Protein–RNA interactions for Protein: Q96HD1

CRELD1, Cysteine-rich with EGF-like domain protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 420 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRELD1Q96HD1 AL590004.2-201ENST00000404787 371 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
CRELD1Q96HD1 MIR1263-201ENST00000408324 86 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
CRELD1Q96HD1 snoU13.26-201ENST00000459452 105 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
CRELD1Q96HD1 RNU6-504P-201ENST00000516568 104 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
CRELD1Q96HD1 Pinc.1-201ENST00000616452 154 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
CRELD1Q96HD1 LINC00645-203ENST00000557399 3512 ntTSL 1 (best) BASIC2.91□□□□□ -1.94
CRELD1Q96HD1 AC108206.1-201ENST00000570186 4159 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
CRELD1Q96HD1 AL161431.1-201ENST00000618966 4205 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
CRELD1Q96HD1 KTN1-206ENST00000413890 4473 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.9□□□□□ -1.94
CRELD1Q96HD1 Y_RNA.17-201ENST00000362433 111 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
CRELD1Q96HD1 RNA5SP109-201ENST00000391010 116 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
CRELD1Q96HD1 RNU6-279P-201ENST00000391297 101 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
CRELD1Q96HD1 MIR1283-2-201ENST00000408621 87 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
CRELD1Q96HD1 RNA5SP229-201ENST00000410809 99 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
CRELD1Q96HD1 HMGN2P3-201ENST00000433603 273 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
CRELD1Q96HD1 HMGN2P5-201ENST00000436882 273 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
CRELD1Q96HD1 AC022217.4-201ENST00000604389 163 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
CRELD1Q96HD1 ZNRD1-AS1_3.8-201ENST00000611686 104 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
CRELD1Q96HD1 CTSLP2-204ENST00000629029 392 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
CRELD1Q96HD1 CHD9-202ENST00000398510 11337 ntTSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.95
CRELD1Q96HD1 OR4C11-202ENST00000641580 2737 ntAPPRIS P1 BASIC2.9□□□□□ -1.95
CRELD1Q96HD1 FAM46D-201ENST00000308293 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
CRELD1Q96HD1 VTRNA1-1-201ENST00000363120 99 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
CRELD1Q96HD1 SNORD68-201ENST00000363214 84 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
CRELD1Q96HD1 Y_RNA.265-201ENST00000364677 108 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
CRELD1Q96HD1 RNU6-1138P-201ENST00000365359 106 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
CRELD1Q96HD1 RNU6-1113P-201ENST00000384348 107 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
CRELD1Q96HD1 Y_RNA.528-201ENST00000384575 108 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
CRELD1Q96HD1 RPL39P39-201ENST00000455840 151 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
CRELD1Q96HD1 CFLAR-AS1-202ENST00000474886 223 ntTSL 3 BASIC2.89□□□□□ -1.95
CRELD1Q96HD1 NDUFA4P2-201ENST00000489989 244 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
CRELD1Q96HD1 RNA5SP153-201ENST00000516498 76 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
CRELD1Q96HD1 AL160236.1-201ENST00000556317 195 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
CRELD1Q96HD1 AL022345.2-201ENST00000606307 135 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
CRELD1Q96HD1 FOXP2-211ENST00000408937 6443 ntTSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
CRELD1Q96HD1 AC025539.1-201ENST00000515343 4019 ntTSL 2 BASIC2.89□□□□□ -1.95
CRELD1Q96HD1 KCNIP4-IT1-201ENST00000627566 9848 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
CRELD1Q96HD1 MAPK10-266ENST00000641066 6555 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
CRELD1Q96HD1 AKAP9-202ENST00000358100 10309 ntTSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
CRELD1Q96HD1 CHD9-218ENST00000566029 13110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
CRELD1Q96HD1 OSTN-201ENST00000339051 402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
CRELD1Q96HD1 Y_RNA.73-201ENST00000362910 113 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
CRELD1Q96HD1 SNORA63.5-201ENST00000363548 123 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
CRELD1Q96HD1 Y_RNA.242-201ENST00000364473 110 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
CRELD1Q96HD1 U8.9-201ENST00000365667 134 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
CRELD1Q96HD1 LINC00407-201ENST00000426509 295 ntTSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
CRELD1Q96HD1 AC073261.1-201ENST00000429409 121 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
CRELD1Q96HD1 CALM2P4-201ENST00000430810 426 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
CRELD1Q96HD1 AL606517.2-201ENST00000442855 241 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
