Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0V3

SH3BP4, SH3 domain-binding protein 4, humanhuman

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Length 963 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4Q9P0V3 SNORA31.10-201ENST00000516482 106 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
SH3BP4Q9P0V3 RNU6-971P-201ENST00000516920 106 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
SH3BP4Q9P0V3 HMSD-204ENST00000526932 162 ntTSL 3 BASIC1.99□□□□□ -2.09
SH3BP4Q9P0V3 MIR4448-201ENST00000584360 86 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
SH3BP4Q9P0V3 AC104819.3-201ENST00000603264 540 ntTSL 4 BASIC1.99□□□□□ -2.09
SH3BP4Q9P0V3 AL365222.1-201ENST00000614661 98 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
SH3BP4Q9P0V3 PRKD3-201ENST00000234179 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.98□□□□□ -2.09
SH3BP4Q9P0V3 CXADR-202ENST00000356275 270 ntTSL 1 (best) BASIC1.98□□□□□ -2.09
SH3BP4Q9P0V3 MIR449A-201ENST00000362113 91 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
SH3BP4Q9P0V3 RNU6-1019P-201ENST00000364424 107 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
SH3BP4Q9P0V3 RNA5SP160-201ENST00000364866 120 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
SH3BP4Q9P0V3 RNA5SP138-201ENST00000365098 114 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
SH3BP4Q9P0V3 RNU6-1168P-201ENST00000390831 104 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
SH3BP4Q9P0V3 AC244636.1-201ENST00000421152 228 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
SH3BP4Q9P0V3 AC245047.3-201ENST00000429428 127 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
SH3BP4Q9P0V3 SNRPGP14-201ENST00000435400 219 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
SH3BP4Q9P0V3 RNVU1-2-201ENST00000516326 135 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
SH3BP4Q9P0V3 RNU6-126P-201ENST00000516685 103 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
SH3BP4Q9P0V3 RNU2-60P-201ENST00000517290 128 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
SH3BP4Q9P0V3 AC087685.1-201ENST00000587507 141 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
SH3BP4Q9P0V3 AL365205.2-201ENST00000594586 68 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
SH3BP4Q9P0V3 AC069114.2-201ENST00000604699 304 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
SH3BP4Q9P0V3 FANCD2-213ENST00000625535 117 ntTSL 5 BASIC1.98□□□□□ -2.09
SH3BP4Q9P0V3 SYT14-201ENST00000367015 5094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.98□□□□□ -2.09
SH3BP4Q9P0V3 LRRD1-203ENST00000430130 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.98□□□□□ -2.09
SH3BP4Q9P0V3 CHST9-202ENST00000581714 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.98□□□□□ -2.09
SH3BP4Q9P0V3 SNORA63D-201ENST00000364359 132 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
SH3BP4Q9P0V3 SNORA25.7-201ENST00000364375 127 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
SH3BP4Q9P0V3 SNORD50B-201ENST00000364995 70 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
SH3BP4Q9P0V3 SNORA1-201ENST00000384107 130 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
SH3BP4Q9P0V3 SNORD61-201ENST00000384252 73 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
SH3BP4Q9P0V3 SNORA26-201ENST00000391286 122 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
SH3BP4Q9P0V3 RNU2-51P-201ENST00000410708 197 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
SH3BP4Q9P0V3 RNA5SP508-201ENST00000411327 119 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
SH3BP4Q9P0V3 AC008413.1-201ENST00000511864 177 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
SH3BP4Q9P0V3 MIR5094-201ENST00000578766 85 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
SH3BP4Q9P0V3 MIR4672-201ENST00000583126 81 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
SH3BP4Q9P0V3 AL096840.1-201ENST00000603287 93 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
SH3BP4Q9P0V3 MIR8054-201ENST00000620877 86 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
SH3BP4Q9P0V3 FSIP2-206ENST00000611759 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.96□□□□□ -2.1
SH3BP4Q9P0V3 MIRLET7C-201ENST00000362160 84 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
SH3BP4Q9P0V3 RNU6-888P-201ENST00000363010 101 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
SH3BP4Q9P0V3 Y_RNA.280-201ENST00000364765 112 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
SH3BP4Q9P0V3 SNORD24-201ENST00000383884 75 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
SH3BP4Q9P0V3 SNORA22C-201ENST00000384614 134 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
SH3BP4Q9P0V3 RNA5SP501-201ENST00000410990 112 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
SH3BP4Q9P0V3 AL162400.2-201ENST00000427547 157 ntTSL 3 BASIC1.96□□□□□ -2.1
SH3BP4Q9P0V3 RNU2-56P-201ENST00000516826 190 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
SH3BP4Q9P0V3 RNU6-365P-201ENST00000517113 106 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
