Protein–RNA interactions for Protein: Q13278

RIG, Putative protein RIG, humanhuman

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Length 110 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIGQ13278 AL162400.2-201ENST00000427547 157 ntTSL 3 BASIC1.24□□□□□ -2.21
RIGQ13278 KRTAP19-11P-201ENST00000439851 104 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
RIGQ13278 GHRL-208ENST00000439975 326 ntTSL 1 (best) BASIC1.24□□□□□ -2.21
RIGQ13278 AC008892.1-201ENST00000511861 384 ntTSL 3 BASIC1.24□□□□□ -2.21
RIGQ13278 RNU5E-3P-201ENST00000515913 68 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
RIGQ13278 RNU6-406P-201ENST00000516470 107 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
RIGQ13278 RNU6-1234P-201ENST00000516877 103 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
RIGQ13278 RNU2-60P-201ENST00000517290 128 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
RIGQ13278 AL358944.1-201ENST00000528537 144 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
RIGQ13278 MIR1273D-201ENST00000577266 86 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
RIGQ13278 MIR4762-201ENST00000585261 75 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
RIGQ13278 AC097639.2-201ENST00000603159 172 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
RIGQ13278 ZNRD1-AS1_3.8-201ENST00000611686 104 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
RIGQ13278 hsa-mir-4536-1.1-201ENST00000636519 88 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
RIGQ13278 AC010332.2-201ENST00000613083 1904 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
RIGQ13278 RNU6-915P-201ENST00000364943 103 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
RIGQ13278 Y_RNA.343-201ENST00000365354 112 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
RIGQ13278 SNORA70.4-201ENST00000365509 134 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
RIGQ13278 Y_RNA.494-201ENST00000384432 111 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
RIGQ13278 Y_RNA.547-201ENST00000384654 119 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
RIGQ13278 MIR526A1-201ENST00000384897 85 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
RIGQ13278 MIR613-201ENST00000385248 95 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
RIGQ13278 SNORD77.3-201ENST00000391113 65 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
RIGQ13278 SNORA75.5-201ENST00000391291 81 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
RIGQ13278 SNORA48.7-201ENST00000391302 135 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
RIGQ13278 RNU2-55P-201ENST00000411146 174 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
RIGQ13278 RPL30P13-201ENST00000418873 348 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
RIGQ13278 SNRPGP13-201ENST00000442212 177 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
RIGQ13278 RNU1-98P-201ENST00000458992 160 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
RIGQ13278 RNU6-1211P-201ENST00000459179 105 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
RIGQ13278 SNORD36C-201ENST00000516733 66 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
RIGQ13278 RNU7-181P-201ENST00000517234 74 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
RIGQ13278 CEP57L1-213ENST00000520883 2055 ntTSL 5 BASIC1.22□□□□□ -2.21
RIGQ13278 SLC9C2-201ENST00000367714 4428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.22□□□□□ -2.21
RIGQ13278 Y_RNA.52-201ENST00000362760 96 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
RIGQ13278 RNU6-457P-201ENST00000363999 107 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
RIGQ13278 Y_RNA.218-201ENST00000364218 104 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
RIGQ13278 SNORA25.7-201ENST00000364375 127 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
RIGQ13278 RNU6-442P-201ENST00000383968 104 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
RIGQ13278 MIR570-201ENST00000384917 97 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
RIGQ13278 MIR660-201ENST00000385235 97 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
RIGQ13278 TRAJ2-201ENST00000390535 66 ntAPPRIS P1 BASIC1.22□□□□□ -2.21
RIGQ13278 RNA5SP171-201ENST00000391071 115 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
RIGQ13278 AL135790.1-201ENST00000427161 157 ntTSL 3 BASIC1.22□□□□□ -2.21
RIGQ13278 TTTY16-201ENST00000437686 192 ntTSL 1 (best) BASIC1.22□□□□□ -2.21
RIGQ13278 RNA5SP153-201ENST00000516498 76 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
RIGQ13278 AC090142.3-201ENST00000519012 385 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
RIGQ13278 IGHVIII-67-2-201ENST00000519849 88 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
RIGQ13278 KIAA1551-201ENST00000312561 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.22□□□□□ -2.21
