Protein–RNA interactions for Protein: Q13601

KRR1, KRR1 small subunit processome component homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 381 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRR1Q13601 RNU6-1199P-201ENST00000411249 104 ntBASIC-0.76□□□□□ -2.53
KRR1Q13601 LINC02541-201ENST00000427157 327 ntTSL 3 BASIC-0.76□□□□□ -2.53
KRR1Q13601 MIR655-201ENST00000362159 97 ntBASIC-0.77□□□□□ -2.53
KRR1Q13601 MIR148A-201ENST00000362215 68 ntBASIC-0.77□□□□□ -2.53
KRR1Q13601 RNU6-403P-201ENST00000363163 104 ntBASIC-0.77□□□□□ -2.53
KRR1Q13601 RNU4-75P-201ENST00000364621 146 ntBASIC-0.77□□□□□ -2.53
KRR1Q13601 SNORD116-11-201ENST00000383882 92 ntBASIC-0.77□□□□□ -2.53
KRR1Q13601 Y_RNA.536-201ENST00000384621 113 ntBASIC-0.77□□□□□ -2.53
KRR1Q13601 SNORA8.3-201ENST00000384679 139 ntBASIC-0.77□□□□□ -2.53
KRR1Q13601 SNORA75.1-201ENST00000391130 148 ntBASIC-0.77□□□□□ -2.53
KRR1Q13601 RNU6-1068P-201ENST00000410958 103 ntBASIC-0.77□□□□□ -2.53
KRR1Q13601 AL035258.1-201ENST00000439450 439 ntTSL 3 BASIC-0.77□□□□□ -2.53
KRR1Q13601 AC093730.1-201ENST00000508825 448 ntTSL 3 BASIC-0.77□□□□□ -2.53
KRR1Q13601 RNU6-765P-201ENST00000516916 99 ntBASIC-0.77□□□□□ -2.53
KRR1Q13601 AC024405.2-202ENST00000532731 184 ntBASIC-0.77□□□□□ -2.53
KRR1Q13601 AC138625.1-201ENST00000567556 483 ntTSL 3 BASIC-0.77□□□□□ -2.53
KRR1Q13601 MIR5706-201ENST00000579841 80 ntBASIC-0.77□□□□□ -2.53
KRR1Q13601 AP003357.1-201ENST00000604497 148 ntBASIC-0.77□□□□□ -2.53
KRR1Q13601 U7.6-201ENST00000610841 64 ntBASIC-0.77□□□□□ -2.53
KRR1Q13601 RNU6-1301P-201ENST00000362724 104 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.53
KRR1Q13601 RNU6-811P-201ENST00000384069 107 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.53
KRR1Q13601 Y_RNA.588-201ENST00000391254 102 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.53
KRR1Q13601 MTATP6P26-201ENST00000445926 662 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.53
KRR1Q13601 AC008243.1-201ENST00000504955 389 ntTSL 3 BASIC-0.78□□□□□ -2.53
KRR1Q13601 Y_RNA.666-201ENST00000516187 112 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.53
KRR1Q13601 SCARNA1-201ENST00000517138 166 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.53
KRR1Q13601 MIR4263-201ENST00000584745 83 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.53
KRR1Q13601 AC005014.2-201ENST00000607795 599 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.53
KRR1Q13601 AC027449.1-201ENST00000608890 407 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.53
KRR1Q13601 AC010205.1-201ENST00000616668 449 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.53
KRR1Q13601 AC068137.3-201ENST00000639191 341 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.53
KRR1Q13601 Y_RNA.530-201ENST00000384587 101 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
KRR1Q13601 RNU6-535P-201ENST00000384722 107 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
KRR1Q13601 MTCO3P40-201ENST00000392516 676 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
KRR1Q13601 RN7SKP142-201ENST00000411236 328 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
KRR1Q13601 AC244250.2-201ENST00000418731 148 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
KRR1Q13601 MTND4LP11-201ENST00000422184 280 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
KRR1Q13601 AL445567.1-201ENST00000439121 144 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
KRR1Q13601 RPS29P8-201ENST00000445109 171 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
KRR1Q13601 AC109327.2-201ENST00000448339 378 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
KRR1Q13601 AL158210.1-201ENST00000448835 500 ntTSL 3 BASIC-0.79□□□□□ -2.54
KRR1Q13601 RNU6-475P-201ENST00000516073 104 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
KRR1Q13601 RNU6-966P-201ENST00000516479 104 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
KRR1Q13601 AC138749.4-201ENST00000563970 127 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
KRR1Q13601 AC127455.1-201ENST00000565496 145 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
KRR1Q13601 MIR378D2-201ENST00000580636 98 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
