Protein–RNA interactions for Protein: Q17RM4

CCDC142, Coiled-coil domain-containing protein 142, humanhuman

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Length 750 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC142Q17RM4 MIR518F-201ENST00000384973 87 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
CCDC142Q17RM4 MIR1294-201ENST00000408503 142 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
CCDC142Q17RM4 RPS26P48-201ENST00000491713 339 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
CCDC142Q17RM4 AC090255.1-201ENST00000495779 349 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
CCDC142Q17RM4 RNU6-693P-201ENST00000516134 107 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
CCDC142Q17RM4 RNU6-948P-201ENST00000516374 107 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
CCDC142Q17RM4 RNU6-126P-201ENST00000516685 103 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
CCDC142Q17RM4 RNU6-1096P-201ENST00000517089 102 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
CCDC142Q17RM4 AC084364.2-201ENST00000546924 395 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
CCDC142Q17RM4 AC022523.2-201ENST00000561045 150 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
CCDC142Q17RM4 AC079466.2-201ENST00000585394 185 ntTSL 5 BASIC2.21□□□□□ -2.06
CCDC142Q17RM4 FAM71BP1-201ENST00000604431 523 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
CCDC142Q17RM4 AC023490.1-201ENST00000614584 375 ntTSL 2 BASIC2.21□□□□□ -2.06
CCDC142Q17RM4 MIR6132-201ENST00000622083 109 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
CCDC142Q17RM4 AC011718.1-201ENST00000622906 375 ntTSL 1 (best) BASIC2.21□□□□□ -2.06
CCDC142Q17RM4 OR2L2-202ENST00000641771 4300 ntAPPRIS P1 BASIC2.21□□□□□ -2.06
CCDC142Q17RM4 CCDC30-201ENST00000340612 2664 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.21□□□□□ -2.06
CCDC142Q17RM4 MUC15-203ENST00000455601 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.2□□□□□ -2.06
CCDC142Q17RM4 IDE-201ENST00000265986 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.2□□□□□ -2.06
CCDC142Q17RM4 NEDD1-204ENST00000457368 3162 ntTSL 2 BASIC2.2□□□□□ -2.06
CCDC142Q17RM4 RNU6-349P-201ENST00000362402 107 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
CCDC142Q17RM4 SNORD114-1-201ENST00000362705 72 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
CCDC142Q17RM4 RNA5SP37-201ENST00000365420 130 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
CCDC142Q17RM4 RNU1-148P-201ENST00000384472 162 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
CCDC142Q17RM4 RNU6-1235P-201ENST00000384559 107 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
CCDC142Q17RM4 HMGN2P3-201ENST00000433603 273 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
CCDC142Q17RM4 HMGN2P5-201ENST00000436882 273 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
CCDC142Q17RM4 RNU6-498P-201ENST00000459468 107 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
CCDC142Q17RM4 MIR4529-201ENST00000578110 78 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
CCDC142Q17RM4 HS1BP3-208ENST00000631166 78 ntTSL 5 BASIC2.2□□□□□ -2.06
CCDC142Q17RM4 ETDC-201ENST00000635820 180 ntAPPRIS P1 BASIC2.2□□□□□ -2.06
CCDC142Q17RM4 Y_RNA.93-201ENST00000363066 109 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
CCDC142Q17RM4 SNORA63D-201ENST00000364359 132 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
CCDC142Q17RM4 Y_RNA.265-201ENST00000364677 108 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
CCDC142Q17RM4 SNORD24-201ENST00000383884 75 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
CCDC142Q17RM4 RNU6-813P-201ENST00000384691 107 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
CCDC142Q17RM4 MIR764-201ENST00000390811 85 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
CCDC142Q17RM4 Y_RNA.621-201ENST00000411065 96 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
CCDC142Q17RM4 AL353689.1-201ENST00000438895 199 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
CCDC142Q17RM4 AL161788.1-201ENST00000441805 169 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
CCDC142Q17RM4 RNU6-717P-201ENST00000459076 104 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
CCDC142Q17RM4 SUMO2P16-201ENST00000519475 264 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
CCDC142Q17RM4 MIR5197-201ENST00000583721 112 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
CCDC142Q17RM4 MIR2052-201ENST00000636055 55 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
CCDC142Q17RM4 PTPRQ-209ENST00000616559 8165 ntTSL 5 BASIC2.19□□□□□ -2.06
CCDC142Q17RM4 Y_RNA.73-201ENST00000362910 113 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
CCDC142Q17RM4 RNU1-72P-201ENST00000362976 153 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
CCDC142Q17RM4 Y_RNA.213-201ENST00000364178 111 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
CCDC142Q17RM4 Y_RNA.221-201ENST00000364248 96 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
CCDC142Q17RM4 Y_RNA.253-201ENST00000364562 112 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
