Protein–RNA interactions for Protein: Q53RE8

ANKRD39, Ankyrin repeat domain-containing protein 39, humanhuman

Predictions only

Length 183 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD39Q53RE8 MIR7703-201ENST00000620784 77 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
ANKRD39Q53RE8 AC005336.3-201ENST00000623833 2679 ntBASIC2.15□□□□□ -2.06
ANKRD39Q53RE8 MAP3K2-203ENST00000409947 10992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.15□□□□□ -2.06
ANKRD39Q53RE8 Y_RNA.116-201ENST00000363292 103 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
ANKRD39Q53RE8 RNU6-301P-201ENST00000384277 107 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
ANKRD39Q53RE8 MIR30B-201ENST00000384850 88 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
ANKRD39Q53RE8 MIR194-1-201ENST00000384892 85 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
ANKRD39Q53RE8 MIR192-201ENST00000384915 110 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
ANKRD39Q53RE8 MT-TI-201ENST00000387365 69 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
ANKRD39Q53RE8 AL023284.1-201ENST00000403956 276 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
ANKRD39Q53RE8 AC244636.1-201ENST00000421152 228 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
ANKRD39Q53RE8 RNU7-43P-201ENST00000516554 64 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
ANKRD39Q53RE8 MIR4764-201ENST00000580680 88 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
ANKRD39Q53RE8 HOTAIRM1_4.1-201ENST00000617934 102 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
ANKRD39Q53RE8 KPNA5-202ENST00000368564 11311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.15□□□□□ -2.07
ANKRD39Q53RE8 PIK3C2G-202ENST00000433979 4840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.15□□□□□ -2.07
ANKRD39Q53RE8 Y_RNA.531-201ENST00000384589 121 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
ANKRD39Q53RE8 TRAJ23-201ENST00000390514 63 ntAPPRIS P1 BASIC2.14□□□□□ -2.07
ANKRD39Q53RE8 TRAJ11-201ENST00000390526 60 ntAPPRIS P1 BASIC2.14□□□□□ -2.07
ANKRD39Q53RE8 AL451046.2-201ENST00000403074 277 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
ANKRD39Q53RE8 AC018495.1-201ENST00000440266 452 ntTSL 3 BASIC2.14□□□□□ -2.07
ANKRD39Q53RE8 AL031737.1-201ENST00000450125 223 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
ANKRD39Q53RE8 RNU7-113P-201ENST00000459273 62 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
ANKRD39Q53RE8 RPS29P22-201ENST00000472363 168 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
ANKRD39Q53RE8 IGKV3-31-201ENST00000523109 329 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
ANKRD39Q53RE8 MIR4679-2-201ENST00000578358 77 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
ANKRD39Q53RE8 RN7SL753P-201ENST00000581238 290 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
ANKRD39Q53RE8 AC103810.6-201ENST00000606708 136 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
ANKRD39Q53RE8 MIR6719-201ENST00000622428 87 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
ANKRD39Q53RE8 TDRD15-201ENST00000405799 6135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.13□□□□□ -2.07
ANKRD39Q53RE8 ASPM-202ENST00000367408 3747 ntTSL 1 (best) BASIC2.13□□□□□ -2.07
ANKRD39Q53RE8 THOC2-201ENST00000245838 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.13□□□□□ -2.07
ANKRD39Q53RE8 Y_RNA.49-201ENST00000362714 112 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
ANKRD39Q53RE8 Y_RNA.85-201ENST00000363014 111 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
ANKRD39Q53RE8 Y_RNA.362-201ENST00000365518 110 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
ANKRD39Q53RE8 RNU6-147P-201ENST00000383983 107 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
ANKRD39Q53RE8 SNORA24-201ENST00000384096 131 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
ANKRD39Q53RE8 RNU6-913P-201ENST00000390913 95 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
ANKRD39Q53RE8 AL033380.1-201ENST00000442781 421 ntTSL 2 BASIC2.13□□□□□ -2.07
ANKRD39Q53RE8 RNU7-73P-201ENST00000458743 63 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
ANKRD39Q53RE8 MIR4277-201ENST00000578298 84 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
ANKRD39Q53RE8 AC025887.1-201ENST00000578349 264 ntTSL 3 BASIC2.13□□□□□ -2.07
ANKRD39Q53RE8 AC090616.3-202ENST00000583346 205 ntTSL 2 BASIC2.13□□□□□ -2.07
ANKRD39Q53RE8 MIR6717-201ENST00000622747 73 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
ANKRD39Q53RE8 KIF20B-202ENST00000371728 6419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.12□□□□□ -2.07
ANKRD39Q53RE8 Y_RNA.171-201ENST00000363760 102 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
ANKRD39Q53RE8 TRAJ39-201ENST00000390498 63 ntAPPRIS P1 BASIC2.12□□□□□ -2.07
ANKRD39Q53RE8 RN7SKP111-201ENST00000410349 271 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
ANKRD39Q53RE8 RNU2-40P-201ENST00000410833 196 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
ANKRD39Q53RE8 POLR2J4-204ENST00000418424 324 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
