Protein–RNA interactions for Protein: A0A0J9YYF1

TRBV7-4, T-cell receptor beta variable 7-4 (gene/pseudogene) (Fragment), humanhuman

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Length 115 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRBV7-4A0A0J9YYF1 JPX_2.1-201ENST00000614161 69 ntBASIC-1.43□□□□□ -2.64
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SATB1-AS1-243ENST00000627546 589 ntTSL 5 BASIC-1.43□□□□□ -2.64
TRBV7-4A0A0J9YYF1 MIR3674-201ENST00000636576 68 ntBASIC-1.43□□□□□ -2.64
TRBV7-4A0A0J9YYF1 MIR382-201ENST00000637119 76 ntBASIC-1.43□□□□□ -2.64
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RNU5F-6P-201ENST00000362979 116 ntBASIC-1.44□□□□□ -2.64
TRBV7-4A0A0J9YYF1 Y_RNA.151-201ENST00000363566 112 ntBASIC-1.44□□□□□ -2.64
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RNU6-1209P-201ENST00000363655 107 ntBASIC-1.44□□□□□ -2.64
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RNU1-141P-201ENST00000364623 158 ntBASIC-1.44□□□□□ -2.64
TRBV7-4A0A0J9YYF1 Y_RNA.294-201ENST00000364916 102 ntBASIC-1.44□□□□□ -2.64
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SNORA69-201ENST00000383895 132 ntBASIC-1.44□□□□□ -2.64
TRBV7-4A0A0J9YYF1 Y_RNA.498-201ENST00000384460 102 ntBASIC-1.44□□□□□ -2.64
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RNU6-456P-201ENST00000384493 107 ntBASIC-1.44□□□□□ -2.64
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AL391863.2-201ENST00000411838 681 ntTSL 2 BASIC-1.44□□□□□ -2.64
TRBV7-4A0A0J9YYF1 USP9YP16-201ENST00000430287 407 ntBASIC-1.44□□□□□ -2.64
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC106053.1-201ENST00000431697 368 ntTSL 3 BASIC-1.44□□□□□ -2.64
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RNU7-55P-201ENST00000459426 62 ntBASIC-1.44□□□□□ -2.64
TRBV7-4A0A0J9YYF1 EBAG9-207ENST00000531677 777 ntTSL 1 (best) BASIC-1.44□□□□□ -2.64
TRBV7-4A0A0J9YYF1 MIR548AE1-201ENST00000583292 70 ntBASIC-1.44□□□□□ -2.64
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC091931.1-201ENST00000623488 728 ntBASIC-1.44□□□□□ -2.64
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RNU6-931P-201ENST00000363850 107 ntBASIC-1.45□□□□□ -2.64
TRBV7-4A0A0J9YYF1 Y_RNA.203-201ENST00000364106 102 ntBASIC-1.45□□□□□ -2.64
TRBV7-4A0A0J9YYF1 Y_RNA.283-201ENST00000364798 112 ntBASIC-1.45□□□□□ -2.64
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RNU6-949P-201ENST00000384040 107 ntBASIC-1.45□□□□□ -2.64
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RNU6-933P-201ENST00000384424 107 ntBASIC-1.45□□□□□ -2.64
TRBV7-4A0A0J9YYF1 MIR147A-201ENST00000385079 72 ntBASIC-1.45□□□□□ -2.64
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RNY1P9-201ENST00000532431 109 ntBASIC-1.45□□□□□ -2.64
TRBV7-4A0A0J9YYF1 Z84480.1-201ENST00000605131 311 ntBASIC-1.45□□□□□ -2.64
TRBV7-4A0A0J9YYF1 Y_RNA.221-201ENST00000364248 96 ntBASIC-1.46□□□□□ -2.64
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RNU6-601P-201ENST00000384540 107 ntBASIC-1.46□□□□□ -2.64
TRBV7-4A0A0J9YYF1 MIR626-201ENST00000385032 94 ntBASIC-1.46□□□□□ -2.64
TRBV7-4A0A0J9YYF1 Y_RNA.598-201ENST00000410480 95 ntBASIC-1.46□□□□□ -2.64
TRBV7-4A0A0J9YYF1 CEP57L1P1-201ENST00000430943 1201 ntBASIC-1.46□□□□□ -2.64
