3.04□□□□□ -2.9
CENPFP49454 AP001825.1-201ENST00000534275 351 ntTSL 2 BASIC-3.04□□□□□ -2.9
CENPFP49454 RNU6-647P-201ENST00000364243 107 ntBASIC-3.04□□□□□ -2.9
CENPFP49454 AL365203.2-201ENST00000423444 196 ntBASIC-3.04□□□□□ -2.9
CENPFP49454 RNU7-88P-201ENST00000458752 63 ntBASIC-3.04□□□□□ -2.9
CENPFP49454 CCDC39-AS1-201ENST00000495357 283 ntTSL 3 BASIC-3.04□□□□□ -2.9
CENPFP49454 MIR4762-201ENST00000585261 75 ntBASIC-3.04□□□□□ -2.9
CENPFP49454 RNU6-132P-201ENST00000383863 107 ntBASIC-3.04□□□□□ -2.9
CENPFP49454 RNU6-878P-201ENST00000384578 110 ntBASIC-3.04□□□□□ -2.9
CENPFP49454 FBXO11-203ENST00000405808 299 ntTSL 5 BASIC-3.04□□□□□ -2.9
CENPFP49454 MTCO2P6-201ENST00000463134 685 ntBASIC-3.04□□□□□ -2.9
CENPFP49454 RNU6-560P-201ENST00000364007 108 ntBASIC-3.05□□□□□ -2.9
CENPFP49454 RNU6-376P-201ENST00000384731 106 ntBASIC-3.05□□□□□ -2.9
CENPFP49454 RNU7-182P-201ENST00000459009 62 ntBASIC-3.05□□□□□ -2.9
CENPFP49454 AC022878.1-201ENST00000530684 149 ntBASIC-3.05□□□□□ -2.9
CENPFP49454 U6.97-201ENST00000636904 101 ntBASIC-3.05□□□□□ -2.9
CENPFP49454 RNU6-20P-201ENST00000384106 107 ntBASIC-3.05□□□□□ -2.9
CENPFP49454 LYRM7-202ENST00000507584 317 ntTSL 2 BASIC-3.05□□□□□ -2.9
CENPFP49454 RNU6-1012P-201ENST00000516606 109 ntBASIC-3.05□□□□□ -2.9
CENPFP49454 AL669831.3-213ENST00000636676 183 ntBASIC-3.05□□□□□ -2.9
CENPFP49454 AL355314.1-201ENST00000453639 316 ntTSL 5 BASIC-3.06□□□□□ -2.9
CENPFP49454 AP005436.2-201ENST00000528458 252 ntTSL 5 BASIC-3.06□□□□□ -2.9
CENPFP49454 AC023158.2-201ENST00000614876 543 ntBASIC-3.06□□□□□ -2.9
CENPFP49454 Y_RNA.517-201ENST00000384551 106 ntBASIC-3.06□□□□□ -2.9
CENPFP49454 MIR1255B2-201ENST00000408618 67 ntBASIC-3.06□□□□□ -2.9
CENPFP49454 RNU2-13P-201ENST00000515909 113 ntBASIC-3.06□□□□□ -2.9
CENPFP49454 AC104629.1-201ENST00000494226 508 ntBASIC-3.06□□□□□ -2.9
CENPFP49454 RNU6-531P-201ENST00000516694 104 ntBASIC-3.06□□□□□ -2.9
CENPFP49454 SCARNA24.2-201ENST00000516968 130 ntBASIC-3.06□□□□□ -2.9
CENPFP49454 RNU6-1174P-201ENST00000517278 101 ntBASIC-3.06□□□□□ -2.9
CENPFP49454 RNU6-325P-201ENST00000411132 105 ntBASIC-3.07□□□□□ -2.9
CENPFP49454 EPS15P1-201ENST00000448836 336 ntBASIC-3.07□□□□□ -2.9
CENPFP49454 AC017015.2-201ENST00000497946 376 ntTSL 2 BASIC-3.07□□□□□ -2.9
CENPFP49454 AC138625.1-201ENST00000567556 483 ntTSL 3 BASIC-3.07□□□□□ -2.9
CENPFP49454 snoU2-30.1-201ENST00000365012 70 ntBASIC-3.07□□□□□ -2.9
CENPFP49454 RNU6-1245P-201ENST00000411130 106 ntBASIC-3.07□□□□□ -2.9
CENPFP49454 Y_RNA.709-201ENST00000516952 92 ntBASIC-3.07□□□□□ -2.9
CENPFP49454 AC005520.5-201ENST00000613926 164 ntBASIC-3.07□□□□□ -2.9
CENPFP49454 Y_RNA.110-201ENST00000363220 99 ntBASIC-3.08□□□□□ -2.9
CENPFP49454 Y_RNA.409-201ENST00000383990 98 ntBASIC-3.08□□□□□ -2.9
CENPFP49454 SNORA75B-201ENST00000384053 137 ntBASIC-3.08□□□□□ -2.9
CENPFP49454 LINC01491-201ENST00000558434 505 ntTSL 3 BASIC-3.08□□□□□ -2.9
CENPFP49454 SNORD115-7-201ENST00000365306 82 ntBASIC-3.08□□□□□ -2.9
CENPFP49454 RNU1-115P-201ENST00000365329 160 ntBASIC-3.08□□□□□ -2.9
CENPFP49454 MAMDC2-AS1-205ENST00000451488 317 ntTSL 3 BASIC-3.08□□□□□ -2.9
CENPFP49454 RNU6-221P-201ENST00000459541 99 ntBASIC-3.08□□□□□ -2.9
CENPFP49454 RNU7-172P-201ENST00000517125 64 ntBASIC-3.08□□□□□ -2.9
CENPFP49454 AL133215.3-201ENST00000609801 448 ntBASIC-3.08□□□□□ -2.9
CENPFP49454 AF228730.4-201ENST00000421457 183 ntBASIC-3.08□□□□□ -2.9
CENPFP49454 Y_RNA.690-201ENST00000516603 95 ntBASIC-3.08□□□□□ -2.9
CENPFP49454 SNORA51.5-201ENST00000384126 131 ntBASIC-3.09□□□□□ -2.9
CENPFP49454 Y_RNA.515-201ENST00000384535 112 ntBASIC-3.09□□□□□ -2.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 256.7 ms