Protein–RNA interactions for Protein: H7C1Q1

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 480 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H7C1Q1 RPL23AP63-201ENST00000498752 471 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
H7C1Q1 MIR4529-201ENST00000578110 78 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
H7C1Q1 AL160408.5-201ENST00000607759 526 ntTSL 4 BASIC1.9□□□□□ -2.11
H7C1Q1 PYGO1-201ENST00000302000 8488 ntTSL 1 (best) BASIC1.89□□□□□ -2.11
H7C1Q1 Y_RNA.66-201ENST00000362862 102 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
H7C1Q1 Y_RNA.226-201ENST00000364337 114 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
H7C1Q1 SNORA63D-201ENST00000364359 132 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
H7C1Q1 snoU2-30.1-201ENST00000365012 70 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
H7C1Q1 MIR520A-201ENST00000384862 85 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
H7C1Q1 MIR221-201ENST00000385135 110 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
H7C1Q1 TRAJ2-201ENST00000390535 66 ntAPPRIS P1 BASIC1.89□□□□□ -2.11
H7C1Q1 Y_RNA.586-201ENST00000391146 98 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
H7C1Q1 RNU7-197P-201ENST00000458836 62 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
H7C1Q1 RNA5SP200-201ENST00000516360 103 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
H7C1Q1 SNORD45.4-201ENST00000516629 73 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
H7C1Q1 AC007751.1-201ENST00000529260 376 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
H7C1Q1 SUB1P4-201ENST00000566062 339 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
H7C1Q1 AC087685.1-201ENST00000587507 141 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
H7C1Q1 AC009831.4-201ENST00000620744 325 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
H7C1Q1 LINC01068-202ENST00000620874 626 ntTSL 3 BASIC1.89□□□□□ -2.11
H7C1Q1 MIR219B-201ENST00000637023 88 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
H7C1Q1 DYNC2H1-203ENST00000398093 12945 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC1.89□□□□□ -2.11
H7C1Q1 AC131280.1-202ENST00000624067 4211 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
H7C1Q1 KNL1-204ENST00000527044 5404 ntTSL 5 BASIC1.88□□□□□ -2.11
H7C1Q1 RNU6-112P-201ENST00000363599 104 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
H7C1Q1 U8.5-201ENST00000364528 136 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
H7C1Q1 SNORD61-201ENST00000384252 73 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
H7C1Q1 RNU6-163P-201ENST00000384396 106 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
H7C1Q1 Y_RNA.542-201ENST00000384641 111 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
H7C1Q1 SNORA40-201ENST00000388090 126 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
H7C1Q1 TRAJ41-201ENST00000390496 62 ntAPPRIS P1 BASIC1.88□□□□□ -2.11
H7C1Q1 RN7SKP200-201ENST00000410564 320 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
H7C1Q1 MTND4LP9-201ENST00000427694 174 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
H7C1Q1 CALM2P4-201ENST00000430810 426 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
H7C1Q1 TTTY16-201ENST00000437686 192 ntTSL 1 (best) BASIC1.88□□□□□ -2.11
H7C1Q1 AC114811.1-201ENST00000507207 168 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
H7C1Q1 RNU6-1053P-201ENST00000515930 101 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
H7C1Q1 RNU6-504P-201ENST00000516568 104 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
H7C1Q1 RNU6-126P-201ENST00000516685 103 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
H7C1Q1 RNU7-28P-201ENST00000516759 62 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
H7C1Q1 MIR3129-201ENST00000581095 76 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
H7C1Q1 AC022596.1-201ENST00000582895 302 ntTSL 5 BASIC1.88□□□□□ -2.11
H7C1Q1 MIR4762-201ENST00000585261 75 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
H7C1Q1 SNORA28-201ENST00000606769 126 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
H7C1Q1 XIRP2-201ENST00000295237 5246 ntTSL 2 BASIC1.87□□□□□ -2.11
H7C1Q1 RNA5SP138-201ENST00000365098 114 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
H7C1Q1 RNU6-442P-201ENST00000383968 104 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
H7C1Q1 SNORA1-201ENST00000384107 130 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
H7C1Q1 RNU6-693P-201ENST00000516134 107 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
H7C1Q1 HMSD-204ENST00000526932 162 ntTSL 3 BASIC1.87□□□□□ -2.11
