Protein–RNA interactions for Protein: Q15223

NECTIN1, Nectin-1, humanhuman

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Length 517 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NECTIN1Q15223 Pinc.1-201ENST00000616452 154 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
NECTIN1Q15223 AC025539.1-201ENST00000515343 4019 ntTSL 2 BASIC1.25□□□□□ -2.21
NECTIN1Q15223 RNU6-682P-201ENST00000363843 106 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
NECTIN1Q15223 RNU6-268P-201ENST00000364174 107 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
NECTIN1Q15223 Y_RNA.233-201ENST00000364407 101 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
NECTIN1Q15223 Y_RNA.412-201ENST00000384001 104 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
NECTIN1Q15223 MIR891A-201ENST00000401237 79 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
NECTIN1Q15223 Y_RNA.622-201ENST00000411091 108 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
NECTIN1Q15223 RNU2-55P-201ENST00000411146 174 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
NECTIN1Q15223 RNU6-1219P-201ENST00000516143 112 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
NECTIN1Q15223 AC006441.5-201ENST00000612680 209 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
NECTIN1Q15223 U6.106-201ENST00000636360 105 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
NECTIN1Q15223 Y_RNA.29-201ENST00000362570 113 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
NECTIN1Q15223 SNORD45.3-201ENST00000363836 72 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
NECTIN1Q15223 Y_RNA.336-201ENST00000365307 109 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
NECTIN1Q15223 MIR653-201ENST00000385279 96 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
NECTIN1Q15223 Y_RNA.793-201ENST00000411222 111 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
NECTIN1Q15223 MTND5P15-201ENST00000434246 349 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
NECTIN1Q15223 RNU7-120P-201ENST00000459334 63 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
NECTIN1Q15223 RNA5SP445-201ENST00000515889 115 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
NECTIN1Q15223 RNU6-917P-201ENST00000516294 104 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
NECTIN1Q15223 AC090142.3-201ENST00000519012 385 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
NECTIN1Q15223 AC109810.1-201ENST00000534066 224 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
NECTIN1Q15223 AP002392.1-201ENST00000537692 208 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
NECTIN1Q15223 SPTSSB-205ENST00000620149 231 ntAPPRIS P1 BASIC1.24□□□□□ -2.21
NECTIN1Q15223 MIR8063-201ENST00000621930 81 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
NECTIN1Q15223 AC106754.2-201ENST00000623006 233 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
NECTIN1Q15223 KTN1-205ENST00000395314 4618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC1.24□□□□□ -2.21
NECTIN1Q15223 Y_RNA.75-201ENST00000362927 97 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
NECTIN1Q15223 Y_RNA.91-201ENST00000363042 107 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
NECTIN1Q15223 Y_RNA.182-201ENST00000363880 111 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
NECTIN1Q15223 SNORD14E-201ENST00000364009 85 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
NECTIN1Q15223 Y_RNA.327-201ENST00000365201 102 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
NECTIN1Q15223 RNU4-70P-201ENST00000384579 139 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
NECTIN1Q15223 RNU4-43P-201ENST00000410628 137 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
NECTIN1Q15223 AC027119.1-201ENST00000440877 241 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
NECTIN1Q15223 AC023449.1-201ENST00000454464 154 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
NECTIN1Q15223 AC092991.1-201ENST00000477176 376 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
NECTIN1Q15223 AC079140.2-201ENST00000506193 142 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
NECTIN1Q15223 Y_RNA.797-201ENST00000515977 94 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
NECTIN1Q15223 Y_RNA.666-201ENST00000516187 112 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
NECTIN1Q15223 RNU6-902P-201ENST00000517212 91 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
NECTIN1Q15223 AC007751.1-201ENST00000529260 376 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
NECTIN1Q15223 MRPS18CP4-201ENST00000535821 231 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
NECTIN1Q15223 AC072026.1-201ENST00000605023 201 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
NECTIN1Q15223 MIR6078-201ENST00000611069 100 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
NECTIN1Q15223 NPPA-AS1_2.1-201ENST00000618496 149 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
NECTIN1Q15223 LRRIQ1-202ENST00000393217 5394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.22□□□□□ -2.21
NECTIN1Q15223 Y_RNA.66-201ENST00000362862 102 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
