Protein–RNA interactions for Protein: Q16254

E2F4, Transcription factor E2F4, humanhuman

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Length 413 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F4Q16254 SNORA84-201ENST00000459229 133 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
E2F4Q16254 SNORD123-201ENST00000459473 70 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
E2F4Q16254 AC120045.1-201ENST00000563502 251 ntTSL 3 BASIC3.66□□□□□ -1.82
E2F4Q16254 AC139426.2-201ENST00000568289 251 ntTSL 3 BASIC3.66□□□□□ -1.82
E2F4Q16254 MIR3158-1-201ENST00000583596 81 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
E2F4Q16254 MIR4276-201ENST00000584832 70 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
E2F4Q16254 AC096720.1-201ENST00000604441 183 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
E2F4Q16254 AL513423.1-201ENST00000621695 132 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
E2F4Q16254 ERBIN-201ENST00000284037 8647 ntTSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.82
E2F4Q16254 NEB-201ENST00000172853 20634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.82
E2F4Q16254 CSNK1G3-202ENST00000360683 4047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.82
E2F4Q16254 TTN-204ENST00000360870 18218 ntTSL 5 BASIC3.65□□□□□ -1.82
E2F4Q16254 AC109327.2-201ENST00000448339 378 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
E2F4Q16254 RN7SL293P-201ENST00000481765 281 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
E2F4Q16254 SNORA64.4-201ENST00000516632 81 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
E2F4Q16254 MIR2682-201ENST00000580305 110 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
E2F4Q16254 MIR548Z-201ENST00000584743 97 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
E2F4Q16254 ERBIN-204ENST00000380943 6410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.83
E2F4Q16254 VPS13C-203ENST00000395896 14579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
E2F4Q16254 CEP57L1-216ENST00000521522 2259 ntTSL 5 BASIC3.64□□□□□ -1.83
E2F4Q16254 TDRD15-201ENST00000405799 6135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.64□□□□□ -1.83
E2F4Q16254 Y_RNA.95-201ENST00000363079 95 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
E2F4Q16254 RNU6-1201P-201ENST00000384227 107 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
E2F4Q16254 MIR518A2-201ENST00000384966 87 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
E2F4Q16254 SNORA48.1-201ENST00000390879 135 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
E2F4Q16254 AL365277.2-201ENST00000415255 551 ntTSL 3 BASIC3.64□□□□□ -1.83
E2F4Q16254 AC115115.1-201ENST00000449927 248 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
E2F4Q16254 MIR4777-201ENST00000583710 86 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
E2F4Q16254 AL020996.3-201ENST00000606617 222 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
E2F4Q16254 AC021506.2-201ENST00000612354 169 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
E2F4Q16254 MIR660-201ENST00000385235 97 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
E2F4Q16254 SNORD28B-201ENST00000390993 75 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
E2F4Q16254 AL451046.2-201ENST00000403074 277 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
E2F4Q16254 RNA5SP481-201ENST00000516814 122 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
E2F4Q16254 Y_RNA.705-201ENST00000516862 110 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
E2F4Q16254 RNA5SP437-201ENST00000517249 129 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
E2F4Q16254 AC007218.2-201ENST00000636913 179 ntTSL 5 BASIC3.63□□□□□ -1.83
E2F4Q16254 SULT1B1-201ENST00000310613 7115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
E2F4Q16254 DDX60L-207ENST00000505890 4568 ntTSL 2 BASIC3.63□□□□□ -1.83
E2F4Q16254 FIGNL1-212ENST00000613602 3187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.62□□□□□ -1.83
E2F4Q16254 GRAMD1C-202ENST00000440446 3475 ntTSL 1 (best) BASIC3.62□□□□□ -1.83
E2F4Q16254 RNA5SP50-201ENST00000363731 107 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
E2F4Q16254 SNORA32-201ENST00000384072 121 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
E2F4Q16254 MIR200C-201ENST00000384980 68 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
E2F4Q16254 RNU6-913P-201ENST00000390913 95 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
E2F4Q16254 RNU6-1190P-201ENST00000410811 104 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
E2F4Q16254 RNA5SP385-201ENST00000515947 110 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
E2F4Q16254 VTRNA2-2P-201ENST00000516091 103 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
E2F4Q16254 AC135178.3-204ENST00000585181 451 ntTSL 2 BASIC3.62□□□□□ -1.83
E2F4Q16254 MIR92B-201ENST00000607575 96 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
