Protein–RNA interactions for Protein: Q14993

COL19A1, Collagen alpha-1(XIX) chain, humanhuman

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Length 1,142 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL19A1Q14993 LIG4-203ENST00000442234 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.95□□□□□ -1.94
COL19A1Q14993 RAB6C-AS1-202ENST00000433431 123 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
COL19A1Q14993 snoU13.23-201ENST00000458863 104 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
COL19A1Q14993 RNA5SP148-201ENST00000516527 94 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
COL19A1Q14993 AC019288.1-201ENST00000557918 224 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
COL19A1Q14993 MIR4778-201ENST00000577635 80 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
COL19A1Q14993 MIR4529-201ENST00000578110 78 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
COL19A1Q14993 MIR4446-201ENST00000578505 67 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
COL19A1Q14993 MIR3683-201ENST00000580847 82 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
COL19A1Q14993 AL049779.4-201ENST00000604500 156 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
COL19A1Q14993 FRS2-201ENST00000397997 6550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.95□□□□□ -1.94
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COL19A1Q14993 RNU1-51P-201ENST00000365345 176 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
COL19A1Q14993 RNU6-675P-201ENST00000384236 104 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
COL19A1Q14993 Y_RNA.507-201ENST00000384500 99 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
COL19A1Q14993 TRAJ50-201ENST00000390487 60 ntAPPRIS P1 BASIC2.94□□□□□ -1.94
COL19A1Q14993 RNU1-143P-201ENST00000516296 146 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
COL19A1Q14993 RNU4ATAC3P-201ENST00000516699 126 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
COL19A1Q14993 TRAV1-1-201ENST00000542354 392 ntAPPRIS P1 BASIC2.94□□□□□ -1.94
COL19A1Q14993 AC022254.1-201ENST00000567857 235 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
COL19A1Q14993 SNORA28-201ENST00000606769 126 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
COL19A1Q14993 U1.23-201ENST00000610293 146 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
COL19A1Q14993 RNU1-68P-201ENST00000615382 146 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
COL19A1Q14993 CDKN2B-AS.1-201ENST00000617921 150 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
COL19A1Q14993 U1.36-201ENST00000620684 176 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
COL19A1Q14993 U1.39-201ENST00000621562 146 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
COL19A1Q14993 MIR376A2-201ENST00000636782 80 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
COL19A1Q14993 SAGE1-202ENST00000370709 2879 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.94□□□□□ -1.94
COL19A1Q14993 PIK3C2G-202ENST00000433979 4840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.94□□□□□ -1.94
COL19A1Q14993 MAPK10-266ENST00000641066 6555 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
COL19A1Q14993 RNU1-133P-201ENST00000364867 167 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
COL19A1Q14993 MIR524-201ENST00000385242 87 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
COL19A1Q14993 RNA5SP482-201ENST00000391269 118 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
COL19A1Q14993 RNA5SP501-201ENST00000410990 112 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
COL19A1Q14993 RNU6-938P-201ENST00000411285 103 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
COL19A1Q14993 LINC00407-201ENST00000426509 295 ntTSL 5 BASIC2.93□□□□□ -1.94
COL19A1Q14993 RNA5SP57-201ENST00000459463 123 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
COL19A1Q14993 RNU7-123P-201ENST00000515911 60 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
COL19A1Q14993 RNU7-193P-201ENST00000516723 65 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
COL19A1Q14993 MIR4666B-201ENST00000578142 81 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
COL19A1Q14993 MIR4305-201ENST00000583252 102 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
COL19A1Q14993 MIR8054-201ENST00000620877 86 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
COL19A1Q14993 AC010297.1-201ENST00000623948 149 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
COL19A1Q14993 JMJD1C-210ENST00000542921 8149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.93□□□□□ -1.94
COL19A1Q14993 FAM214A-201ENST00000261844 4217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.93□□□□□ -1.94
COL19A1Q14993 SACS-201ENST00000382292 15324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.92□□□□□ -1.94
COL19A1Q14993 U8.2-201ENST00000363156 134 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
COL19A1Q14993 RNU6-24P-201ENST00000384440 107 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
COL19A1Q14993 RNU6-950P-201ENST00000384651 107 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
COL19A1Q14993 RNU6-1104P-201ENST00000384723 104 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
COL19A1Q14993 RN7SKP200-201ENST00000410564 320 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
COL19A1Q14993 AC004941.2-201ENST00000427009 228 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
COL19A1Q14993 AL603825.1-201ENST00000438481 80 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
COL19A1Q14993 RNU7-61P-201ENST00000515897 61 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
COL19A1Q14993 SNORA64.4-201ENST00000516632 81 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
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COL19A1Q14993 MIR4694-201ENST00000578534 80 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
COL19A1Q14993 MIR4662A-201ENST00000637499 67 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
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COL19A1Q14993 AC108752.1-201ENST00000484679 576 ntTSL 5 BASIC2.91□□□□□ -1.94
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COL19A1Q14993 U7.3-201ENST00000616123 62 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
COL19A1Q14993 MIR6733-201ENST00000635723 61 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
COL19A1Q14993 CC2D2B-210ENST00000636965 3247 ntTSL 5 BASIC2.91□□□□□ -1.94
COL19A1Q14993 MBNL3-205ENST00000370857 8760 ntTSL 5 BASIC2.9□□□□□ -1.94
COL19A1Q14993 RNU6-787P-201ENST00000384032 107 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
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COL19A1Q14993 AL034345.1-201ENST00000407768 123 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
COL19A1Q14993 FTH1P12-201ENST00000432137 551 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
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COL19A1Q14993 RNU6-857P-201ENST00000515893 110 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
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COL19A1Q14993 AC007450.1-201ENST00000536492 188 ntTSL 3 BASIC2.9□□□□□ -1.95
COL19A1Q14993 MIR5588-201ENST00000581890 63 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
COL19A1Q14993 AC006441.5-201ENST00000612680 209 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
COL19A1Q14993 GCNT4-201ENST00000322348 5554 ntAPPRIS P1 BASIC2.9□□□□□ -1.95
COL19A1Q14993 OSTN-201ENST00000339051 402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
COL19A1Q14993 SNORD115-28-201ENST00000363931 81 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
COL19A1Q14993 snoU2-30.1-201ENST00000365012 70 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
COL19A1Q14993 RNU6-163P-201ENST00000384396 106 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
COL19A1Q14993 MIR548O-201ENST00000408583 114 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
COL19A1Q14993 RNA5SP274-201ENST00000410484 108 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
COL19A1Q14993 AC018511.2-201ENST00000413431 189 ntTSL 3 BASIC2.89□□□□□ -1.95
COL19A1Q14993 AC122707.1-201ENST00000502882 219 ntTSL 2 BASIC2.89□□□□□ -1.95
COL19A1Q14993 RNA5SP282-201ENST00000516355 108 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
COL19A1Q14993 DLEU2_5.2-201ENST00000610606 84 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
COL19A1Q14993 NBPF20-202ENST00000392971 18450 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
COL19A1Q14993 RNU6-661P-201ENST00000362409 107 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
COL19A1Q14993 Y_RNA.37-201ENST00000362606 108 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
COL19A1Q14993 RNU6-170P-201ENST00000362832 104 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
COL19A1Q14993 Y_RNA.73-201ENST00000362910 113 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
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