Protein–RNA interactions for Protein: Q13554

CAMK2B, Calcium/calmodulin-dependent protein kinase type II subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 666 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAMK2BQ13554 Y_RNA.4-201ENST00000362333 112 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
CAMK2BQ13554 SPRR2E-201ENST00000368750 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.83
CAMK2BQ13554 MIR206-201ENST00000384872 86 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
CAMK2BQ13554 MIR660-201ENST00000385235 97 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
CAMK2BQ13554 MIR1251-201ENST00000408552 70 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
CAMK2BQ13554 RPL23AP6-201ENST00000446637 472 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
CAMK2BQ13554 RNA5SP481-201ENST00000516814 122 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
CAMK2BQ13554 RNA5SP137-201ENST00000516833 135 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
CAMK2BQ13554 ZNF804B-202ENST00000611114 3968 ntTSL 5 BASIC3.58□□□□□ -1.84
CAMK2BQ13554 CYSLTR2-201ENST00000282018 4672 ntAPPRIS P1 BASIC3.58□□□□□ -1.84
CAMK2BQ13554 Y_RNA.140-201ENST00000363474 103 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
CAMK2BQ13554 SNORD38.2-201ENST00000384470 69 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
CAMK2BQ13554 RNU7-26P-201ENST00000458980 63 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
CAMK2BQ13554 SCARNA16.3-201ENST00000516595 184 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
CAMK2BQ13554 MIR7153-201ENST00000637758 57 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
CAMK2BQ13554 MACF1-204ENST00000372915 23440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.58□□□□□ -1.84
CAMK2BQ13554 RNU6-509P-201ENST00000363519 107 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
CAMK2BQ13554 SLC16A10-201ENST00000368850 10051 ntTSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.84
CAMK2BQ13554 CUL4B-202ENST00000371322 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.84
CAMK2BQ13554 SNORA48.8-201ENST00000391324 134 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
CAMK2BQ13554 HMGN1P33-201ENST00000432945 451 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
CAMK2BQ13554 Z96811.1-201ENST00000445880 108 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
CAMK2BQ13554 AC007370.2-201ENST00000506899 2694 ntTSL 5 BASIC3.57□□□□□ -1.84
CAMK2BQ13554 UBL5P1-201ENST00000507979 193 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
CAMK2BQ13554 AL078612.1-201ENST00000533009 150 ntTSL 5 BASIC3.57□□□□□ -1.84
CAMK2BQ13554 FAM106DP-201ENST00000586416 501 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
CAMK2BQ13554 AC021506.2-201ENST00000612354 169 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
CAMK2BQ13554 AC006160.2-201ENST00000637708 154 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
CAMK2BQ13554 GABRG2-213ENST00000639046 3058 ntTSL 5 BASIC3.57□□□□□ -1.84
CAMK2BQ13554 ZNF451-208ENST00000491832 3632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.56□□□□□ -1.84
CAMK2BQ13554 AC093831.2-201ENST00000624393 3427 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
CAMK2BQ13554 MAPK10-373ENST00000641983 6772 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
CAMK2BQ13554 TCF12-203ENST00000343827 3956 ntTSL 1 (best) BASIC3.56□□□□□ -1.84
CAMK2BQ13554 CREBRF-201ENST00000296953 7778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.56□□□□□ -1.84
CAMK2BQ13554 SNORD9-201ENST00000362566 104 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
CAMK2BQ13554 Y_RNA.191-201ENST00000363972 113 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
CAMK2BQ13554 Y_RNA.247-201ENST00000364500 92 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
CAMK2BQ13554 Y_RNA.609-201ENST00000410669 89 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
CAMK2BQ13554 RNU6-1086P-201ENST00000410930 100 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
CAMK2BQ13554 snoU13.27-201ENST00000459278 104 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
CAMK2BQ13554 RNU6-826P-201ENST00000516827 104 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
CAMK2BQ13554 MIR4425-201ENST00000580572 84 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
CAMK2BQ13554 RNU6-90P-201ENST00000606352 106 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
CAMK2BQ13554 ADGRL2-207ENST00000370723 5254 ntTSL 5 BASIC3.56□□□□□ -1.84
CAMK2BQ13554 RTN4-209ENST00000405240 4061 ntTSL 1 (best) BASIC3.56□□□□□ -1.84
CAMK2BQ13554 PCDH15-218ENST00000437009 6804 ntTSL 5 BASIC3.56□□□□□ -1.84
CAMK2BQ13554 SYNE1-212ENST00000423061 27436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
CAMK2BQ13554 ETV1-202ENST00000399357 6096 ntTSL 2 BASIC3.55□□□□□ -1.84
CAMK2BQ13554 AC025164.2-202ENST00000499685 5699 ntTSL 3 BASIC3.55□□□□□ -1.84
CAMK2BQ13554 RNU6-1163P-201ENST00000364516 107 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
