Protein–RNA interactions for Protein: Q9C009

FOXQ1, Forkhead box protein Q1, humanhuman

Predictions only

Length 403 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXQ1Q9C009 RNU6-830P-201ENST00000516353 107 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
FOXQ1Q9C009 RNU7-28P-201ENST00000516759 62 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
FOXQ1Q9C009 NCRNA00250-201ENST00000519500 519 ntTSL 4 BASIC2.72□□□□□ -1.97
FOXQ1Q9C009 AC002984.1-201ENST00000591692 448 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
FOXQ1Q9C009 AC022202.1-201ENST00000613515 211 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
FOXQ1Q9C009 CEP44-203ENST00000426172 3037 ntTSL 5 BASIC2.72□□□□□ -1.97
FOXQ1Q9C009 LPP-221ENST00000618621 18277 ntTSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
FOXQ1Q9C009 LPP-222ENST00000640853 18277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
FOXQ1Q9C009 AC092435.3-201ENST00000565538 3654 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
FOXQ1Q9C009 TSGA10-205ENST00000410001 3036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.71□□□□□ -1.98
FOXQ1Q9C009 Y_RNA.49-201ENST00000362714 112 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
FOXQ1Q9C009 RNU6-414P-201ENST00000363705 104 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
FOXQ1Q9C009 Y_RNA.213-201ENST00000364178 111 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
FOXQ1Q9C009 Y_RNA.336-201ENST00000365307 109 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
FOXQ1Q9C009 RNU6ATAC37P-201ENST00000408328 131 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
FOXQ1Q9C009 LINC02041-201ENST00000440726 246 ntTSL 5 BASIC2.71□□□□□ -1.98
FOXQ1Q9C009 UQCRHP3-201ENST00000451503 251 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
FOXQ1Q9C009 AC006483.1-201ENST00000487308 313 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
FOXQ1Q9C009 AP001363.1-201ENST00000544108 264 ntTSL 3 BASIC2.71□□□□□ -1.98
FOXQ1Q9C009 AC090616.3-202ENST00000583346 205 ntTSL 2 BASIC2.71□□□□□ -1.98
FOXQ1Q9C009 AC021443.1-201ENST00000604478 211 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
FOXQ1Q9C009 RNU6-94P-201ENST00000607728 107 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
FOXQ1Q9C009 OXR1-215ENST00000531443 3599 ntTSL 5 BASIC2.71□□□□□ -1.98
FOXQ1Q9C009 WDR3-201ENST00000349139 9974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.7□□□□□ -1.98
FOXQ1Q9C009 Y_RNA.298-201ENST00000364960 107 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
FOXQ1Q9C009 Y_RNA.440-201ENST00000384120 114 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
FOXQ1Q9C009 RNY1P6-201ENST00000384193 109 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
FOXQ1Q9C009 AC018511.2-201ENST00000413431 189 ntTSL 3 BASIC2.7□□□□□ -1.98
FOXQ1Q9C009 LINC00407-201ENST00000426509 295 ntTSL 5 BASIC2.7□□□□□ -1.98
FOXQ1Q9C009 RNA5SP281-201ENST00000516504 135 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
FOXQ1Q9C009 RNU7-70P-201ENST00000516941 66 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
FOXQ1Q9C009 SUMO2P16-201ENST00000519475 264 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
FOXQ1Q9C009 AC015726.2-201ENST00000620112 122 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
FOXQ1Q9C009 OR4C11-202ENST00000641580 2737 ntAPPRIS P1 BASIC2.7□□□□□ -1.98
FOXQ1Q9C009 FTX-214ENST00000638437 12267 ntTSL 5 BASIC2.7□□□□□ -1.98
FOXQ1Q9C009 AC108206.1-201ENST00000570186 4159 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
FOXQ1Q9C009 RNU1-58P-201ENST00000362413 163 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
FOXQ1Q9C009 RNY4P6-201ENST00000363667 96 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
FOXQ1Q9C009 RNU1-133P-201ENST00000364867 167 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
FOXQ1Q9C009 U8.6-201ENST00000364939 135 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
FOXQ1Q9C009 MIR764-201ENST00000390811 85 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
FOXQ1Q9C009 RNU6-440P-201ENST00000390882 105 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
FOXQ1Q9C009 RNU4-53P-201ENST00000410828 140 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
FOXQ1Q9C009 RN7SKP192-201ENST00000411291 327 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
FOXQ1Q9C009 STAG3L5P-204ENST00000443759 179 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
FOXQ1Q9C009 Z96811.1-201ENST00000445880 108 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
FOXQ1Q9C009 AL354733.1-201ENST00000458016 476 ntTSL 3 BASIC2.69□□□□□ -1.98
