Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZP0

PDGFD, Platelet-derived growth factor D, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 370 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDGFDQ9GZP0 MIR3613-201ENST00000579844 87 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
PDGFDQ9GZP0 THOC2-216ENST00000491737 4452 ntTSL 5 BASIC2.61□□□□□ -1.99
PDGFDQ9GZP0 RNU6-23P-201ENST00000363283 107 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
PDGFDQ9GZP0 SNORA25.7-201ENST00000364375 127 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
PDGFDQ9GZP0 SNORD114-6-201ENST00000364393 72 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
PDGFDQ9GZP0 Y_RNA.393-201ENST00000383936 102 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
PDGFDQ9GZP0 MIR144-201ENST00000384886 86 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
PDGFDQ9GZP0 MIR802-201ENST00000390235 94 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
PDGFDQ9GZP0 RNU6ATAC38P-201ENST00000408119 126 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
PDGFDQ9GZP0 SNORA72.7-201ENST00000516349 94 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
PDGFDQ9GZP0 RNU2-56P-201ENST00000516826 190 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
PDGFDQ9GZP0 MIR3646-201ENST00000578301 84 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
PDGFDQ9GZP0 MIR5694-201ENST00000581190 76 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
PDGFDQ9GZP0 MIR8081-201ENST00000611533 95 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
PDGFDQ9GZP0 FOXP2-211ENST00000408937 6443 ntTSL 1 (best) BASIC2.61□□□□□ -1.99
PDGFDQ9GZP0 HIF1A-212ENST00000557538 3468 ntTSL 1 (best) BASIC2.6□□□□□ -1.99
PDGFDQ9GZP0 MIR340-201ENST00000362125 95 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
PDGFDQ9GZP0 SNORA26-201ENST00000391286 122 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
PDGFDQ9GZP0 AC019129.1-201ENST00000403786 261 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
PDGFDQ9GZP0 SNORD88.1-201ENST00000408684 91 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
PDGFDQ9GZP0 RNU2-55P-201ENST00000411146 174 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
PDGFDQ9GZP0 RNA5SP182-201ENST00000516064 82 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
PDGFDQ9GZP0 RNU6-197P-201ENST00000516680 100 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
PDGFDQ9GZP0 Y_RNA.714-201ENST00000517065 90 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
PDGFDQ9GZP0 CYCSP26-201ENST00000534107 320 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
PDGFDQ9GZP0 MIR4679-2-201ENST00000578358 77 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
PDGFDQ9GZP0 AC104819.3-201ENST00000603264 540 ntTSL 4 BASIC2.6□□□□□ -1.99
PDGFDQ9GZP0 MIR6840-201ENST00000611937 71 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
PDGFDQ9GZP0 MIR6079-201ENST00000635807 62 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
PDGFDQ9GZP0 MIR338-201ENST00000636369 67 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
PDGFDQ9GZP0 NEB-203ENST00000397345 26202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.6□□□□□ -1.99
PDGFDQ9GZP0 NEB-209ENST00000427231 26202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.6□□□□□ -1.99
PDGFDQ9GZP0 SMARCAD1-201ENST00000354268 4912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.6□□□□□ -1.99
PDGFDQ9GZP0 KTN1-203ENST00000395309 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.59□□□□□ -1.99
PDGFDQ9GZP0 APC-201ENST00000257430 10701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.59□□□□□ -1.99
PDGFDQ9GZP0 RNU1-96P-201ENST00000364163 162 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
PDGFDQ9GZP0 MIR1262-201ENST00000408276 93 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
PDGFDQ9GZP0 RNA5SP89-201ENST00000410300 108 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
PDGFDQ9GZP0 RNU4-43P-201ENST00000410628 137 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
PDGFDQ9GZP0 MTND5P34-201ENST00000568888 325 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
