Protein–RNA interactions for Protein: Q14994

NR1I3, Nuclear receptor subfamily 1 group I member 3, humanhuman

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Length 352 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR1I3Q14994 RNU7-80P-201ENST00000459562 61 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
NR1I3Q14994 RNU6-109P-201ENST00000516364 107 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
NR1I3Q14994 RNU6-184P-201ENST00000516514 107 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
NR1I3Q14994 MIR5194-201ENST00000582634 120 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
NR1I3Q14994 CAPS2-203ENST00000393284 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.38□□□□□ -2.03
NR1I3Q14994 CCPG1-203ENST00000442196 3453 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.37□□□□□ -2.03
NR1I3Q14994 DNAH7-201ENST00000312428 12394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.37□□□□□ -2.03
NR1I3Q14994 Y_RNA.323-201ENST00000365157 109 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
NR1I3Q14994 RNA5SP37-201ENST00000365420 130 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
NR1I3Q14994 RNA5SP338-201ENST00000410495 85 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
NR1I3Q14994 SNORA31.4-201ENST00000516049 129 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
NR1I3Q14994 RNU7-181P-201ENST00000517234 74 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
NR1I3Q14994 IGKV3-31-201ENST00000523109 329 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
NR1I3Q14994 MIR5009-201ENST00000578736 100 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
NR1I3Q14994 SNORA28-201ENST00000606769 126 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
NR1I3Q14994 RNU6-94P-201ENST00000607728 107 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
NR1I3Q14994 AL449363.1-201ENST00000617815 186 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
NR1I3Q14994 PRKACB-204ENST00000370685 4481 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.36□□□□□ -2.03
NR1I3Q14994 RNU6-1131P-201ENST00000364955 107 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
NR1I3Q14994 SNORA27-201ENST00000384323 126 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
NR1I3Q14994 MIR29C-201ENST00000385231 88 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
NR1I3Q14994 AC015922.2-201ENST00000435593 184 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
NR1I3Q14994 RNU6-717P-201ENST00000459076 104 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
NR1I3Q14994 AC068339.1-201ENST00000526965 141 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
NR1I3Q14994 PLOD2-204ENST00000461497 3043 ntTSL 2 BASIC2.35□□□□□ -2.03
NR1I3Q14994 RNA5SP160-201ENST00000364866 120 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
NR1I3Q14994 MIR548D2-201ENST00000384955 97 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
NR1I3Q14994 MIR590-201ENST00000385008 97 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
NR1I3Q14994 AL627390.1-201ENST00000396055 340 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
NR1I3Q14994 RN7SKP200-201ENST00000410564 320 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
NR1I3Q14994 AC092783.1-201ENST00000435832 231 ntTSL 3 BASIC2.35□□□□□ -2.03
NR1I3Q14994 AC020594.1-201ENST00000437680 338 ntTSL 3 BASIC2.35□□□□□ -2.03
NR1I3Q14994 AC079804.2-201ENST00000490376 200 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
NR1I3Q14994 RNA5SP168-201ENST00000516642 112 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
NR1I3Q14994 MIR4658-201ENST00000584344 65 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
NR1I3Q14994 AC078899.2-201ENST00000595282 212 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
NR1I3Q14994 MALAT1-207ENST00000613376 132 ntTSL 3 BASIC2.35□□□□□ -2.03
NR1I3Q14994 COMMD6-213ENST00000626103 120 ntTSL 5 BASIC2.35□□□□□ -2.03
NR1I3Q14994 SI-201ENST00000264382 6011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.35□□□□□ -2.03
NR1I3Q14994 STX7-202ENST00000367941 15791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.34□□□□□ -2.03
NR1I3Q14994 SNORA5B-201ENST00000363786 132 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
NR1I3Q14994 Y_RNA.454-201ENST00000384224 113 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
NR1I3Q14994 MIR516B2-201ENST00000385190 85 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
NR1I3Q14994 SNORA11.1-201ENST00000408133 129 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
NR1I3Q14994 HMGN2P3-201ENST00000433603 273 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
NR1I3Q14994 HMGN2P5-201ENST00000436882 273 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
NR1I3Q14994 AC025033.1-201ENST00000463883 194 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
NR1I3Q14994 RNU7-12P-201ENST00000516030 62 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
NR1I3Q14994 RNVU1-2-201ENST00000516326 135 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
