Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEK5

ZNF548, Zinc finger protein 548, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 533 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF548Q8NEK5 RNU6-1019P-201ENST00000364424 107 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
ZNF548Q8NEK5 MIR539-201ENST00000365690 78 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
ZNF548Q8NEK5 MIR597-201ENST00000384968 97 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
ZNF548Q8NEK5 SNORA12.1-201ENST00000390873 148 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
ZNF548Q8NEK5 SNORD72-201ENST00000390994 80 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
ZNF548Q8NEK5 RNU11-3P-201ENST00000391111 133 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
ZNF548Q8NEK5 RN7SL274P-201ENST00000492268 272 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
ZNF548Q8NEK5 AC122707.1-201ENST00000502882 219 ntTSL 2 BASIC1.85□□□□□ -2.11
ZNF548Q8NEK5 RNU6-971P-201ENST00000516920 106 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
ZNF548Q8NEK5 RNU6-365P-201ENST00000517113 106 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
ZNF548Q8NEK5 AC007751.1-201ENST00000529260 376 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
ZNF548Q8NEK5 AC084364.2-201ENST00000546924 395 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
ZNF548Q8NEK5 MIR4287-201ENST00000579398 78 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
ZNF548Q8NEK5 CERS6-AS1-202ENST00000594898 499 ntTSL 5 BASIC1.85□□□□□ -2.11
ZNF548Q8NEK5 AL365222.1-201ENST00000614661 98 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
ZNF548Q8NEK5 Y_RNA.242-201ENST00000364473 110 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
ZNF548Q8NEK5 SNORD24-201ENST00000383884 75 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
ZNF548Q8NEK5 RNU6-1336P-201ENST00000383886 109 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
ZNF548Q8NEK5 TRAJ2-201ENST00000390535 66 ntAPPRIS P1 BASIC1.84□□□□□ -2.11
ZNF548Q8NEK5 RNA5SP489-201ENST00000410986 109 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
ZNF548Q8NEK5 CFLAR-AS1-202ENST00000474886 223 ntTSL 3 BASIC1.84□□□□□ -2.11
ZNF548Q8NEK5 Y_RNA.714-201ENST00000517065 90 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
ZNF548Q8NEK5 AP001328.1-201ENST00000528550 176 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
ZNF548Q8NEK5 AP000942.3-201ENST00000603702 160 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
ZNF548Q8NEK5 AC069114.2-201ENST00000604699 304 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
ZNF548Q8NEK5 TBL1XR1-208ENST00000430069 7948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.84□□□□□ -2.12
ZNF548Q8NEK5 GABRA2-209ENST00000510861 3411 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.83□□□□□ -2.12
ZNF548Q8NEK5 LRRD1-203ENST00000430130 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.83□□□□□ -2.12
ZNF548Q8NEK5 RNA5SP276-201ENST00000362580 94 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
ZNF548Q8NEK5 RNU6-888P-201ENST00000363010 101 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
ZNF548Q8NEK5 SNORA22C-201ENST00000384614 134 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
ZNF548Q8NEK5 MIR548A2-201ENST00000384956 97 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
ZNF548Q8NEK5 MIR17-201ENST00000385012 84 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
ZNF548Q8NEK5 MIR9-3-201ENST00000385084 90 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
ZNF548Q8NEK5 MIR624-201ENST00000385217 97 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
ZNF548Q8NEK5 Y_RNA.584-201ENST00000391090 114 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
ZNF548Q8NEK5 AC245047.3-201ENST00000429428 127 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
ZNF548Q8NEK5 AC008267.6-201ENST00000441664 139 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
ZNF548Q8NEK5 RNU6-313P-201ENST00000516317 112 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
ZNF548Q8NEK5 RNU6ATAC12P-201ENST00000516542 115 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
ZNF548Q8NEK5 RNU6-504P-201ENST00000516568 104 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
ZNF548Q8NEK5 RNU7-28P-201ENST00000516759 62 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
ZNF548Q8NEK5 AC090142.3-201ENST00000519012 385 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
ZNF548Q8NEK5 AC131055.1-201ENST00000584626 316 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
ZNF548Q8NEK5 U7.2-201ENST00000607576 63 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
ZNF548Q8NEK5 FANCD2-213ENST00000625535 117 ntTSL 5 BASIC1.83□□□□□ -2.12
ZNF548Q8NEK5 CHST9-202ENST00000581714 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.83□□□□□ -2.12
ZNF548Q8NEK5 Y_RNA.71-201ENST00000362892 104 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
ZNF548Q8NEK5 Y_RNA.127-201ENST00000363386 109 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