PDGFDQ9GZP0 MIR6132-201ENST00000622083 109 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
PDGFDQ9GZP0 CCDC30-201ENST00000340612 2664 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.59□□□□□ -2
PDGFDQ9GZP0 SENP7-201ENST00000314261 4736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -2
PDGFDQ9GZP0 WWP1P1-201ENST00000466609 2769 ntBASIC2.58□□□□□ -2
PDGFDQ9GZP0 RNU6-235P-201ENST00000362644 107 ntBASIC2.58□□□□□ -2
PDGFDQ9GZP0 RNU6-862P-201ENST00000362804 105 ntBASIC2.58□□□□□ -2
PDGFDQ9GZP0 RNU6-147P-201ENST00000383983 107 ntBASIC2.58□□□□□ -2
PDGFDQ9GZP0 RNU6-1056P-201ENST00000383996 107 ntBASIC2.58□□□□□ -2
PDGFDQ9GZP0 SNORA75.5-201ENST00000391291 81 ntBASIC2.58□□□□□ -2
PDGFDQ9GZP0 SNRPGP10-201ENST00000432323 225 ntBASIC2.58□□□□□ -2
PDGFDQ9GZP0 AC245047.4-201ENST00000433189 144 ntBASIC2.58□□□□□ -2
PDGFDQ9GZP0 AL353689.1-201ENST00000438895 199 ntBASIC2.58□□□□□ -2
PDGFDQ9GZP0 OR9P1P-201ENST00000496431 281 ntBASIC2.58□□□□□ -2
PDGFDQ9GZP0 RNU6-659P-201ENST00000516454 104 ntBASIC2.58□□□□□ -2
PDGFDQ9GZP0 MIR3683-201ENST00000580847 82 ntBASIC2.58□□□□□ -2
PDGFDQ9GZP0 MIR3670-2-201ENST00000582974 65 ntBASIC2.58□□□□□ -2
PDGFDQ9GZP0 MIR3670-1-201ENST00000584160 65 ntBASIC2.58□□□□□ -2
PDGFDQ9GZP0 MIR3670-3-201ENST00000584855 65 ntBASIC2.58□□□□□ -2
PDGFDQ9GZP0 AC006254.2-201ENST00000603259 279 ntBASIC2.58□□□□□ -2
PDGFDQ9GZP0 MIR3670-4-201ENST00000612260 65 ntBASIC2.58□□□□□ -2
PDGFDQ9GZP0 TUG1_4.1-201ENST00000619464 181 ntBASIC2.58□□□□□ -2
PDGFDQ9GZP0 RNA5SP493-201ENST00000364115 91 ntBASIC2.57□□□□□ -2
PDGFDQ9GZP0 MIR539-201ENST00000365690 78 ntBASIC2.57□□□□□ -2
PDGFDQ9GZP0 MIR515-2-201ENST00000384883 83 ntBASIC2.57□□□□□ -2
PDGFDQ9GZP0 MIR515-1-201ENST00000384884 83 ntBASIC2.57□□□□□ -2
PDGFDQ9GZP0 MIR562-201ENST00000384894 95 ntBASIC2.57□□□□□ -2
PDGFDQ9GZP0 SNORA12.1-201ENST00000390873 148 ntBASIC2.57□□□□□ -2
PDGFDQ9GZP0 AL627390.1-201ENST00000396055 340 ntBASIC2.57□□□□□ -2
PDGFDQ9GZP0 AL445685.2-201ENST00000422551 342 ntBASIC2.57□□□□□ -2
PDGFDQ9GZP0 AL360175.1-201ENST00000426547 285 ntTSL 5 BASIC2.57□□□□□ -2
PDGFDQ9GZP0 RNU1-131P-201ENST00000458943 161 ntBASIC2.57□□□□□ -2
PDGFDQ9GZP0 HMGN1P7-201ENST00000491722 313 ntBASIC2.57□□□□□ -2
PDGFDQ9GZP0 RNU7-193P-201ENST00000516723 65 ntBASIC2.57□□□□□ -2
PDGFDQ9GZP0 RNU7-149P-201ENST00000516739 59 ntBASIC2.57□□□□□ -2
PDGFDQ9GZP0 AP001328.1-201ENST00000528550 176 ntBASIC2.57□□□□□ -2
PDGFDQ9GZP0 NPPA-AS1_2.1-201ENST00000618496 149 ntBASIC2.57□□□□□ -2
PDGFDQ9GZP0 PYGO1-201ENST00000302000 8488 ntTSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
PDGFDQ9GZP0 ZNF355P-201ENST00000427301 3216 ntBASIC2.57□□□□□ -2
PDGFDQ9GZP0 AC018630.2-201ENST00000534866 2403 ntBASIC2.57□□□□□ -2
PDGFDQ9GZP0 PCDH11Y-203ENST00000362095 4220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
PDGFDQ9GZP0 LRRD1-203ENST00000430130 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
PDGFDQ9GZP0 MIR126-201ENST00000362291 85 ntBASIC2.56□□□□□ -2
PDGFDQ9GZP0 RNU1-148P-201ENST00000384472 162 ntBASIC2.56□□□□□ -2
PDGFDQ9GZP0 Y_RNA.584-201ENST00000391090 114 ntBASIC2.56□□□□□ -2
PDGFDQ9GZP0 RNU6-1064P-201ENST00000410626 104 ntBASIC2.56□□□□□ -2
PDGFDQ9GZP0 RNU7-94P-201ENST00000459576 63 ntBASIC2.56□□□□□ -2
PDGFDQ9GZP0 AL049830.1-201ENST00000468034 425 ntBASIC2.56□□□□□ -2
PDGFDQ9GZP0 AC092991.1-201ENST00000477176 376 ntBASIC2.56□□□□□ -2
PDGFDQ9GZP0 AC009930.1-201ENST00000522330 191 ntTSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
PDGFDQ9GZP0 MIR5582-201ENST00000579697 68 ntBASIC2.56□□□□□ -2
PDGFDQ9GZP0 AC120024.3-201ENST00000603167 156 ntBASIC2.56□□□□□ -2
PDGFDQ9GZP0 AC108081.1-201ENST00000604358 221 ntBASIC2.56□□□□□ -2
PDGFDQ9GZP0 Z82195.2-201ENST00000612348 18351 ntBASIC2.56□□□□□ -2
PDGFDQ9GZP0 SNORD68-201ENST00000363214 84 ntBASIC2.55□□□□□ -2
PDGFDQ9GZP0 SNORD18B-201ENST00000365659 72 ntBASIC2.55□□□□□ -2
PDGFDQ9GZP0 RNU6-1336P-201ENST00000383886 109 ntBASIC2.55□□□□□ -2
PDGFDQ9GZP0 FAR2P3-204ENST00000434661 444 ntTSL 2 BASIC2.55□□□□□ -2
PDGFDQ9GZP0 RNU7-197P-201ENST00000458836 62 ntBASIC2.55□□□□□ -2
PDGFDQ9GZP0 RNU5E-3P-201ENST00000515913 68 ntBASIC2.55□□□□□ -2
PDGFDQ9GZP0 SNORD77.4-201ENST00000516158 81 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 186 ms