CRELD1Q96HD1 AC107297.1-201ENST00000459991 176 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
CRELD1Q96HD1 AC084364.2-201ENST00000546924 395 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
CRELD1Q96HD1 AC087685.1-201ENST00000587507 141 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
CRELD1Q96HD1 uc_338.25-201ENST00000613756 156 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
CRELD1Q96HD1 Y_RNA.91-201ENST00000363042 107 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
CRELD1Q96HD1 RNU6-497P-201ENST00000365316 104 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
CRELD1Q96HD1 SNORD18B-201ENST00000365659 72 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
CRELD1Q96HD1 MIR570-201ENST00000384917 97 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
CRELD1Q96HD1 RNA5SP274-201ENST00000410484 108 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
CRELD1Q96HD1 U91324.1-201ENST00000442864 447 ntTSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
CRELD1Q96HD1 AC108752.1-201ENST00000484679 576 ntTSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
CRELD1Q96HD1 RNU6-857P-201ENST00000515893 110 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
CRELD1Q96HD1 RNU6-158P-201ENST00000517104 100 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
CRELD1Q96HD1 AC079600.2-201ENST00000550076 130 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
CRELD1Q96HD1 CLRN1-AS1.1-201ENST00000615643 79 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
CRELD1Q96HD1 ZNF705G-201ENST00000400156 3644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.87□□□□□ -1.95
CRELD1Q96HD1 AC009487.2-201ENST00000420969 6821 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
CRELD1Q96HD1 Y_RNA.634-201ENST00000364811 113 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
CRELD1Q96HD1 Y_RNA.313-201ENST00000365095 103 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
CRELD1Q96HD1 RNU6-1276P-201ENST00000365372 104 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
CRELD1Q96HD1 RNU1-52P-201ENST00000384190 164 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
CRELD1Q96HD1 RNU6ATAC3P-201ENST00000387974 126 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
CRELD1Q96HD1 TRAJ50-201ENST00000390487 60 ntAPPRIS P1 BASIC2.86□□□□□ -1.95
CRELD1Q96HD1 STAG3L5P-204ENST00000443759 179 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
CRELD1Q96HD1 RPL39P40-201ENST00000445481 146 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
CRELD1Q96HD1 RNU6-893P-201ENST00000458841 100 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
CRELD1Q96HD1 AP004217.1-201ENST00000480579 346 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
CRELD1Q96HD1 MRPS17P9-201ENST00000511924 393 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
CRELD1Q96HD1 WDR3-201ENST00000349139 9974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
CRELD1Q96HD1 SENP7-205ENST00000394091 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
CRELD1Q96HD1 MIR22-201ENST00000362190 85 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
CRELD1Q96HD1 MIR196B-201ENST00000384852 84 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
CRELD1Q96HD1 RNA5SP482-201ENST00000391269 118 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
CRELD1Q96HD1 AL021397.1-201ENST00000451806 248 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
CRELD1Q96HD1 SCGB1D5P-201ENST00000515134 247 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
CRELD1Q96HD1 RNU7-28P-201ENST00000516759 62 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
CRELD1Q96HD1 RNU6-365P-201ENST00000517113 106 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
CRELD1Q96HD1 AC008507.4-201ENST00000585464 127 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
CRELD1Q96HD1 AC097639.2-201ENST00000603159 172 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
CRELD1Q96HD1 Y_RNA.818-201ENST00000618813 71 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
CRELD1Q96HD1 Y_RNA.52-201ENST00000362760 96 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
CRELD1Q96HD1 SNORD15B-201ENST00000384714 146 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
CRELD1Q96HD1 MIR522-201ENST00000385071 87 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
CRELD1Q96HD1 TRAJ41-201ENST00000390496 62 ntAPPRIS P1 BASIC2.84□□□□□ -1.95
CRELD1Q96HD1 SNORD88.1-201ENST00000408684 91 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
CRELD1Q96HD1 SNORD109B-201ENST00000458961 67 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
CRELD1Q96HD1 SNORD109A-201ENST00000459128 67 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
CRELD1Q96HD1 MIR8054-201ENST00000620877 86 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
CRELD1Q96HD1 VPS54-202ENST00000354504 3594 ntTSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
CRELD1Q96HD1 SLCO1B3-202ENST00000381545 2805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.84□□□□□ -1.95
CRELD1Q96HD1 TFEC-202ENST00000320239 6605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 107.6 ms