Protein–RNA interactions for Protein: Q15751

HERC1, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC1, humanhuman

Predictions only

Length 4,861 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC1Q15751 MIR208B-201ENST00000401172 77 ntBASIC-0.71□□□□□ -2.52
HERC1Q15751 AC097510.1-201ENST00000510945 133 ntBASIC-0.71□□□□□ -2.52
HERC1Q15751 U7.5-201ENST00000517224 61 ntBASIC-0.71□□□□□ -2.52
HERC1Q15751 AC084365.1-201ENST00000552470 310 ntTSL 3 BASIC-0.71□□□□□ -2.52
HERC1Q15751 AC008507.2-201ENST00000588402 1176 ntBASIC-0.71□□□□□ -2.52
HERC1Q15751 AC005520.5-201ENST00000613926 164 ntBASIC-0.71□□□□□ -2.52
HERC1Q15751 U4.7-201ENST00000638126 106 ntBASIC-0.71□□□□□ -2.52
HERC1Q15751 OSBPL1A-217ENST00000638614 84 ntTSL 5 BASIC-0.71□□□□□ -2.52
HERC1Q15751 SNORD68-201ENST00000363214 84 ntBASIC-0.71□□□□□ -2.52
HERC1Q15751 Y_RNA.548-201ENST00000384656 105 ntBASIC-0.71□□□□□ -2.52
HERC1Q15751 RNU6-1179P-201ENST00000384667 107 ntBASIC-0.71□□□□□ -2.52
HERC1Q15751 SNORA26.4-201ENST00000391188 123 ntBASIC-0.71□□□□□ -2.52
HERC1Q15751 FNDC1-IT1-201ENST00000419703 516 ntTSL 3 BASIC-0.71□□□□□ -2.52
HERC1Q15751 AJ239322.2-201ENST00000421696 575 ntTSL 5 BASIC-0.71□□□□□ -2.52
HERC1Q15751 HSPE1P25-201ENST00000455484 251 ntBASIC-0.71□□□□□ -2.52
HERC1Q15751 RNU6-437P-201ENST00000459408 95 ntBASIC-0.71□□□□□ -2.52
HERC1Q15751 AC009902.1-201ENST00000519351 183 ntBASIC-0.71□□□□□ -2.52
HERC1Q15751 MIR548W-201ENST00000581970 74 ntBASIC-0.71□□□□□ -2.52
HERC1Q15751 AP000907.4-201ENST00000604143 237 ntBASIC-0.71□□□□□ -2.52
HERC1Q15751 CDKN2B-AS_3.1-201ENST00000617587 144 ntBASIC-0.71□□□□□ -2.52
HERC1Q15751 AC231657.1-201ENST00000624313 397 ntBASIC-0.71□□□□□ -2.52
HERC1Q15751 RNU6-223P-201ENST00000362830 107 ntBASIC-0.71□□□□□ -2.52
HERC1Q15751 SNORD115-4-201ENST00000363810 82 ntBASIC-0.71□□□□□ -2.52
HERC1Q15751 RNU4-17P-201ENST00000365598 141 ntBASIC-0.71□□□□□ -2.52
HERC1Q15751 RNU6-1040P-201ENST00000383974 107 ntBASIC-0.71□□□□□ -2.52
HERC1Q15751 Y_RNA.509-201ENST00000384506 99 ntBASIC-0.71□□□□□ -2.52
HERC1Q15751 SNORA72.6-201ENST00000384520 129 ntBASIC-0.71□□□□□ -2.52
HERC1Q15751 RNU6-325P-201ENST00000411132 105 ntBASIC-0.71□□□□□ -2.52
HERC1Q15751 RNY4P25-201ENST00000459254 96 ntBASIC-0.71□□□□□ -2.52
HERC1Q15751 RNU6-1006P-201ENST00000516998 103 ntBASIC-0.71□□□□□ -2.52
HERC1Q15751 ZNF321P-202ENST00000550843 495 ntBASIC-0.71□□□□□ -2.52
HERC1Q15751 AC004217.3-201ENST00000551552 878 ntBASIC-0.71□□□□□ -2.52
HERC1Q15751 RNU7-10P-201ENST00000607194 63 ntBASIC-0.71□□□□□ -2.52
HERC1Q15751 ST7-OT3_1.1-201ENST00000619607 74 ntBASIC-0.71□□□□□ -2.52