FOXQ1Q9C009 AC003982.1-202ENST00000469928 248 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
FOXQ1Q9C009 RNU7-123P-201ENST00000515911 60 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
FOXQ1Q9C009 AC005786.1-201ENST00000588553 154 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
FOXQ1Q9C009 MIR8054-201ENST00000620877 86 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
FOXQ1Q9C009 HIF1A-212ENST00000557538 3468 ntTSL 1 (best) BASIC2.69□□□□□ -1.98
FOXQ1Q9C009 PKHD1L1-201ENST00000378402 13076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.69□□□□□ -1.98
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FOXQ1Q9C009 RNU6-1131P-201ENST00000364955 107 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
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FOXQ1Q9C009 U8.17-201ENST00000391292 132 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
FOXQ1Q9C009 MIR1289-2-201ENST00000408360 111 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
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FOXQ1Q9C009 snoU13.23-201ENST00000458863 104 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
FOXQ1Q9C009 RNU7-164P-201ENST00000459221 62 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
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FOXQ1Q9C009 AC022523.2-201ENST00000561045 150 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
FOXQ1Q9C009 ZBTB20-201ENST00000357258 27125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.68□□□□□ -1.98
FOXQ1Q9C009 AASDH-207ENST00000513376 3241 ntTSL 1 (best) BASIC2.68□□□□□ -1.98
FOXQ1Q9C009 PCDH11Y-201ENST00000215473 4595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.68□□□□□ -1.98
FOXQ1Q9C009 RNF219-AS1-214ENST00000607862 6001 ntTSL 1 (best) BASIC2.67□□□□□ -1.98
FOXQ1Q9C009 GYPA-201ENST00000324022 751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.67□□□□□ -1.98
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FOXQ1Q9C009 RNU1-91P-201ENST00000364746 163 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
FOXQ1Q9C009 RNU6-49P-201ENST00000384256 107 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
FOXQ1Q9C009 MIR29C-201ENST00000385231 88 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
FOXQ1Q9C009 SNORA19.1-201ENST00000410656 129 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
FOXQ1Q9C009 AC114811.1-201ENST00000507207 168 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
FOXQ1Q9C009 RNU6-1116P-201ENST00000517269 99 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
FOXQ1Q9C009 AC084364.2-201ENST00000546924 395 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
FOXQ1Q9C009 HSPE1P19-201ENST00000603327 295 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
FOXQ1Q9C009 TAB3-205ENST00000378933 6671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.67□□□□□ -1.98
FOXQ1Q9C009 LCOR-205ENST00000421806 16004 ntTSL 3 BASIC2.66□□□□□ -1.98
FOXQ1Q9C009 CHORDC1-205ENST00000529726 4805 ntTSL 2 BASIC2.66□□□□□ -1.98
FOXQ1Q9C009 AL596211.1-201ENST00000569873 2277 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
FOXQ1Q9C009 RNU6-1019P-201ENST00000364424 107 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
FOXQ1Q9C009 Y_RNA.344-201ENST00000365381 112 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
FOXQ1Q9C009 Y_RNA.351-201ENST00000365436 96 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
FOXQ1Q9C009 MIR590-201ENST00000385008 97 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
FOXQ1Q9C009 RNA5SP425-201ENST00000410336 112 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
FOXQ1Q9C009 BX510359.4-201ENST00000423750 193 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
FOXQ1Q9C009 CFLAR-AS1-202ENST00000474886 223 ntTSL 3 BASIC2.66□□□□□ -1.98
FOXQ1Q9C009 RN7SKP43-201ENST00000516173 320 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
FOXQ1Q9C009 RNU6-109P-201ENST00000516364 107 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
FOXQ1Q9C009 RNU6-184P-201ENST00000516514 107 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
FOXQ1Q9C009 AC068339.1-201ENST00000526965 141 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
FOXQ1Q9C009 MIR3126-201ENST00000577443 74 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
FOXQ1Q9C009 MIR5009-201ENST00000578736 100 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
FOXQ1Q9C009 MIR4648-201ENST00000580107 72 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
FOXQ1Q9C009 AC069114.2-201ENST00000604699 304 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
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