Protein–RNA interactions for Protein: Q15223

NECTIN1, Nectin-1, humanhuman

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Length 517 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NECTIN1Q15223 AL160236.1-201ENST00000556317 195 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
NECTIN1Q15223 AL513423.1-201ENST00000621695 132 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
NECTIN1Q15223 Y_RNA.297-201ENST00000364950 91 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
NECTIN1Q15223 RNU4-17P-201ENST00000365598 141 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
NECTIN1Q15223 MIR616-201ENST00000385293 97 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
NECTIN1Q15223 SNORD72-201ENST00000390994 80 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
NECTIN1Q15223 RNU6ATAC15P-201ENST00000408279 121 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
NECTIN1Q15223 AL353742.1-201ENST00000453455 224 ntTSL 3 BASIC1.31□□□□□ -2.2
NECTIN1Q15223 AC114811.1-201ENST00000507207 168 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
NECTIN1Q15223 AC138625.2-201ENST00000563968 551 ntTSL 3 BASIC1.31□□□□□ -2.2
NECTIN1Q15223 AL049861.1-201ENST00000603130 150 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
NECTIN1Q15223 JPX_2.1-201ENST00000614161 69 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
NECTIN1Q15223 uc_338.4-201ENST00000616635 176 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
NECTIN1Q15223 RNU6-53P-201ENST00000365367 106 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
NECTIN1Q15223 MIR660-201ENST00000385235 97 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
NECTIN1Q15223 RNU6-131P-201ENST00000391144 107 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
NECTIN1Q15223 RNU1-78P-201ENST00000391248 165 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
NECTIN1Q15223 PIGPP3-201ENST00000425307 415 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
NECTIN1Q15223 SNRPGP14-201ENST00000435400 219 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
NECTIN1Q15223 AC093850.1-201ENST00000454121 251 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
NECTIN1Q15223 AC005908.1-201ENST00000468701 347 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
NECTIN1Q15223 RNU6-561P-201ENST00000516222 102 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
NECTIN1Q15223 SNORD45.4-201ENST00000516629 73 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
NECTIN1Q15223 AC008507.4-201ENST00000585464 127 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
NECTIN1Q15223 AC120024.3-201ENST00000603167 156 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
NECTIN1Q15223 AC027279.3-201ENST00000625055 122 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
NECTIN1Q15223 MT-ATP8-201ENST00000361851 207 ntAPPRIS P1 BASIC1.29□□□□□ -2.2
NECTIN1Q15223 MIR302D-201ENST00000362275 68 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
NECTIN1Q15223 RNU6-1123P-201ENST00000362347 106 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
NECTIN1Q15223 RNU6-833P-201ENST00000363486 107 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
NECTIN1Q15223 Y_RNA.238-201ENST00000364441 102 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
NECTIN1Q15223 RNU6-907P-201ENST00000390924 102 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
NECTIN1Q15223 Y_RNA.587-201ENST00000391210 103 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
NECTIN1Q15223 AL606845.1-201ENST00000404881 255 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
NECTIN1Q15223 MIR1285-1-201ENST00000408593 84 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
NECTIN1Q15223 RNU6-955P-201ENST00000410497 104 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
NECTIN1Q15223 RPL30P13-201ENST00000418873 348 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
NECTIN1Q15223 SNRPGP8-201ENST00000454064 226 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
NECTIN1Q15223 Y_RNA.644-201ENST00000459006 113 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
NECTIN1Q15223 RN7SKP164-201ENST00000516138 266 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
NECTIN1Q15223 SNORD77.4-201ENST00000516158 81 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
NECTIN1Q15223 Y_RNA.674-201ENST00000516362 113 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
NECTIN1Q15223 AC022559.1-201ENST00000520905 205 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
NECTIN1Q15223 LINC02277-202ENST00000556472 453 ntTSL 3 BASIC1.29□□□□□ -2.2
NECTIN1Q15223 AC015688.6-201ENST00000577737 104 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
NECTIN1Q15223 MIR4422-201ENST00000581938 83 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
NECTIN1Q15223 Z83818.1-201ENST00000603584 150 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
NECTIN1Q15223 AL391903.3-201ENST00000612158 163 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
NECTIN1Q15223 HS1BP3-208ENST00000631166 78 ntTSL 5 BASIC1.29□□□□□ -2.2