CAMK2BQ13554 RNU6-652P-201ENST00000365488 107 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
CAMK2BQ13554 RNU1-148P-201ENST00000384472 162 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
CAMK2BQ13554 RNU6-342P-201ENST00000384521 104 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
CAMK2BQ13554 MIR526A1-201ENST00000384897 85 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
CAMK2BQ13554 Y_RNA.607-201ENST00000410597 98 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
CAMK2BQ13554 HMGN2P3-201ENST00000433603 273 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
CAMK2BQ13554 HMGN2P5-201ENST00000436882 273 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
CAMK2BQ13554 SPINT5P-201ENST00000448174 155 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
CAMK2BQ13554 UBE2DNL-203ENST00000474922 222 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
CAMK2BQ13554 RNU7-35P-201ENST00000517174 62 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
CAMK2BQ13554 AL137849.1-201ENST00000604767 169 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
CAMK2BQ13554 MIR548BB-201ENST00000626714 66 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
CAMK2BQ13554 SLC8A1-AS1-230ENST00000627538 212 ntTSL 5 BASIC3.55□□□□□ -1.84
CAMK2BQ13554 FRYL-205ENST00000503238 11103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.55□□□□□ -1.84
CAMK2BQ13554 ADAT2-203ENST00000606514 6651 ntTSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
CAMK2BQ13554 POSTN-209ENST00000541179 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
CAMK2BQ13554 ZBTB37-201ENST00000367701 19128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.54□□□□□ -1.84
CAMK2BQ13554 PGGT1B-203ENST00000419445 9545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.54□□□□□ -1.84
CAMK2BQ13554 AL356274.2-201ENST00000624379 3752 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
CAMK2BQ13554 SNORA38.1-201ENST00000364172 131 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
CAMK2BQ13554 Y_RNA.448-201ENST00000384185 108 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
CAMK2BQ13554 Y_RNA.510-201ENST00000384511 114 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
CAMK2BQ13554 Y_RNA.567-201ENST00000384736 106 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
CAMK2BQ13554 RNU6-447P-201ENST00000410293 104 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
CAMK2BQ13554 RNU6-1118P-201ENST00000410382 104 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
CAMK2BQ13554 RNU6-1076P-201ENST00000410397 104 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
CAMK2BQ13554 RNU6-355P-201ENST00000410427 104 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
CAMK2BQ13554 RNU6-791P-201ENST00000410467 104 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
CAMK2BQ13554 RNU6-705P-201ENST00000410601 104 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
CAMK2BQ13554 RNU6-1100P-201ENST00000410691 104 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
CAMK2BQ13554 RNU6-860P-201ENST00000410860 104 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
CAMK2BQ13554 RNU6-1217P-201ENST00000411276 104 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
CAMK2BQ13554 RNU6-785P-201ENST00000411324 104 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
CAMK2BQ13554 AL365434.1-201ENST00000412362 380 ntTSL 3 BASIC3.54□□□□□ -1.84
CAMK2BQ13554 RPS29P31-201ENST00000446147 164 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
CAMK2BQ13554 AC234781.5-201ENST00000508429 271 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
CAMK2BQ13554 U6.90-201ENST00000614007 104 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
CAMK2BQ13554 U6.70-201ENST00000620287 104 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
CAMK2BQ13554 BCLAF1-205ENST00000527536 5371 ntTSL 5 BASIC3.54□□□□□ -1.84
CAMK2BQ13554 MUC19-205ENST00000454784 24775 ntTSL 5 BASIC3.54□□□□□ -1.84
CAMK2BQ13554 ZNF99-201ENST00000397104 3114 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.54□□□□□ -1.84
CAMK2BQ13554 SLITRK6-201ENST00000400286 4318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.53□□□□□ -1.84
CAMK2BQ13554 TRAV39-201ENST00000390466 331 ntAPPRIS P1 BASIC3.53□□□□□ -1.84
CAMK2BQ13554 MIR548G-201ENST00000408442 89 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
CAMK2BQ13554 RNU2-27P-201ENST00000516185 142 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
CAMK2BQ13554 RNVU1-2-201ENST00000516326 135 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
CAMK2BQ13554 SNORA74.3-201ENST00000517108 154 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
CAMK2BQ13554 CYP3A52P-201ENST00000563326 91 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
CAMK2BQ13554 RPL12P50-201ENST00000603116 116 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
CAMK2BQ13554 AL161431.1-201ENST00000618966 4205 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 100 ms