Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZN3

EHD3, EH domain-containing protein 3, humanhuman

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Length 535 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EHD3Q9NZN3 STAG3L5P-204ENST00000443759 179 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
EHD3Q9NZN3 AC092991.1-201ENST00000477176 376 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
EHD3Q9NZN3 MIR3646-201ENST00000578301 84 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
EHD3Q9NZN3 MIR4662B-201ENST00000579498 81 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
EHD3Q9NZN3 FANCD2-213ENST00000625535 117 ntTSL 5 BASIC2.01□□□□□ -2.09
EHD3Q9NZN3 AC010332.2-201ENST00000613083 1904 ntBASIC2□□□□□ -2.09
EHD3Q9NZN3 Y_RNA.66-201ENST00000362862 102 ntBASIC2□□□□□ -2.09
EHD3Q9NZN3 SNORA75.5-201ENST00000391291 81 ntBASIC2□□□□□ -2.09
EHD3Q9NZN3 RNA5SP450-201ENST00000411206 102 ntBASIC2□□□□□ -2.09
EHD3Q9NZN3 AL158823.1-201ENST00000418441 478 ntBASIC2□□□□□ -2.09
EHD3Q9NZN3 SUB1P4-201ENST00000566062 339 ntBASIC2□□□□□ -2.09
EHD3Q9NZN3 MIR4762-201ENST00000585261 75 ntBASIC2□□□□□ -2.09
EHD3Q9NZN3 AC091895.1-201ENST00000624494 256 ntBASIC2□□□□□ -2.09
EHD3Q9NZN3 PTPN22-206ENST00000525799 2118 ntTSL 1 (best) BASIC2□□□□□ -2.09
EHD3Q9NZN3 SMARCAD1-201ENST00000354268 4912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2□□□□□ -2.09
EHD3Q9NZN3 OR5M1-202ENST00000641076 4302 ntAPPRIS P1 BASIC2□□□□□ -2.09
EHD3Q9NZN3 DYNC2H1-203ENST00000398093 12945 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC1.99□□□□□ -2.09
EHD3Q9NZN3 SNORA63D-201ENST00000364359 132 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
EHD3Q9NZN3 Y_RNA.420-201ENST00000384043 110 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
EHD3Q9NZN3 Y_RNA.586-201ENST00000391146 98 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
EHD3Q9NZN3 RNU6-460P-201ENST00000391158 108 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
EHD3Q9NZN3 RNA5SP482-201ENST00000391269 118 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
EHD3Q9NZN3 SNORA26-201ENST00000391286 122 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
EHD3Q9NZN3 AL023284.1-201ENST00000403956 276 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
EHD3Q9NZN3 HMGN2P19-201ENST00000425149 265 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
EHD3Q9NZN3 DIP2A-IT1-201ENST00000442434 428 ntTSL 2 BASIC1.99□□□□□ -2.09
EHD3Q9NZN3 AC025033.1-201ENST00000463883 194 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
EHD3Q9NZN3 Y_RNA.666-201ENST00000516187 112 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
EHD3Q9NZN3 Y_RNA.714-201ENST00000517065 90 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
EHD3Q9NZN3 RNU6-365P-201ENST00000517113 106 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
EHD3Q9NZN3 RNA5SP437-201ENST00000517249 129 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
EHD3Q9NZN3 MIR1273D-201ENST00000577266 86 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
EHD3Q9NZN3 SCN7A-201ENST00000409855 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.98□□□□□ -2.09
EHD3Q9NZN3 SYT14-201ENST00000367015 5094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.98□□□□□ -2.09
EHD3Q9NZN3 RNU6-1084P-201ENST00000362498 107 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
EHD3Q9NZN3 U8.5-201ENST00000364528 136 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
EHD3Q9NZN3 RNU6-81P-201ENST00000365608 104 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
EHD3Q9NZN3 SNORA67.3-201ENST00000384366 140 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
EHD3Q9NZN3 SNORA64-201ENST00000384674 134 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
EHD3Q9NZN3 RNU6ATAC37P-201ENST00000408328 131 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
EHD3Q9NZN3 RNA5SP425-201ENST00000410336 112 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
EHD3Q9NZN3 RN7SKP223-201ENST00000410582 62 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
EHD3Q9NZN3 GHRL-208ENST00000439975 326 ntTSL 1 (best) BASIC1.98□□□□□ -2.09
EHD3Q9NZN3 AL021397.1-201ENST00000451806 248 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
EHD3Q9NZN3 RNU6-1116P-201ENST00000517269 99 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
EHD3Q9NZN3 AL161716.1-201ENST00000606365 273 ntTSL 5 BASIC1.98□□□□□ -2.09
EHD3Q9NZN3 AC025539.1-201ENST00000515343 4019 ntTSL 2 BASIC1.98□□□□□ -2.09
EHD3Q9NZN3 SAGE1-202ENST00000370709 2879 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC1.98□□□□□ -2.09
EHD3Q9NZN3 CHST9-202ENST00000581714 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.98□□□□□ -2.09
EHD3Q9NZN3 U8.2-201ENST00000363156 134 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