E2F4Q16254 AL160408.5-201ENST00000607759 526 ntTSL 4 BASIC3.62□□□□□ -1.83
E2F4Q16254 ST7-OT3_3.1-201ENST00000611709 115 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
E2F4Q16254 SNORD3E-202ENST00000627253 216 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
E2F4Q16254 AC091304.10-201ENST00000641554 121 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
E2F4Q16254 CREBRF-201ENST00000296953 7778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.62□□□□□ -1.83
E2F4Q16254 KIAA0586-215ENST00000619722 5597 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.62□□□□□ -1.83
E2F4Q16254 AC108206.1-201ENST00000570186 4159 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
E2F4Q16254 NEB-204ENST00000409198 20637 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC3.61□□□□□ -1.83
E2F4Q16254 FOXP2-206ENST00000393491 6085 ntTSL 5 BASIC3.61□□□□□ -1.83
E2F4Q16254 RNA5SP383-201ENST00000362934 120 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
E2F4Q16254 Y_RNA.537-201ENST00000384626 109 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
E2F4Q16254 MIR183-201ENST00000384958 110 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
E2F4Q16254 snoU13.27-201ENST00000459278 104 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
E2F4Q16254 MIR1270-201ENST00000459320 83 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
E2F4Q16254 SUB1P4-201ENST00000566062 339 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
E2F4Q16254 U6.105-201ENST00000637379 88 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
E2F4Q16254 ZNF117-204ENST00000620222 5317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.61□□□□□ -1.83
E2F4Q16254 MIR133A1HG-202ENST00000581072 4226 ntTSL 1 (best) BASIC3.6□□□□□ -1.83
E2F4Q16254 MIR526A1-201ENST00000384897 85 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
E2F4Q16254 TRAJ50-201ENST00000390487 60 ntAPPRIS P1 BASIC3.6□□□□□ -1.83
E2F4Q16254 BTF3P4-201ENST00000418852 495 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
E2F4Q16254 AC234781.5-202ENST00000453508 426 ntTSL 3 BASIC3.6□□□□□ -1.83
E2F4Q16254 AC022137.1-201ENST00000483735 151 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
E2F4Q16254 CLLU1-201ENST00000378485 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.6□□□□□ -1.83
E2F4Q16254 RNU6-1313P-201ENST00000362622 102 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
E2F4Q16254 SNORA1.1-201ENST00000364671 133 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
E2F4Q16254 RNU6-972P-201ENST00000391208 107 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
E2F4Q16254 RNU6-887P-201ENST00000410660 100 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
E2F4Q16254 AC009093.3-203ENST00000565800 121 ntTSL 2 BASIC3.59□□□□□ -1.83
E2F4Q16254 AC006023.1-201ENST00000603944 259 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
E2F4Q16254 CC2D2B-210ENST00000636965 3247 ntTSL 5 BASIC3.59□□□□□ -1.84
E2F4Q16254 SLC9C1-205ENST00000487372 3979 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
E2F4Q16254 RNU6-112P-201ENST00000363599 104 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
E2F4Q16254 SNORD56.5-201ENST00000364281 72 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
E2F4Q16254 RNU6-242P-201ENST00000384359 107 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
E2F4Q16254 MIR449B-201ENST00000384995 97 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
E2F4Q16254 HMGN2P39-201ENST00000398005 273 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
E2F4Q16254 AC091153.1-201ENST00000466297 402 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
E2F4Q16254 RNA5SP217-201ENST00000515959 91 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
E2F4Q16254 KIAA1109-203ENST00000388738 15574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
E2F4Q16254 5S_rRNA.1-201ENST00000364415 116 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
E2F4Q16254 SNORD116-22-201ENST00000384430 92 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
E2F4Q16254 AC073127.1-201ENST00000447336 333 ntTSL 3 BASIC3.57□□□□□ -1.84
E2F4Q16254 snoU13.16-201ENST00000459350 104 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
E2F4Q16254 AC108729.3-201ENST00000513484 108 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
E2F4Q16254 IGHVIII-5-1-201ENST00000523059 99 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
E2F4Q16254 MIR4429-201ENST00000580105 73 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
E2F4Q16254 MIR4444-1-201ENST00000581696 74 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
E2F4Q16254 MIR4439-201ENST00000583746 80 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
E2F4Q16254 MIR4444-2-201ENST00000584390 74 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
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