RIGQ13278 AC092881.1-201ENST00000638218 2733 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
RIGQ13278 ZNF732-201ENST00000419098 2193 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC1.21□□□□□ -2.22
RIGQ13278 MIR342-201ENST00000362212 99 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
RIGQ13278 RNU6-888P-201ENST00000363010 101 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
RIGQ13278 RNU6-309P-201ENST00000364573 106 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
RIGQ13278 RNU6-597P-201ENST00000365620 102 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
RIGQ13278 RPS27P16-201ENST00000425758 201 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
RIGQ13278 DIP2A-IT1-201ENST00000442434 428 ntTSL 2 BASIC1.21□□□□□ -2.22
RIGQ13278 TMSB4XP3-201ENST00000445144 114 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
RIGQ13278 AL392103.1-201ENST00000447000 198 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
RIGQ13278 CYCTP-201ENST00000504253 315 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
RIGQ13278 SNORA18.4-201ENST00000516440 124 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
RIGQ13278 RNU6-504P-201ENST00000516568 104 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
RIGQ13278 Y_RNA.714-201ENST00000517065 90 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
RIGQ13278 MIR4662B-201ENST00000579498 81 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
RIGQ13278 AC132825.6-201ENST00000638861 357 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
RIGQ13278 RNU6-235P-201ENST00000362644 107 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
RIGQ13278 Y_RNA.261-201ENST00000364631 102 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
RIGQ13278 RNU6-938P-201ENST00000411285 103 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
RIGQ13278 AC015922.2-201ENST00000435593 184 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
RIGQ13278 HSPE1P19-201ENST00000603327 295 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
RIGQ13278 AC011603.4-201ENST00000611325 277 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
RIGQ13278 AC006441.5-201ENST00000612680 209 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
RIGQ13278 AL365222.1-201ENST00000614661 98 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
RIGQ13278 ZGRF1-208ENST00000505019 6652 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.19□□□□□ -2.22
RIGQ13278 CTDSPL2-202ENST00000558373 4255 ntTSL 1 (best) BASIC1.19□□□□□ -2.22
RIGQ13278 CXADR-202ENST00000356275 270 ntTSL 1 (best) BASIC1.19□□□□□ -2.22
RIGQ13278 Y_RNA.37-201ENST00000362606 108 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
RIGQ13278 SNORD115-28-201ENST00000363931 81 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
RIGQ13278 SNORA40-201ENST00000388090 126 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
RIGQ13278 SNORD28B-201ENST00000390993 75 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
RIGQ13278 Y_RNA.584-201ENST00000391090 114 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
RIGQ13278 MIR891A-201ENST00000401237 79 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
RIGQ13278 AL135923.1-201ENST00000413066 196 ntTSL 3 BASIC1.19□□□□□ -2.22
RIGQ13278 AC092783.1-201ENST00000435832 231 ntTSL 3 BASIC1.19□□□□□ -2.22
RIGQ13278 RNU7-107P-201ENST00000459121 61 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
RIGQ13278 RNU6-1149P-201ENST00000516810 97 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
RIGQ13278 SNORA18.7-201ENST00000516910 131 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
RIGQ13278 EIF4BP1-201ENST00000554881 351 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
RIGQ13278 AL160236.1-201ENST00000556317 195 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
RIGQ13278 MIR3646-201ENST00000578301 84 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
RIGQ13278 AL365205.2-201ENST00000594586 68 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
RIGQ13278 AL391516.1-201ENST00000554380 2449 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
RIGQ13278 JMJD1C-212ENST00000639129 7901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.18□□□□□ -2.22
RIGQ13278 RNU1-42P-201ENST00000364033 160 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
RIGQ13278 SNORD24-201ENST00000383884 75 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
RIGQ13278 SNORA26-201ENST00000391286 122 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
RIGQ13278 RNU6-955P-201ENST00000410497 104 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
RIGQ13278 RNA5SP127-201ENST00000411051 133 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
RIGQ13278 AC131956.1-201ENST00000506420 258 ntTSL 2 BASIC1.18□□□□□ -2.22
RIGQ13278 RNU4-57P-201ENST00000515980 135 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
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