Protein–RNA interactions for Protein: Q14008

CKAP5, Cytoskeleton-associated protein 5, humanhuman

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Length 2,032 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CKAP5Q14008 AC004148.1-201ENST00000571506 398 ntTSL 5 BASIC1.69□□□□□ -2.14
CKAP5Q14008 DLEU2_5.2-201ENST00000610606 84 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
CKAP5Q14008 AC242852.1-201ENST00000612151 96 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
CKAP5Q14008 AC244015.1-201ENST00000622301 99 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
CKAP5Q14008 hsa-mir-3158-1.1-201ENST00000637571 81 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
CKAP5Q14008 KIAA1107-201ENST00000370378 4622 ntTSL 5 BASIC1.68□□□□□ -2.14
CKAP5Q14008 Y_RNA.91-201ENST00000363042 107 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
CKAP5Q14008 SNORA63D-201ENST00000364359 132 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
CKAP5Q14008 RNU1-52P-201ENST00000384190 164 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
CKAP5Q14008 Y_RNA.497-201ENST00000384447 98 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
CKAP5Q14008 AP001043.2-201ENST00000434589 288 ntTSL 3 BASIC1.68□□□□□ -2.14
CKAP5Q14008 AC015922.2-201ENST00000435593 184 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
CKAP5Q14008 SNORD77.4-201ENST00000516158 81 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
CKAP5Q14008 PTPN22-206ENST00000525799 2118 ntTSL 1 (best) BASIC1.68□□□□□ -2.14
CKAP5Q14008 AL035078.1-202ENST00000531627 413 ntTSL 2 BASIC1.68□□□□□ -2.14
CKAP5Q14008 RNU6-1228P-201ENST00000391014 107 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
CKAP5Q14008 RNU7-95P-201ENST00000459222 64 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
CKAP5Q14008 RNU1-104P-201ENST00000517280 175 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
CKAP5Q14008 AC131055.1-201ENST00000584626 316 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
CKAP5Q14008 MIR4781-201ENST00000585250 76 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
CKAP5Q14008 snoU13.31-201ENST00000607291 104 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
CKAP5Q14008 LRRD1-203ENST00000430130 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.67□□□□□ -2.14
CKAP5Q14008 RNU6-275P-201ENST00000364910 107 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
CKAP5Q14008 RNU6-424P-201ENST00000384367 105 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
CKAP5Q14008 Y_RNA.542-201ENST00000384641 111 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
CKAP5Q14008 RNU6-440P-201ENST00000390882 105 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
CKAP5Q14008 RNU6-1211P-201ENST00000459179 105 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
CKAP5Q14008 AC114811.1-201ENST00000507207 168 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
CKAP5Q14008 AC107027.2-201ENST00000512197 115 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
CKAP5Q14008 AC090155.2-201ENST00000518854 267 ntTSL 3 BASIC1.67□□□□□ -2.14
CKAP5Q14008 MIR4662B-201ENST00000579498 81 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
CKAP5Q14008 5S_rRNA.13-201ENST00000622298 123 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
CKAP5Q14008 DENND4A-209ENST00000635620 5887 ntTSL 5 BASIC1.67□□□□□ -2.14
CKAP5Q14008 SNORA33-201ENST00000363664 130 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
CKAP5Q14008 Y_RNA.370-201ENST00000365589 108 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
CKAP5Q14008 RNU6-449P-201ENST00000383914 107 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
CKAP5Q14008 RNU6-406P-201ENST00000516470 107 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
CKAP5Q14008 ZNF260-203ENST00000588993 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.66□□□□□ -2.14
CKAP5Q14008 CEP162-201ENST00000257766 5063 ntTSL 1 (best) BASIC1.66□□□□□ -2.14
CKAP5Q14008 RNU6-1138P-201ENST00000365359 106 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
CKAP5Q14008 MIR520A-201ENST00000384862 85 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
CKAP5Q14008 SNORD72-201ENST00000390994 80 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
CKAP5Q14008 AL606753.1-201ENST00000427435 87 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
CKAP5Q14008 AC055731.1-201ENST00000474387 401 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
CKAP5Q14008 NDUFA4P2-201ENST00000489989 244 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
CKAP5Q14008 HMSD-204ENST00000526932 162 ntTSL 3 BASIC1.66□□□□□ -2.14
CKAP5Q14008 MIR3618-201ENST00000580330 88 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
CKAP5Q14008 AC097639.2-201ENST00000603159 172 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
CKAP5Q14008 AC021506.2-201ENST00000612354 169 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
