Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPL8

TIMMDC1, Complex I assembly factor TIMMDC1, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 285 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TIMMDC1Q9NPL8 SNORD115-39-201ENST00000363694 82 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
TIMMDC1Q9NPL8 Y_RNA.171-201ENST00000363760 102 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
TIMMDC1Q9NPL8 SNORD115-4-201ENST00000363810 82 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
TIMMDC1Q9NPL8 SNORD115-16-201ENST00000363887 82 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
TIMMDC1Q9NPL8 SNORD115-6-201ENST00000363942 82 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
TIMMDC1Q9NPL8 SNORA25.6-201ENST00000364121 118 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
TIMMDC1Q9NPL8 SNORD115-42-201ENST00000364273 82 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
TIMMDC1Q9NPL8 SNORD115-15-201ENST00000364809 81 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
TIMMDC1Q9NPL8 SNORD115-1-201ENST00000364961 82 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
TIMMDC1Q9NPL8 SNORD115-26-201ENST00000365067 82 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
TIMMDC1Q9NPL8 SNORD115-10-201ENST00000365073 81 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
TIMMDC1Q9NPL8 SNORD115-43-201ENST00000365503 82 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
TIMMDC1Q9NPL8 SNORD115-36-201ENST00000365629 82 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
TIMMDC1Q9NPL8 RNA5SP109-201ENST00000391010 116 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
TIMMDC1Q9NPL8 SNORA26.7-201ENST00000391288 122 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
TIMMDC1Q9NPL8 AL731684.2-201ENST00000426839 333 ntTSL 5 BASIC3.15□□□□□ -1.91
TIMMDC1Q9NPL8 RN7SL504P-201ENST00000494496 287 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
TIMMDC1Q9NPL8 RNU6-1258P-201ENST00000516911 111 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
TIMMDC1Q9NPL8 SCARNA20.6-201ENST00000517251 106 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
TIMMDC1Q9NPL8 IGKV2-26-201ENST00000518305 343 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
TIMMDC1Q9NPL8 AC090821.2-201ENST00000523552 176 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
TIMMDC1Q9NPL8 MIR4666B-201ENST00000578142 81 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
TIMMDC1Q9NPL8 USP45-208ENST00000500704 5826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.15□□□□□ -1.91
TIMMDC1Q9NPL8 FAM46D-201ENST00000308293 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.14□□□□□ -1.91
TIMMDC1Q9NPL8 RNU6-219P-201ENST00000364728 107 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
TIMMDC1Q9NPL8 RNU6-163P-201ENST00000384396 106 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
TIMMDC1Q9NPL8 SNORA46-201ENST00000384762 135 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
TIMMDC1Q9NPL8 RNU6-220P-201ENST00000390919 107 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
TIMMDC1Q9NPL8 RNU1-101P-201ENST00000391171 127 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
TIMMDC1Q9NPL8 MIR1262-201ENST00000408276 93 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
TIMMDC1Q9NPL8 RPL23AP83-201ENST00000434984 473 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
TIMMDC1Q9NPL8 AC020743.3-201ENST00000440351 360 ntTSL 3 BASIC3.14□□□□□ -1.91
TIMMDC1Q9NPL8 RNU7-113P-201ENST00000459273 62 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
TIMMDC1Q9NPL8 RNU7-45P-201ENST00000459460 63 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
TIMMDC1Q9NPL8 RNU7-171P-201ENST00000459581 62 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
TIMMDC1Q9NPL8 RN7SL499P-201ENST00000481141 276 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
TIMMDC1Q9NPL8 RNU6-521P-201ENST00000516663 105 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
TIMMDC1Q9NPL8 SNORA70.24-201ENST00000517233 118 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
TIMMDC1Q9NPL8 ST7-OT3_3.1-201ENST00000611709 115 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
TIMMDC1Q9NPL8 hsa-mir-4776-1.1-201ENST00000636364 80 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
TIMMDC1Q9NPL8 FILIP1L-206ENST00000471562 2854 ntTSL 1 (best) BASIC3.14□□□□□ -1.91
TIMMDC1Q9NPL8 OSTN-202ENST00000445281 3134 ntTSL 5 BASIC3.14□□□□□ -1.91
TIMMDC1Q9NPL8 Z83843.1-201ENST00000604070 3685 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
TIMMDC1Q9NPL8 AC245060.5-201ENST00000610778 3293 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
TIMMDC1Q9NPL8 PPIP5K2-203ENST00000414217 5842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.13□□□□□ -1.91
TIMMDC1Q9NPL8 AP003174.1-201ENST00000306533 376 ntTSL 2 BASIC3.13□□□□□ -1.91
TIMMDC1Q9NPL8 MIRLET7C-201ENST00000362160 84 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
TIMMDC1Q9NPL8 RNA5SP493-201ENST00000364115 91 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
TIMMDC1Q9NPL8 Y_RNA.313-201ENST00000365095 103 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
