Protein–RNA interactions for Protein: Q14050

COL9A3, Collagen alpha-3(IX) chain, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 684 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL9A3Q14050 SIRT1-203ENST00000406900 3295 ntTSL 2 BASIC3.04□□□□□ -1.92
COL9A3Q14050 SNORD115-13-201ENST00000363358 82 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
COL9A3Q14050 SNORD115-16-201ENST00000363887 82 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
COL9A3Q14050 SNORD115-1-201ENST00000364961 82 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
COL9A3Q14050 SNORD77B-201ENST00000391112 67 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
COL9A3Q14050 RNU4-69P-201ENST00000410677 143 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
COL9A3Q14050 AL512326.2-201ENST00000426359 151 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
COL9A3Q14050 RN7SL636P-201ENST00000497504 294 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
COL9A3Q14050 RNA5SP320-201ENST00000516263 124 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
COL9A3Q14050 RNU7-28P-201ENST00000516759 62 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
COL9A3Q14050 AL513534.2-201ENST00000603836 250 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
COL9A3Q14050 NEDD4-208ENST00000508342 7235 ntTSL 1 (best) BASIC3.04□□□□□ -1.92
COL9A3Q14050 SENP7-205ENST00000394091 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.03□□□□□ -1.92
COL9A3Q14050 MIR95-201ENST00000385072 81 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
COL9A3Q14050 SNORA7.5-201ENST00000410672 110 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
COL9A3Q14050 AC108210.2-201ENST00000503681 201 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
COL9A3Q14050 SNORA48.11-201ENST00000517015 89 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
COL9A3Q14050 MIR3199-1-201ENST00000582434 88 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
COL9A3Q14050 AC002984.1-201ENST00000591692 448 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
COL9A3Q14050 AL356280.1-201ENST00000603614 379 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
COL9A3Q14050 AC021613.1-201ENST00000623880 111 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
COL9A3Q14050 NEB-218ENST00000603639 25578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.03□□□□□ -1.92
COL9A3Q14050 NEB-219ENST00000604864 25578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.03□□□□□ -1.92
COL9A3Q14050 FTX-214ENST00000638437 12267 ntTSL 5 BASIC3.03□□□□□ -1.92
COL9A3Q14050 TMPRSS11A-201ENST00000334830 3054 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC3.03□□□□□ -1.92
COL9A3Q14050 FOXP2-211ENST00000408937 6443 ntTSL 1 (best) BASIC3.03□□□□□ -1.92
COL9A3Q14050 LRRTM2-201ENST00000274711 6017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.03□□□□□ -1.92
COL9A3Q14050 RTL4-201ENST00000340433 2613 ntAPPRIS P1 BASIC3.03□□□□□ -1.93
COL9A3Q14050 SLC8A1-207ENST00000406785 20987 ntTSL 1 (best) BASIC3.03□□□□□ -1.93
COL9A3Q14050 DMD-203ENST00000357033 13956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.02□□□□□ -1.93
COL9A3Q14050 MGA-207ENST00000566586 14439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.02□□□□□ -1.93
COL9A3Q14050 HELZ-201ENST00000358691 13810 ntTSL 1 (best) BASIC3.02□□□□□ -1.93
COL9A3Q14050 Y_RNA.241-201ENST00000364470 117 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
COL9A3Q14050 RNU6-987P-201ENST00000384759 104 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
COL9A3Q14050 MIR591-201ENST00000385290 95 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
COL9A3Q14050 RNU2-63P-201ENST00000410792 194 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
COL9A3Q14050 ATP5J2P3-201ENST00000451550 258 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
COL9A3Q14050 RNU6-998P-201ENST00000515894 101 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
COL9A3Q14050 MIR4439-201ENST00000583746 80 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
COL9A3Q14050 MIR548Z-201ENST00000584743 97 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
COL9A3Q14050 XIST_intron.1-201ENST00000619444 68 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
COL9A3Q14050 ICE2P2-201ENST00000483823 2787 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
COL9A3Q14050 TUG1-202ENST00000521091 2110 ntTSL 1 (best) BASIC3.02□□□□□ -1.93
COL9A3Q14050 SNORD116-10-201ENST00000363791 102 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
COL9A3Q14050 SNORA25.6-201ENST00000364121 118 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
COL9A3Q14050 RNA5SP139-201ENST00000364340 117 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
