Protein–RNA interactions for Protein: Q16665

HIF1A, Hypoxia-inducible factor 1-alpha, humanhuman

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Length 826 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIF1AQ16665 WDR3-201ENST00000349139 9974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.93□□□□□ -1.94
HIF1AQ16665 SCN1A-219ENST00000641575 12874 ntAPPRIS ALT1 BASIC2.92□□□□□ -1.94
HIF1AQ16665 AC007336.1-201ENST00000576365 3828 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
HIF1AQ16665 RNY3P2-201ENST00000362918 102 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
HIF1AQ16665 Y_RNA.107-201ENST00000363190 121 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
HIF1AQ16665 SNORA71.1-201ENST00000364523 117 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
HIF1AQ16665 RNU1-148P-201ENST00000384472 162 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
HIF1AQ16665 Y_RNA.510-201ENST00000384511 114 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
HIF1AQ16665 MIR29C-201ENST00000385231 88 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
HIF1AQ16665 AL034345.1-201ENST00000407768 123 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
HIF1AQ16665 LINC00393-201ENST00000443621 282 ntTSL 3 BASIC2.92□□□□□ -1.94
HIF1AQ16665 RNA5SP57-201ENST00000459463 123 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
HIF1AQ16665 RNU7-96P-201ENST00000459535 64 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
HIF1AQ16665 AC006483.1-201ENST00000487308 313 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
HIF1AQ16665 LINC02514-201ENST00000509058 498 ntTSL 3 BASIC2.92□□□□□ -1.94
HIF1AQ16665 SNORA9.3-201ENST00000516383 129 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
HIF1AQ16665 IGLV3-17-201ENST00000519099 244 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
HIF1AQ16665 AC021785.1-201ENST00000520780 453 ntTSL 3 BASIC2.92□□□□□ -1.94
HIF1AQ16665 DEFB131E-201ENST00000532329 154 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
HIF1AQ16665 ZNF861P-201ENST00000588126 639 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
HIF1AQ16665 MALAT1-207ENST00000613376 132 ntTSL 3 BASIC2.92□□□□□ -1.94
HIF1AQ16665 HOTAIRM1_4.1-201ENST00000617934 102 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
HIF1AQ16665 LTN1-201ENST00000361371 7685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.92□□□□□ -1.94
HIF1AQ16665 USP45-208ENST00000500704 5826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.92□□□□□ -1.94
HIF1AQ16665 TAB3-203ENST00000378930 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.91□□□□□ -1.94
HIF1AQ16665 CHORDC1-205ENST00000529726 4805 ntTSL 2 BASIC2.91□□□□□ -1.94
HIF1AQ16665 AP003174.1-201ENST00000306533 376 ntTSL 2 BASIC2.91□□□□□ -1.94
HIF1AQ16665 SNORD115-34-201ENST00000362441 82 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
HIF1AQ16665 SNORD115-12-201ENST00000362583 82 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
HIF1AQ16665 SNORD115-29-201ENST00000362834 82 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
HIF1AQ16665 SNORD115-9-201ENST00000362912 82 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
HIF1AQ16665 SNORD115-21-201ENST00000362963 81 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
HIF1AQ16665 Y_RNA.78-201ENST00000362970 110 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
HIF1AQ16665 SNORD115-14-201ENST00000363090 81 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
HIF1AQ16665 SNORD115-13-201ENST00000363358 82 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
HIF1AQ16665 SNORD115-41-201ENST00000363608 82 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
HIF1AQ16665 SNORD115-11-201ENST00000363616 82 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
HIF1AQ16665 SNORD115-5-201ENST00000363633 82 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
HIF1AQ16665 SNORD115-39-201ENST00000363694 82 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
HIF1AQ16665 Y_RNA.171-201ENST00000363760 102 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
HIF1AQ16665 SNORD115-4-201ENST00000363810 82 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
HIF1AQ16665 SNORD115-16-201ENST00000363887 82 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
HIF1AQ16665 SNORD115-6-201ENST00000363942 82 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
HIF1AQ16665 SNORD115-42-201ENST00000364273 82 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
HIF1AQ16665 SNORD115-15-201ENST00000364809 81 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
HIF1AQ16665 SNORD115-1-201ENST00000364961 82 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
HIF1AQ16665 SNORD115-26-201ENST00000365067 82 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
HIF1AQ16665 SNORD115-10-201ENST00000365073 81 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
HIF1AQ16665 SNORD115-43-201ENST00000365503 82 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
