Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0V3

SH3BP4, SH3 domain-binding protein 4, humanhuman

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Length 963 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4Q9P0V3 AC099513.1-201ENST00000490423 301 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
SH3BP4Q9P0V3 AC114811.1-201ENST00000507207 168 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
SH3BP4Q9P0V3 RNU4-57P-201ENST00000515980 135 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
SH3BP4Q9P0V3 SNORA18.4-201ENST00000516440 124 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
SH3BP4Q9P0V3 5S_rRNA.3-201ENST00000517021 110 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
SH3BP4Q9P0V3 SNORA44.1-201ENST00000517031 108 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
SH3BP4Q9P0V3 AC099850.3-201ENST00000577678 321 ntTSL 3 BASIC1.88□□□□□ -2.11
SH3BP4Q9P0V3 MIR5089-201ENST00000580047 84 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
SH3BP4Q9P0V3 5S_rRNA.19-201ENST00000612131 110 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
SH3BP4Q9P0V3 AL590808.1-201ENST00000618696 141 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
SH3BP4Q9P0V3 5S_rRNA.18-201ENST00000621941 110 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
SH3BP4Q9P0V3 SAGE1-202ENST00000370709 2879 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC1.87□□□□□ -2.11
SH3BP4Q9P0V3 RNU6-1084P-201ENST00000362498 107 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
SH3BP4Q9P0V3 SNORD14E-201ENST00000364009 85 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
SH3BP4Q9P0V3 RNU6-1031P-201ENST00000384773 107 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
SH3BP4Q9P0V3 MIR520A-201ENST00000384862 85 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
SH3BP4Q9P0V3 RNU6-938P-201ENST00000411285 103 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
SH3BP4Q9P0V3 ATP6V0E1P3-201ENST00000420036 246 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
SH3BP4Q9P0V3 AC108866.1-201ENST00000503073 2339 ntTSL 5 BASIC1.87□□□□□ -2.11
SH3BP4Q9P0V3 AC131956.1-201ENST00000506420 258 ntTSL 2 BASIC1.87□□□□□ -2.11
SH3BP4Q9P0V3 AC012493.3-201ENST00000604494 112 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
SH3BP4Q9P0V3 SNORA28-201ENST00000606769 126 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
SH3BP4Q9P0V3 AC027279.3-201ENST00000625055 122 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
SH3BP4Q9P0V3 PLD1-217ENST00000627725 174 ntTSL 5 BASIC1.87□□□□□ -2.11
SH3BP4Q9P0V3 DYNC2H1-203ENST00000398093 12945 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC1.86□□□□□ -2.11
SH3BP4Q9P0V3 Y_RNA.563-201ENST00000384707 108 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
SH3BP4Q9P0V3 RNU6ATAC38P-201ENST00000408119 126 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
SH3BP4Q9P0V3 RN7SKP200-201ENST00000410564 320 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
SH3BP4Q9P0V3 AL158147.1-201ENST00000443970 75 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
SH3BP4Q9P0V3 RN7SL429P-201ENST00000479090 223 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
SH3BP4Q9P0V3 RN7SL489P-201ENST00000486185 223 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
SH3BP4Q9P0V3 RN7SL327P-201ENST00000488659 223 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
SH3BP4Q9P0V3 CYCTP-201ENST00000504253 315 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
SH3BP4Q9P0V3 AC110009.1-201ENST00000512965 451 ntTSL 5 BASIC1.86□□□□□ -2.11
SH3BP4Q9P0V3 Y_RNA.690-201ENST00000516603 95 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
SH3BP4Q9P0V3 MIR5197-201ENST00000583721 112 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
SH3BP4Q9P0V3 SNRPGP19-201ENST00000603826 189 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
SH3BP4Q9P0V3 RN7SL853P-201ENST00000617250 223 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
SH3BP4Q9P0V3 AC064859.1-201ENST00000624741 174 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
SH3BP4Q9P0V3 MUC15-203ENST00000455601 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.86□□□□□ -2.11
SH3BP4Q9P0V3 LINC00645-203ENST00000557399 3512 ntTSL 1 (best) BASIC1.85□□□□□ -2.11
SH3BP4Q9P0V3 OSTN-201ENST00000339051 402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.85□□□□□ -2.11
SH3BP4Q9P0V3 Y_RNA.114-201ENST00000363265 113 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
SH3BP4Q9P0V3 SNORA3.2-201ENST00000408221 125 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
SH3BP4Q9P0V3 RN7SKP223-201ENST00000410582 62 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
SH3BP4Q9P0V3 AL445646.1-201ENST00000431784 216 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
SH3BP4Q9P0V3 HMGN2P32-201ENST00000444648 269 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
SH3BP4Q9P0V3 RN7SL274P-201ENST00000492268 272 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
SH3BP4Q9P0V3 Y_RNA.692-201ENST00000516627 105 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