ZNF548Q8NEK5 SNORA63D-201ENST00000364359 132 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
ZNF548Q8NEK5 RNU6-915P-201ENST00000364943 103 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
ZNF548Q8NEK5 SNORD116-14-201ENST00000383894 92 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
ZNF548Q8NEK5 SNORD116-17-201ENST00000383929 92 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
ZNF548Q8NEK5 SNORD61-201ENST00000384252 73 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
ZNF548Q8NEK5 SNORD116-15-201ENST00000384445 92 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
ZNF548Q8NEK5 SNORD116-19-201ENST00000384729 92 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
ZNF548Q8NEK5 RNU6-1154P-201ENST00000391001 104 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
ZNF548Q8NEK5 RNA5SP109-201ENST00000391010 116 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
ZNF548Q8NEK5 RNA5SP482-201ENST00000391269 118 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
ZNF548Q8NEK5 AL135790.1-201ENST00000427161 157 ntTSL 3 BASIC1.82□□□□□ -2.12
ZNF548Q8NEK5 SNRPGP14-201ENST00000435400 219 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
ZNF548Q8NEK5 AL353743.2-204ENST00000456242 419 ntTSL 3 BASIC1.82□□□□□ -2.12
ZNF548Q8NEK5 RNU2-56P-201ENST00000516826 190 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
ZNF548Q8NEK5 AC007450.1-201ENST00000536492 188 ntTSL 3 BASIC1.82□□□□□ -2.12
ZNF548Q8NEK5 AC022596.1-201ENST00000582895 302 ntTSL 5 BASIC1.82□□□□□ -2.12
ZNF548Q8NEK5 MIR8054-201ENST00000620877 86 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
ZNF548Q8NEK5 AC084768.2-201ENST00000622736 221 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
ZNF548Q8NEK5 SMARCAD1-201ENST00000354268 4912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.82□□□□□ -2.12
ZNF548Q8NEK5 Y_RNA.120-201ENST00000363304 110 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
ZNF548Q8NEK5 RNA5SP205-201ENST00000364653 136 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
ZNF548Q8NEK5 Y_RNA.280-201ENST00000364765 112 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
ZNF548Q8NEK5 SNORD50B-201ENST00000364995 70 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
ZNF548Q8NEK5 RNU6-80P-201ENST00000384195 107 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
ZNF548Q8NEK5 TRAJ50-201ENST00000390487 60 ntAPPRIS P1 BASIC1.81□□□□□ -2.12
ZNF548Q8NEK5 TRAJ41-201ENST00000390496 62 ntAPPRIS P1 BASIC1.81□□□□□ -2.12
ZNF548Q8NEK5 AL356379.1-201ENST00000414105 126 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
ZNF548Q8NEK5 AC069257.2-201ENST00000441819 155 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
ZNF548Q8NEK5 RPS27P21-201ENST00000486977 252 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
ZNF548Q8NEK5 RNU2-60P-201ENST00000517290 128 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
ZNF548Q8NEK5 AC006441.5-201ENST00000612680 209 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
ZNF548Q8NEK5 5S_rRNA.11-201ENST00000618635 84 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
ZNF548Q8NEK5 ZNF451-208ENST00000491832 3632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.81□□□□□ -2.12
ZNF548Q8NEK5 AC008555.8-201ENST00000623602 2168 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
ZNF548Q8NEK5 RNU6-1292P-201ENST00000383856 107 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
ZNF548Q8NEK5 SNORA1-201ENST00000384107 130 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
ZNF548Q8NEK5 SNORA48.1-201ENST00000390879 135 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
ZNF548Q8NEK5 RNU6-440P-201ENST00000390882 105 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
ZNF548Q8NEK5 MIR891A-201ENST00000401237 79 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
ZNF548Q8NEK5 RNA5SP127-201ENST00000411051 133 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
ZNF548Q8NEK5 MLLT10P1-201ENST00000418346 262 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
ZNF548Q8NEK5 HMGN2P19-201ENST00000425149 265 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
ZNF548Q8NEK5 RNU6-1211P-201ENST00000459179 105 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
ZNF548Q8NEK5 RPS29P11-201ENST00000496507 171 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
ZNF548Q8NEK5 Y_RNA.666-201ENST00000516187 112 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
ZNF548Q8NEK5 SNORA31.10-201ENST00000516482 106 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
ZNF548Q8NEK5 SNORA25.15-201ENST00000516487 89 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
ZNF548Q8NEK5 SUB1P4-201ENST00000566062 339 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
ZNF548Q8NEK5 MIR5094-201ENST00000578766 85 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
ZNF548Q8NEK5 AC245060.5-201ENST00000610778 3293 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
ZNF548Q8NEK5 CEP57L1-213ENST00000520883 2055 ntTSL 5 BASIC1.79□□□□□ -2.12
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