TIMMDC1Q9NPL8 RNU6-1201P-201ENST00000384227 107 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
TIMMDC1Q9NPL8 Y_RNA.467-201ENST00000384297 102 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
TIMMDC1Q9NPL8 RNU6-616P-201ENST00000384353 107 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
TIMMDC1Q9NPL8 Z92545.1-201ENST00000411782 234 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
TIMMDC1Q9NPL8 AC018511.2-201ENST00000413431 189 ntTSL 3 BASIC3.13□□□□□ -1.91
TIMMDC1Q9NPL8 AC003685.2-201ENST00000422795 395 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
TIMMDC1Q9NPL8 AL353747.2-201ENST00000439207 205 ntTSL 3 BASIC3.13□□□□□ -1.91
TIMMDC1Q9NPL8 AL135938.1-201ENST00000443141 297 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
TIMMDC1Q9NPL8 STAG3L5P-204ENST00000443759 179 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
TIMMDC1Q9NPL8 Y_RNA.659-201ENST00000515994 113 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
TIMMDC1Q9NPL8 Y_RNA.705-201ENST00000516862 110 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
TIMMDC1Q9NPL8 MIR5195-201ENST00000583555 115 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
TIMMDC1Q9NPL8 MIR4276-201ENST00000584832 70 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
TIMMDC1Q9NPL8 AL442644.1-201ENST00000454390 3105 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
TIMMDC1Q9NPL8 ZNF83-201ENST00000301096 2599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.13□□□□□ -1.91
TIMMDC1Q9NPL8 CHST9-202ENST00000581714 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.13□□□□□ -1.91
TIMMDC1Q9NPL8 ANKAR-209ENST00000520309 4410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.13□□□□□ -1.91
TIMMDC1Q9NPL8 KTN1-206ENST00000413890 4473 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.13□□□□□ -1.91
TIMMDC1Q9NPL8 TANK-201ENST00000259075 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.12□□□□□ -1.91
TIMMDC1Q9NPL8 MGAT4C-210ENST00000620241 3194 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.12□□□□□ -1.91
TIMMDC1Q9NPL8 SNORD115-2-201ENST00000362842 82 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
TIMMDC1Q9NPL8 SNORD115-20-201ENST00000365099 82 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
TIMMDC1Q9NPL8 RNU6-887P-201ENST00000410660 100 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
TIMMDC1Q9NPL8 RNA5SP120-201ENST00000410900 112 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
TIMMDC1Q9NPL8 RNU6-1018P-201ENST00000516577 106 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
TIMMDC1Q9NPL8 IGLV3-17-201ENST00000519099 244 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
TIMMDC1Q9NPL8 HNRNPDLP4-201ENST00000605144 301 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
TIMMDC1Q9NPL8 LIG4-205ENST00000614526 3884 ntTSL 2 BASIC3.12□□□□□ -1.91
TIMMDC1Q9NPL8 KIAA1841-211ENST00000612149 4202 ntTSL 5 BASIC3.12□□□□□ -1.91
TIMMDC1Q9NPL8 ABCG2-204ENST00000515655 4276 ntTSL 1 (best) BASIC3.12□□□□□ -1.91
TIMMDC1Q9NPL8 PIK3C2G-201ENST00000266497 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.11□□□□□ -1.91
TIMMDC1Q9NPL8 SNORA38.1-201ENST00000364172 131 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
TIMMDC1Q9NPL8 Y_RNA.437-201ENST00000384113 113 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
TIMMDC1Q9NPL8 AC005326.1-201ENST00000429197 123 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
TIMMDC1Q9NPL8 AC015922.2-201ENST00000435593 184 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
TIMMDC1Q9NPL8 AC018495.1-201ENST00000440266 452 ntTSL 3 BASIC3.11□□□□□ -1.91
TIMMDC1Q9NPL8 MIR1270-201ENST00000459320 83 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
TIMMDC1Q9NPL8 AL049873.1-201ENST00000480540 376 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
TIMMDC1Q9NPL8 RNU7-181P-201ENST00000517234 74 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
TIMMDC1Q9NPL8 AL161756.2-201ENST00000604597 246 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
TIMMDC1Q9NPL8 MIR8054-201ENST00000620877 86 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
TIMMDC1Q9NPL8 AC027279.3-201ENST00000625055 122 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
TIMMDC1Q9NPL8 CLOCK-201ENST00000309964 10304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.11□□□□□ -1.91
TIMMDC1Q9NPL8 THNSL1-201ENST00000376356 3691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.11□□□□□ -1.91
TIMMDC1Q9NPL8 RNU6-1296P-201ENST00000383879 107 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
TIMMDC1Q9NPL8 Y_RNA.470-201ENST00000384307 117 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
TIMMDC1Q9NPL8 MIR491-201ENST00000384877 84 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
TIMMDC1Q9NPL8 TRDJ3-201ENST00000390476 59 ntAPPRIS P1 BASIC3.1□□□□□ -1.91
TIMMDC1Q9NPL8 RNU6-1319P-201ENST00000390855 104 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
TIMMDC1Q9NPL8 RNU6-747P-201ENST00000390928 104 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
TIMMDC1Q9NPL8 RNU6-241P-201ENST00000391148 104 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 105.3 ms