SH3BP4Q9P0V3 RNA5SP168-201ENST00000516642 112 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
SH3BP4Q9P0V3 Y_RNA.712-201ENST00000517011 92 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
SH3BP4Q9P0V3 IGHVIII-67-2-201ENST00000519849 88 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
SH3BP4Q9P0V3 CERS6-AS1-202ENST00000594898 499 ntTSL 5 BASIC1.85□□□□□ -2.11
SH3BP4Q9P0V3 AC021506.2-201ENST00000612354 169 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
SH3BP4Q9P0V3 AC007370.2-201ENST00000506899 2694 ntTSL 5 BASIC1.85□□□□□ -2.11
SH3BP4Q9P0V3 RNU6-661P-201ENST00000362409 107 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
SH3BP4Q9P0V3 Y_RNA.37-201ENST00000362606 108 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
SH3BP4Q9P0V3 RNU6-235P-201ENST00000362644 107 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
SH3BP4Q9P0V3 RNU6-833P-201ENST00000363486 107 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
SH3BP4Q9P0V3 RNA5SP126-201ENST00000365092 109 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
SH3BP4Q9P0V3 AL034345.1-201ENST00000407768 123 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
SH3BP4Q9P0V3 Y_RNA.617-201ENST00000410920 90 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
SH3BP4Q9P0V3 Y_RNA.629-201ENST00000411368 105 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
SH3BP4Q9P0V3 AL353614.1-201ENST00000445631 206 ntTSL 5 BASIC1.84□□□□□ -2.11
SH3BP4Q9P0V3 RNU6-1149P-201ENST00000516810 97 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
SH3BP4Q9P0V3 HIF1A-212ENST00000557538 3468 ntTSL 1 (best) BASIC1.84□□□□□ -2.12
SH3BP4Q9P0V3 SLC9C2-201ENST00000367714 4428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.83□□□□□ -2.12
SH3BP4Q9P0V3 SNORD115-28-201ENST00000363931 81 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
SH3BP4Q9P0V3 Y_RNA.410-201ENST00000383992 113 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
SH3BP4Q9P0V3 RNU6-163P-201ENST00000384396 106 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
SH3BP4Q9P0V3 SNORD36C-201ENST00000516733 66 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
SH3BP4Q9P0V3 IGKV1-22-201ENST00000524313 326 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
SH3BP4Q9P0V3 AC004148.1-201ENST00000571506 398 ntTSL 5 BASIC1.83□□□□□ -2.12
SH3BP4Q9P0V3 MIR3198-2-201ENST00000577868 80 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
SH3BP4Q9P0V3 AC108081.1-201ENST00000604358 221 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
SH3BP4Q9P0V3 AL022345.2-201ENST00000606307 135 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
SH3BP4Q9P0V3 AC134878.1-201ENST00000619901 243 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
SH3BP4Q9P0V3 C16orf97-206ENST00000622950 415 ntTSL 2 BASIC1.83□□□□□ -2.12
SH3BP4Q9P0V3 AC092881.1-201ENST00000638218 2733 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
SH3BP4Q9P0V3 RNU6-950P-201ENST00000384651 107 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
SH3BP4Q9P0V3 MIR802-201ENST00000390235 94 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
SH3BP4Q9P0V3 SNORA40.5-201ENST00000391061 128 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
SH3BP4Q9P0V3 RNU6ATAC37P-201ENST00000408328 131 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
SH3BP4Q9P0V3 RNA5SP489-201ENST00000410986 109 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
SH3BP4Q9P0V3 snoU13.27-201ENST00000459278 104 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
SH3BP4Q9P0V3 RNU6-772P-201ENST00000516042 105 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
SH3BP4Q9P0V3 RNU6-830P-201ENST00000516353 107 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
SH3BP4Q9P0V3 RNA5SP481-201ENST00000516814 122 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
SH3BP4Q9P0V3 SNORA31.17-201ENST00000516953 127 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
SH3BP4Q9P0V3 AC090049.2-201ENST00000550377 109 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
SH3BP4Q9P0V3 Y_RNA.757-201ENST00000578934 114 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
SH3BP4Q9P0V3 AC034238.1-213ENST00000611148 150 ntTSL 5 BASIC1.82□□□□□ -2.12
SH3BP4Q9P0V3 Y_RNA.273-201ENST00000364703 102 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
SH3BP4Q9P0V3 MIRLET7F2-201ENST00000385277 83 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
SH3BP4Q9P0V3 Y_RNA.630-201ENST00000411370 108 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
SH3BP4Q9P0V3 TTTY16-201ENST00000437686 192 ntTSL 1 (best) BASIC1.81□□□□□ -2.12
SH3BP4Q9P0V3 AC104984.5-201ENST00000586878 94 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
SH3BP4Q9P0V3 AC103810.8-201ENST00000607347 118 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
SH3BP4Q9P0V3 MIR3914-2-201ENST00000637339 95 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
SH3BP4Q9P0V3 TBL1XR1-208ENST00000430069 7948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.8□□□□□ -2.12
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