ANKRD39Q53RE8 snoU13.16-201ENST00000459350 104 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
ANKRD39Q53RE8 AC021491.3-201ENST00000513378 156 ntTSL 3 BASIC2.12□□□□□ -2.07
ANKRD39Q53RE8 AC026402.1-201ENST00000513642 170 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
ANKRD39Q53RE8 IGHVII-40-1-201ENST00000517316 58 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
ANKRD39Q53RE8 AL020996.3-201ENST00000606617 222 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
ANKRD39Q53RE8 uc_338.28-201ENST00000612082 187 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
ANKRD39Q53RE8 AASDH-207ENST00000513376 3241 ntTSL 1 (best) BASIC2.12□□□□□ -2.07
ANKRD39Q53RE8 RASA1-202ENST00000456692 3776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.11□□□□□ -2.07
ANKRD39Q53RE8 MUC15-203ENST00000455601 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.11□□□□□ -2.07
ANKRD39Q53RE8 MIR450A1-201ENST00000362262 91 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
ANKRD39Q53RE8 RNU6-661P-201ENST00000362409 107 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
ANKRD39Q53RE8 SNORA22.1-201ENST00000362701 134 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
ANKRD39Q53RE8 RNA5SP51-201ENST00000364750 119 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
ANKRD39Q53RE8 MIR548D2-201ENST00000384955 97 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
ANKRD39Q53RE8 MIR1302-5-201ENST00000408164 150 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
ANKRD39Q53RE8 RNA5SP33-201ENST00000516687 98 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
ANKRD39Q53RE8 AL035470.1-201ENST00000622571 220 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
ANKRD39Q53RE8 AC008133.2-201ENST00000624540 351 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
ANKRD39Q53RE8 NAALADL2-203ENST00000454872 9865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.11□□□□□ -2.07
ANKRD39Q53RE8 SNORA1.1-201ENST00000364671 133 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
ANKRD39Q53RE8 Y_RNA.299-201ENST00000364973 94 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
ANKRD39Q53RE8 MIR653-201ENST00000385279 96 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
ANKRD39Q53RE8 RNU6-1190P-201ENST00000410811 104 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
ANKRD39Q53RE8 RNA5SP489-201ENST00000410986 109 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
ANKRD39Q53RE8 ATP5A1P2-201ENST00000412323 255 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
ANKRD39Q53RE8 RPS3AP1-201ENST00000413190 320 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
ANKRD39Q53RE8 IGKV2-26-201ENST00000518305 343 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
ANKRD39Q53RE8 MIR4299-201ENST00000577899 72 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
ANKRD39Q53RE8 MIR3613-201ENST00000579844 87 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
ANKRD39Q53RE8 MIR2682-201ENST00000580305 110 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
ANKRD39Q53RE8 MIR4713-201ENST00000582691 75 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
ANKRD39Q53RE8 AL513534.2-201ENST00000603836 250 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
ANKRD39Q53RE8 MIR8074-201ENST00000615081 81 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
ANKRD39Q53RE8 BRCA1-202ENST00000354071 4497 ntTSL 1 (best) BASIC2.1□□□□□ -2.07
ANKRD39Q53RE8 SLC30A6-202ENST00000357055 4758 ntTSL 2 BASIC2.09□□□□□ -2.07
ANKRD39Q53RE8 RNU6-1014P-201ENST00000383940 103 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
ANKRD39Q53RE8 RNU6-106P-201ENST00000384405 107 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
ANKRD39Q53RE8 ATP6V0E1P3-201ENST00000420036 246 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
ANKRD39Q53RE8 HMGN1P33-201ENST00000432945 451 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
ANKRD39Q53RE8 AC008413.1-201ENST00000511864 177 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
ANKRD39Q53RE8 AP000346.3-201ENST00000622821 210 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
ANKRD39Q53RE8 ZNF260-205ENST00000593142 4047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.09□□□□□ -2.08
ANKRD39Q53RE8 SAMD9L-201ENST00000318238 7134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.09□□□□□ -2.08
ANKRD39Q53RE8 Z82195.2-201ENST00000612348 18351 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
ANKRD39Q53RE8 CLUL1-208ENST00000581619 2449 ntTSL 2 BASIC2.08□□□□□ -2.08
ANKRD39Q53RE8 Y_RNA.344-201ENST00000365381 112 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
ANKRD39Q53RE8 SNORD17-201ENST00000390930 237 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
ANKRD39Q53RE8 SNORA26.6-201ENST00000391256 115 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
ANKRD39Q53RE8 AL161935.2-201ENST00000414627 60 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
ANKRD39Q53RE8 RPL39P34-201ENST00000477141 156 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
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