Protein–RNA interactions for Protein: Q16827

PTPRO, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase O, humanhuman

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Length 1,216 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPROQ16827 RNU6-917P-201ENST00000516294 104 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
PTPROQ16827 Y_RNA.679-201ENST00000516416 91 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
PTPROQ16827 MIR4419B-201ENST00000577260 68 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
PTPROQ16827 FAM106DP-201ENST00000586416 501 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
PTPROQ16827 AC006006.1-201ENST00000603082 144 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
PTPROQ16827 KIAA1107-201ENST00000370378 4622 ntTSL 5 BASIC1.94□□□□□ -2.1
PTPROQ16827 MIR136-201ENST00000385207 82 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
PTPROQ16827 MIR526A2-201ENST00000390198 65 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
PTPROQ16827 MIR1278-201ENST00000408753 81 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
PTPROQ16827 MIR548H3-201ENST00000408771 118 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
PTPROQ16827 MTND3P2-201ENST00000438452 342 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
PTPROQ16827 MIR3664-201ENST00000579074 99 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
PTPROQ16827 MIR4255-201ENST00000579351 72 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
PTPROQ16827 Y_RNA.82-201ENST00000363000 102 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
PTPROQ16827 Y_RNA.92-201ENST00000363043 102 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
PTPROQ16827 Y_RNA.235-201ENST00000364412 102 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
PTPROQ16827 Y_RNA.306-201ENST00000365015 102 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
PTPROQ16827 Y_RNA.312-201ENST00000365089 102 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
PTPROQ16827 Y_RNA.322-201ENST00000365151 102 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
PTPROQ16827 Y_RNA.466-201ENST00000384294 113 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
PTPROQ16827 SNORA8.3-201ENST00000384679 139 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
PTPROQ16827 TRAJ47-201ENST00000390490 57 ntAPPRIS P1 BASIC1.92□□□□□ -2.1
PTPROQ16827 Y_RNA.650-201ENST00000459002 102 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
PTPROQ16827 snoU13.18-201ENST00000459483 104 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
PTPROQ16827 Y_RNA.777-201ENST00000516982 102 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
PTPROQ16827 Y_RNA.771-201ENST00000598668 102 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
PTPROQ16827 BX248123.2-201ENST00000606318 124 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
PTPROQ16827 Y_RNA.789-201ENST00000622480 102 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
PTPROQ16827 XIRP2-201ENST00000295237 5246 ntTSL 2 BASIC1.92□□□□□ -2.1
PTPROQ16827 Y_RNA.117-201ENST00000363294 101 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
PTPROQ16827 SNORD38C-201ENST00000384381 69 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
PTPROQ16827 RNU6-383P-201ENST00000410864 94 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
PTPROQ16827 AP000235.1-201ENST00000424017 479 ntTSL 3 BASIC1.91□□□□□ -2.1
PTPROQ16827 SNORD127-201ENST00000458892 86 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
PTPROQ16827 SNORD11-201ENST00000459124 84 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
PTPROQ16827 NDUFA4P2-201ENST00000489989 244 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
PTPROQ16827 AC017015.2-201ENST00000497946 376 ntTSL 2 BASIC1.91□□□□□ -2.1
PTPROQ16827 RN7SKP88-201ENST00000516847 250 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
PTPROQ16827 MIR4303-201ENST00000581299 66 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
PTPROQ16827 AC008507.4-201ENST00000585464 127 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
PTPROQ16827 7SK.8-201ENST00000612110 250 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
PTPROQ16827 7SK.11-201ENST00000615477 250 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
PTPROQ16827 7SK.13-201ENST00000622040 250 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
PTPROQ16827 AC015922.2-201ENST00000435593 184 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
PTPROQ16827 RPL39P39-201ENST00000455840 151 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
PTPROQ16827 AC012433.1-201ENST00000588916 398 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
PTPROQ16827 U4.1-201ENST00000620349 87 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
PTPROQ16827 Y_RNA.54-201ENST00000362766 105 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
PTPROQ16827 Y_RNA.224-201ENST00000364308 111 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