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC087683.2-201ENST00000611384 326 ntBASIC-1.46□□□□□ -2.64
TRBV7-4A0A0J9YYF1 Y_RNA.56-201ENST00000362798 112 ntBASIC-1.47□□□□□ -2.64
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RNU6-108P-201ENST00000365558 107 ntBASIC-1.47□□□□□ -2.64
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RNU6-1062P-201ENST00000383908 107 ntBASIC-1.47□□□□□ -2.64
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RNU6-154P-201ENST00000384306 106 ntBASIC-1.47□□□□□ -2.64
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SNORA40.5-201ENST00000391061 128 ntBASIC-1.47□□□□□ -2.64
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RNU6-903P-201ENST00000391270 109 ntBASIC-1.47□□□□□ -2.64
TRBV7-4A0A0J9YYF1 MIR548I3-201ENST00000408378 149 ntBASIC-1.47□□□□□ -2.64
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RNU6-1203P-201ENST00000410703 110 ntBASIC-1.47□□□□□ -2.64
TRBV7-4A0A0J9YYF1 MTCO2P16-201ENST00000436962 677 ntBASIC-1.47□□□□□ -2.64
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RPS29P24-201ENST00000486345 171 ntBASIC-1.47□□□□□ -2.64
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RNU6-1114P-201ENST00000516022 107 ntBASIC-1.47□□□□□ -2.64
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SNORA19.3-201ENST00000516165 130 ntBASIC-1.47□□□□□ -2.64
TRBV7-4A0A0J9YYF1 YWHAEP2-201ENST00000580066 112 ntBASIC-1.47□□□□□ -2.64
TRBV7-4A0A0J9YYF1 POLR3GP2-201ENST00000588366 668 ntBASIC-1.47□□□□□ -2.64
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AL163152.1-201ENST00000642001 374 ntBASIC-1.47□□□□□ -2.64
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SNORD115-2-201ENST00000362842 82 ntBASIC-1.48□□□□□ -2.65
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RNU4-58P-201ENST00000363192 141 ntBASIC-1.48□□□□□ -2.65
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RNA5SP192-201ENST00000364404 120 ntBASIC-1.48□□□□□ -2.65
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RNU4-66P-201ENST00000365199 138 ntBASIC-1.48□□□□□ -2.65
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SNORD24-201ENST00000383884 75 ntBASIC-1.48□□□□□ -2.65
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RNU6-1201P-201ENST00000384227 107 ntBASIC-1.48□□□□□ -2.65
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RNU6-1145P-201ENST00000384246 107 ntBASIC-1.48□□□□□ -2.65
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SNORA27-201ENST00000384323 126 ntBASIC-1.48□□□□□ -2.65
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RNU6-1250P-201ENST00000391218 107 ntBASIC-1.48□□□□□ -2.65
TRBV7-4A0A0J9YYF1 CCDC34P1-201ENST00000507441 517 ntBASIC-1.48□□□□□ -2.65
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC022878.1-201ENST00000530684 149 ntBASIC-1.48□□□□□ -2.65
TRBV7-4A0A0J9YYF1 MIR5704-201ENST00000584029 77 ntBASIC-1.48□□□□□ -2.65
TRBV7-4A0A0J9YYF1 HULC.1-201ENST00000612720 240 ntBASIC-1.48□□□□□ -2.65
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AL607023.1-201ENST00000620045 248 ntBASIC-1.48□□□□□ -2.65
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RNU6-192P-201ENST00000391253 100 ntBASIC-1.49□□□□□ -2.65
