Protein–RNA interactions for Protein: Q13435

SF3B2, Splicing factor 3B subunit 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 895 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SF3B2Q13435 SNORA28-201ENST00000606769 126 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
SF3B2Q13435 AC010297.1-201ENST00000623948 149 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
SF3B2Q13435 ZNF732-201ENST00000419098 2193 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC3.04□□□□□ -1.92
SF3B2Q13435 SNORA25.6-201ENST00000364121 118 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
SF3B2Q13435 Y_RNA.273-201ENST00000364703 102 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
SF3B2Q13435 Y_RNA.525-201ENST00000384570 113 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
SF3B2Q13435 AL603914.1-201ENST00000401964 204 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
SF3B2Q13435 MIR548O-201ENST00000408583 114 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
SF3B2Q13435 AL136985.1-201ENST00000424592 395 ntTSL 3 BASIC3.03□□□□□ -1.92
SF3B2Q13435 MTATP6P21-201ENST00000440681 189 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
SF3B2Q13435 LINC01766-201ENST00000453968 362 ntTSL 3 BASIC3.03□□□□□ -1.92
SF3B2Q13435 TRMT112P2-201ENST00000512910 132 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
SF3B2Q13435 MYSM1-208ENST00000622766 6020 ntTSL 1 (best) BASIC3.03□□□□□ -1.92
SF3B2Q13435 AC016717.2-201ENST00000609089 5141 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
SF3B2Q13435 MIR524-201ENST00000385242 87 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
SF3B2Q13435 RNA5SP465-201ENST00000391195 109 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
SF3B2Q13435 RNA5SP270-201ENST00000411361 118 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
SF3B2Q13435 AL158823.1-201ENST00000418441 478 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
SF3B2Q13435 RNU2-60P-201ENST00000517290 128 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
SF3B2Q13435 IGHVIII-67-2-201ENST00000519849 88 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
SF3B2Q13435 MIR6845-201ENST00000613182 61 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
SF3B2Q13435 SCN7A-206ENST00000619410 7186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.02□□□□□ -1.93
SF3B2Q13435 SCN7A-207ENST00000621965 7186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.02□□□□□ -1.93
SF3B2Q13435 NAALADL2-203ENST00000454872 9865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.02□□□□□ -1.93
SF3B2Q13435 KPNA5-202ENST00000368564 11311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.02□□□□□ -1.93
SF3B2Q13435 Y_RNA.114-201ENST00000363265 113 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
SF3B2Q13435 RNU6-309P-201ENST00000364573 106 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
SF3B2Q13435 RNU6-1292P-201ENST00000383856 107 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
SF3B2Q13435 MIR583-201ENST00000384846 75 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
SF3B2Q13435 MIR891A-201ENST00000401237 79 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
SF3B2Q13435 RNU4ATAC16P-201ENST00000408512 126 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
SF3B2Q13435 MIR1283-2-201ENST00000408621 87 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
SF3B2Q13435 AC133485.4-201ENST00000561835 220 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
SF3B2Q13435 AC138907.4-201ENST00000570107 226 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
SF3B2Q13435 MIR3121-201ENST00000579680 77 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
SF3B2Q13435 MTND5P32-201ENST00000560711 1802 ntBASIC3□□□□□ -1.93
SF3B2Q13435 LCORL-202ENST00000382224 4984 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3□□□□□ -1.93
SF3B2Q13435 MIR6073-201ENST00000352083 89 ntBASIC3□□□□□ -1.93
SF3B2Q13435 Y_RNA.353-201ENST00000365440 108 ntBASIC3□□□□□ -1.93
SF3B2Q13435 RNU6-163P-201ENST00000384396 106 ntBASIC3□□□□□ -1.93
SF3B2Q13435 MIR548A2-201ENST00000384956 97 ntBASIC3□□□□□ -1.93
SF3B2Q13435 MIR518F-201ENST00000384973 87 ntBASIC3□□□□□ -1.93
SF3B2Q13435 HMGN2P39-201ENST00000398005 273 ntBASIC3□□□□□ -1.93
SF3B2Q13435 RN7SKP200-201ENST00000410564 320 ntBASIC3□□□□□ -1.93
SF3B2Q13435 RNU2-7P-201ENST00000410794 178 ntBASIC3□□□□□ -1.93
SF3B2Q13435 AF228730.3-201ENST00000436691 102 ntBASIC3□□□□□ -1.93
SF3B2Q13435 AL158147.1-201ENST00000443970 75 ntBASIC3□□□□□ -1.93
SF3B2Q13435 RNVU1-2-201ENST00000516326 135 ntBASIC3□□□□□ -1.93
SF3B2Q13435 RNU6-1061P-201ENST00000516530 99 ntBASIC3□□□□□ -1.93
SF3B2Q13435 PTPN22-206ENST00000525799 2118 ntTSL 1 (best) BASIC3□□□□□ -1.93
SF3B2Q13435 Clostridiales-1.3-201ENST00000637703 147 ntBASIC3□□□□□ -1.93