CKAP5Q14008 GS1-279B7.1-204ENST00000641809 378 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
CKAP5Q14008 FAR1-204ENST00000532502 5820 ntTSL 2 BASIC1.66□□□□□ -2.14
CKAP5Q14008 HIF1A-212ENST00000557538 3468 ntTSL 1 (best) BASIC1.65□□□□□ -2.14
CKAP5Q14008 snoU2_19.4-201ENST00000364329 80 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
CKAP5Q14008 MIR597-201ENST00000384968 97 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
CKAP5Q14008 RN7SKP200-201ENST00000410564 320 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
CKAP5Q14008 RNU2-70P-201ENST00000410718 179 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
CKAP5Q14008 SNRPGP14-201ENST00000435400 219 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
CKAP5Q14008 AL392103.1-201ENST00000447000 198 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
CKAP5Q14008 AL121914.1-201ENST00000450188 156 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
CKAP5Q14008 RNA5SP153-201ENST00000516498 76 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
CKAP5Q14008 AC024614.2-201ENST00000577584 372 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
CKAP5Q14008 MTND1P7-201ENST00000632801 297 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
CKAP5Q14008 RNU6-1209P-201ENST00000363655 107 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
CKAP5Q14008 RNU2-51P-201ENST00000410708 197 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
CKAP5Q14008 RNA5SP127-201ENST00000411051 133 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
CKAP5Q14008 Y_RNA.622-201ENST00000411091 108 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
CKAP5Q14008 AL035415.1-201ENST00000447150 289 ntTSL 5 BASIC1.64□□□□□ -2.15
CKAP5Q14008 RNA5SP272-201ENST00000516095 111 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
CKAP5Q14008 MIR3121-201ENST00000579680 77 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
CKAP5Q14008 MIR5194-201ENST00000582634 120 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
CKAP5Q14008 CHST9-202ENST00000581714 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.64□□□□□ -2.15
CKAP5Q14008 RNY1P5-201ENST00000383890 115 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
CKAP5Q14008 RNU6-804P-201ENST00000384286 107 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
CKAP5Q14008 MIR522-201ENST00000385071 87 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
CKAP5Q14008 MIR624-201ENST00000385217 97 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
CKAP5Q14008 TRAJ2-201ENST00000390535 66 ntAPPRIS P1 BASIC1.64□□□□□ -2.15
CKAP5Q14008 MIR1267-201ENST00000408723 78 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
CKAP5Q14008 RNU2-40P-201ENST00000410833 196 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
CKAP5Q14008 RNU7-34P-201ENST00000459394 64 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
CKAP5Q14008 SUMO2P16-201ENST00000519475 264 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
CKAP5Q14008 BX248123.2-201ENST00000606318 124 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
CKAP5Q14008 Hammerhead_HH9.1-201ENST00000616606 77 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
CKAP5Q14008 AC132825.6-201ENST00000638861 357 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
CKAP5Q14008 CEP57L1-213ENST00000520883 2055 ntTSL 5 BASIC1.64□□□□□ -2.15
CKAP5Q14008 OR4C11-202ENST00000641580 2737 ntAPPRIS P1 BASIC1.64□□□□□ -2.15
CKAP5Q14008 ZNF732-201ENST00000419098 2193 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC1.63□□□□□ -2.15
CKAP5Q14008 Y_RNA.218-201ENST00000364218 104 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
CKAP5Q14008 SNORA16.1-201ENST00000364597 132 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
CKAP5Q14008 SNORD50B-201ENST00000364995 70 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
CKAP5Q14008 Y_RNA.488-201ENST00000384403 102 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
CKAP5Q14008 MIR194-1-201ENST00000384892 85 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
CKAP5Q14008 RNA5SP501-201ENST00000410990 112 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
CKAP5Q14008 Y_RNA.666-201ENST00000516187 112 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
CKAP5Q14008 MIR3198-2-201ENST00000577868 80 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
CKAP5Q14008 RNU6-112P-201ENST00000363599 104 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
CKAP5Q14008 SNORD115-28-201ENST00000363931 81 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
CKAP5Q14008 RNU6-309P-201ENST00000364573 106 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
CKAP5Q14008 SNORA4.2-201ENST00000365313 147 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
CKAP5Q14008 SNORD18B-201ENST00000365659 72 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
CKAP5Q14008 HMGN2P19-201ENST00000425149 265 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
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