Protein–RNA interactions for Protein: Q15042

RAB3GAP1, Rab3 GTPase-activating protein catalytic subunit, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB3GAP1Q15042 SENP7-206ENST00000394094 4703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.6□□□□□ -1.99
RAB3GAP1Q15042 MAP4K3-205ENST00000437545 3924 ntTSL 5 BASIC2.6□□□□□ -1.99
RAB3GAP1Q15042 SNORD114-1-201ENST00000362705 72 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
RAB3GAP1Q15042 Y_RNA.99-201ENST00000363138 105 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
RAB3GAP1Q15042 SNORA67.1-201ENST00000364749 141 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
RAB3GAP1Q15042 SNORA8-201ENST00000384574 139 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
RAB3GAP1Q15042 Y_RNA.549-201ENST00000384657 102 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
RAB3GAP1Q15042 MIR1262-201ENST00000408276 93 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
RAB3GAP1Q15042 RNA5SP136-201ENST00000410906 107 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
RAB3GAP1Q15042 ATP5J2P3-201ENST00000451550 258 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
RAB3GAP1Q15042 AL049830.1-201ENST00000468034 425 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
RAB3GAP1Q15042 Y_RNA.694-201ENST00000516677 117 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
RAB3GAP1Q15042 AP002004.2-201ENST00000531656 154 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
RAB3GAP1Q15042 AP001363.1-201ENST00000544108 264 ntTSL 3 BASIC2.6□□□□□ -1.99
RAB3GAP1Q15042 MIR5582-201ENST00000579697 68 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
RAB3GAP1Q15042 AC022217.4-201ENST00000604389 163 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
RAB3GAP1Q15042 Y_RNA.242-201ENST00000364473 110 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
RAB3GAP1Q15042 RNU6-1072P-201ENST00000384703 107 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
RAB3GAP1Q15042 RNU6-443P-201ENST00000384780 107 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
RAB3GAP1Q15042 MIR570-201ENST00000384917 97 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
RAB3GAP1Q15042 AL023284.1-201ENST00000403956 276 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
RAB3GAP1Q15042 LINC02532-205ENST00000430094 628 ntTSL 5 BASIC2.59□□□□□ -1.99
RAB3GAP1Q15042 HMGN2P3-201ENST00000433603 273 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
RAB3GAP1Q15042 HMGN2P5-201ENST00000436882 273 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
RAB3GAP1Q15042 AL163195.1-201ENST00000496941 348 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
RAB3GAP1Q15042 MIR4762-201ENST00000585261 75 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
RAB3GAP1Q15042 AC079466.2-201ENST00000585394 185 ntTSL 5 BASIC2.59□□□□□ -1.99
RAB3GAP1Q15042 ZNFX1-AS1_2.1-201ENST00000610973 93 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
RAB3GAP1Q15042 AC006441.5-201ENST00000612680 209 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
RAB3GAP1Q15042 USP53-202ENST00000450251 6072 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
RAB3GAP1Q15042 PRKACB-204ENST00000370685 4481 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
RAB3GAP1Q15042 Y_RNA.85-201ENST00000363014 111 ntBASIC2.58□□□□□ -2
RAB3GAP1Q15042 RNU6-1107P-201ENST00000364817 104 ntBASIC2.58□□□□□ -2
RAB3GAP1Q15042 RNA5SP323-201ENST00000391094 133 ntBASIC2.58□□□□□ -2
RAB3GAP1Q15042 MIR548O-201ENST00000408583 114 ntBASIC2.58□□□□□ -2
RAB3GAP1Q15042 AL592431.2-201ENST00000422198 171 ntTSL 3 BASIC2.58□□□□□ -2
RAB3GAP1Q15042 SNRPGP14-201ENST00000435400 219 ntBASIC2.58□□□□□ -2
RAB3GAP1Q15042 RPS29P24-201ENST00000486345 171 ntBASIC2.58□□□□□ -2
RAB3GAP1Q15042 COX6CP6-201ENST00000490840 228 ntBASIC2.58□□□□□ -2
RAB3GAP1Q15042 RPS26P48-201ENST00000491713 339 ntBASIC2.58□□□□□ -2
RAB3GAP1Q15042 AC110009.1-201ENST00000512965 451 ntTSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
RAB3GAP1Q15042 RNU6-240P-201ENST00000516098 97 ntBASIC2.58□□□□□ -2
RAB3GAP1Q15042 RNU6-412P-201ENST00000516434 106 ntBASIC2.58□□□□□ -2
RAB3GAP1Q15042 Y_RNA.714-201ENST00000517065 90 ntBASIC2.58□□□□□ -2