EHD3Q9NZN3 RNU6-112P-201ENST00000363599 104 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
EHD3Q9NZN3 SNORA25.7-201ENST00000364375 127 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
EHD3Q9NZN3 Y_RNA.251-201ENST00000364551 99 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
EHD3Q9NZN3 SNORD113-1-201ENST00000365321 69 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
EHD3Q9NZN3 SNORD61-201ENST00000384252 73 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
EHD3Q9NZN3 RNU6-296P-201ENST00000384608 107 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
EHD3Q9NZN3 TRAJ11-201ENST00000390526 60 ntAPPRIS P1 BASIC1.97□□□□□ -2.09
EHD3Q9NZN3 MTND4LP9-201ENST00000427694 174 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
EHD3Q9NZN3 AC069257.2-201ENST00000441819 155 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
EHD3Q9NZN3 SNORD45.4-201ENST00000516629 73 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
EHD3Q9NZN3 RNU7-28P-201ENST00000516759 62 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
EHD3Q9NZN3 RNU6-1270P-201ENST00000517128 108 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
EHD3Q9NZN3 AC007751.1-201ENST00000529260 376 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
EHD3Q9NZN3 AC087685.1-201ENST00000587507 141 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
EHD3Q9NZN3 AC092881.1-201ENST00000638218 2733 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
EHD3Q9NZN3 XIRP2-201ENST00000295237 5246 ntTSL 2 BASIC1.96□□□□□ -2.09
EHD3Q9NZN3 ATP11C-202ENST00000361648 6010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.96□□□□□ -2.1
EHD3Q9NZN3 KNL1-204ENST00000527044 5404 ntTSL 5 BASIC1.96□□□□□ -2.1
EHD3Q9NZN3 Y_RNA.542-201ENST00000384641 111 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
EHD3Q9NZN3 MIR520A-201ENST00000384862 85 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
EHD3Q9NZN3 MIR548A2-201ENST00000384956 97 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
EHD3Q9NZN3 TRAJ41-201ENST00000390496 62 ntAPPRIS P1 BASIC1.96□□□□□ -2.1
EHD3Q9NZN3 TRAJ2-201ENST00000390535 66 ntAPPRIS P1 BASIC1.96□□□□□ -2.1
EHD3Q9NZN3 RPL23AP63-201ENST00000498752 471 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
EHD3Q9NZN3 RNU6-126P-201ENST00000516685 103 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
EHD3Q9NZN3 HMSD-204ENST00000526932 162 ntTSL 3 BASIC1.96□□□□□ -2.1
EHD3Q9NZN3 hsa-mir-4536-1.1-201ENST00000636519 88 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
EHD3Q9NZN3 MIRLET7C-201ENST00000362160 84 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
EHD3Q9NZN3 snoU2-30.1-201ENST00000365012 70 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
EHD3Q9NZN3 SNORA1-201ENST00000384107 130 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
EHD3Q9NZN3 SNORA40-201ENST00000388090 126 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
EHD3Q9NZN3 MIR802-201ENST00000390235 94 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
EHD3Q9NZN3 TRAJ49-201ENST00000390488 56 ntAPPRIS P1 BASIC1.95□□□□□ -2.1
EHD3Q9NZN3 RN7SKP200-201ENST00000410564 320 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
EHD3Q9NZN3 RNU2-7P-201ENST00000410794 178 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
EHD3Q9NZN3 CALM2P4-201ENST00000430810 426 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
EHD3Q9NZN3 CFLAR-AS1-202ENST00000474886 223 ntTSL 3 BASIC1.95□□□□□ -2.1
EHD3Q9NZN3 RNU6-504P-201ENST00000516568 104 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
EHD3Q9NZN3 AC090142.3-201ENST00000519012 385 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
EHD3Q9NZN3 MIR3129-201ENST00000581095 76 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
EHD3Q9NZN3 MIR3935-201ENST00000583472 104 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
EHD3Q9NZN3 AC012493.3-201ENST00000604494 112 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
EHD3Q9NZN3 LINC01068-202ENST00000620874 626 ntTSL 3 BASIC1.95□□□□□ -2.1
EHD3Q9NZN3 MIR219B-201ENST00000637023 88 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
EHD3Q9NZN3 CEP57L1-213ENST00000520883 2055 ntTSL 5 BASIC1.94□□□□□ -2.1
EHD3Q9NZN3 CXADR-202ENST00000356275 270 ntTSL 1 (best) BASIC1.94□□□□□ -2.1
EHD3Q9NZN3 SNORD14E-201ENST00000364009 85 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
EHD3Q9NZN3 RNA5SP160-201ENST00000364866 120 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
EHD3Q9NZN3 RNA5SP100-201ENST00000410903 110 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
EHD3Q9NZN3 RNA5SP59-201ENST00000410922 110 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
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