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SNORA26.6-201ENST00000391256 115 ntBASIC-1.49□□□□□ -2.65
TRBV7-4A0A0J9YYF1 MIR548O-201ENST00000408583 114 ntBASIC-1.49□□□□□ -2.65
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RNU6-938P-201ENST00000411285 103 ntBASIC-1.49□□□□□ -2.65
TRBV7-4A0A0J9YYF1 MTATP6P20-201ENST00000414147 562 ntBASIC-1.49□□□□□ -2.65
TRBV7-4A0A0J9YYF1 MTND1P11-201ENST00000456661 876 ntBASIC-1.49□□□□□ -2.65
TRBV7-4A0A0J9YYF1 snoU13.19-201ENST00000459148 104 ntBASIC-1.49□□□□□ -2.65
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RNU6-625P-201ENST00000459412 107 ntBASIC-1.49□□□□□ -2.65
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TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC069503.3-201ENST00000618674 145 ntBASIC-1.49□□□□□ -2.65
TRBV7-4A0A0J9YYF1 MIR6717-201ENST00000622747 73 ntBASIC-1.49□□□□□ -2.65
TRBV7-4A0A0J9YYF1 Y_RNA.18-201ENST00000362461 102 ntBASIC-1.5□□□□□ -2.65
TRBV7-4A0A0J9YYF1 Y_RNA.60-201ENST00000362831 98 ntBASIC-1.5□□□□□ -2.65
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SNORD77.3-201ENST00000391113 65 ntBASIC-1.5□□□□□ -2.65
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AL031003.1-201ENST00000404229 172 ntBASIC-1.5□□□□□ -2.65
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RNU2-61P-201ENST00000411069 191 ntBASIC-1.5□□□□□ -2.65
TRBV7-4A0A0J9YYF1 MTND3P23-201ENST00000431980 347 ntBASIC-1.5□□□□□ -2.65
TRBV7-4A0A0J9YYF1 FCF1P4-201ENST00000448326 183 ntBASIC-1.5□□□□□ -2.65
TRBV7-4A0A0J9YYF1 CHEK2P4-201ENST00000450340 246 ntBASIC-1.5□□□□□ -2.65
TRBV7-4A0A0J9YYF1 MTCO2P30-201ENST00000503662 364 ntBASIC-1.5□□□□□ -2.65
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RNA5SP395-201ENST00000516567 118 ntBASIC-1.5□□□□□ -2.65
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC040936.1-201ENST00000534543 172 ntTSL 5 BASIC-1.5□□□□□ -2.65
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC006566.1-201ENST00000608943 513 ntBASIC-1.5□□□□□ -2.65
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC145423.2-201ENST00000610631 239 ntBASIC-1.5□□□□□ -2.65
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC011603.4-201ENST00000611325 277 ntBASIC-1.5□□□□□ -2.65
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RNU6-653P-201ENST00000363074 106 ntBASIC-1.51□□□□□ -2.65
TRBV7-4A0A0J9YYF1 Y_RNA.433-201ENST00000384089 102 ntBASIC-1.51□□□□□ -2.65
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RNY3P9-201ENST00000384727 106 ntBASIC-1.51□□□□□ -2.65
TRBV7-4A0A0J9YYF1 MTCO2P21-201ENST00000419780 677 ntBASIC-1.51□□□□□ -2.65
TRBV7-4A0A0J9YYF1 LINC02238-202ENST00000436262 320 ntTSL 3 BASIC-1.51□□□□□ -2.65
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RNU7-180P-201ENST00000459240 63 ntBASIC-1.51□□□□□ -2.65
TRBV7-4A0A0J9YYF1 Y_RNA.659-201ENST00000515994 113 ntBASIC-1.51□□□□□ -2.65
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC124312.5-201ENST00000604451 268 ntBASIC-1.51□□□□□ -2.65
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AL357078.3-201ENST00000607528 618 ntBASIC-1.51□□□□□ -2.65
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC004223.4-201ENST00000612426 332 ntBASIC-1.51□□□□□ -2.65
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