KRR1Q13601 AP001180.6-201ENST00000584918 159 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
KRR1Q13601 AL133255.1-201ENST00000606374 441 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
KRR1Q13601 AL590491.3-201ENST00000610731 82 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
KRR1Q13601 Y_RNA.242-201ENST00000364473 110 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
KRR1Q13601 Y_RNA.450-201ENST00000384198 113 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
KRR1Q13601 MIR1278-201ENST00000408753 81 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
KRR1Q13601 RNU6-1190P-201ENST00000410811 104 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
KRR1Q13601 AL360091.3-201ENST00000442146 387 ntTSL 5 BASIC-0.8□□□□□ -2.54
KRR1Q13601 MTND3P3-201ENST00000505004 126 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
KRR1Q13601 RNU6-155P-201ENST00000516347 100 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
KRR1Q13601 RNU7-53P-201ENST00000516705 60 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
KRR1Q13601 MTND5P34-201ENST00000568888 325 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
KRR1Q13601 MIR4432-201ENST00000581823 84 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
KRR1Q13601 AC245884.10-201ENST00000597355 337 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
KRR1Q13601 AL391099.1-201ENST00000624635 187 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
KRR1Q13601 G3BP1-214ENST00000627077 114 ntTSL 5 BASIC-0.8□□□□□ -2.54
KRR1Q13601 CCDC7-215ENST00000639629 4158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC-0.8□□□□□ -2.54
KRR1Q13601 RNU6-726P-201ENST00000364680 107 ntBASIC-0.81□□□□□ -2.54
KRR1Q13601 Y_RNA.310-201ENST00000365063 113 ntBASIC-0.81□□□□□ -2.54
KRR1Q13601 RNU6-708P-201ENST00000384217 107 ntBASIC-0.81□□□□□ -2.54
KRR1Q13601 Y_RNA.481-201ENST00000384373 102 ntBASIC-0.81□□□□□ -2.54
KRR1Q13601 Y_RNA.539-201ENST00000384635 107 ntBASIC-0.81□□□□□ -2.54
KRR1Q13601 MIR548O-201ENST00000408583 114 ntBASIC-0.81□□□□□ -2.54
KRR1Q13601 RPL39P25-201ENST00000449384 154 ntBASIC-0.81□□□□□ -2.54
KRR1Q13601 AC018462.2-201ENST00000605375 395 ntBASIC-0.81□□□□□ -2.54
KRR1Q13601 CYP19A1-220ENST00000613097 123 ntTSL 5 BASIC-0.81□□□□□ -2.54
KRR1Q13601 MIR6507-201ENST00000613630 70 ntBASIC-0.81□□□□□ -2.54
KRR1Q13601 AC091931.1-201ENST00000623488 728 ntBASIC-0.81□□□□□ -2.54
KRR1Q13601 AL162376.1-201ENST00000624117 175 ntBASIC-0.81□□□□□ -2.54
KRR1Q13601 Y_RNA.146-201ENST00000363549 102 ntBASIC-0.82□□□□□ -2.54
KRR1Q13601 RNA5SP205-201ENST00000364653 136 ntBASIC-0.82□□□□□ -2.54
KRR1Q13601 Y_RNA.446-201ENST00000384178 104 ntBASIC-0.82□□□□□ -2.54
KRR1Q13601 U8.15-201ENST00000390947 134 ntBASIC-0.82□□□□□ -2.54
KRR1Q13601 RNU6ATAC42P-201ENST00000408637 95 ntBASIC-0.82□□□□□ -2.54
KRR1Q13601 SNORD11-201ENST00000459124 84 ntBASIC-0.82□□□□□ -2.54
KRR1Q13601 RNU6-437P-201ENST00000459408 95 ntBASIC-0.82□□□□□ -2.54
KRR1Q13601 AC096733.1-201ENST00000503844 402 ntTSL 3 BASIC-0.82□□□□□ -2.54
KRR1Q13601 Y_RNA.697-201ENST00000516776 113 ntBASIC-0.82□□□□□ -2.54
KRR1Q13601 NAMPTP3-201ENST00000569273 224 ntBASIC-0.82□□□□□ -2.54
KRR1Q13601 hsa-mir-3130-1.1-201ENST00000579223 75 ntBASIC-0.82□□□□□ -2.54
KRR1Q13601 MIR4491-201ENST00000581087 68 ntBASIC-0.82□□□□□ -2.54
KRR1Q13601 MIR2681-201ENST00000581814 105 ntBASIC-0.82□□□□□ -2.54
KRR1Q13601 AP001282.2-201ENST00000616149 309 ntBASIC-0.82□□□□□ -2.54
KRR1Q13601 Z69908.1-201ENST00000622603 247 ntBASIC-0.82□□□□□ -2.54
KRR1Q13601 SNORA25.7-201ENST00000364375 127 ntBASIC-0.83□□□□□ -2.54
KRR1Q13601 Y_RNA.341-201ENST00000365341 102 ntBASIC-0.83□□□□□ -2.54
KRR1Q13601 SNORA22B-201ENST00000383876 138 ntBASIC-0.83□□□□□ -2.54
KRR1Q13601 Y_RNA.414-201ENST00000384011 101 ntBASIC-0.83□□□□□ -2.54
KRR1Q13601 SNORA75-201ENST00000384158 137 ntBASIC-0.83□□□□□ -2.54
KRR1Q13601 Y_RNA.549-201ENST00000384657 102 ntBASIC-0.83□□□□□ -2.54
KRR1Q13601 MIR7-2-201ENST00000384970 110 ntBASIC-0.83□□□□□ -2.54
KRR1Q13601 MIR625-201ENST00000385047 85 ntBASIC-0.83□□□□□ -2.54
KRR1Q13601 AC108059.2-201ENST00000434626 151 ntBASIC-0.83□□□□□ -2.54
KRR1Q13601 SNORD5.1-201ENST00000458800 75 ntBASIC-0.83□□□□□ -2.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 105.6 ms