NECTIN1Q15223 RNU6-199P-201ENST00000362954 107 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
NECTIN1Q15223 Y_RNA.634-201ENST00000364811 113 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
NECTIN1Q15223 RNU6-275P-201ENST00000364910 107 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
NECTIN1Q15223 RNA5SP259-201ENST00000365541 109 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
NECTIN1Q15223 RNU6-442P-201ENST00000383968 104 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
NECTIN1Q15223 MIR548A2-201ENST00000384956 97 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
NECTIN1Q15223 RNU6ATAC2P-201ENST00000387943 126 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
NECTIN1Q15223 HMGN2P32-201ENST00000444648 269 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
NECTIN1Q15223 RNU6-1299P-201ENST00000516316 100 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
NECTIN1Q15223 RNU6-861P-201ENST00000516745 106 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
NECTIN1Q15223 AC032019.2-201ENST00000584916 403 ntTSL 5 BASIC1.22□□□□□ -2.21
NECTIN1Q15223 AC097639.2-201ENST00000603159 172 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
NECTIN1Q15223 ZNF415-224ENST00000601493 2132 ntTSL 1 (best) BASIC1.22□□□□□ -2.21
NECTIN1Q15223 AL161722.3-201ENST00000605789 2983 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
NECTIN1Q15223 GNPDA2-204ENST00000509756 5382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC1.21□□□□□ -2.22
NECTIN1Q15223 EYS-205ENST00000393380 5450 ntTSL 1 (best) BASIC1.21□□□□□ -2.22
NECTIN1Q15223 Y_RNA.240-201ENST00000364469 95 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
NECTIN1Q15223 RNU4-38P-201ENST00000364472 129 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
NECTIN1Q15223 RNU6-728P-201ENST00000365375 104 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
NECTIN1Q15223 SNORD61-201ENST00000384252 73 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
NECTIN1Q15223 MIR15B-201ENST00000385045 98 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
NECTIN1Q15223 RNU6-830P-201ENST00000516353 107 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
NECTIN1Q15223 RNA5SP153-201ENST00000516498 76 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
NECTIN1Q15223 RNU6-197P-201ENST00000516680 100 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
NECTIN1Q15223 MIR4662B-201ENST00000579498 81 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
NECTIN1Q15223 MIR4295-201ENST00000585286 85 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
NECTIN1Q15223 AL365434.2-201ENST00000607979 234 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
NECTIN1Q15223 FTX_2.1-201ENST00000618816 94 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
NECTIN1Q15223 BRDT-206ENST00000402388 3125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.2□□□□□ -2.22
NECTIN1Q15223 RNU6-312P-201ENST00000364629 107 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
NECTIN1Q15223 RNU6-392P-201ENST00000364926 101 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
NECTIN1Q15223 SNORA2.2-201ENST00000365473 135 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
NECTIN1Q15223 Y_RNA.432-201ENST00000384087 111 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
NECTIN1Q15223 MIR452-201ENST00000385020 85 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
NECTIN1Q15223 MIR516B2-201ENST00000385190 85 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
NECTIN1Q15223 PCNPP3-201ENST00000393579 471 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
NECTIN1Q15223 RNU5E-9P-201ENST00000411164 104 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
NECTIN1Q15223 AL121914.1-201ENST00000450188 156 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
NECTIN1Q15223 AC087343.1-201ENST00000477341 475 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
NECTIN1Q15223 AC074198.2-201ENST00000508153 258 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
NECTIN1Q15223 RNU6-182P-201ENST00000516970 105 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
NECTIN1Q15223 AC090049.2-201ENST00000550377 109 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
NECTIN1Q15223 MIR4498-201ENST00000577599 66 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
NECTIN1Q15223 AL359821.1-201ENST00000605519 182 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
NECTIN1Q15223 FAS-AS1.2-201ENST00000620386 170 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
NECTIN1Q15223 Y_RNA.23-201ENST00000362496 106 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
NECTIN1Q15223 RNU6-1065P-201ENST00000384513 106 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
NECTIN1Q15223 Y_RNA.547-201ENST00000384654 119 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
NECTIN1Q15223 SNORD41-201ENST00000386967 70 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
NECTIN1Q15223 RNU4-57P-201ENST00000515980 135 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
NECTIN1Q15223 RNU7-25P-201ENST00000516544 62 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
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