NECTIN1Q15223 HFM1-201ENST00000370425 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.28□□□□□ -2.2
NECTIN1Q15223 Y_RNA.7-201ENST00000362352 102 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
NECTIN1Q15223 Y_RNA.435-201ENST00000384095 112 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
NECTIN1Q15223 Y_RNA.785-201ENST00000384290 109 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
NECTIN1Q15223 Y_RNA.571-201ENST00000384753 98 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
NECTIN1Q15223 MIR150-201ENST00000385048 84 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
NECTIN1Q15223 RNU6-1228P-201ENST00000391014 107 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
NECTIN1Q15223 AL603825.1-201ENST00000438481 80 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
NECTIN1Q15223 CYCTP-201ENST00000504253 315 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
NECTIN1Q15223 AC097716.1-201ENST00000509136 180 ntTSL 2 BASIC1.28□□□□□ -2.2
NECTIN1Q15223 RNU7-12P-201ENST00000516030 62 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
NECTIN1Q15223 RNU7-149P-201ENST00000516739 59 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
NECTIN1Q15223 SUMO2P16-201ENST00000519475 264 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
NECTIN1Q15223 MIR4778-201ENST00000577635 80 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
NECTIN1Q15223 AC025887.1-201ENST00000578349 264 ntTSL 3 BASIC1.28□□□□□ -2.2
NECTIN1Q15223 AC087685.1-201ENST00000587507 141 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
NECTIN1Q15223 RNU2-4P-201ENST00000606190 192 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
NECTIN1Q15223 SNORD114-21-201ENST00000606412 72 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
NECTIN1Q15223 SNORD3E-202ENST00000627253 216 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
NECTIN1Q15223 ICE2P2-201ENST00000483823 2787 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
NECTIN1Q15223 SNORD33-201ENST00000362761 85 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
NECTIN1Q15223 Y_RNA.121-201ENST00000363309 113 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
NECTIN1Q15223 RNU6-1138P-201ENST00000365359 106 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
NECTIN1Q15223 RNU6-484P-201ENST00000384016 107 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
NECTIN1Q15223 RNY3P5-201ENST00000384127 102 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
NECTIN1Q15223 RNU6-163P-201ENST00000384396 106 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
NECTIN1Q15223 MIR513A1-201ENST00000385138 129 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
NECTIN1Q15223 LINC01073-201ENST00000441659 149 ntTSL 3 BASIC1.27□□□□□ -2.21
NECTIN1Q15223 RPS29P28-201ENST00000446439 141 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
NECTIN1Q15223 AC245517.4-201ENST00000448601 281 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
NECTIN1Q15223 Y_RNA.700-201ENST00000516806 100 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
NECTIN1Q15223 MIR4744-201ENST00000581563 82 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
NECTIN1Q15223 snoU13.31-201ENST00000607291 104 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
NECTIN1Q15223 AC108706.1-201ENST00000611053 297 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
NECTIN1Q15223 ZGRF1-202ENST00000309071 3347 ntTSL 1 (best) BASIC1.27□□□□□ -2.21
NECTIN1Q15223 RNU6-1084P-201ENST00000362498 107 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
NECTIN1Q15223 RNU6-1020P-201ENST00000363684 107 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
NECTIN1Q15223 RNU6-103P-201ENST00000363686 107 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
NECTIN1Q15223 SNORD1A-201ENST00000364968 72 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
NECTIN1Q15223 snoU2-30.1-201ENST00000365012 70 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
NECTIN1Q15223 Y_RNA.486-201ENST00000384398 107 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
NECTIN1Q15223 MIR526A1-201ENST00000384897 85 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
NECTIN1Q15223 RNU6-578P-201ENST00000390980 103 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
NECTIN1Q15223 RNU2-64P-201ENST00000411315 191 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
NECTIN1Q15223 AL138752.1-201ENST00000452964 351 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
NECTIN1Q15223 RNU6-237P-201ENST00000515985 71 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
NECTIN1Q15223 RNA5SP458-201ENST00000516188 119 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
NECTIN1Q15223 RNU6-1007P-201ENST00000516586 107 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
NECTIN1Q15223 Y_RNA.714-201ENST00000517065 90 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
NECTIN1Q15223 SNORA81.3-201ENST00000517283 198 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
NECTIN1Q15223 AC004792.1-201ENST00000614523 137 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
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