HIF1AQ16665 SNORD115-36-201ENST00000365629 82 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
HIF1AQ16665 RN7SKP192-201ENST00000411291 327 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
HIF1AQ16665 RNVU1-2-201ENST00000516326 135 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
HIF1AQ16665 RNU6-844P-201ENST00000517175 102 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
HIF1AQ16665 MIR3618-201ENST00000580330 88 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
HIF1AQ16665 AL033523.1-201ENST00000605153 153 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
HIF1AQ16665 AC103810.6-201ENST00000606708 136 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
HIF1AQ16665 MIR7106-201ENST00000612419 65 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
HIF1AQ16665 AL449363.1-201ENST00000617815 186 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
HIF1AQ16665 MIR6733-201ENST00000635723 61 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
HIF1AQ16665 AC092435.3-201ENST00000565538 3654 ntBASIC2.9□□□□□ -1.94
HIF1AQ16665 HIF1A-201ENST00000323441 3555 ntTSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.94
HIF1AQ16665 FAM184A-202ENST00000352896 3700 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.94
HIF1AQ16665 Y_RNA.155-201ENST00000363632 101 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
HIF1AQ16665 MIR1912-201ENST00000410389 80 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
HIF1AQ16665 HMGN2P3-201ENST00000433603 273 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
HIF1AQ16665 HMGN2P5-201ENST00000436882 273 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
HIF1AQ16665 AL135938.1-201ENST00000443141 297 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
HIF1AQ16665 ITCH-AS1-201ENST00000454205 299 ntTSL 5 BASIC2.9□□□□□ -1.95
HIF1AQ16665 RNU7-34P-201ENST00000459394 64 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
HIF1AQ16665 CFLAR-AS1-202ENST00000474886 223 ntTSL 3 BASIC2.9□□□□□ -1.95
HIF1AQ16665 RPS23P4-201ENST00000487908 423 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
HIF1AQ16665 MIR3605-201ENST00000583214 100 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
HIF1AQ16665 MIR4298-201ENST00000584380 73 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
HIF1AQ16665 NPPA-AS1_3.1-201ENST00000617059 108 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
HIF1AQ16665 MIR203B-201ENST00000636080 86 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
HIF1AQ16665 VPS54-202ENST00000354504 3594 ntTSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.95
HIF1AQ16665 SNORA5B-201ENST00000363786 132 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
HIF1AQ16665 RNU4-36P-201ENST00000364294 144 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
HIF1AQ16665 Y_RNA.342-201ENST00000365352 113 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
HIF1AQ16665 RNU2-7P-201ENST00000410794 178 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
HIF1AQ16665 ATP6V0E1P1-201ENST00000412537 226 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
HIF1AQ16665 POLR2J4-204ENST00000418424 324 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
HIF1AQ16665 AC022018.1-201ENST00000430685 241 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
HIF1AQ16665 AC107297.1-201ENST00000459991 176 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
HIF1AQ16665 AC003982.1-202ENST00000469928 248 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
HIF1AQ16665 UBL5P3-201ENST00000475112 231 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
HIF1AQ16665 RNU6-958P-201ENST00000516995 106 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
HIF1AQ16665 FAS-AS1.2-201ENST00000620386 170 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
HIF1AQ16665 OR2J3-203ENST00000641960 3342 ntAPPRIS P1 BASIC2.89□□□□□ -1.95
HIF1AQ16665 RTKN2-202ENST00000373789 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
HIF1AQ16665 RNU6-833P-201ENST00000363486 107 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
HIF1AQ16665 Y_RNA.507-201ENST00000384500 99 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
HIF1AQ16665 PGBD4P5-201ENST00000445958 426 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
HIF1AQ16665 AC108752.1-201ENST00000484679 576 ntTSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
HIF1AQ16665 RNU6-1258P-201ENST00000516911 111 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
HIF1AQ16665 MIR4513-201ENST00000581077 86 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
HIF1AQ16665 AC064859.1-201ENST00000624741 174 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
HIF1AQ16665 LINC01790-201ENST00000447194 2852 ntTSL 2 BASIC2.87□□□□□ -1.95
HIF1AQ16665 AC011124.2-201ENST00000518739 3222 ntTSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
HIF1AQ16665 MIR26A1-201ENST00000362205 77 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
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