SF3B2Q13435 FGF7-206ENST00000614567 3936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3□□□□□ -1.93
SF3B2Q13435 RNU6-508P-201ENST00000363231 103 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
SF3B2Q13435 Y_RNA.224-201ENST00000364308 111 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
SF3B2Q13435 Y_RNA.336-201ENST00000365307 109 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
SF3B2Q13435 SNORD20-201ENST00000384550 80 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
SF3B2Q13435 SNORD77.3-201ENST00000391113 65 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
SF3B2Q13435 HMGN2P32-201ENST00000444648 269 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
SF3B2Q13435 RNU7-25P-201ENST00000516544 62 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
SF3B2Q13435 SNORA31.15-201ENST00000516771 132 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
SF3B2Q13435 AL022345.2-201ENST00000606307 135 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
SF3B2Q13435 AC006441.5-201ENST00000612680 209 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
SF3B2Q13435 MIR203B-201ENST00000636080 86 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
SF3B2Q13435 CENPE-201ENST00000265148 8612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.99□□□□□ -1.93
SF3B2Q13435 RNU6-268P-201ENST00000364174 107 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
SF3B2Q13435 DEFA7P-201ENST00000382676 285 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
SF3B2Q13435 RNU6-950P-201ENST00000384651 107 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
SF3B2Q13435 TRAJ41-201ENST00000390496 62 ntAPPRIS P1 BASIC2.98□□□□□ -1.93
SF3B2Q13435 RNA5SP210-201ENST00000391034 120 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
SF3B2Q13435 HSPE1P9-201ENST00000440046 311 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
SF3B2Q13435 AC114811.1-201ENST00000507207 168 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
SF3B2Q13435 RNU6-772P-201ENST00000516042 105 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
SF3B2Q13435 SNORA31.10-201ENST00000516482 106 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
SF3B2Q13435 RNU6-1116P-201ENST00000517269 99 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
SF3B2Q13435 AL359821.1-201ENST00000605519 182 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
SF3B2Q13435 AC134878.1-201ENST00000619901 243 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
SF3B2Q13435 AL034345.1-201ENST00000407768 123 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
SF3B2Q13435 RNU6-1149P-201ENST00000516810 97 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
SF3B2Q13435 MIR5007-201ENST00000583098 95 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
SF3B2Q13435 SNORD14A-201ENST00000606526 91 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
SF3B2Q13435 CLRN1-AS1.1-201ENST00000615643 79 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
SF3B2Q13435 AC015726.2-201ENST00000620112 122 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
SF3B2Q13435 SACS-201ENST00000382292 15324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.97□□□□□ -1.93
SF3B2Q13435 RGPD6-201ENST00000329516 7165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.96□□□□□ -1.94
SF3B2Q13435 RNU6-647P-201ENST00000364243 107 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
SF3B2Q13435 RNU6-1056P-201ENST00000383996 107 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
SF3B2Q13435 TRAV41-201ENST00000390468 336 ntAPPRIS P1 BASIC2.96□□□□□ -1.94
SF3B2Q13435 CYCTP-201ENST00000504253 315 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
SF3B2Q13435 MIR5092-201ENST00000583139 88 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
SF3B2Q13435 AL161716.1-201ENST00000606365 273 ntTSL 5 BASIC2.96□□□□□ -1.94
SF3B2Q13435 VPS54-202ENST00000354504 3594 ntTSL 1 (best) BASIC2.96□□□□□ -1.94
SF3B2Q13435 CHST9-202ENST00000581714 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.95□□□□□ -1.94
SF3B2Q13435 Y_RNA.81-201ENST00000362997 102 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
SF3B2Q13435 SNORD115-28-201ENST00000363931 81 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
SF3B2Q13435 SNORA4.2-201ENST00000365313 147 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
SF3B2Q13435 TRAJ50-201ENST00000390487 60 ntAPPRIS P1 BASIC2.95□□□□□ -1.94
SF3B2Q13435 AC019129.1-201ENST00000403786 261 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
SF3B2Q13435 FAR2P3-204ENST00000434661 444 ntTSL 2 BASIC2.95□□□□□ -1.94
SF3B2Q13435 AC131956.1-201ENST00000506420 258 ntTSL 2 BASIC2.95□□□□□ -1.94
SF3B2Q13435 Y_RNA.712-201ENST00000517011 92 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
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