HERC1Q15751 U6.109-201ENST00000636749 87 ntBASIC-0.71□□□□□ -2.52
HERC1Q15751 Y_RNA.54-201ENST00000362766 105 ntBASIC-0.72□□□□□ -2.52
HERC1Q15751 Y_RNA.80-201ENST00000362996 102 ntBASIC-0.72□□□□□ -2.52
HERC1Q15751 Y_RNA.153-201ENST00000363615 91 ntBASIC-0.72□□□□□ -2.52
HERC1Q15751 Y_RNA.372-201ENST00000365599 102 ntBASIC-0.72□□□□□ -2.52
HERC1Q15751 MIR539-201ENST00000365690 78 ntBASIC-0.72□□□□□ -2.52
HERC1Q15751 Y_RNA.394-201ENST00000383942 103 ntBASIC-0.72□□□□□ -2.52
HERC1Q15751 SNORA75B-201ENST00000384053 137 ntBASIC-0.72□□□□□ -2.52
HERC1Q15751 Y_RNA.504-201ENST00000384481 104 ntBASIC-0.72□□□□□ -2.52
HERC1Q15751 AC010975.2-201ENST00000427781 588 ntBASIC-0.72□□□□□ -2.52
HERC1Q15751 VN1R10P-201ENST00000447106 875 ntBASIC-0.72□□□□□ -2.52
HERC1Q15751 AP000542.1-201ENST00000448473 371 ntBASIC-0.72□□□□□ -2.52
HERC1Q15751 RNU7-57P-201ENST00000459540 60 ntBASIC-0.72□□□□□ -2.52
HERC1Q15751 RNU6-221P-201ENST00000459541 99 ntBASIC-0.72□□□□□ -2.52
HERC1Q15751 RNU6-1315P-201ENST00000517187 99 ntBASIC-0.72□□□□□ -2.52
HERC1Q15751 MTND2P32-201ENST00000521584 1038 ntBASIC-0.72□□□□□ -2.52
HERC1Q15751 YWHAEP2-201ENST00000580066 112 ntBASIC-0.72□□□□□ -2.52
HERC1Q15751 Y_RNA.75-201ENST00000362927 97 ntBASIC-0.72□□□□□ -2.52
HERC1Q15751 RNU6-767P-201ENST00000384132 107 ntBASIC-0.72□□□□□ -2.52
HERC1Q15751 SNORD77.3-201ENST00000391113 65 ntBASIC-0.72□□□□□ -2.52
HERC1Q15751 EPS15P1-201ENST00000448836 336 ntBASIC-0.72□□□□□ -2.52
HERC1Q15751 NDUFB1P2-201ENST00000449477 176 ntBASIC-0.72□□□□□ -2.52
HERC1Q15751 AC108733.1-201ENST00000479244 705 ntTSL 3 BASIC-0.72□□□□□ -2.52
HERC1Q15751 RNU6-966P-201ENST00000516479 104 ntBASIC-0.72□□□□□ -2.52
HERC1Q15751 RNU6-143P-201ENST00000516942 93 ntBASIC-0.72□□□□□ -2.52
HERC1Q15751 MIR6888-201ENST00000621977 67 ntBASIC-0.72□□□□□ -2.52
HERC1Q15751 RNU6-131P-201ENST00000391144 107 ntBASIC-0.72□□□□□ -2.52
HERC1Q15751 AL359634.1-202ENST00000404721 284 ntBASIC-0.72□□□□□ -2.52
HERC1Q15751 RNU6-602P-201ENST00000411155 105 ntBASIC-0.72□□□□□ -2.52
HERC1Q15751 AL357793.1-201ENST00000448412 401 ntTSL 5 BASIC-0.72□□□□□ -2.52
HERC1Q15751 PLSCR5-AS1-201ENST00000473817 450 ntTSL 3 BASIC-0.72□□□□□ -2.52
HERC1Q15751 snoU2-30.1-201ENST00000365012 70 ntBASIC-0.72□□□□□ -2.53
HERC1Q15751 CoTC_ribozyme.1-201ENST00000408104 192 ntBASIC-0.72□□□□□ -2.53
HERC1Q15751 MIR548O-201ENST00000408583 114 ntBASIC-0.72□□□□□ -2.53
HERC1Q15751 RNU6ATAC41P-201ENST00000408600 126 ntBASIC-0.72□□□□□ -2.53
HERC1Q15751 ELOCP4-201ENST00000420090 333 ntBASIC-0.72□□□□□ -2.53
HERC1Q15751 UBE2D3P4-201ENST00000441973 436 ntBASIC-0.72□□□□□ -2.53
