Protein–RNA interactions for Protein: Q14264

ERV3-1, Endogenous retrovirus group 3 member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 604 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERV3-1Q14264 U8.13-201ENST00000390842 128 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
ERV3-1Q14264 RNU2-55P-201ENST00000411146 174 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
ERV3-1Q14264 RNA5SP481-201ENST00000516814 122 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
ERV3-1Q14264 AC011604.1-201ENST00000545978 196 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
ERV3-1Q14264 SNRPGP19-201ENST00000603826 189 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
ERV3-1Q14264 uc_338.4-201ENST00000616635 176 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
ERV3-1Q14264 SYT14-201ENST00000367015 5094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.95□□□□□ -2.1
ERV3-1Q14264 SCN7A-201ENST00000409855 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.94□□□□□ -2.1
ERV3-1Q14264 PTPN22-206ENST00000525799 2118 ntTSL 1 (best) BASIC1.94□□□□□ -2.1
ERV3-1Q14264 ZDBF2-202ENST00000611847 9890 ntTSL 5 BASIC1.94□□□□□ -2.1
ERV3-1Q14264 RNU6-153P-201ENST00000364422 104 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
ERV3-1Q14264 Y_RNA.634-201ENST00000364811 113 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
ERV3-1Q14264 RNA5SP37-201ENST00000365420 130 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
ERV3-1Q14264 RNU6-1080P-201ENST00000383982 107 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
ERV3-1Q14264 AC019129.1-201ENST00000403786 261 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
ERV3-1Q14264 AC245047.4-201ENST00000433189 144 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
ERV3-1Q14264 SNORD77.4-201ENST00000516158 81 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
ERV3-1Q14264 AC024995.1-201ENST00000523014 93 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
ERV3-1Q14264 MIR3198-2-201ENST00000577868 80 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
ERV3-1Q14264 AC103810.8-201ENST00000607347 118 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
ERV3-1Q14264 MIR6129-201ENST00000616087 109 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
ERV3-1Q14264 OSBPL1A-217ENST00000638614 84 ntTSL 5 BASIC1.94□□□□□ -2.1
ERV3-1Q14264 HAS2-201ENST00000303924 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.93□□□□□ -2.1
ERV3-1Q14264 SNORA63.4-201ENST00000362763 126 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
ERV3-1Q14264 SNORA25.7-201ENST00000364375 127 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
ERV3-1Q14264 RNU6-1056P-201ENST00000383996 107 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
ERV3-1Q14264 RNU6-296P-201ENST00000384608 107 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
ERV3-1Q14264 MIR583-201ENST00000384846 75 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
ERV3-1Q14264 SNORA26.9-201ENST00000391322 122 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
ERV3-1Q14264 RNU2-70P-201ENST00000410718 179 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
ERV3-1Q14264 AL136985.1-201ENST00000424592 395 ntTSL 3 BASIC1.93□□□□□ -2.1
ERV3-1Q14264 AC010154.1-201ENST00000425857 269 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
ERV3-1Q14264 FTH1P12-201ENST00000432137 551 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
ERV3-1Q14264 RNU2-60P-201ENST00000517290 128 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
ERV3-1Q14264 AC084364.2-201ENST00000546924 395 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
ERV3-1Q14264 AC090049.2-201ENST00000550377 109 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
ERV3-1Q14264 AL160236.1-201ENST00000556317 195 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
ERV3-1Q14264 AC012493.3-201ENST00000604494 112 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
ERV3-1Q14264 TP73-AS1.1-201ENST00000611447 161 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
ERV3-1Q14264 U6.73-201ENST00000619194 103 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
ERV3-1Q14264 PLD1-217ENST00000627725 174 ntTSL 5 BASIC1.93□□□□□ -2.1
ERV3-1Q14264 LRRCC1-202ENST00000414626 4493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.93□□□□□ -2.1
ERV3-1Q14264 RNU6-834P-201ENST00000362367 110 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
ERV3-1Q14264 RNA5SP160-201ENST00000364866 120 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
ERV3-1Q14264 MIR562-201ENST00000384894 95 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
ERV3-1Q14264 MIR30A-201ENST00000385092 71 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
ERV3-1Q14264 SNORA40.5-201ENST00000391061 128 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
ERV3-1Q14264 SNORA40.18-201ENST00000391200 128 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
ERV3-1Q14264 RNU6-1064P-201ENST00000410626 104 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
ERV3-1Q14264 MLLT10P1-201ENST00000418346 262 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
