Protein–RNA interactions for Protein: Q13488

TCIRG1, V-type proton ATPase 116 kDa subunit a isoform 3, humanhuman

Predictions only

Length 830 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCIRG1Q13488 Y_RNA.118-201ENST00000363300 101 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
TCIRG1Q13488 Y_RNA.218-201ENST00000364218 104 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
TCIRG1Q13488 SNORA25.7-201ENST00000364375 127 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
TCIRG1Q13488 AL035415.1-201ENST00000447150 289 ntTSL 5 BASIC2.36□□□□□ -2.03
TCIRG1Q13488 MRPS17P9-201ENST00000511924 393 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
TCIRG1Q13488 RNU6-313P-201ENST00000516317 112 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
TCIRG1Q13488 RNU6-126P-201ENST00000516685 103 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
TCIRG1Q13488 AC090142.3-201ENST00000519012 385 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
TCIRG1Q13488 AC084364.2-201ENST00000546924 395 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
TCIRG1Q13488 LINC02277-202ENST00000556472 453 ntTSL 3 BASIC2.36□□□□□ -2.03
TCIRG1Q13488 MIR4287-201ENST00000579398 78 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
TCIRG1Q13488 AC002984.1-201ENST00000591692 448 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
TCIRG1Q13488 AL773524.1-201ENST00000614065 229 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
TCIRG1Q13488 AL591926.4-201ENST00000616895 298 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
TCIRG1Q13488 AP001340.1-201ENST00000624405 217 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
TCIRG1Q13488 TEX15-203ENST00000638951 11341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.36□□□□□ -2.03
TCIRG1Q13488 PTPRQ-209ENST00000616559 8165 ntTSL 5 BASIC2.36□□□□□ -2.03
TCIRG1Q13488 MIPOL1-203ENST00000537471 5954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.35□□□□□ -2.03
TCIRG1Q13488 MIR539-201ENST00000365690 78 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
TCIRG1Q13488 MIR520A-201ENST00000384862 85 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
TCIRG1Q13488 SNORA17.3-201ENST00000391159 129 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
TCIRG1Q13488 SNORA26-201ENST00000391286 122 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
TCIRG1Q13488 AC008267.6-201ENST00000441664 139 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
TCIRG1Q13488 RNA5SP233-201ENST00000459153 113 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
TCIRG1Q13488 RNU6-1211P-201ENST00000459179 105 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
TCIRG1Q13488 RPS29P11-201ENST00000496507 171 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
TCIRG1Q13488 RNU6ATAC12P-201ENST00000516542 115 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
TCIRG1Q13488 AP001328.1-201ENST00000528550 176 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
TCIRG1Q13488 AP002004.2-201ENST00000531656 154 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
TCIRG1Q13488 TUG1_4.1-201ENST00000619464 181 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
TCIRG1Q13488 ZNF260-203ENST00000588993 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.35□□□□□ -2.03
TCIRG1Q13488 RNA5SP276-201ENST00000362580 94 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
TCIRG1Q13488 Y_RNA.66-201ENST00000362862 102 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
TCIRG1Q13488 Y_RNA.71-201ENST00000362892 104 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
TCIRG1Q13488 RNU6-112P-201ENST00000363599 104 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
TCIRG1Q13488 SNORA63D-201ENST00000364359 132 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
TCIRG1Q13488 Y_RNA.508-201ENST00000384502 114 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
TCIRG1Q13488 SNORD72-201ENST00000390994 80 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
TCIRG1Q13488 Y_RNA.584-201ENST00000391090 114 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
TCIRG1Q13488 RNA5SP100-201ENST00000410903 110 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
TCIRG1Q13488 RNA5SP59-201ENST00000410922 110 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
TCIRG1Q13488 AC244636.1-201ENST00000421152 228 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
TCIRG1Q13488 AL049830.1-201ENST00000468034 425 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
TCIRG1Q13488 MIR514B-201ENST00000516774 80 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
TCIRG1Q13488 RNU1-40P-201ENST00000516816 164 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
TCIRG1Q13488 RNU2-56P-201ENST00000516826 190 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
TCIRG1Q13488 RNU1-97P-201ENST00000516872 164 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
TCIRG1Q13488 5S_rRNA.3-201ENST00000517021 110 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
TCIRG1Q13488 AC008507.4-201ENST00000585464 127 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
