Protein–RNA interactions for Protein: Q13114

TRAF3, TNF receptor-associated factor 3, humanhuman

Predictions only

Length 568 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF3Q13114 Y_RNA.343-201ENST00000365354 112 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
TRAF3Q13114 SNORD61-201ENST00000384252 73 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
TRAF3Q13114 Y_RNA.488-201ENST00000384403 102 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
TRAF3Q13114 Y_RNA.542-201ENST00000384641 111 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
TRAF3Q13114 MIR613-201ENST00000385248 95 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
TRAF3Q13114 SNORD37.2-201ENST00000391075 66 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
TRAF3Q13114 AC110009.1-201ENST00000512965 451 ntTSL 5 BASIC1.56□□□□□ -2.16
TRAF3Q13114 Y_RNA.666-201ENST00000516187 112 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
TRAF3Q13114 AL365205.2-201ENST00000594586 68 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
TRAF3Q13114 AC103810.8-201ENST00000607347 118 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
TRAF3Q13114 TP73-AS1.1-201ENST00000611447 161 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
TRAF3Q13114 SENP7-201ENST00000314261 4736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.56□□□□□ -2.16
TRAF3Q13114 AL442644.1-201ENST00000454390 3105 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
TRAF3Q13114 RNU6-1123P-201ENST00000362347 106 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
TRAF3Q13114 RNU6-661P-201ENST00000362409 107 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
TRAF3Q13114 RNU4-11P-201ENST00000365287 132 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
TRAF3Q13114 SNORD38C-201ENST00000384381 69 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
TRAF3Q13114 RNU6-997P-201ENST00000384725 107 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
TRAF3Q13114 MIR660-201ENST00000385235 97 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
TRAF3Q13114 TRAJ23-201ENST00000390514 63 ntAPPRIS P1 BASIC1.55□□□□□ -2.16
TRAF3Q13114 RNU6-482P-201ENST00000391068 107 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
TRAF3Q13114 SNORA26.9-201ENST00000391322 122 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
TRAF3Q13114 MIR513C-201ENST00000401352 84 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
TRAF3Q13114 RNU6-693P-201ENST00000516134 107 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
TRAF3Q13114 RNU6-346P-201ENST00000516288 111 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
TRAF3Q13114 RNU6-1116P-201ENST00000517269 99 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
TRAF3Q13114 AC112693.2-201ENST00000556538 232 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
TRAF3Q13114 MIR3658-201ENST00000636291 56 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
TRAF3Q13114 BRCA1-202ENST00000354071 4497 ntTSL 1 (best) BASIC1.55□□□□□ -2.16
TRAF3Q13114 RNU6-1292P-201ENST00000383856 107 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
TRAF3Q13114 AL135790.1-201ENST00000427161 157 ntTSL 3 BASIC1.54□□□□□ -2.16
TRAF3Q13114 AL353747.2-201ENST00000439207 205 ntTSL 3 BASIC1.54□□□□□ -2.16
TRAF3Q13114 RNU6-830P-201ENST00000516353 107 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
TRAF3Q13114 SNORD3E-202ENST00000627253 216 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
TRAF3Q13114 RNU6-187P-201ENST00000384139 106 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
TRAF3Q13114 MIR194-1-201ENST00000384892 85 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
TRAF3Q13114 MIR548A2-201ENST00000384956 97 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
TRAF3Q13114 MIR452-201ENST00000385020 85 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
TRAF3Q13114 MIR624-201ENST00000385217 97 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
TRAF3Q13114 5S_rRNA.2-201ENST00000391293 112 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
TRAF3Q13114 MIR548O-201ENST00000408583 114 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
TRAF3Q13114 RNU4-61P-201ENST00000411243 107 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
TRAF3Q13114 AC015922.2-201ENST00000435593 184 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
TRAF3Q13114 RNU6-789P-201ENST00000517105 102 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
TRAF3Q13114 AC007751.1-201ENST00000529260 376 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
TRAF3Q13114 AP001485.1-201ENST00000604799 199 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
TRAF3Q13114 MIR502-201ENST00000606349 86 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
TRAF3Q13114 AC134878.1-201ENST00000619901 243 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
TRAF3Q13114 CENPQ-201ENST00000335783 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.52□□□□□ -2.17