NR1I3Q14994 RNU7-6P-201ENST00000516845 62 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
NR1I3Q14994 AC090821.2-201ENST00000523552 176 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
NR1I3Q14994 MIR4778-201ENST00000577635 80 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
NR1I3Q14994 AC027279.3-201ENST00000625055 122 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
NR1I3Q14994 SAGE1-202ENST00000370709 2879 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.34□□□□□ -2.04
NR1I3Q14994 RNU6-49P-201ENST00000384256 107 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
NR1I3Q14994 MIR144-201ENST00000384886 86 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
NR1I3Q14994 MIR1283-2-201ENST00000408621 87 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
NR1I3Q14994 AC093850.1-201ENST00000454121 251 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
NR1I3Q14994 RNU7-45P-201ENST00000459460 63 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
NR1I3Q14994 RNA5SP82-201ENST00000516707 92 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
NR1I3Q14994 RNU1-40P-201ENST00000516816 164 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
NR1I3Q14994 RNU1-97P-201ENST00000516872 164 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
NR1I3Q14994 AC141557.1-201ENST00000540982 400 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
NR1I3Q14994 AL513534.2-201ENST00000603836 250 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
NR1I3Q14994 MUC15-202ENST00000436318 3118 ntTSL 5 BASIC2.33□□□□□ -2.04
NR1I3Q14994 FGF7-206ENST00000614567 3936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.33□□□□□ -2.04
NR1I3Q14994 USP53-202ENST00000450251 6072 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.33□□□□□ -2.04
NR1I3Q14994 LRRCC1-202ENST00000414626 4493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.32□□□□□ -2.04
NR1I3Q14994 OR2L2-202ENST00000641771 4300 ntAPPRIS P1 BASIC2.32□□□□□ -2.04
NR1I3Q14994 AC011124.2-201ENST00000518739 3222 ntTSL 1 (best) BASIC2.32□□□□□ -2.04
NR1I3Q14994 RNA5SP289-201ENST00000362332 137 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
NR1I3Q14994 SNORA38-201ENST00000363946 132 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
NR1I3Q14994 SNORA67.1-201ENST00000364749 141 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
NR1I3Q14994 RNU6-301P-201ENST00000384277 107 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
NR1I3Q14994 RNU6-1113P-201ENST00000384348 107 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
NR1I3Q14994 RNU6-424P-201ENST00000384367 105 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
NR1I3Q14994 AL034345.1-201ENST00000407768 123 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
NR1I3Q14994 AL512326.2-201ENST00000426359 151 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
NR1I3Q14994 CFLAR-AS1-202ENST00000474886 223 ntTSL 3 BASIC2.32□□□□□ -2.04
NR1I3Q14994 RNU6-998P-201ENST00000515894 101 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
NR1I3Q14994 SNORA40.13-201ENST00000516379 120 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
NR1I3Q14994 SCARNA16.3-201ENST00000516595 184 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
NR1I3Q14994 MIR3683-201ENST00000580847 82 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
NR1I3Q14994 MIR3163-201ENST00000581592 73 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
NR1I3Q14994 SAMD9L-201ENST00000318238 7134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.32□□□□□ -2.04
NR1I3Q14994 MIR302B-201ENST00000362188 73 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
NR1I3Q14994 SNORD73B-201ENST00000364394 72 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
NR1I3Q14994 RNA5SP138-201ENST00000365098 114 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
NR1I3Q14994 MIR1267-201ENST00000408723 78 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
NR1I3Q14994 RNU2-11P-201ENST00000459191 187 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
NR1I3Q14994 SNORD53-201ENST00000579969 78 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
NR1I3Q14994 AL161716.1-201ENST00000606365 273 ntTSL 5 BASIC2.31□□□□□ -2.04
NR1I3Q14994 SLITRK6-201ENST00000400286 4318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.31□□□□□ -2.04
NR1I3Q14994 NEDD4-205ENST00000506154 6751 ntTSL 1 (best) BASIC2.31□□□□□ -2.04
NR1I3Q14994 AL365361.1-201ENST00000566942 3481 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
NR1I3Q14994 RNU6-294P-201ENST00000364999 102 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
NR1I3Q14994 MIR488-201ENST00000365739 83 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
NR1I3Q14994 RNU6-1031P-201ENST00000384773 107 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
NR1I3Q14994 MIR483-201ENST00000385070 76 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
NR1I3Q14994 RNA5SP144-201ENST00000410846 116 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
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