ERV3-1Q14264 RNU6-772P-201ENST00000516042 105 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
ERV3-1Q14264 RNA5SP153-201ENST00000516498 76 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
ERV3-1Q14264 RNU7-149P-201ENST00000516739 59 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
ERV3-1Q14264 Y_RNA.712-201ENST00000517011 92 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
ERV3-1Q14264 AC097639.2-201ENST00000603159 172 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
ERV3-1Q14264 AC073413.2-201ENST00000604332 360 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
ERV3-1Q14264 MIR6845-201ENST00000613182 61 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
ERV3-1Q14264 Pinc.1-201ENST00000616452 154 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
ERV3-1Q14264 PYGO1-201ENST00000302000 8488 ntTSL 1 (best) BASIC1.92□□□□□ -2.1
ERV3-1Q14264 AC108866.1-201ENST00000503073 2339 ntTSL 5 BASIC1.92□□□□□ -2.1
ERV3-1Q14264 SCN7A-206ENST00000619410 7186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.92□□□□□ -2.1
ERV3-1Q14264 SCN7A-207ENST00000621965 7186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.92□□□□□ -2.1
ERV3-1Q14264 AC092881.1-201ENST00000638218 2733 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
ERV3-1Q14264 ZNF732-201ENST00000419098 2193 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC1.91□□□□□ -2.1
ERV3-1Q14264 RNU6-414P-201ENST00000363705 104 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
ERV3-1Q14264 Y_RNA.280-201ENST00000364765 112 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
ERV3-1Q14264 Y_RNA.486-201ENST00000384398 107 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
ERV3-1Q14264 RNA5SP323-201ENST00000391094 133 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
ERV3-1Q14264 RNY4P18-201ENST00000391107 89 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
ERV3-1Q14264 RNU6-1186P-201ENST00000410429 97 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
ERV3-1Q14264 Y_RNA.630-201ENST00000411370 108 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
ERV3-1Q14264 RN7SKP179-201ENST00000516126 217 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
ERV3-1Q14264 RNU6-1096P-201ENST00000517089 102 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
ERV3-1Q14264 RNU7-128P-201ENST00000517247 62 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
ERV3-1Q14264 MIR2681-201ENST00000581814 105 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
ERV3-1Q14264 AC131055.1-201ENST00000584626 316 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
ERV3-1Q14264 CEP162-201ENST00000257766 5063 ntTSL 1 (best) BASIC1.91□□□□□ -2.1
ERV3-1Q14264 DYNC2H1-203ENST00000398093 12945 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC1.9□□□□□ -2.11
ERV3-1Q14264 Y_RNA.114-201ENST00000363265 113 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
ERV3-1Q14264 Y_RNA.120-201ENST00000363304 110 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
ERV3-1Q14264 SNORA63D-201ENST00000364359 132 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
ERV3-1Q14264 RNU6-309P-201ENST00000364573 106 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
ERV3-1Q14264 RNU6-1144P-201ENST00000384247 104 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
ERV3-1Q14264 RNU6-476P-201ENST00000384726 107 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
ERV3-1Q14264 RNA5SP467-201ENST00000391274 118 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
ERV3-1Q14264 AL445685.2-201ENST00000422551 342 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
ERV3-1Q14264 NDUFA4P2-201ENST00000489989 244 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
ERV3-1Q14264 PDCD5P2-201ENST00000507570 312 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
ERV3-1Q14264 AC008834.1-201ENST00000511612 175 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
ERV3-1Q14264 Y_RNA.692-201ENST00000516627 105 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
ERV3-1Q14264 Y_RNA.757-201ENST00000578934 114 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
ERV3-1Q14264 MIR3121-201ENST00000579680 77 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
ERV3-1Q14264 AL359075.3-201ENST00000613288 217 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
ERV3-1Q14264 MIR8074-201ENST00000615081 81 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
ERV3-1Q14264 MIR3914-2-201ENST00000637339 95 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
ERV3-1Q14264 KTN1-204ENST00000395311 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.9□□□□□ -2.11
ERV3-1Q14264 Y_RNA.66-201ENST00000362862 102 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
ERV3-1Q14264 RNU1-17P-201ENST00000363022 152 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
ERV3-1Q14264 SNORA33-201ENST00000363664 130 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
ERV3-1Q14264 TRAJ41-201ENST00000390496 62 ntAPPRIS P1 BASIC1.89□□□□□ -2.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 167 ms