H7C1Q1 MIR4287-201ENST00000579398 78 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
H7C1Q1 hsa-mir-4536-1.1-201ENST00000636519 88 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
H7C1Q1 PI15-201ENST00000260113 6732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.87□□□□□ -2.11
H7C1Q1 CEP57L1-213ENST00000520883 2055 ntTSL 5 BASIC1.87□□□□□ -2.11
H7C1Q1 CHST9-202ENST00000581714 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.86□□□□□ -2.11
H7C1Q1 CXADR-202ENST00000356275 270 ntTSL 1 (best) BASIC1.86□□□□□ -2.11
H7C1Q1 RNA5SP276-201ENST00000362580 94 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
H7C1Q1 RNU1-17P-201ENST00000363022 152 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
H7C1Q1 RNU6-296P-201ENST00000384608 107 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
H7C1Q1 Y_RNA.584-201ENST00000391090 114 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
H7C1Q1 U8.16-201ENST00000391279 133 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
H7C1Q1 SNORA26.9-201ENST00000391322 122 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
H7C1Q1 AL023284.1-201ENST00000403956 276 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
H7C1Q1 AL034345.1-201ENST00000407768 123 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
H7C1Q1 MIR548O-201ENST00000408583 114 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
H7C1Q1 SNRPGP13-201ENST00000442212 177 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
H7C1Q1 RNU6-1211P-201ENST00000459179 105 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
H7C1Q1 RNA5SP57-201ENST00000459463 123 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
H7C1Q1 CFLAR-AS1-202ENST00000474886 223 ntTSL 3 BASIC1.86□□□□□ -2.11
H7C1Q1 SNORA18.4-201ENST00000516440 124 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
H7C1Q1 RNU1-40P-201ENST00000516816 164 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
H7C1Q1 RNU1-97P-201ENST00000516872 164 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
H7C1Q1 RNU6-971P-201ENST00000516920 106 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
H7C1Q1 PLD1-217ENST00000627725 174 ntTSL 5 BASIC1.86□□□□□ -2.11
H7C1Q1 Y_RNA.251-201ENST00000364551 99 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
H7C1Q1 RNU6-915P-201ENST00000364943 103 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
H7C1Q1 RNU6-81P-201ENST00000365608 104 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
H7C1Q1 RNU6-950P-201ENST00000384651 107 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
H7C1Q1 MIR1287-201ENST00000408492 90 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
H7C1Q1 RNU7-25P-201ENST00000516544 62 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
H7C1Q1 MIR4709-201ENST00000577272 72 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
H7C1Q1 AC011603.4-201ENST00000611325 277 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
H7C1Q1 U1.36-201ENST00000620684 176 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
H7C1Q1 KTN1-207ENST00000438792 4449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.85□□□□□ -2.11
H7C1Q1 MIRLET7C-201ENST00000362160 84 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
H7C1Q1 U8.1-201ENST00000362843 134 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
H7C1Q1 RNU6-888P-201ENST00000363010 101 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
H7C1Q1 RNU6-268P-201ENST00000364174 107 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
H7C1Q1 Y_RNA.242-201ENST00000364473 110 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
H7C1Q1 RNU6-1031P-201ENST00000384773 107 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
H7C1Q1 MIR548A2-201ENST00000384956 97 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
H7C1Q1 MIR518F-201ENST00000384973 87 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
H7C1Q1 U8.13-201ENST00000390842 128 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
H7C1Q1 RNA5SP100-201ENST00000410903 110 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
H7C1Q1 RNA5SP59-201ENST00000410922 110 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
H7C1Q1 AL135790.1-201ENST00000427161 157 ntTSL 3 BASIC1.84□□□□□ -2.11
H7C1Q1 AL353747.2-201ENST00000439207 205 ntTSL 3 BASIC1.84□□□□□ -2.11
H7C1Q1 RNU6-717P-201ENST00000459076 104 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
H7C1Q1 snoU13.27-201ENST00000459278 104 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
H7C1Q1 CYCTP-201ENST00000504253 315 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 109.7 ms