SH3BP4Q9P0V3 SUB1P4-201ENST00000566062 339 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
SH3BP4Q9P0V3 MIR4299-201ENST00000577899 72 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
SH3BP4Q9P0V3 LINC01068-202ENST00000620874 626 ntTSL 3 BASIC1.96□□□□□ -2.1
SH3BP4Q9P0V3 ATP13A3-201ENST00000256031 7322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.95□□□□□ -2.1
SH3BP4Q9P0V3 SCN7A-206ENST00000619410 7186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.95□□□□□ -2.1
SH3BP4Q9P0V3 SCN7A-207ENST00000621965 7186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.95□□□□□ -2.1
SH3BP4Q9P0V3 KTN1-207ENST00000438792 4449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.95□□□□□ -2.1
SH3BP4Q9P0V3 RNU4-82P-201ENST00000362443 140 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
SH3BP4Q9P0V3 Y_RNA.71-201ENST00000362892 104 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
SH3BP4Q9P0V3 RNU6-915P-201ENST00000364943 103 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
SH3BP4Q9P0V3 MIR624-201ENST00000385217 97 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
SH3BP4Q9P0V3 TRAJ49-201ENST00000390488 56 ntAPPRIS P1 BASIC1.95□□□□□ -2.1
SH3BP4Q9P0V3 TRAJ2-201ENST00000390535 66 ntAPPRIS P1 BASIC1.95□□□□□ -2.1
SH3BP4Q9P0V3 RNU6-440P-201ENST00000390882 105 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
SH3BP4Q9P0V3 MLLT10P1-201ENST00000418346 262 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
SH3BP4Q9P0V3 AL135790.1-201ENST00000427161 157 ntTSL 3 BASIC1.95□□□□□ -2.1
SH3BP4Q9P0V3 HSPE1P9-201ENST00000440046 311 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
SH3BP4Q9P0V3 AL353743.2-204ENST00000456242 419 ntTSL 3 BASIC1.95□□□□□ -2.1
SH3BP4Q9P0V3 Y_RNA.666-201ENST00000516187 112 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
SH3BP4Q9P0V3 Y_RNA.686-201ENST00000516548 134 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
SH3BP4Q9P0V3 AL161716.1-201ENST00000606365 273 ntTSL 5 BASIC1.95□□□□□ -2.1
SH3BP4Q9P0V3 5S_rRNA.11-201ENST00000618635 84 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
SH3BP4Q9P0V3 uc_338.20-201ENST00000621563 178 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
SH3BP4Q9P0V3 AC008163.1-205ENST00000413944 4649 ntTSL 1 (best) BASIC1.95□□□□□ -2.1
SH3BP4Q9P0V3 ZNF415-224ENST00000601493 2132 ntTSL 1 (best) BASIC1.94□□□□□ -2.1
SH3BP4Q9P0V3 AC245060.5-201ENST00000610778 3293 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
SH3BP4Q9P0V3 SI-201ENST00000264382 6011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.94□□□□□ -2.1
SH3BP4Q9P0V3 U8.1-201ENST00000362843 134 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
SH3BP4Q9P0V3 SNORD68-201ENST00000363214 84 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
SH3BP4Q9P0V3 RNU6-1081P-201ENST00000384537 107 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
SH3BP4Q9P0V3 MIR518F-201ENST00000384973 87 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
SH3BP4Q9P0V3 Y_RNA.584-201ENST00000391090 114 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
SH3BP4Q9P0V3 RNA5SP482-201ENST00000391269 118 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
SH3BP4Q9P0V3 AL356320.1-201ENST00000429616 163 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
SH3BP4Q9P0V3 RNU6-504P-201ENST00000516568 104 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
SH3BP4Q9P0V3 RNU7-28P-201ENST00000516759 62 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
SH3BP4Q9P0V3 RNU6-1234P-201ENST00000516877 103 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
SH3BP4Q9P0V3 AP001328.1-201ENST00000528550 176 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
SH3BP4Q9P0V3 AC131055.1-201ENST00000584626 316 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
SH3BP4Q9P0V3 AC006441.5-201ENST00000612680 209 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
SH3BP4Q9P0V3 TUG1_4.1-201ENST00000619464 181 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
SH3BP4Q9P0V3 AL442644.1-201ENST00000454390 3105 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
SH3BP4Q9P0V3 Y_RNA.127-201ENST00000363386 109 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
SH3BP4Q9P0V3 Y_RNA.261-201ENST00000364631 102 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
SH3BP4Q9P0V3 SNORA4.2-201ENST00000365313 147 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
SH3BP4Q9P0V3 SNORD116-14-201ENST00000383894 92 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
SH3BP4Q9P0V3 SNORD116-17-201ENST00000383929 92 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
SH3BP4Q9P0V3 SNORD116-15-201ENST00000384445 92 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
SH3BP4Q9P0V3 RNU6-296P-201ENST00000384608 107 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
SH3BP4Q9P0V3 SNORD116-19-201ENST00000384729 92 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
SH3BP4Q9P0V3 TRAJ41-201ENST00000390496 62 ntAPPRIS P1 BASIC1.93□□□□□ -2.1
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