PTPROQ16827 RNA5SP363-201ENST00000365072 115 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
PTPROQ16827 RNU6-196P-201ENST00000384315 107 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
PTPROQ16827 MIR526A1-201ENST00000384897 85 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
PTPROQ16827 MIR489-201ENST00000384923 84 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
PTPROQ16827 SNORD2.1-201ENST00000458762 69 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
PTPROQ16827 MIR8065-201ENST00000620577 100 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
PTPROQ16827 MBNL3-212ENST00000538204 11294 ntTSL 1 (best) BASIC1.89□□□□□ -2.11
PTPROQ16827 SNORD48-201ENST00000364953 64 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
PTPROQ16827 MIR568-201ENST00000385036 95 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
PTPROQ16827 RNU2-38P-201ENST00000410856 79 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
PTPROQ16827 RN7SKP101-201ENST00000411376 320 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
PTPROQ16827 RNU6-1132P-201ENST00000459214 107 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
PTPROQ16827 RNU7-95P-201ENST00000459222 64 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
PTPROQ16827 uc_338.4-201ENST00000616635 176 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
PTPROQ16827 UHRF1BP1L-203ENST00000545232 4088 ntTSL 1 (best) BASIC1.88□□□□□ -2.11
PTPROQ16827 UBE3A-225ENST00000636667 5726 ntTSL 5 BASIC1.88□□□□□ -2.11
PTPROQ16827 FSIP2-202ENST00000424728 20788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC1.87□□□□□ -2.11
PTPROQ16827 SLC9C2-201ENST00000367714 4428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.87□□□□□ -2.11
PTPROQ16827 MIR516B2-201ENST00000385190 85 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
PTPROQ16827 AL603910.2-201ENST00000407268 136 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
PTPROQ16827 AC009474.2-201ENST00000451383 136 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
PTPROQ16827 AC090142.3-201ENST00000519012 385 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
PTPROQ16827 LINC02277-202ENST00000556472 453 ntTSL 3 BASIC1.87□□□□□ -2.11
PTPROQ16827 CYP3A52P-201ENST00000563326 91 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
PTPROQ16827 AL162730.1-201ENST00000605734 292 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
PTPROQ16827 BX284668.6-201ENST00000606899 438 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
PTPROQ16827 SEMG2-201ENST00000372769 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.87□□□□□ -2.11
PTPROQ16827 SYT14-201ENST00000367015 5094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.87□□□□□ -2.11
PTPROQ16827 CTDSPL2-202ENST00000558373 4255 ntTSL 1 (best) BASIC1.86□□□□□ -2.11
PTPROQ16827 Y_RNA.327-201ENST00000365201 102 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
PTPROQ16827 SNORD41-201ENST00000386967 70 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
PTPROQ16827 AC137770.1-201ENST00000504620 530 ntTSL 3 BASIC1.86□□□□□ -2.11
PTPROQ16827 RNU6-126P-201ENST00000516685 103 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
PTPROQ16827 AL021707.8-201ENST00000609428 183 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
PTPROQ16827 TRAJ36-201ENST00000614481 58 ntAPPRIS P1 BASIC1.86□□□□□ -2.11
PTPROQ16827 AP003715.1-201ENST00000532109 435 ntTSL 3 BASIC1.85□□□□□ -2.11
PTPROQ16827 SNORD53B-201ENST00000577887 78 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
PTPROQ16827 MIR4662B-201ENST00000579498 81 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
PTPROQ16827 MIR4282-201ENST00000583613 67 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
PTPROQ16827 RNU6-702P-201ENST00000364982 107 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
PTPROQ16827 Y_RNA.668-201ENST00000516233 93 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
PTPROQ16827 RNU6-947P-201ENST00000516264 106 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
PTPROQ16827 AL049861.1-201ENST00000603130 150 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
PTPROQ16827 AC062037.2-201ENST00000610137 73 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
PTPROQ16827 Y_RNA.24-201ENST00000362508 103 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
PTPROQ16827 Y_RNA.277-201ENST00000364754 102 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
PTPROQ16827 RNU6-392P-201ENST00000364926 101 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
PTPROQ16827 Y_RNA.416-201ENST00000384014 113 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
PTPROQ16827 Y_RNA.562-201ENST00000384695 113 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
PTPROQ16827 MIR626-201ENST00000385032 94 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
PTPROQ16827 RNU1-98P-201ENST00000458992 160 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
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