COL9A3Q14050 RNU6-219P-201ENST00000364728 107 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
COL9A3Q14050 RNU6-424P-201ENST00000384367 105 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
COL9A3Q14050 RNA5SP344-201ENST00000411081 104 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
COL9A3Q14050 AC068295.1-201ENST00000413056 153 ntTSL 3 BASIC3.01□□□□□ -1.93
COL9A3Q14050 RNU7-113P-201ENST00000459273 62 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
COL9A3Q14050 RNU6-267P-201ENST00000516714 103 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
COL9A3Q14050 MIR4668-201ENST00000582284 70 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
COL9A3Q14050 MIR4506-201ENST00000584693 77 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
COL9A3Q14050 AC095038.3-201ENST00000634439 195 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
COL9A3Q14050 AC110079.1-202ENST00000635213 138 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
COL9A3Q14050 KNL1-204ENST00000527044 5404 ntTSL 5 BASIC3.01□□□□□ -1.93
COL9A3Q14050 RICTOR-202ENST00000357387 9543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.01□□□□□ -1.93
COL9A3Q14050 CREBRF-201ENST00000296953 7778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3□□□□□ -1.93
COL9A3Q14050 RNU6-859P-201ENST00000362728 107 ntBASIC3□□□□□ -1.93
COL9A3Q14050 RNU1-23P-201ENST00000363361 144 ntBASIC3□□□□□ -1.93
COL9A3Q14050 RNA5SP99-201ENST00000364020 114 ntBASIC3□□□□□ -1.93
COL9A3Q14050 MIR561-201ENST00000385216 97 ntBASIC3□□□□□ -1.93
COL9A3Q14050 RNU6-679P-201ENST00000391003 106 ntBASIC3□□□□□ -1.93
COL9A3Q14050 RNU6-482P-201ENST00000391068 107 ntBASIC3□□□□□ -1.93
COL9A3Q14050 MIR889-201ENST00000401280 79 ntBASIC3□□□□□ -1.93
COL9A3Q14050 RNU4-37P-201ENST00000410214 84 ntBASIC3□□□□□ -1.93
COL9A3Q14050 Y_RNA.620-201ENST00000411009 88 ntBASIC3□□□□□ -1.93
COL9A3Q14050 CST2P1-201ENST00000425770 87 ntBASIC3□□□□□ -1.93
COL9A3Q14050 AL163195.1-201ENST00000496941 348 ntBASIC3□□□□□ -1.93
COL9A3Q14050 LINC02269-201ENST00000509968 511 ntTSL 3 BASIC3□□□□□ -1.93
COL9A3Q14050 DEFB122-202ENST00000569013 197 ntBASIC3□□□□□ -1.93
COL9A3Q14050 MIR3152-201ENST00000579801 74 ntBASIC3□□□□□ -1.93
COL9A3Q14050 SNORD53-201ENST00000579969 78 ntBASIC3□□□□□ -1.93
COL9A3Q14050 AC012254.1-201ENST00000592747 200 ntTSL 3 BASIC3□□□□□ -1.93
COL9A3Q14050 MIR7515-201ENST00000637837 67 ntBASIC3□□□□□ -1.93
COL9A3Q14050 HMHB1-202ENST00000638299 126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3□□□□□ -1.93
COL9A3Q14050 CHST9-202ENST00000581714 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3□□□□□ -1.93
COL9A3Q14050 HDX-206ENST00000506585 6158 ntTSL 2 BASIC3□□□□□ -1.93
COL9A3Q14050 AC091152.2-201ENST00000591628 2569 ntBASIC3□□□□□ -1.93
COL9A3Q14050 SAGE1-201ENST00000324447 2952 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.99□□□□□ -1.93
COL9A3Q14050 ARHGAP15-202ENST00000409869 2968 ntTSL 5 BASIC2.99□□□□□ -1.93
COL9A3Q14050 RNU2-40P-201ENST00000410833 196 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
COL9A3Q14050 SRIP3-201ENST00000413200 219 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
COL9A3Q14050 AL590705.2-201ENST00000420204 281 ntTSL 5 BASIC2.99□□□□□ -1.93
COL9A3Q14050 AL591806.2-201ENST00000433122 173 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
COL9A3Q14050 RNA5SP24-201ENST00000516478 95 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
COL9A3Q14050 AL078612.1-201ENST00000533009 150 ntTSL 5 BASIC2.99□□□□□ -1.93
COL9A3Q14050 AL512310.12-203ENST00000640543 90 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
COL9A3Q14050 AC091304.10-201ENST00000641554 121 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
COL9A3Q14050 VPS54-202ENST00000354504 3594 ntTSL 1 (best) BASIC2.98□□□□□ -1.93
COL9A3Q14050 SNORD115-34-201ENST00000362441 82 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
COL9A3Q14050 SNORD115-12-201ENST00000362583 82 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
COL9A3Q14050 SNORD115-29-201ENST00000362834 82 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
COL9A3Q14050 SNORD115-9-201ENST00000362912 82 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
COL9A3Q14050 SNORD115-21-201ENST00000362963 81 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
COL9A3Q14050 SNORD115-14-201ENST00000363090 81 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
COL9A3Q14050 SNORD115-41-201ENST00000363608 82 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
COL9A3Q14050 SNORD115-11-201ENST00000363616 82 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
COL9A3Q14050 SNORD115-5-201ENST00000363633 82 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
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