TCIRG1Q13488 AC022217.4-201ENST00000604389 163 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
TCIRG1Q13488 5S_rRNA.19-201ENST00000612131 110 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
TCIRG1Q13488 5S_rRNA.18-201ENST00000621941 110 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
TCIRG1Q13488 FSIP2-206ENST00000611759 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.33□□□□□ -2.04
TCIRG1Q13488 AL596028.1-201ENST00000326971 197 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
TCIRG1Q13488 CXADR-202ENST00000356275 270 ntTSL 1 (best) BASIC2.33□□□□□ -2.04
TCIRG1Q13488 MIR126-201ENST00000362291 85 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
TCIRG1Q13488 TRAJ41-201ENST00000390496 62 ntAPPRIS P1 BASIC2.33□□□□□ -2.04
TCIRG1Q13488 RNA5SP338-201ENST00000410495 85 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
TCIRG1Q13488 RNU6-321P-201ENST00000410912 106 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
TCIRG1Q13488 AL606517.2-201ENST00000442855 241 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
TCIRG1Q13488 SNORA25.15-201ENST00000516487 89 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
TCIRG1Q13488 RNU6-1234P-201ENST00000516877 103 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
TCIRG1Q13488 RNU6-365P-201ENST00000517113 106 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
TCIRG1Q13488 AC007751.1-201ENST00000529260 376 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
TCIRG1Q13488 MIR3683-201ENST00000580847 82 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
TCIRG1Q13488 U7.2-201ENST00000607576 63 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
TCIRG1Q13488 AC011603.4-201ENST00000611325 277 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
TCIRG1Q13488 PTPN22-206ENST00000525799 2118 ntTSL 1 (best) BASIC2.33□□□□□ -2.04
TCIRG1Q13488 ATP11C-202ENST00000361648 6010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.33□□□□□ -2.04
TCIRG1Q13488 MIER3-204ENST00000381226 5210 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.32□□□□□ -2.04
TCIRG1Q13488 AC007370.2-201ENST00000506899 2694 ntTSL 5 BASIC2.32□□□□□ -2.04
TCIRG1Q13488 WWP1P1-201ENST00000466609 2769 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
TCIRG1Q13488 RNY1P10-201ENST00000363268 113 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
TCIRG1Q13488 Y_RNA.127-201ENST00000363386 109 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
TCIRG1Q13488 Y_RNA.261-201ENST00000364631 102 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
TCIRG1Q13488 RNU6-915P-201ENST00000364943 103 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
TCIRG1Q13488 RNA5SP190-201ENST00000365222 118 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
TCIRG1Q13488 SNORD116-14-201ENST00000383894 92 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
TCIRG1Q13488 SNORD116-17-201ENST00000383929 92 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
TCIRG1Q13488 SNORD116-15-201ENST00000384445 92 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
TCIRG1Q13488 SNORD116-19-201ENST00000384729 92 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
TCIRG1Q13488 MIR522-201ENST00000385071 87 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
TCIRG1Q13488 TRAJ2-201ENST00000390535 66 ntAPPRIS P1 BASIC2.32□□□□□ -2.04
TCIRG1Q13488 AL356379.1-201ENST00000414105 126 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
TCIRG1Q13488 MLLT10P1-201ENST00000418346 262 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
TCIRG1Q13488 RNU6-717P-201ENST00000459076 104 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
TCIRG1Q13488 RPS27P21-201ENST00000486977 252 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
TCIRG1Q13488 RNA5SP481-201ENST00000516814 122 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
TCIRG1Q13488 AC087685.1-201ENST00000587507 141 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
TCIRG1Q13488 AP000553.5-201ENST00000641933 54 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
TCIRG1Q13488 TBL1XR1-208ENST00000430069 7948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.32□□□□□ -2.04
TCIRG1Q13488 LRRD1-203ENST00000430130 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.32□□□□□ -2.04
TCIRG1Q13488 RNU6-1290P-201ENST00000362957 109 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
TCIRG1Q13488 RNU6-457P-201ENST00000363999 107 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
TCIRG1Q13488 RNU6-296P-201ENST00000384608 107 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
TCIRG1Q13488 MIR499A-201ENST00000384903 122 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
TCIRG1Q13488 RNU6-735P-201ENST00000410612 107 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
TCIRG1Q13488 BTF3P4-201ENST00000418852 495 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
TCIRG1Q13488 RPL23AP6-201ENST00000446637 472 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
TCIRG1Q13488 RNU6-1333P-201ENST00000516162 93 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
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