HERC1Q15751 Z83846.1-201ENST00000446798 265 ntBASIC-0.72□□□□□ -2.53
HERC1Q15751 AC010486.2-201ENST00000505572 483 ntBASIC-0.72□□□□□ -2.53
HERC1Q15751 AC093730.1-201ENST00000508825 448 ntTSL 3 BASIC-0.72□□□□□ -2.53
HERC1Q15751 RNU6-311P-201ENST00000516224 102 ntBASIC-0.72□□□□□ -2.53
HERC1Q15751 SNORA43.2-201ENST00000516652 128 ntBASIC-0.72□□□□□ -2.53
HERC1Q15751 Y_RNA.701-201ENST00000516812 110 ntBASIC-0.72□□□□□ -2.53
HERC1Q15751 AC009145.3-201ENST00000567386 476 ntTSL 3 BASIC-0.72□□□□□ -2.53
HERC1Q15751 SNORD11B-201ENST00000607707 90 ntBASIC-0.72□□□□□ -2.53
HERC1Q15751 TCL6_2.1-201ENST00000615162 119 ntBASIC-0.72□□□□□ -2.53
HERC1Q15751 AL669831.3-213ENST00000636676 183 ntBASIC-0.72□□□□□ -2.53
HERC1Q15751 Y_RNA.51-201ENST00000362725 102 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
HERC1Q15751 MIR626-201ENST00000385032 94 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
HERC1Q15751 MIR586-201ENST00000385035 97 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
HERC1Q15751 RNU4-22P-201ENST00000411058 166 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
HERC1Q15751 RPL35AP4-201ENST00000412007 102 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
HERC1Q15751 AC092755.1-201ENST00000441746 97 ntTSL 3 BASIC-0.73□□□□□ -2.53
HERC1Q15751 AC097635.1-201ENST00000450678 155 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
HERC1Q15751 AC023449.1-201ENST00000454464 154 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
HERC1Q15751 RNU7-182P-201ENST00000459009 62 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
HERC1Q15751 LYRM7-202ENST00000507584 317 ntTSL 2 BASIC-0.73□□□□□ -2.53
HERC1Q15751 SNORA15B-2-201ENST00000384058 135 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
HERC1Q15751 SNORA15B-1-201ENST00000384334 135 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
HERC1Q15751 MIR599-201ENST00000385069 95 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
HERC1Q15751 MIR519E-201ENST00000385075 84 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
HERC1Q15751 AC096949.1-201ENST00000412047 152 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
HERC1Q15751 RNU6-572P-201ENST00000516724 80 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
HERC1Q15751 AC145350.1-201ENST00000567426 208 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
HERC1Q15751 AC091588.1-201ENST00000578504 359 ntTSL 3 BASIC-0.73□□□□□ -2.53
HERC1Q15751 AC005972.2-201ENST00000604690 348 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
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