Protein–RNA interactions for Protein: Q9C009

FOXQ1, Forkhead box protein Q1, humanhuman

Predictions only

Length 403 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXQ1Q9C009 AC091932.4-201ENST00000623386 200 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
FOXQ1Q9C009 AC068631.1-220ENST00000630726 256 ntTSL 5 BASIC2.66□□□□□ -1.98
FOXQ1Q9C009 AL355596.1-201ENST00000565399 3996 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
FOXQ1Q9C009 CHST9-202ENST00000581714 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.66□□□□□ -1.98
FOXQ1Q9C009 SIRT1-203ENST00000406900 3295 ntTSL 2 BASIC2.66□□□□□ -1.98
FOXQ1Q9C009 KIAA1107-202ENST00000636278 4065 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.65□□□□□ -1.98
FOXQ1Q9C009 MIR26A1-201ENST00000362205 77 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
FOXQ1Q9C009 RNU4-16P-201ENST00000364737 141 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
FOXQ1Q9C009 RNU6-294P-201ENST00000364999 102 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
FOXQ1Q9C009 RNU6-1113P-201ENST00000384348 107 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
FOXQ1Q9C009 RNU6-163P-201ENST00000384396 106 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
FOXQ1Q9C009 MIR759-201ENST00000390224 91 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
FOXQ1Q9C009 MIR1302-4-201ENST00000408701 150 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
FOXQ1Q9C009 RN7SKP223-201ENST00000410582 62 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
FOXQ1Q9C009 AL591806.2-201ENST00000433122 173 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
FOXQ1Q9C009 AC087499.4-201ENST00000448505 178 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
FOXQ1Q9C009 RNU7-26P-201ENST00000458980 63 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
FOXQ1Q9C009 RNA5SP282-201ENST00000516355 108 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
FOXQ1Q9C009 SNORA40.13-201ENST00000516379 120 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
FOXQ1Q9C009 AC015712.3-201ENST00000559380 164 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
FOXQ1Q9C009 MIR5094-201ENST00000578766 85 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
FOXQ1Q9C009 MIR4305-201ENST00000583252 102 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
FOXQ1Q9C009 SNORA28-201ENST00000606769 126 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
FOXQ1Q9C009 SPTSSB-205ENST00000620149 231 ntAPPRIS P1 BASIC2.65□□□□□ -1.99
FOXQ1Q9C009 SNORA50A-202ENST00000629536 136 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
FOXQ1Q9C009 AC025539.1-201ENST00000515343 4019 ntTSL 2 BASIC2.65□□□□□ -1.99
FOXQ1Q9C009 ANKRD18EP-201ENST00000405487 2632 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
FOXQ1Q9C009 CC2D2B-210ENST00000636965 3247 ntTSL 5 BASIC2.64□□□□□ -1.99
FOXQ1Q9C009 CAPS2-203ENST00000393284 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.64□□□□□ -1.99
FOXQ1Q9C009 TFEC-202ENST00000320239 6605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.64□□□□□ -1.99
FOXQ1Q9C009 MIR488-201ENST00000365739 83 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
FOXQ1Q9C009 SNORD38C-201ENST00000384381 69 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
FOXQ1Q9C009 SNX2P2-201ENST00000424553 323 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
FOXQ1Q9C009 LINC00393-201ENST00000443621 282 ntTSL 3 BASIC2.64□□□□□ -1.99
FOXQ1Q9C009 UBBP3-201ENST00000445497 241 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
FOXQ1Q9C009 AC108210.2-201ENST00000503681 201 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
FOXQ1Q9C009 RNU2-35P-201ENST00000516446 142 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
FOXQ1Q9C009 SNORA31.10-201ENST00000516482 106 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
FOXQ1Q9C009 AC021785.1-201ENST00000520780 453 ntTSL 3 BASIC2.64□□□□□ -1.99
FOXQ1Q9C009 AC008264.2-201ENST00000610193 3731 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
FOXQ1Q9C009 ZNF470-202ENST00000391709 6601 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.64□□□□□ -1.99
FOXQ1Q9C009 MIRLET7C-201ENST00000362160 84 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
FOXQ1Q9C009 MIR342-201ENST00000362212 99 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
FOXQ1Q9C009 RNU1-148P-201ENST00000384472 162 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
FOXQ1Q9C009 Y_RNA.544-201ENST00000384650 113 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
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FOXQ1Q9C009 AL162400.2-201ENST00000427547 157 ntTSL 3 BASIC2.63□□□□□ -1.99
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FOXQ1Q9C009 AC005703.2-201ENST00000453339 343 ntTSL 2 BASIC2.61□□□□□ -1.99
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FOXQ1Q9C009 CDKN2B-AS.1-201ENST00000617921 150 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
FOXQ1Q9C009 SIRT1-202ENST00000403579 3333 ntTSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -1.99
FOXQ1Q9C009 OR2J3-203ENST00000641960 3342 ntAPPRIS P1 BASIC2.59□□□□□ -1.99
FOXQ1Q9C009 Y_RNA.241-201ENST00000364470 117 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
FOXQ1Q9C009 TRAJ41-201ENST00000390496 62 ntAPPRIS P1 BASIC2.59□□□□□ -1.99
FOXQ1Q9C009 HMGN2P3-201ENST00000433603 273 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
FOXQ1Q9C009 HMGN2P5-201ENST00000436882 273 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
FOXQ1Q9C009 RNA5SP137-201ENST00000516833 135 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
FOXQ1Q9C009 MIR3683-201ENST00000580847 82 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
FOXQ1Q9C009 AGL-204ENST00000370161 6923 ntTSL 5 BASIC2.59□□□□□ -2
FOXQ1Q9C009 MACC1-202ENST00000400331 9159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.59□□□□□ -2
FOXQ1Q9C009 OR4K2-204ENST00000641885 8681 ntAPPRIS P1 BASIC2.58□□□□□ -2
FOXQ1Q9C009 SNORA38-201ENST00000363946 132 ntBASIC2.58□□□□□ -2
FOXQ1Q9C009 SNORA27-201ENST00000384323 126 ntBASIC2.58□□□□□ -2
FOXQ1Q9C009 Y_RNA.494-201ENST00000384432 111 ntBASIC2.58□□□□□ -2
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