TRAF3Q13114 RNU6-414P-201ENST00000363705 104 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
TRAF3Q13114 RNU6-704P-201ENST00000364162 103 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
TRAF3Q13114 RNU6-818P-201ENST00000364837 108 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
TRAF3Q13114 Y_RNA.410-201ENST00000383992 113 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
TRAF3Q13114 MIR518F-201ENST00000384973 87 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
TRAF3Q13114 MIR569-201ENST00000385228 96 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
TRAF3Q13114 RNU6-588P-201ENST00000410281 105 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
TRAF3Q13114 RNA5SP127-201ENST00000411051 133 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
TRAF3Q13114 AC004965.1-201ENST00000413033 213 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
TRAF3Q13114 AL360175.1-201ENST00000426547 285 ntTSL 5 BASIC1.52□□□□□ -2.17
TRAF3Q13114 JTBP1-201ENST00000441314 247 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
TRAF3Q13114 AC131956.1-201ENST00000506420 258 ntTSL 2 BASIC1.52□□□□□ -2.17
TRAF3Q13114 RNU6-1270P-201ENST00000517128 108 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
TRAF3Q13114 AL353997.5-201ENST00000618886 171 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
TRAF3Q13114 SNORD115-28-201ENST00000363931 81 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
TRAF3Q13114 Y_RNA.251-201ENST00000364551 99 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
TRAF3Q13114 RNU6-1082P-201ENST00000364574 107 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
TRAF3Q13114 RNU6-203P-201ENST00000384038 104 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
TRAF3Q13114 Y_RNA.547-201ENST00000384654 119 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
TRAF3Q13114 Y_RNA.568-201ENST00000384742 113 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
TRAF3Q13114 AL161935.2-201ENST00000414627 60 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
TRAF3Q13114 AC087499.4-201ENST00000448505 178 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
TRAF3Q13114 HMGN2P23-201ENST00000456759 269 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
TRAF3Q13114 RNU7-197P-201ENST00000458836 62 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
TRAF3Q13114 SNORA18.4-201ENST00000516440 124 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
TRAF3Q13114 RNU7-25P-201ENST00000516544 62 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
TRAF3Q13114 MIR3683-201ENST00000580847 82 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
TRAF3Q13114 TDRD15-202ENST00000622654 5805 ntAPPRIS P1 BASIC1.51□□□□□ -2.17
TRAF3Q13114 RNA5SP99-201ENST00000364020 114 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
TRAF3Q13114 SNORA1-201ENST00000384107 130 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
TRAF3Q13114 RNU6-439P-201ENST00000384188 106 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
TRAF3Q13114 Y_RNA.497-201ENST00000384447 98 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
TRAF3Q13114 MIR136-201ENST00000385207 82 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
TRAF3Q13114 MIR320A-201ENST00000385302 82 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
TRAF3Q13114 CYCSP49-201ENST00000420810 319 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
TRAF3Q13114 DIP2A-IT1-201ENST00000442434 428 ntTSL 2 BASIC1.5□□□□□ -2.17
TRAF3Q13114 AC092991.1-201ENST00000477176 376 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
TRAF3Q13114 MIR3129-201ENST00000581095 76 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
TRAF3Q13114 AC131055.1-201ENST00000584626 316 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
TRAF3Q13114 ZNF415-224ENST00000601493 2132 ntTSL 1 (best) BASIC1.5□□□□□ -2.17
TRAF3Q13114 Y_RNA.37-201ENST00000362606 108 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
TRAF3Q13114 Y_RNA.584-201ENST00000391090 114 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
TRAF3Q13114 SNORD77.3-201ENST00000391113 65 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
TRAF3Q13114 MIR1323-201ENST00000408090 73 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
TRAF3Q13114 AF228730.3-201ENST00000436691 102 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
TRAF3Q13114 TMSB4XP3-201ENST00000445144 114 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
TRAF3Q13114 SNORA25.12-201ENST00000516202 82 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
TRAF3Q13114 SNORA25.15-201ENST00000516487 89 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
TRAF3Q13114 MIR4778-201ENST00000577635 80 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
TRAF3Q13114 SNORA77B-201ENST00000578179 125 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
TRAF3Q13114 MIR4285-201ENST00000581001 85 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 167.9 ms