CCDC142Q17RM4 RNA5SP160-201ENST00000364866 120 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
CCDC142Q17RM4 Y_RNA.290-201ENST00000364879 114 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
CCDC142Q17RM4 Y_RNA.298-201ENST00000364960 107 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
CCDC142Q17RM4 TRDJ2-201ENST00000390475 54 ntAPPRIS P1 BASIC2.18□□□□□ -2.06
CCDC142Q17RM4 AL445646.1-201ENST00000431784 216 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
CCDC142Q17RM4 SNRPGP10-201ENST00000432323 225 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
CCDC142Q17RM4 AC022137.1-201ENST00000483735 151 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
CCDC142Q17RM4 AC008507.4-201ENST00000585464 127 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
CCDC142Q17RM4 ZNRD1-AS1_2.5-201ENST00000614729 76 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
CCDC142Q17RM4 MIR7843-201ENST00000622274 79 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
CCDC142Q17RM4 MIR1248-201ENST00000629190 106 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
CCDC142Q17RM4 MIR219B-201ENST00000637023 88 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
CCDC142Q17RM4 AC011124.2-201ENST00000518739 3222 ntTSL 1 (best) BASIC2.18□□□□□ -2.06
CCDC142Q17RM4 LRRCC1-202ENST00000414626 4493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.17□□□□□ -2.06
CCDC142Q17RM4 RNU6-690P-201ENST00000365242 106 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
CCDC142Q17RM4 RNU6-787P-201ENST00000384032 107 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
CCDC142Q17RM4 MIR548D2-201ENST00000384955 97 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
CCDC142Q17RM4 MIR561-201ENST00000385216 97 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
CCDC142Q17RM4 HMGN1P7-201ENST00000491722 313 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
CCDC142Q17RM4 AC010255.2-201ENST00000505209 428 ntTSL 3 BASIC2.17□□□□□ -2.06
CCDC142Q17RM4 RNU6-965P-201ENST00000516721 96 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
CCDC142Q17RM4 TRAV1-1-201ENST00000542354 392 ntAPPRIS P1 BASIC2.17□□□□□ -2.06
CCDC142Q17RM4 AC073413.2-201ENST00000604332 360 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
CCDC142Q17RM4 ATP13A3-201ENST00000256031 7322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.17□□□□□ -2.06
CCDC142Q17RM4 RNY3P2-201ENST00000362918 102 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
CCDC142Q17RM4 RNU6-1125P-201ENST00000363601 107 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
CCDC142Q17RM4 ATP6V0E1P1-201ENST00000412537 226 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
CCDC142Q17RM4 AC093423.2-201ENST00000429074 437 ntTSL 3 BASIC2.16□□□□□ -2.06
CCDC142Q17RM4 TTTY16-201ENST00000437686 192 ntTSL 1 (best) BASIC2.16□□□□□ -2.06
CCDC142Q17RM4 SNRPGP13-201ENST00000442212 177 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
CCDC142Q17RM4 HMGN2P18-201ENST00000450680 270 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
CCDC142Q17RM4 AC233266.1-201ENST00000454518 96 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
CCDC142Q17RM4 AC025033.1-201ENST00000463883 194 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
CCDC142Q17RM4 RPS27P21-201ENST00000486977 252 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
CCDC142Q17RM4 RNU7-123P-201ENST00000515911 60 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
CCDC142Q17RM4 RNU6-1291P-201ENST00000516591 104 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
CCDC142Q17RM4 AC021443.1-201ENST00000604478 211 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
CCDC142Q17RM4 AL357054.2-201ENST00000607644 423 ntTSL 5 BASIC2.16□□□□□ -2.06
CCDC142Q17RM4 AC242852.1-201ENST00000612151 96 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
CCDC142Q17RM4 ST7-OT4_1.1-201ENST00000615322 200 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
CCDC142Q17RM4 FAS-AS1.2-201ENST00000620386 170 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
CCDC142Q17RM4 AC244015.1-201ENST00000622301 99 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
CCDC142Q17RM4 ZBBX-205ENST00000455345 3185 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.16□□□□□ -2.06
CCDC142Q17RM4 CCDC148-202ENST00000409187 2523 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.16□□□□□ -2.06
CCDC142Q17RM4 Y_RNA.244-201ENST00000364484 109 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
CCDC142Q17RM4 RNA5SP138-201ENST00000365098 114 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
CCDC142Q17RM4 RNU6-497P-201ENST00000365316 104 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
CCDC142Q17RM4 MIR17-201ENST00000385012 84 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
CCDC142Q17RM4 AC003989.2-201ENST00000440224 169 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
CCDC142Q17RM4 RPL39P39-201ENST00000455840 151 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
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