RAB3GAP1Q15042 LINC02386-203ENST00000552182 501 ntTSL 3 BASIC2.58□□□□□ -2
RAB3GAP1Q15042 MIR4524B-201ENST00000581569 115 ntBASIC2.58□□□□□ -2
RAB3GAP1Q15042 AC006254.2-201ENST00000603259 279 ntBASIC2.58□□□□□ -2
RAB3GAP1Q15042 LRRD1-203ENST00000430130 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
RAB3GAP1Q15042 PTPN22-206ENST00000525799 2118 ntTSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
RAB3GAP1Q15042 RNA5SP138-201ENST00000365098 114 ntBASIC2.57□□□□□ -2
RAB3GAP1Q15042 SNORD12C-201ENST00000386307 89 ntBASIC2.57□□□□□ -2
RAB3GAP1Q15042 CST2P1-201ENST00000425770 87 ntBASIC2.57□□□□□ -2
RAB3GAP1Q15042 AC099677.2-201ENST00000436385 175 ntBASIC2.57□□□□□ -2
RAB3GAP1Q15042 AC108752.1-201ENST00000484679 576 ntTSL 5 BASIC2.57□□□□□ -2
RAB3GAP1Q15042 RNU7-25P-201ENST00000516544 62 ntBASIC2.57□□□□□ -2
RAB3GAP1Q15042 AC024995.1-201ENST00000523014 93 ntBASIC2.57□□□□□ -2
RAB3GAP1Q15042 MIR6132-201ENST00000622083 109 ntBASIC2.57□□□□□ -2
RAB3GAP1Q15042 FAR1-204ENST00000532502 5820 ntTSL 2 BASIC2.56□□□□□ -2
RAB3GAP1Q15042 NEDD1-204ENST00000457368 3162 ntTSL 2 BASIC2.56□□□□□ -2
RAB3GAP1Q15042 RNU6-862P-201ENST00000362804 105 ntBASIC2.56□□□□□ -2
RAB3GAP1Q15042 SNORD68-201ENST00000363214 84 ntBASIC2.56□□□□□ -2
RAB3GAP1Q15042 RNU6-268P-201ENST00000364174 107 ntBASIC2.56□□□□□ -2
RAB3GAP1Q15042 U8.5-201ENST00000364528 136 ntBASIC2.56□□□□□ -2
RAB3GAP1Q15042 RNA5SP160-201ENST00000364866 120 ntBASIC2.56□□□□□ -2
RAB3GAP1Q15042 RNU6-160P-201ENST00000384591 107 ntBASIC2.56□□□□□ -2
RAB3GAP1Q15042 MIR515-2-201ENST00000384883 83 ntBASIC2.56□□□□□ -2
RAB3GAP1Q15042 MIR515-1-201ENST00000384884 83 ntBASIC2.56□□□□□ -2
RAB3GAP1Q15042 AL606517.2-201ENST00000442855 241 ntBASIC2.56□□□□□ -2
RAB3GAP1Q15042 AC011753.1-201ENST00000451001 220 ntBASIC2.56□□□□□ -2
RAB3GAP1Q15042 RNU7-94P-201ENST00000459576 63 ntBASIC2.56□□□□□ -2
RAB3GAP1Q15042 SNORA72.7-201ENST00000516349 94 ntBASIC2.56□□□□□ -2
RAB3GAP1Q15042 Y_RNA.677-201ENST00000516401 85 ntBASIC2.56□□□□□ -2
RAB3GAP1Q15042 5S_rRNA.11-201ENST00000618635 84 ntBASIC2.56□□□□□ -2
RAB3GAP1Q15042 AC134878.1-201ENST00000619901 243 ntBASIC2.56□□□□□ -2
RAB3GAP1Q15042 AL035470.1-201ENST00000622571 220 ntBASIC2.56□□□□□ -2
RAB3GAP1Q15042 COMMD6-213ENST00000626103 120 ntTSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
RAB3GAP1Q15042 SI-201ENST00000264382 6011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
RAB3GAP1Q15042 SAMD9L-201ENST00000318238 7134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
RAB3GAP1Q15042 RNA5SP493-201ENST00000364115 91 ntBASIC2.55□□□□□ -2
RAB3GAP1Q15042 Y_RNA.410-201ENST00000383992 113 ntBASIC2.55□□□□□ -2
RAB3GAP1Q15042 Y_RNA.547-201ENST00000384654 119 ntBASIC2.55□□□□□ -2
RAB3GAP1Q15042 AC025033.1-201ENST00000463883 194 ntBASIC2.55□□□□□ -2
RAB3GAP1Q15042 RNA5SP200-201ENST00000516360 103 ntBASIC2.55□□□□□ -2
RAB3GAP1Q15042 AC121758.2-201ENST00000553271 193 ntBASIC2.55□□□□□ -2
RAB3GAP1Q15042 LINC00645-203ENST00000557399 3512 ntTSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
RAB3GAP1Q15042 MIR3169-201ENST00000578032 83 ntBASIC2.55□□□□□ -2
RAB3GAP1Q15042 AL449363.1-201ENST00000617815 186 ntBASIC2.55□□□□□ -2
RAB3GAP1Q15042 MIR219B-201ENST00000637023 88 ntBASIC2.55□□□□□ -2
RAB3GAP1Q15042 LRRCC1-202ENST00000414626 4493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
RAB3GAP1Q15042 ENAM-201ENST00000396073 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
RAB3GAP1Q15042 RNU6-349P-201ENST00000362402 107 ntBASIC2.54□□□□□ -2
RAB3GAP1Q15042 Y_RNA.37-201ENST00000362606 108 ntBASIC2.54□□□□□ -2
RAB3GAP1Q15042 Y_RNA.328-201ENST00000365208 113 ntBASIC2.54□□□□□ -2
RAB3GAP1Q15042 SNORA2.2-201ENST00000365473 135 ntBASIC2.54□□□□□ -2
RAB3GAP1Q15042 Y_RNA.369-201ENST00000365568 117 ntBASIC2.54□□□□□ -2
RAB3GAP1Q15042 RNU6-1189P-201ENST00000383958 107 ntBASIC2.54□□□□□ -2
RAB3GAP1Q15042 RNU6-442P-201ENST00000383968 104 ntBASIC2.54□□□□□ -2
RAB3GAP1Q15042 RNU6-938P-201ENST00000411285 103 ntBASIC2.54□□□□□ -2
RAB3GAP1Q15042 AC131956.1-201ENST00000506420 258 ntTSL 2 BASIC2.54□□□□□ -2
RAB3GAP1Q15042 SCARNA16.3-201ENST00000516595 184 ntBASIC2.54□□□□□ -2
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